MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004113	TGA	2	6	306767	306772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297863
5002	NC_004113	ATG	4	12	306775	306786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297863
5003	NC_004113	TGA	3	9	306845	306853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297863
5004	NC_004113	ATAAA	2	10	306862	306871	80 %	20 %	0 %	0 %	22297863
5005	NC_004113	GAA	2	6	306879	306884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297863
5006	NC_004113	ACT	2	6	306938	306943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297863
5007	NC_004113	AG	3	6	307059	307064	50 %	0 %	50 %	0 %	22297863
5008	NC_004113	TCA	2	6	307075	307080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297863
5009	NC_004113	CAT	2	6	307175	307180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297863
5010	NC_004113	ACG	2	6	307261	307266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297863
5011	NC_004113	AGAA	2	8	307375	307382	75 %	0 %	25 %	0 %	22297863
5012	NC_004113	TC	3	6	307396	307401	0 %	50 %	0 %	50 %	22297863
5013	NC_004113	AAG	2	6	307454	307459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297863
5014	NC_004113	TGG	2	6	307473	307478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297863
5015	NC_004113	GTT	2	6	307487	307492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297863
5016	NC_004113	GAAT	2	8	307667	307674	50 %	25 %	25 %	0 %	22297863
5017	NC_004113	CCA	2	6	307721	307726	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297863
5018	NC_004113	CA	3	6	307776	307781	50 %	0 %	0 %	50 %	22297863
5019	NC_004113	CTT	2	6	307810	307815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297863
5020	NC_004113	GCG	2	6	308646	308651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297864
5021	NC_004113	CGA	2	6	308656	308661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5022	NC_004113	TGT	2	6	308761	308766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297864
5023	NC_004113	TGG	2	6	308770	308775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297864
5024	NC_004113	GCC	2	6	308976	308981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297864
5025	NC_004113	CTG	2	6	309059	309064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5026	NC_004113	GCA	2	6	309201	309206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5027	NC_004113	GCG	2	6	309243	309248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297864
5028	NC_004113	CAC	2	6	309281	309286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297864
5029	NC_004113	ATA	2	6	309305	309310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297864
5030	NC_004113	CCT	2	6	309316	309321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297864
5031	NC_004113	CAA	2	6	309355	309360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297864
5032	NC_004113	CTG	2	6	309362	309367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5033	NC_004113	GGT	2	6	309368	309373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297864
5034	NC_004113	G	6	6	309403	309408	0 %	0 %	100 %	0 %	22297864
5035	NC_004113	GCC	2	6	309439	309444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297864
5036	NC_004113	GCC	2	6	309470	309475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297864
5037	NC_004113	AATC	2	8	309481	309488	50 %	25 %	0 %	25 %	22297864
5038	NC_004113	ACC	2	6	309492	309497	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297864
5039	NC_004113	CGG	2	6	309503	309508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297864
5040	NC_004113	TGC	2	6	309510	309515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5041	NC_004113	GTAG	2	8	309517	309524	25 %	25 %	50 %	0 %	22297864
5042	NC_004113	TGA	2	6	309559	309564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297864
5043	NC_004113	GCG	2	6	309630	309635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297864
5044	NC_004113	GCC	2	6	309687	309692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297864
5045	NC_004113	CAG	2	6	309713	309718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297864
5046	NC_004113	GCG	2	6	309795	309800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297865
5047	NC_004113	TTG	2	6	309904	309909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297865
5048	NC_004113	T	7	7	309933	309939	0 %	100 %	0 %	0 %	22297865
5049	NC_004113	AGC	2	6	309954	309959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5050	NC_004113	GCG	2	6	310016	310021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297865
5051	NC_004113	GCT	2	6	310086	310091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5052	NC_004113	GCA	2	6	310170	310175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5053	NC_004113	G	7	7	310392	310398	0 %	0 %	100 %	0 %	22297865
5054	NC_004113	AGC	2	6	310465	310470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5055	NC_004113	CAC	2	6	310573	310578	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297865
5056	NC_004113	TGC	2	6	310668	310673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5057	NC_004113	GCA	2	6	310734	310739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297865
5058	NC_004113	GTA	2	6	310778	310783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297865
5059	NC_004113	GCG	2	6	311127	311132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297866
5060	NC_004113	CG	3	6	311154	311159	0 %	0 %	50 %	50 %	22297866
5061	NC_004113	CAA	2	6	311245	311250	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297866
5062	NC_004113	CAA	2	6	311272	311277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297866
5063	NC_004113	CTA	2	6	311375	311380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297866
5064	NC_004113	AATA	2	8	311419	311426	75 %	25 %	0 %	0 %	22297866
5065	NC_004113	TCT	2	6	311435	311440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297866
5066	NC_004113	CGC	2	6	311451	311456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297866
