MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004113	G	6	6	88559	88564	0 %	0 %	100 %	0 %	22297655
1502	NC_004113	TTA	2	6	88567	88572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297655
1503	NC_004113	TGC	2	6	88593	88598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297655
1504	NC_004113	TCA	2	6	88784	88789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297655
1505	NC_004113	CTC	2	6	88810	88815	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297655
1506	NC_004113	CTGG	2	8	88852	88859	0 %	25 %	50 %	25 %	22297655
1507	NC_004113	CCT	2	6	88887	88892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297655
1508	NC_004113	G	6	6	88932	88937	0 %	0 %	100 %	0 %	22297655
1509	NC_004113	CAC	2	6	88971	88976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297655
1510	NC_004113	CCT	2	6	88986	88991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297655
1511	NC_004113	GA	3	6	89303	89308	50 %	0 %	50 %	0 %	22297655
1512	NC_004113	TGCC	2	8	89312	89319	0 %	25 %	25 %	50 %	22297655
1513	NC_004113	TAC	2	6	89346	89351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297655
1514	NC_004113	TGT	3	9	89352	89360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297655
1515	NC_004113	CAG	2	6	89491	89496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297655
1516	NC_004113	TGC	2	6	89519	89524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297656
1517	NC_004113	A	7	7	89696	89702	100 %	0 %	0 %	0 %	22297656
1518	NC_004113	GGT	2	6	89747	89752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297656
1519	NC_004113	T	6	6	89766	89771	0 %	100 %	0 %	0 %	22297656
1520	NC_004113	ACA	2	6	89794	89799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297656
1521	NC_004113	TGAT	2	8	89809	89816	25 %	50 %	25 %	0 %	22297656
1522	NC_004113	G	6	6	89819	89824	0 %	0 %	100 %	0 %	22297656
1523	NC_004113	CTG	2	6	89957	89962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297656
1524	NC_004113	GCA	2	6	89982	89987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297656
1525	NC_004113	GTG	2	6	90126	90131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297656
1526	NC_004113	G	6	6	90155	90160	0 %	0 %	100 %	0 %	22297656
1527	NC_004113	TGG	2	6	90208	90213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297656
1528	NC_004113	GGC	2	6	90284	90289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297656
1529	NC_004113	CTT	2	6	90296	90301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297656
1530	NC_004113	TTG	2	6	90333	90338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297656
1531	NC_004113	AAG	2	6	90860	90865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297657
1532	NC_004113	GAT	2	6	90932	90937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297657
1533	NC_004113	AGA	2	6	90952	90957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297657
1534	NC_004113	CCG	2	6	90969	90974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297657
1535	NC_004113	GGC	2	6	91008	91013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297657
1536	NC_004113	CTT	2	6	91025	91030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297657
1537	NC_004113	GGC	2	6	91043	91048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297657
1538	NC_004113	GTC	2	6	91071	91076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297657
1539	NC_004113	AAC	2	6	91101	91106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297657
1540	NC_004113	GCT	2	6	91218	91223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297657
1541	NC_004113	GTC	2	6	91542	91547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297658
1542	NC_004113	ACC	2	6	91551	91556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297658
1543	NC_004113	TGG	2	6	91576	91581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297658
1544	NC_004113	ACC	2	6	91632	91637	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297658
1545	NC_004113	TTC	2	6	91642	91647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1546	NC_004113	CGG	2	6	91657	91662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297658
1547	NC_004113	CTT	2	6	91685	91690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1548	NC_004113	TGA	2	6	91871	91876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297658
1549	NC_004113	GTTT	2	8	91904	91911	0 %	75 %	25 %	0 %	22297658
1550	NC_004113	GT	3	6	92033	92038	0 %	50 %	50 %	0 %	22297658
1551	NC_004113	TTC	3	9	92113	92121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1552	NC_004113	TGA	2	6	92129	92134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297658
1553	NC_004113	TCCA	2	8	92162	92169	25 %	25 %	0 %	50 %	22297658
1554	NC_004113	CTT	2	6	92183	92188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1555	NC_004113	TCT	2	6	92212	92217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1556	NC_004113	TTC	2	6	92353	92358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1557	NC_004113	TTC	2	6	92364	92369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297658
1558	NC_004113	CCCT	2	8	92412	92419	0 %	25 %	0 %	75 %	22297658
1559	NC_004113	TGT	2	6	92510	92515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297658
1560	NC_004113	TAG	2	6	92517	92522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297658
1561	NC_004113	TGT	2	6	92537	92542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297658
1562	NC_004113	AT	3	6	92572	92577	50 %	50 %	0 %	0 %	22297658
1563	NC_004113	GCA	2	6	92620	92625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297658
1564	NC_004113	GCT	2	6	92756	92761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297658
1565	NC_004113	GCTT	2	8	92766	92773	0 %	50 %	25 %	25 %	22297658
1566	NC_004113	GGGGTT	2	12	92795	92806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297658
