MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
42501	NC_004113	TCA	2	6	2545201	2545206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299973
42502	NC_004113	AAT	2	6	2545215	2545220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22299973
42503	NC_004113	CTT	2	6	2545472	2545477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299974
42504	NC_004113	GT	3	6	2545538	2545543	0 %	50 %	50 %	0 %	22299974
42505	NC_004113	CAA	2	6	2545641	2545646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299974
42506	NC_004113	GTC	2	6	2545859	2545864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299974
42507	NC_004113	TTTG	2	8	2545956	2545963	0 %	75 %	25 %	0 %	22299974
42508	NC_004113	GTA	2	6	2545999	2546004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299974
42509	NC_004113	GCT	2	6	2546059	2546064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299974
42510	NC_004113	AACC	2	8	2546079	2546086	50 %	0 %	0 %	50 %	22299974
42511	NC_004113	TCA	2	6	2546123	2546128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22299974
42512	NC_004113	CAG	2	6	2546154	2546159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299974
42513	NC_004113	A	6	6	2546350	2546355	100 %	0 %	0 %	0 %	22299974
42514	NC_004113	CTG	2	6	2546389	2546394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299974
42515	NC_004113	CTT	2	6	2546440	2546445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299974
42516	NC_004113	TC	3	6	2546485	2546490	0 %	50 %	0 %	50 %	22299974
42517	NC_004113	AACC	2	8	2546539	2546546	50 %	0 %	0 %	50 %	22299974
42518	NC_004113	GTT	2	6	2546588	2546593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22299974
42519	NC_004113	ATT	2	6	2546642	2546647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22299974
42520	NC_004113	AAC	2	6	2547071	2547076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299975
42521	NC_004113	G	7	7	2547195	2547201	0 %	0 %	100 %	0 %	22299975
42522	NC_004113	GCA	2	6	2547355	2547360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299975
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42524	NC_004113	GAA	2	6	2547425	2547430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299975
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42528	NC_004113	GAA	2	6	2547509	2547514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22299975
42529	NC_004113	TGC	2	6	2547528	2547533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299975
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42531	NC_004113	TGC	2	6	2547549	2547554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299975
42532	NC_004113	TGC	2	6	2547816	2547821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299975
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42535	NC_004113	CAG	2	6	2547911	2547916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299975
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42538	NC_004113	CCA	3	9	2548028	2548036	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299975
42539	NC_004113	CTCC	2	8	2548049	2548056	0 %	25 %	0 %	75 %	22299975
42540	NC_004113	ACA	2	6	2548067	2548072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22299975
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42542	NC_004113	GCG	2	6	2548112	2548117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299975
42543	NC_004113	ACC	2	6	2548159	2548164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299975
42544	NC_004113	CCT	2	6	2548172	2548177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22299975
42545	NC_004113	GGGC	2	8	2548209	2548216	0 %	0 %	75 %	25 %	22299975
42546	NC_004113	TGA	2	6	2548248	2548253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299975
42547	NC_004113	TGA	2	6	2548263	2548268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22299975
42548	NC_004113	G	7	7	2548310	2548316	0 %	0 %	100 %	0 %	22299975
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42552	NC_004113	CTT	2	6	2548405	2548410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299975
42553	NC_004113	T	6	6	2548409	2548414	0 %	100 %	0 %	0 %	22299975
42554	NC_004113	CTT	2	6	2548417	2548422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22299975
42555	NC_004113	CTG	2	6	2548451	2548456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299975
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42559	NC_004113	TGC	2	6	2548805	2548810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22299976
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42562	NC_004113	CCA	2	6	2548897	2548902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22299976
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42573	NC_004113	TGG	2	6	2549565	2549570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22299977
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42589	NC_004113	GCA	2	6	2550198	2550203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299978
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42593	NC_004113	CGTC	2	8	2550370	2550377	0 %	25 %	25 %	50 %	22299978
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42602	NC_004113	CAG	2	6	2550822	2550827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299979
42603	NC_004113	GCA	3	9	2550891	2550899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299979
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42612	NC_004113	TGCGG	2	10	2551886	2551895	0 %	20 %	60 %	20 %	22299979
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42618	NC_004113	G	6	6	2552115	2552120	0 %	0 %	100 %	0 %	22299980
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42726	NC_004113	CTGC	2	8	2558020	2558027	0 %	25 %	25 %	50 %	22299987
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42729	NC_004113	GCG	2	6	2558130	2558135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22299987
42730	NC_004113	GAG	2	6	2558257	2558262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22299987
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42735	NC_004113	GCA	2	6	2558461	2558466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22299987
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42970	NC_004113	AGC	2	6	2573361	2573366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22300001
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42972	NC_004113	TGA	2	6	2573421	2573426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22300001
42973	NC_004113	CTG	2	6	2573449	2573454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22300001
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