MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004113	ATC	2	6	206424	206429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297769
3502	NC_004113	TGGAT	2	10	206462	206471	20 %	40 %	40 %	0 %	22297769
3503	NC_004113	GCAA	2	8	206508	206515	50 %	0 %	25 %	25 %	22297769
3504	NC_004113	AGC	2	6	206545	206550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297769
3505	NC_004113	TGCA	2	8	206553	206560	25 %	25 %	25 %	25 %	22297769
3506	NC_004113	ATG	2	6	207090	207095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297770
3507	NC_004113	AAC	2	6	207115	207120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297770
3508	NC_004113	ATTC	2	8	207147	207154	25 %	50 %	0 %	25 %	22297770
3509	NC_004113	CGCTG	2	10	207220	207229	0 %	20 %	40 %	40 %	22297770
3510	NC_004113	AGG	2	6	207335	207340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297770
3511	NC_004113	GTG	2	6	207352	207357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297770
3512	NC_004113	GGC	2	6	207461	207466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297770
3513	NC_004113	GGT	2	6	207473	207478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297770
3514	NC_004113	CGG	2	6	207534	207539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297770
3515	NC_004113	TGA	2	6	207587	207592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297770
3516	NC_004113	GAT	2	6	207642	207647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297770
3517	NC_004113	GGC	2	6	207745	207750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297770
3518	NC_004113	C	7	7	207920	207926	0 %	0 %	0 %	100 %	22297771
3519	NC_004113	AGC	2	6	208031	208036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3520	NC_004113	GGC	2	6	208040	208045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3521	NC_004113	TTA	2	6	208117	208122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297771
3522	NC_004113	ACA	2	6	208150	208155	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297771
3523	NC_004113	GCG	2	6	208177	208182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3524	NC_004113	A	6	6	208213	208218	100 %	0 %	0 %	0 %	22297771
3525	NC_004113	GTG	2	6	208248	208253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297771
3526	NC_004113	C	6	6	208407	208412	0 %	0 %	0 %	100 %	22297771
3527	NC_004113	ATT	2	6	208416	208421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297771
3528	NC_004113	TGA	2	6	208430	208435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297771
3529	NC_004113	CGA	2	6	208438	208443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3530	NC_004113	GCA	2	6	208466	208471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3531	NC_004113	G	6	6	208499	208504	0 %	0 %	100 %	0 %	22297771
3532	NC_004113	TCGGGG	2	12	208549	208560	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22297771
3533	NC_004113	GCAG	2	8	208667	208674	25 %	0 %	50 %	25 %	22297771
3534	NC_004113	TTG	2	6	208678	208683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297771
3535	NC_004113	TC	3	6	208739	208744	0 %	50 %	0 %	50 %	22297771
3536	NC_004113	GCA	2	6	208757	208762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3537	NC_004113	ACT	2	6	208772	208777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297771
3538	NC_004113	GCC	2	6	208800	208805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297771
3539	NC_004113	TTG	2	6	208807	208812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297771
3540	NC_004113	GCC	2	6	208821	208826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297771
3541	NC_004113	GTGA	2	8	208887	208894	25 %	25 %	50 %	0 %	22297771
3542	NC_004113	GAT	2	6	209055	209060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297771
3543	NC_004113	CTT	2	6	209113	209118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297771
3544	NC_004113	GGC	2	6	209190	209195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3545	NC_004113	GCC	2	6	209285	209290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297771
3546	NC_004113	A	6	6	209346	209351	100 %	0 %	0 %	0 %	22297771
3547	NC_004113	GAA	2	6	209421	209426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297771
3548	NC_004113	TGC	2	6	209503	209508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3549	NC_004113	TTG	2	6	209530	209535	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297771
3550	NC_004113	G	6	6	209540	209545	0 %	0 %	100 %	0 %	22297771
3551	NC_004113	TGT	2	6	209581	209586	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297771
3552	NC_004113	TGG	2	6	209686	209691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297771
3553	NC_004113	CAC	2	6	209699	209704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297771
3554	NC_004113	CGA	2	6	209747	209752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3555	NC_004113	TGC	2	6	209827	209832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297771
3556	NC_004113	TACC	3	12	209960	209971	25 %	25 %	0 %	50 %	22297771
3557	NC_004113	GCG	2	6	209991	209996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3558	NC_004113	GCG	2	6	210027	210032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3559	NC_004113	CTT	2	6	210062	210067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297771
3560	NC_004113	G	6	6	210263	210268	0 %	0 %	100 %	0 %	22297771
3561	NC_004113	AGG	2	6	210352	210357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297771
3562	NC_004113	CGG	2	6	210504	210509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297771
3563	NC_004113	CTA	2	6	210521	210526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297771
3564	NC_004113	G	7	7	210528	210534	0 %	0 %	100 %	0 %	22297771
3565	NC_004113	C	6	6	210566	210571	0 %	0 %	0 %	100 %	22297772
3566	NC_004113	CCGC	2	8	210662	210669	0 %	0 %	25 %	75 %	22297772
3567	NC_004113	GCG	2	6	210751	210756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297772
3568	NC_004113	G	6	6	210764	210769	0 %	0 %	100 %	0 %	22297772
3569	NC_004113	CG	3	6	210770	210775	0 %	0 %	50 %	50 %	22297772
3570	NC_004113	TGG	2	6	210807	210812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297772
3571	NC_004113	G	6	6	210871	210876	0 %	0 %	100 %	0 %	22297772
3572	NC_004113	GAGG	2	8	210911	210918	25 %	0 %	75 %	0 %	22297772
3573	NC_004113	GCA	2	6	211036	211041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297772