1567	NC_004113	TG	3	6	92854	92859	0 %	50 %	50 %	0 %	22297658
1568	NC_004113	TGC	2	6	92891	92896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297658
1569	NC_004113	TCCT	2	8	92988	92995	0 %	50 %	0 %	50 %	22297658
1570	NC_004113	TGGT	2	8	93082	93089	0 %	50 %	50 %	0 %	22297658
1571	NC_004113	G	6	6	93838	93843	0 %	0 %	100 %	0 %	22297659
1572	NC_004113	TTGC	2	8	93845	93852	0 %	50 %	25 %	25 %	22297659
1573	NC_004113	AGC	2	6	93932	93937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297659
1574	NC_004113	GCC	2	6	94011	94016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297659
1575	NC_004113	CCAT	2	8	94048	94055	25 %	25 %	0 %	50 %	22297659
1576	NC_004113	GTG	2	6	94084	94089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297659
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1578	NC_004113	CAA	2	6	94325	94330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297659
1579	NC_004113	TGC	2	6	94342	94347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297659
1580	NC_004113	CGC	2	6	94368	94373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297659
1581	NC_004113	GCC	2	6	94407	94412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297659
1582	NC_004113	GCG	2	6	94520	94525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297659
1583	NC_004113	CGG	2	6	94562	94567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297659
1584	NC_004113	AGC	2	6	94628	94633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297659
1585	NC_004113	GGTT	2	8	94708	94715	0 %	50 %	50 %	0 %	22297659
1586	NC_004113	ATCT	2	8	94728	94735	25 %	50 %	0 %	25 %	22297659
1587	NC_004113	GTA	2	6	94855	94860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297659
1588	NC_004113	CCTTG	2	10	94889	94898	0 %	40 %	20 %	40 %	22297659
1589	NC_004113	CTG	2	6	94941	94946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297659
1590	NC_004113	CAC	3	9	94949	94957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297659
1591	NC_004113	ATT	2	6	95350	95355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297660
1592	NC_004113	CGC	2	6	95378	95383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297660
1593	NC_004113	GTG	2	6	95420	95425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297660
1594	NC_004113	GCTT	2	8	95432	95439	0 %	50 %	25 %	25 %	22297660
1595	NC_004113	GGAAGA	2	12	95491	95502	50 %	0 %	50 %	0 %	22297660
1596	NC_004113	TGA	3	9	95535	95543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297660
1597	NC_004113	CTG	2	6	95552	95557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297660
1598	NC_004113	AGCA	2	8	95577	95584	50 %	0 %	25 %	25 %	22297660
1599	NC_004113	AGCC	2	8	95641	95648	25 %	0 %	25 %	50 %	22297660
1600	NC_004113	AAG	2	6	95649	95654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297660
1601	NC_004113	GAT	2	6	95673	95678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297660
1602	NC_004113	CCT	2	6	95718	95723	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297661
1603	NC_004113	ACC	2	6	95795	95800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297661
1604	NC_004113	CTC	2	6	95806	95811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297661
1605	NC_004113	CA	3	6	95884	95889	50 %	0 %	0 %	50 %	22297661
1606	NC_004113	TCG	2	6	96118	96123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297662
1607	NC_004113	CAG	2	6	96131	96136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297662
1608	NC_004113	CGT	2	6	96180	96185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297662
1609	NC_004113	CTC	2	6	96288	96293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297662
1610	NC_004113	GTC	2	6	96316	96321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297662
1611	NC_004113	GGT	2	6	96329	96334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297662
1612	NC_004113	GCG	2	6	96360	96365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297662
1613	NC_004113	CCA	2	6	96493	96498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297663
1614	NC_004113	ATC	2	6	96531	96536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297663
1615	NC_004113	CTTCAT	2	12	96580	96591	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	22297663
1616	NC_004113	TCA	2	6	96607	96612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297663
1617	NC_004113	ATC	2	6	96651	96656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297663
1618	NC_004113	C	6	6	96710	96715	0 %	0 %	0 %	100 %	22297663
1619	NC_004113	CTT	2	6	96724	96729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297663
1620	NC_004113	CCG	2	6	96856	96861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297663
1621	NC_004113	T	6	6	96862	96867	0 %	100 %	0 %	0 %	22297663
1622	NC_004113	CCA	2	6	96868	96873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297663
1623	NC_004113	AG	3	6	96883	96888	50 %	0 %	50 %	0 %	22297663
1624	NC_004113	AGC	2	6	96897	96902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297663
1625	NC_004113	GGC	2	6	96919	96924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297663
1626	NC_004113	GTA	2	6	96938	96943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297663
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1628	NC_004113	CCA	2	6	97027	97032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297663
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1874	NC_004113	A	6	6	110429	110434	100 %	0 %	0 %	0 %	22297674
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1998	NC_004113	CGC	2	6	117727	117732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297681
1999	NC_004113	TACGG	2	10	117738	117747	20 %	20 %	40 %	20 %	22297681
2000	NC_004113	GCGGT	2	10	117871	117880	0 %	20 %	60 %	20 %	22297681

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