MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermosynechococcus elongatus BP-1 chromosome

Total Repeats: 43327

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004113	G	8	8	275109	275116	0 %	0 %	100 %	0 %	22297834
4502	NC_004113	CAG	2	6	275154	275159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4503	NC_004113	CCCAC	2	10	275326	275335	20 %	0 %	0 %	80 %	22297834
4504	NC_004113	G	8	8	275370	275377	0 %	0 %	100 %	0 %	22297834
4505	NC_004113	CA	3	6	275396	275401	50 %	0 %	0 %	50 %	22297834
4506	NC_004113	GCT	2	6	275447	275452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4507	NC_004113	GAG	2	6	275491	275496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297834
4508	NC_004113	GTT	2	6	275531	275536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297834
4509	NC_004113	TTC	2	6	275553	275558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297834
4510	NC_004113	AAG	2	6	275573	275578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297834
4511	NC_004113	GCG	2	6	275587	275592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
4512	NC_004113	CTT	2	6	275612	275617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	22297834
4513	NC_004113	CGG	2	6	275721	275726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
4514	NC_004113	GGT	2	6	275763	275768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297834
4515	NC_004113	GCC	2	6	275790	275795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297834
4516	NC_004113	CAC	2	6	275843	275848	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297834
4517	NC_004113	GCTGC	2	10	275877	275886	0 %	20 %	40 %	40 %	22297834
4518	NC_004113	CCA	2	6	275901	275906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297834
4519	NC_004113	GTAG	2	8	275916	275923	25 %	25 %	50 %	0 %	22297834
4520	NC_004113	AACC	2	8	276007	276014	50 %	0 %	0 %	50 %	22297834
4521	NC_004113	GTG	2	6	276028	276033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297834
4522	NC_004113	CTG	2	6	276159	276164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4523	NC_004113	CTG	2	6	276171	276176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4524	NC_004113	ATGA	2	8	276210	276217	50 %	25 %	25 %	0 %	22297834
4525	NC_004113	CGG	2	6	276266	276271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
4526	NC_004113	CGG	2	6	276275	276280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297834
4527	NC_004113	AGCCA	2	10	276439	276448	40 %	0 %	20 %	40 %	22297834
4528	NC_004113	GATG	2	8	276473	276480	25 %	25 %	50 %	0 %	22297834
4529	NC_004113	CCT	2	6	276578	276583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297834
4530	NC_004113	AGC	2	6	276586	276591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4531	NC_004113	CAA	2	6	276653	276658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297834
4532	NC_004113	GCAG	2	8	276692	276699	25 %	0 %	50 %	25 %	22297834
4533	NC_004113	TGA	2	6	276734	276739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297834
4534	NC_004113	AAAT	2	8	276810	276817	75 %	25 %	0 %	0 %	22297834
4535	NC_004113	CAC	2	6	276868	276873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297834
4536	NC_004113	CGCTA	2	10	276900	276909	20 %	20 %	20 %	40 %	22297834
4537	NC_004113	GTC	2	6	277012	277017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297834
4538	NC_004113	GAGG	2	8	277029	277036	25 %	0 %	75 %	0 %	22297834
4539	NC_004113	GTGAG	2	10	277037	277046	20 %	20 %	60 %	0 %	22297834
4540	NC_004113	GAAT	2	8	277060	277067	50 %	25 %	25 %	0 %	22297834
4541	NC_004113	CGG	2	6	277274	277279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297835
4542	NC_004113	ACC	2	6	277313	277318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297835
4543	NC_004113	TGT	2	6	277387	277392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297835
4544	NC_004113	TTCC	2	8	277411	277418	0 %	50 %	0 %	50 %	22297835
4545	NC_004113	GCC	2	6	277454	277459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297835
4546	NC_004113	GCA	2	6	277489	277494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
4547	NC_004113	TC	3	6	277509	277514	0 %	50 %	0 %	50 %	22297835
4548	NC_004113	GCA	2	6	277576	277581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
4549	NC_004113	GCC	2	6	277654	277659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297835
4550	NC_004113	CCAAGG	2	12	277681	277692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
4551	NC_004113	TAA	2	6	277782	277787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	22297835
4552	NC_004113	GGGT	2	8	277815	277822	0 %	25 %	75 %	0 %	22297835
4553	NC_004113	CTG	2	6	277845	277850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297835
4554	NC_004113	CTC	2	6	277871	277876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297835
4555	NC_004113	GCA	2	6	277968	277973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297835
4556	NC_004113	CAC	2	6	278011	278016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297835
4557	NC_004113	CGAT	2	8	278136	278143	25 %	25 %	25 %	25 %	22297836
4558	NC_004113	ATC	2	6	278151	278156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297836
4559	NC_004113	CCG	2	6	278158	278163	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297836
4560	NC_004113	AAG	2	6	278319	278324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297836
4561	NC_004113	GCA	2	6	278336	278341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297836
4562	NC_004113	GCC	2	6	278367	278372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297836
4563	NC_004113	TGA	2	6	278454	278459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297836
4564	NC_004113	CAC	2	6	278678	278683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	22297836
4565	NC_004113	GCC	2	6	278736	278741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297836
4566	NC_004113	CCG	2	6	278833	278838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297836
4567	NC_004113	A	7	7	278878	278884	100 %	0 %	0 %	0 %	22297836
4568	NC_004113	GGC	2	6	278889	278894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297836
