MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004113	GCC	2	6	174810	174815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297737
3002	NC_004113	CAG	2	6	174817	174822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3003	NC_004113	TGCGG	2	10	174856	174865	0 %	20 %	60 %	20 %	22297737
3004	NC_004113	GGTT	2	8	175055	175062	0 %	50 %	50 %	0 %	22297737
3005	NC_004113	TAC	2	6	175069	175074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297737
3006	NC_004113	TGA	2	6	175099	175104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297737
3007	NC_004113	CCCCA	2	10	175211	175220	20 %	0 %	0 %	80 %	22297737
3008	NC_004113	ACCC	2	8	175221	175228	25 %	0 %	0 %	75 %	22297737
3009	NC_004113	AAG	2	6	175230	175235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297737
3010	NC_004113	GCA	2	6	175250	175255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3011	NC_004113	T	6	6	175280	175285	0 %	100 %	0 %	0 %	22297737
3012	NC_004113	CAGCGG	2	12	175380	175391	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	22297737
3013	NC_004113	GCC	2	6	175403	175408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297737
3014	NC_004113	GAAA	2	8	175442	175449	75 %	0 %	25 %	0 %	22297737
3015	NC_004113	CGT	2	6	175517	175522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3016	NC_004113	GCC	2	6	175568	175573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297737
3017	NC_004113	CGC	2	6	175582	175587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297737
3018	NC_004113	AGT	2	6	175697	175702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297737
3019	NC_004113	CAGC	2	8	175722	175729	25 %	0 %	25 %	50 %	22297737
3020	NC_004113	CTG	2	6	175823	175828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3021	NC_004113	CAG	2	6	175887	175892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3022	NC_004113	G	7	7	176110	176116	0 %	0 %	100 %	0 %	22297737
3023	NC_004113	CGG	2	6	176148	176153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297737
3024	NC_004113	TGG	2	6	176154	176159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297737
3025	NC_004113	GATGGC	2	12	176192	176203	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	22297737
3026	NC_004113	TGG	2	6	176275	176280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297737
3027	NC_004113	GGC	2	6	176302	176307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297737
3028	NC_004113	CAA	2	6	176330	176335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297737
3029	NC_004113	CTG	2	6	176393	176398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3030	NC_004113	TG	3	6	176463	176468	0 %	50 %	50 %	0 %	22297737
3031	NC_004113	TGG	2	6	176496	176501	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297737
3032	NC_004113	GCC	2	6	176588	176593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297737
3033	NC_004113	TTTGG	2	10	176669	176678	0 %	60 %	40 %	0 %	22297737
3034	NC_004113	CGA	2	6	176707	176712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297737
3035	NC_004113	GTG	2	6	176732	176737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297737
3036	NC_004113	TGTA	2	8	176813	176820	25 %	50 %	25 %	0 %	22297737
3037	NC_004113	TTCCT	2	10	177108	177117	0 %	60 %	0 %	40 %	22297738
3038	NC_004113	ACAA	2	8	177135	177142	75 %	0 %	0 %	25 %	22297738
3039	NC_004113	AGC	2	6	177150	177155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297738
3040	NC_004113	AAG	2	6	177168	177173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297738
3041	NC_004113	GTCA	2	8	177221	177228	25 %	25 %	25 %	25 %	22297738
3042	NC_004113	CCAT	2	8	177243	177250	25 %	25 %	0 %	50 %	22297738
3043	NC_004113	GCT	2	6	177256	177261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297738
3044	NC_004113	GAA	2	6	177302	177307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297738
3045	NC_004113	TTG	2	6	177365	177370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297738
3046	NC_004113	GAA	2	6	177371	177376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297738
3047	NC_004113	GTG	2	6	177390	177395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297738
3048	NC_004113	GCCA	2	8	177457	177464	25 %	0 %	25 %	50 %	22297739
3049	NC_004113	GAA	2	6	177467	177472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297739
3050	NC_004113	TGC	2	6	177475	177480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297739
3051	NC_004113	TTG	2	6	177504	177509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297739
3052	NC_004113	GGC	2	6	177601	177606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297739
