MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004113	CGT	2	6	61708	61713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297611
1002	NC_004113	GGC	2	6	61803	61808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297611
1003	NC_004113	TCG	2	6	61812	61817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297611
1004	NC_004113	ATT	2	6	61828	61833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297611
1005	NC_004113	C	6	6	61862	61867	0 %	0 %	0 %	100 %	22297611
1006	NC_004113	GCT	2	6	61882	61887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297611
1007	NC_004113	CAT	2	6	61935	61940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297611
1008	NC_004113	CAC	2	6	61953	61958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297611
1009	NC_004113	GCA	2	6	61968	61973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297611
1010	NC_004113	GCGG	2	8	61983	61990	0 %	0 %	75 %	25 %	22297611
1011	NC_004113	CCA	2	6	62077	62082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297611
1012	NC_004113	ATC	2	6	62164	62169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297612
1013	NC_004113	CTC	2	6	62283	62288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297612
1014	NC_004113	CTG	2	6	62298	62303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297612
1015	NC_004113	TCA	2	6	62381	62386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297612
1016	NC_004113	TCA	2	6	62401	62406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297612
1017	NC_004113	AGTGCC	2	12	62415	62426	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	22297612
1018	NC_004113	TGG	2	6	62429	62434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297612
1019	NC_004113	GTT	2	6	62804	62809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297613
1020	NC_004113	CCTG	2	8	62882	62889	0 %	25 %	25 %	50 %	22297613
1021	NC_004113	GTGA	2	8	62898	62905	25 %	25 %	50 %	0 %	22297613
1022	NC_004113	CGG	2	6	62941	62946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297613
1023	NC_004113	GT	3	6	62953	62958	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
1024	NC_004113	GTG	2	6	63048	63053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297613
1025	NC_004113	CCA	2	6	63083	63088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297613
1026	NC_004113	CAT	2	6	63092	63097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297613
1027	NC_004113	TGA	2	6	63124	63129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297613
1028	NC_004113	TGG	2	6	63178	63183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297613
1029	NC_004113	CCG	2	6	63267	63272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297613
1030	NC_004113	TG	3	6	63423	63428	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
1031	NC_004113	TTG	2	6	63538	63543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297613
1032	NC_004113	ATT	2	6	63559	63564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297613
1033	NC_004113	GGC	2	6	63610	63615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297613
1034	NC_004113	TG	3	6	63658	63663	0 %	50 %	50 %	0 %	22297613
1035	NC_004113	GGC	2	6	63683	63688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297613
1036	NC_004113	CTT	2	6	63732	63737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297613
1037	NC_004113	TCG	2	6	64088	64093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297614
1038	NC_004113	TTG	2	6	64101	64106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297614
1039	NC_004113	GTA	2	6	64209	64214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297614
1040	NC_004113	CGT	2	6	64236	64241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297614
1041	NC_004113	GAAA	2	8	64402	64409	75 %	0 %	25 %	0 %	22297614
1042	NC_004113	ACC	2	6	64412	64417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297614
1043	NC_004113	AGCG	2	8	64439	64446	25 %	0 %	50 %	25 %	22297614
1044	NC_004113	CCCGCA	2	12	64553	64564	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	22297614
1045	NC_004113	CAG	3	9	64601	64609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297614
1046	NC_004113	GCC	2	6	64635	64640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297615
1047	NC_004113	TTG	2	6	64698	64703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297615
1048	NC_004113	AGG	2	6	64704	64709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297615
1049	NC_004113	CGG	2	6	64750	64755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297615
1050	NC_004113	TAAA	2	8	64830	64837	75 %	25 %	0 %	0 %	22297615
1051	NC_004113	CTA	2	6	64851	64856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297615
1052	NC_004113	CGA	2	6	64942	64947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297615
1053	NC_004113	CTG	2	6	64966	64971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297615
1054	NC_004113	GCT	2	6	64977	64982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297615
1055	NC_004113	GTG	2	6	64998	65003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297615
1056	NC_004113	CAC	2	6	65156	65161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297615
1057	NC_004113	GGT	2	6	65197	65202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297615
1058	NC_004113	GGC	2	6	65231	65236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297615
1059	NC_004113	TGT	2	6	65237	65242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297615
1060	NC_004113	GCA	2	6	65287	65292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297615
1061	NC_004113	GAA	2	6	65326	65331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297616
1062	NC_004113	GCAG	2	8	65332	65339	25 %	0 %	50 %	25 %	22297616