5067	NC_004113	CGA	2	6	311511	311516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297866
5068	NC_004113	GGCG	2	8	311535	311542	0 %	0 %	75 %	25 %	22297866
5069	NC_004113	ACT	2	6	312295	312300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297867
5070	NC_004113	AGC	2	6	312347	312352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297867
5071	NC_004113	TCG	2	6	312356	312361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297867
5072	NC_004113	GAG	2	6	312429	312434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297867
5073	NC_004113	CTC	2	6	312491	312496	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297867
5074	NC_004113	GAACCA	2	12	312504	312515	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	22297867
5075	NC_004113	CAAT	2	8	312625	312632	50 %	25 %	0 %	25 %	22297867
5076	NC_004113	AAC	2	6	312639	312644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297867
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5079	NC_004113	ATTCT	2	10	312741	312750	20 %	60 %	0 %	20 %	22297867
5080	NC_004113	TGGT	2	8	312751	312758	0 %	50 %	50 %	0 %	22297867
5081	NC_004113	GTTG	2	8	312761	312768	0 %	50 %	50 %	0 %	22297867
5082	NC_004113	GTAT	2	8	312800	312807	25 %	50 %	25 %	0 %	22297867
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5084	NC_004113	CAGT	2	8	312856	312863	25 %	25 %	25 %	25 %	22297867
5085	NC_004113	AGA	2	6	312931	312936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297867
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5088	NC_004113	AAAAAG	2	12	313081	313092	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	22297867
5089	NC_004113	GCA	2	6	313103	313108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297867
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5091	NC_004113	AGC	2	6	313139	313144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297867
5092	NC_004113	ATC	2	6	313184	313189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297867
5093	NC_004113	TTGC	2	8	313388	313395	0 %	50 %	25 %	25 %	22297868
5094	NC_004113	GAA	2	6	313436	313441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297868
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5096	NC_004113	TGA	2	6	313473	313478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297868
5097	NC_004113	CCAA	2	8	313521	313528	50 %	0 %	0 %	50 %	22297868
5098	NC_004113	ATT	2	6	313535	313540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297868
5099	NC_004113	GGGT	2	8	313551	313558	0 %	25 %	75 %	0 %	22297868
5100	NC_004113	TGCC	2	8	313575	313582	0 %	25 %	25 %	50 %	22297868
5101	NC_004113	TGC	3	9	313633	313641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297868
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5104	NC_004113	ATT	2	6	313769	313774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297868
5105	NC_004113	GAGC	2	8	313862	313869	25 %	0 %	50 %	25 %	22297868
5106	NC_004113	AAC	2	6	313872	313877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297868
5107	NC_004113	TTA	2	6	313926	313931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297868
5108	NC_004113	GCA	2	6	313960	313965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297868
5109	NC_004113	TTAA	2	8	313967	313974	50 %	50 %	0 %	0 %	22297868
5110	NC_004113	ATT	2	6	314012	314017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297868
5111	NC_004113	ATT	2	6	314036	314041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297868
5112	NC_004113	GGC	2	6	314089	314094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297868
5113	NC_004113	GAA	2	6	314192	314197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297868
5114	NC_004113	TCC	2	6	314244	314249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297868
5115	NC_004113	CGG	2	6	314268	314273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297868
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5117	NC_004113	TGG	2	6	314368	314373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297868
5118	NC_004113	TGC	2	6	314443	314448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297868
5119	NC_004113	CT	3	6	314462	314467	0 %	50 %	0 %	50 %	22297868
5120	NC_004113	TGA	2	6	314665	314670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297868
5121	NC_004113	TGC	2	6	314703	314708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297868
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5123	NC_004113	GGTGAT	2	12	314824	314835	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	22297868
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5247	NC_004113	A	7	7	321935	321941	100 %	0 %	0 %	0 %	22297876
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5251	NC_004113	GCCG	2	8	322051	322058	0 %	0 %	50 %	50 %	22297876
5252	NC_004113	CCA	2	6	322062	322067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297876
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5489	NC_004113	CT	3	6	334526	334531	0 %	50 %	0 %	50 %	22297887
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5491	NC_004113	GAT	2	6	334707	334712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297888
5492	NC_004113	GCCACA	2	12	334771	334782	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	22297888
5493	NC_004113	TGG	2	6	334893	334898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297888
5494	NC_004113	CTG	2	6	334947	334952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297888
5495	NC_004113	GTT	2	6	334971	334976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297888
5496	NC_004113	GCT	2	6	335054	335059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297888
5497	NC_004113	A	6	6	335091	335096	100 %	0 %	0 %	0 %	22297888
5498	NC_004113	GCC	2	6	335224	335229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297888
5499	NC_004113	CTG	2	6	335274	335279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297888
5500	NC_004113	CTT	2	6	335353	335358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297888

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