4569	NC_004113	CAT	2	6	278917	278922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297836
4570	NC_004113	GAA	2	6	279154	279159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297837
4571	NC_004113	GTG	2	6	279169	279174	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297837
4572	NC_004113	GCT	2	6	279238	279243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297837
4573	NC_004113	TGGC	2	8	279274	279281	0 %	25 %	50 %	25 %	22297837
4574	NC_004113	T	6	6	279290	279295	0 %	100 %	0 %	0 %	22297837
4575	NC_004113	GTGA	2	8	279331	279338	25 %	25 %	50 %	0 %	22297838
4576	NC_004113	A	8	8	279458	279465	100 %	0 %	0 %	0 %	22297838
4577	NC_004113	AGC	2	6	279482	279487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297838
4578	NC_004113	TCA	2	6	279548	279553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297838
4579	NC_004113	A	6	6	279559	279564	100 %	0 %	0 %	0 %	22297838
4580	NC_004113	TGA	3	9	279663	279671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297838
4581	NC_004113	AGC	2	6	279725	279730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297838
4582	NC_004113	CAAGAA	2	12	279814	279825	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	22297838
4583	NC_004113	GTG	2	6	279851	279856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297838
4584	NC_004113	GCA	2	6	279926	279931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297838
4585	NC_004113	GTC	2	6	280038	280043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297839
4586	NC_004113	TTA	2	6	280048	280053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297839
4587	NC_004113	C	6	6	280089	280094	0 %	0 %	0 %	100 %	22297839
4588	NC_004113	CAT	2	6	280127	280132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297839
4589	NC_004113	GC	3	6	280155	280160	0 %	0 %	50 %	50 %	22297839
4590	NC_004113	CCG	2	6	280162	280167	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297839
4591	NC_004113	TGG	2	6	280180	280185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297839
4592	NC_004113	CGC	2	6	280240	280245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297839
4593	NC_004113	GCT	2	6	280269	280274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297839
4594	NC_004113	A	6	6	280308	280313	100 %	0 %	0 %	0 %	22297839
4595	NC_004113	GCA	2	6	280318	280323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297839
4596	NC_004113	GAA	2	6	280355	280360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297839
4597	NC_004113	CGA	2	6	280553	280558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297840
4598	NC_004113	GGA	2	6	280582	280587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297840
4599	NC_004113	CGG	2	6	280656	280661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	22297840
4600	NC_004113	CAA	2	6	280703	280708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	22297840
4601	NC_004113	TAC	2	6	280714	280719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	22297840
4602	NC_004113	GTG	2	6	280773	280778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297840
4603	NC_004113	GCC	2	6	280799	280804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297840
4604	NC_004113	TGT	2	6	280813	280818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	22297840
4605	NC_004113	CCT	2	6	280870	280875	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	22297840
4606	NC_004113	ATG	2	6	280892	280897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297840
4607	NC_004113	GTG	2	6	281139	281144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297840
4608	NC_004113	GCC	2	6	281243	281248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297840
4609	NC_004113	AGG	2	6	281251	281256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297840
4610	NC_004113	ACGC	2	8	281435	281442	25 %	0 %	25 %	50 %	161485774
4611	NC_004113	CAAA	2	8	281446	281453	75 %	0 %	0 %	25 %	161485774
4612	NC_004113	A	6	6	281451	281456	100 %	0 %	0 %	0 %	161485774
4613	NC_004113	AAAG	2	8	281622	281629	75 %	0 %	25 %	0 %	161485774
4614	NC_004113	A	7	7	281742	281748	100 %	0 %	0 %	0 %	161485774
4615	NC_004113	AAC	2	6	281830	281835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161485774
4616	NC_004113	GATC	2	8	281957	281964	25 %	25 %	25 %	25 %	161485774
4617	NC_004113	CTG	2	6	282037	282042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297842
4618	NC_004113	TGG	2	6	282149	282154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297842
4619	NC_004113	GAT	2	6	282155	282160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	22297842
4620	NC_004113	TGC	2	6	282182	282187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297842
4621	NC_004113	GCT	2	6	282189	282194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	22297842
4622	NC_004113	AGA	2	6	282200	282205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297842
4623	NC_004113	GAA	2	6	282240	282245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297842
4624	NC_004113	AAG	2	6	282258	282263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297842
4625	NC_004113	GTG	2	6	282279	282284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297842
4626	NC_004113	GTG	2	6	282324	282329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	22297842
4627	NC_004113	AAG	2	6	282352	282357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297842
4628	NC_004113	AGA	2	6	282368	282373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	22297842
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4639	NC_004113	CCG	2	6	282924	282929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	22297843
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4996	NC_004113	ACG	2	6	306611	306616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	22297863
4997	NC_004113	GAG	2	6	306645	306650	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	22297863
4998	NC_004113	ACCA	2	8	306684	306691	50 %	0 %	0 %	50 %	22297863
4999	NC_004113	TTA	2	6	306702	306707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297863
5000	NC_004113	TAT	2	6	306713	306718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	22297863

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