3053	NC_004113	CTG	2	6	177611	177616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297739
3054	NC_004113	ACC	2	6	177640	177645	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297739
3055	NC_004113	GGT	2	6	177691	177696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297739
3056	NC_004113	CCAA	2	8	177708	177715	50 %	0 %	0 %	50 %	22297739
3057	NC_004113	TGG	2	6	177759	177764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297739
3058	NC_004113	TGGC	2	8	177785	177792	0 %	25 %	50 %	25 %	22297739
3059	NC_004113	AGCAG	2	10	177793	177802	40 %	0 %	40 %	20 %	22297739
3060	NC_004113	CAA	2	6	177860	177865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297739
3061	NC_004113	GCC	2	6	177950	177955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297739
3062	NC_004113	GGA	2	6	178063	178068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297739
3063	NC_004113	CAGC	2	8	178108	178115	25 %	0 %	25 %	50 %	22297739
3064	NC_004113	GCC	2	6	178175	178180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297739
3065	NC_004113	TGG	2	6	178215	178220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297739
3066	NC_004113	GCC	2	6	178237	178242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297739
3067	NC_004113	AGG	2	6	178269	178274	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297739
3068	NC_004113	AGG	2	6	178401	178406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297739
3069	NC_004113	TGC	2	6	178500	178505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297739
3070	NC_004113	CAG	2	6	178635	178640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
3071	NC_004113	GGGC	2	8	178753	178760	0 %	0 %	75 %	25 %	22297740
3072	NC_004113	ATG	2	6	178762	178767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297740
3073	NC_004113	GGCTTG	2	12	178828	178839	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	22297740
3074	NC_004113	GAC	2	6	178851	178856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
3075	NC_004113	TCT	2	6	178866	178871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297740
3076	NC_004113	GCG	2	6	178905	178910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297740
3077	NC_004113	CCT	2	6	178920	178925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297740
3078	NC_004113	GCA	2	6	178936	178941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
3079	NC_004113	CTTG	2	8	178947	178954	0 %	50 %	25 %	25 %	22297740
3080	NC_004113	ACG	3	9	178960	178968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
3081	NC_004113	GGC	2	6	179019	179024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297740
3082	NC_004113	G	6	6	179057	179062	0 %	0 %	100 %	0 %	22297740
3083	NC_004113	TGG	2	6	179090	179095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297740
3084	NC_004113	ACG	2	6	179148	179153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297740
3085	NC_004113	AGT	2	6	179390	179395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297741
3086	NC_004113	A	6	6	179551	179556	100 %	0 %	0 %	0 %	22297742
3087	NC_004113	TGC	2	6	179605	179610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297742
3088	NC_004113	CGG	2	6	179763	179768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297742
3089	NC_004113	AGG	3	9	179779	179787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297742
3090	NC_004113	GCG	2	6	179810	179815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297742
3091	NC_004113	CGC	2	6	179893	179898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297743
3092	NC_004113	CTG	2	6	179951	179956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297743
3093	NC_004113	C	6	6	180033	180038	0 %	0 %	0 %	100 %	22297743
3094	NC_004113	CAC	2	6	180056	180061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297743
3095	NC_004113	GCA	2	6	180082	180087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297743
3096	NC_004113	GATAGC	2	12	180097	180108	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	22297743
3097	NC_004113	GCA	2	6	180268	180273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297743
3098	NC_004113	GGC	2	6	180295	180300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297743
3099	NC_004113	ACCA	2	8	180422	180429	50 %	0 %	0 %	50 %	22297743
3100	NC_004113	TGT	2	6	180477	180482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297743
3101	NC_004113	ATA	2	6	180548	180553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297743
3102	NC_004113	CGG	2	6	180786	180791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297744
3103	NC_004113	ACG	2	6	180799	180804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297744