3574	NC_004113	GGT	2	6	211129	211134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297772
3575	NC_004113	GCTG	2	8	211285	211292	0 %	25 %	50 %	25 %	22297773
3576	NC_004113	C	7	7	211339	211345	0 %	0 %	0 %	100 %	22297773
3577	NC_004113	GCA	2	6	211367	211372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297773
3578	NC_004113	CAGT	2	8	211402	211409	25 %	25 %	25 %	25 %	22297773
3579	NC_004113	TGAAT	2	10	211430	211439	40 %	40 %	20 %	0 %	22297773
3580	NC_004113	CTT	2	6	211442	211447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297773
3581	NC_004113	CCG	2	6	211449	211454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297773
3582	NC_004113	A	7	7	211489	211495	100 %	0 %	0 %	0 %	22297773
3583	NC_004113	GAA	2	6	211517	211522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297773
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3587	NC_004113	CCT	2	6	212052	212057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297774
3588	NC_004113	GCC	2	6	212065	212070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297774
3589	NC_004113	CAA	2	6	212076	212081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297774
3590	NC_004113	TTC	2	6	212101	212106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297774
3591	NC_004113	GCC	2	6	212281	212286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297774
3592	NC_004113	G	6	6	212418	212423	0 %	0 %	100 %	0 %	22297774
3593	NC_004113	TGCAG	2	10	212466	212475	20 %	20 %	40 %	20 %	22297774
3594	NC_004113	AGC	2	6	212497	212502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297774
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3596	NC_004113	ACT	2	6	212573	212578	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297774
3597	NC_004113	ACT	3	9	212606	212614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297774
3598	NC_004113	CGC	2	6	212641	212646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297774
3599	NC_004113	TTGA	2	8	212647	212654	25 %	50 %	25 %	0 %	22297774
3600	NC_004113	TGG	2	6	212900	212905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297775
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3603	NC_004113	CGG	2	6	213199	213204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297775
3604	NC_004113	CTG	2	6	213208	213213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297775
3605	NC_004113	AGC	2	6	213325	213330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297775
3606	NC_004113	CGC	2	6	213370	213375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297775
3607	NC_004113	GCA	2	6	213384	213389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297775
3608	NC_004113	GCC	2	6	213476	213481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297775
3609	NC_004113	GTA	2	6	213544	213549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297775
3610	NC_004113	CCA	2	6	213600	213605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297775
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3612	NC_004113	G	7	7	213618	213624	0 %	0 %	100 %	0 %	22297775
3613	NC_004113	G	6	6	213627	213632	0 %	0 %	100 %	0 %	22297775
3614	NC_004113	TCA	2	6	213667	213672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297776
3615	NC_004113	TAT	2	6	213696	213701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297776
3616	NC_004113	ACC	2	6	213734	213739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297776
3617	NC_004113	GGGCAC	2	12	213750	213761	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22297776
3618	NC_004113	GCCAA	2	10	213842	213851	40 %	0 %	20 %	40 %	22297776
3619	NC_004113	TGG	2	6	214023	214028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297776
3620	NC_004113	GCC	2	6	214050	214055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
3621	NC_004113	GTT	2	6	214150	214155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297776
3622	NC_004113	GGTGG	2	10	214194	214203	0 %	20 %	80 %	0 %	22297776
3623	NC_004113	GGC	2	6	214219	214224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297776
3624	NC_004113	GGC	2	6	214281	214286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297776
3625	NC_004113	GTTTTT	2	12	214382	214393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	22297776
3626	NC_004113	GACGGC	2	12	214408	214419	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22297776
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3628	NC_004113	GCC	2	6	214471	214476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297776
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3652	NC_004113	CTT	2	6	215458	215463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297777
3653	NC_004113	CGC	2	6	215528	215533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297777
3654	NC_004113	GA	3	6	215558	215563	50 %	0 %	50 %	0 %	22297777
3655	NC_004113	AAC	2	6	215616	215621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297777
3656	NC_004113	TG	3	6	215632	215637	0 %	50 %	50 %	0 %	22297777
3657	NC_004113	TGGC	2	8	215868	215875	0 %	25 %	50 %	25 %	22297777
3658	NC_004113	GCA	2	6	216312	216317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297778
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3732	NC_004113	GTG	2	6	224483	224488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297785
3733	NC_004113	ACCGCG	2	12	224525	224536	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	22297785
3734	NC_004113	CCG	2	6	224537	224542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297785
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3736	NC_004113	TGA	2	6	224649	224654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297785
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3995	NC_004113	AAC	2	6	242228	242233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297801
3996	NC_004113	CGG	2	6	242266	242271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297801
3997	NC_004113	GAA	2	6	242412	242417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297801
3998	NC_004113	CAA	2	6	242487	242492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297801
3999	NC_004113	ACT	2	6	242713	242718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297801
4000	NC_004113	ATC	2	6	242749	242754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297801

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