1063	NC_004113	G	6	6	65343	65348	0 %	0 %	100 %	0 %	22297616
1064	NC_004113	GAT	2	6	65351	65356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297616
1065	NC_004113	AAGG	2	8	65418	65425	50 %	0 %	50 %	0 %	22297616
1066	NC_004113	CAC	2	6	65433	65438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297616
1067	NC_004113	A	7	7	65503	65509	100 %	0 %	0 %	0 %	22297616
1068	NC_004113	CTG	2	6	65574	65579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297616
1069	NC_004113	GCC	2	6	65667	65672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297616
1070	NC_004113	AAT	2	6	65697	65702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297616
1071	NC_004113	GAAAAT	2	12	65736	65747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	22297616
1072	NC_004113	GCG	2	6	65814	65819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297616
1073	NC_004113	GAG	2	6	65865	65870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297616
1074	NC_004113	TCA	2	6	65884	65889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297616
1075	NC_004113	TGC	2	6	65893	65898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297616
1076	NC_004113	CTG	2	6	65956	65961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297616
1077	NC_004113	AAATT	2	10	65972	65981	60 %	40 %	0 %	0 %	22297616
1078	NC_004113	CATCCA	2	12	66047	66058	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	22297616
1079	NC_004113	CCAC	2	8	66083	66090	25 %	0 %	0 %	75 %	22297616
1080	NC_004113	GTT	2	6	66152	66157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297616
1081	NC_004113	CAC	2	6	66180	66185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297616
1082	NC_004113	CAG	2	6	66219	66224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297616
1083	NC_004113	CTC	2	6	66264	66269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297616
1084	NC_004113	CAAGGA	2	12	66314	66325	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	22297616
1085	NC_004113	CCA	2	6	66329	66334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297616
1086	NC_004113	GCCAA	2	10	66397	66406	40 %	0 %	20 %	40 %	22297616
1087	NC_004113	CCA	2	6	66441	66446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297616
1088	NC_004113	TTC	2	6	66509	66514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297617
1089	NC_004113	GCC	4	12	66594	66605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297617
1090	NC_004113	TGC	2	6	66680	66685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1091	NC_004113	AGC	2	6	66707	66712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1092	NC_004113	TGG	2	6	66829	66834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297617
1093	NC_004113	TCCAC	2	10	66850	66859	20 %	20 %	0 %	60 %	22297617
1094	NC_004113	CGG	2	6	66934	66939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297617
1095	NC_004113	AGA	2	6	66972	66977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297617
1096	NC_004113	AGG	2	6	67026	67031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297617
1097	NC_004113	CCA	2	6	67121	67126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297617
1098	NC_004113	ATC	2	6	67169	67174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297617
1099	NC_004113	TGG	2	6	67219	67224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297617
1100	NC_004113	G	8	8	67303	67310	0 %	0 %	100 %	0 %	22297617
1101	NC_004113	CTA	2	6	67329	67334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297617
1102	NC_004113	GCT	2	6	67428	67433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1103	NC_004113	GGC	2	6	67442	67447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297617
1104	NC_004113	GTT	3	9	67461	67469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297617
1105	NC_004113	AC	3	6	67490	67495	50 %	0 %	0 %	50 %	22297617
1106	NC_004113	AGC	2	6	67565	67570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1107	NC_004113	AGTTG	2	10	67669	67678	20 %	40 %	40 %	0 %	22297617
1108	NC_004113	GCA	2	6	67699	67704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1109	NC_004113	GGC	2	6	67735	67740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297617
1110	NC_004113	GCA	2	6	67788	67793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297617
1111	NC_004113	GACCAA	2	12	67804	67815	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22297617
1112	NC_004113	CCT	2	6	68041	68046	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297618
1113	NC_004113	CGCC	2	8	68071	68078	0 %	0 %	25 %	75 %	22297618
1114	NC_004113	GTG	2	6	68096	68101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297618
1115	NC_004113	ACC	2	6	68151	68156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297618
1116	NC_004113	CTG	2	6	68246	68251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297618
1117	NC_004113	TGAT	2	8	68283	68290	25 %	50 %	25 %	0 %	22297618
1118	NC_004113	AGGCG	2	10	68296	68305	20 %	0 %	60 %	20 %	22297618
1119	NC_004113	GCGG	3	12	68327	68338	0 %	0 %	75 %	25 %	22297618
1120	NC_004113	CAA	2	6	68393	68398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297618
1121	NC_004113	G	6	6	68442	68447	0 %	0 %	100 %	0 %	22297619
1122	NC_004113	ATT	2	6	68515	68520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297619
1123	NC_004113	CAC	2	6	68572	68577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297619
1124	NC_004113	TCA	2	6	68579	68584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297619
1125	NC_004113	GGT	2	6	68747	68752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297619
1126	NC_004113	AGC	2	6	68824	68829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297619
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