3104	NC_004113	GCA	2	6	180825	180830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297744
3105	NC_004113	GAG	2	6	180838	180843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297744
3106	NC_004113	CTGGGC	2	12	180889	180900	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	22297744
3107	NC_004113	TG	3	6	180908	180913	0 %	50 %	50 %	0 %	22297744
3108	NC_004113	CTGAA	2	10	180922	180931	40 %	20 %	20 %	20 %	22297744
3109	NC_004113	ATCA	2	8	180979	180986	50 %	25 %	0 %	25 %	22297744
3110	NC_004113	A	6	6	181033	181038	100 %	0 %	0 %	0 %	22297744
3111	NC_004113	TGC	2	6	181055	181060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297744
3112	NC_004113	CGC	2	6	181061	181066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297744
3113	NC_004113	C	6	6	181161	181166	0 %	0 %	0 %	100 %	22297744
3114	NC_004113	GCG	3	9	181248	181256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297744
3115	NC_004113	GTCGGG	2	12	181473	181484	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22297745
3116	NC_004113	GAG	2	6	181494	181499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297745
3117	NC_004113	TCAAT	2	10	181614	181623	40 %	40 %	0 %	20 %	22297745
3118	NC_004113	GAC	2	6	181638	181643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297745
3119	NC_004113	GA	3	6	181646	181651	50 %	0 %	50 %	0 %	22297745
3120	NC_004113	GCA	2	6	181698	181703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297745
3121	NC_004113	AGC	2	6	181758	181763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297745
3122	NC_004113	AAT	2	6	181777	181782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297745
3123	NC_004113	TTC	2	6	181828	181833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297745
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3233	NC_004113	GCC	2	6	189171	189176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297753
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3243	NC_004113	C	6	6	189748	189753	0 %	0 %	0 %	100 %	22297753
3244	NC_004113	GCA	2	6	189846	189851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
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3246	NC_004113	GCC	2	6	190106	190111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297753
3247	NC_004113	AGC	2	6	190133	190138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
3248	NC_004113	GCA	3	9	190166	190174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297753
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3250	NC_004113	T	6	6	190187	190192	0 %	100 %	0 %	0 %	22297753
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3261	NC_004113	AC	3	6	190725	190730	50 %	0 %	0 %	50 %	22297754
3262	NC_004113	TGG	2	6	190808	190813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297754
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3265	NC_004113	A	6	6	190907	190912	100 %	0 %	0 %	0 %	22297754
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3278	NC_004113	TCA	2	6	191542	191547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297756
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3357	NC_004113	AATA	2	8	196254	196261	75 %	25 %	0 %	0 %	22297758
3358	NC_004113	CCT	2	6	196346	196351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297758
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3361	NC_004113	AAAG	2	8	196459	196466	75 %	0 %	25 %	0 %	22297758
3362	NC_004113	AAC	2	6	196518	196523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297758
3363	NC_004113	A	7	7	196556	196562	100 %	0 %	0 %	0 %	22297758
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3366	NC_004113	TAT	2	6	196637	196642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297758
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3492	NC_004113	A	6	6	205793	205798	100 %	0 %	0 %	0 %	22297768
3493	NC_004113	GTGGCG	2	12	205914	205925	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	22297768
3494	NC_004113	GGA	2	6	205928	205933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297768
3495	NC_004113	CAG	2	6	205946	205951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297768
3496	NC_004113	AGGG	2	8	206075	206082	25 %	0 %	75 %	0 %	22297769
3497	NC_004113	TGCT	2	8	206091	206098	0 %	50 %	25 %	25 %	22297769
3498	NC_004113	GGC	2	6	206186	206191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297769
3499	NC_004113	CGC	2	6	206210	206215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297769
3500	NC_004113	AGT	2	6	206255	206260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297769

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