MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 2220

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002967	GCTAT	2	10	4272	4281	20 %	40 %	20 %	20 %	42525522
2	NC_002967	AGAAA	2	10	5954	5963	80 %	0 %	20 %	0 %	42525524
3	NC_002967	GGTTC	2	10	6582	6591	0 %	40 %	40 %	20 %	42525525
4	NC_002967	ATTTC	2	10	6721	6730	20 %	60 %	0 %	20 %	42525525
5	NC_002967	TTATC	2	10	6919	6928	20 %	60 %	0 %	20 %	42525525
6	NC_002967	CTCAT	2	10	8736	8745	20 %	40 %	0 %	40 %	42525525
7	NC_002967	GCTTT	2	10	8948	8957	0 %	60 %	20 %	20 %	42525525
8	NC_002967	AACGG	2	10	9210	9219	40 %	0 %	40 %	20 %	42525525
9	NC_002967	AGATA	2	10	11339	11348	60 %	20 %	20 %	0 %	42525527
10	NC_002967	GATTT	2	10	11871	11880	20 %	60 %	20 %	0 %	42525527
11	NC_002967	GATAA	2	10	12138	12147	60 %	20 %	20 %	0 %	42525527
12	NC_002967	CAAAA	2	10	12978	12987	80 %	0 %	0 %	20 %	42525527
13	NC_002967	ACGGA	2	10	13099	13108	40 %	0 %	40 %	20 %	42525527
14	NC_002967	GCCGT	2	10	13183	13192	0 %	20 %	40 %	40 %	42525527
15	NC_002967	ACTGT	2	10	13447	13456	20 %	40 %	20 %	20 %	42525527
16	NC_002967	TCAAA	2	10	13990	13999	60 %	20 %	0 %	20 %	42525528
17	NC_002967	AAAAG	2	10	15265	15274	80 %	0 %	20 %	0 %	42525529
18	NC_002967	TCAAA	2	10	17481	17490	60 %	20 %	0 %	20 %	42525531
19	NC_002967	AACAT	2	10	22161	22170	60 %	20 %	0 %	20 %	42525536
20	NC_002967	ATTTT	2	10	22185	22194	20 %	80 %	0 %	0 %	42525536
21	NC_002967	CAAGG	2	10	25183	25192	40 %	0 %	40 %	20 %	42525538
22	NC_002967	AATTA	2	10	25252	25261	60 %	40 %	0 %	0 %	42525538
23	NC_002967	GCTTC	2	10	25383	25392	0 %	40 %	20 %	40 %	42525538
24	NC_002967	GTTTT	2	10	25641	25650	0 %	80 %	20 %	0 %	42525539
25	NC_002967	TCTTT	2	10	27628	27637	0 %	80 %	0 %	20 %	42525540
26	NC_002967	GTTTT	2	10	29089	29098	0 %	80 %	20 %	0 %	42525542
27	NC_002967	TAGGA	2	10	29685	29694	40 %	20 %	40 %	0 %	42525543
28	NC_002967	CGTTC	2	10	32427	32436	0 %	40 %	20 %	40 %	42525545
29	NC_002967	TTCAT	2	10	32784	32793	20 %	60 %	0 %	20 %	42525545
30	NC_002967	TAAAG	2	10	33527	33536	60 %	20 %	20 %	0 %	42525546
31	NC_002967	AAAGC	2	10	35922	35931	60 %	0 %	20 %	20 %	42525547
32	NC_002967	GTTTT	2	10	36203	36212	0 %	80 %	20 %	0 %	42525548
33	NC_002967	TTCAT	2	10	36461	36470	20 %	60 %	0 %	20 %	42525548
34	NC_002967	TTTTA	2	10	38459	38468	20 %	80 %	0 %	0 %	42525549
35	NC_002967	GGTTA	2	10	43264	43273	20 %	40 %	40 %	0 %	42525557
36	NC_002967	TCTTT	2	10	46510	46519	0 %	80 %	0 %	20 %	42525559
37	NC_002967	TTCTT	2	10	47091	47100	0 %	80 %	0 %	20 %	42525559
38	NC_002967	GCAGG	2	10	47203	47212	20 %	0 %	60 %	20 %	42525559
39	NC_002967	ATGAA	2	10	48829	48838	60 %	20 %	20 %	0 %	42525561
40	NC_002967	GCTCG	2	10	50223	50232	0 %	20 %	40 %	40 %	42525562
41	NC_002967	ATTTT	2	10	52612	52621	20 %	80 %	0 %	0 %	42525563
42	NC_002967	TTCTT	2	10	52993	53002	0 %	80 %	0 %	20 %	42525563
43	NC_002967	TCTTT	2	10	53790	53799	0 %	80 %	0 %	20 %	42525564
44	NC_002967	TTCCT	2	10	54112	54121	0 %	60 %	0 %	40 %	42525564
45	NC_002967	AAAAC	2	10	54720	54729	80 %	0 %	0 %	20 %	42525564
46	NC_002967	CAAGG	2	10	55114	55123	40 %	0 %	40 %	20 %	42525564
47	NC_002967	GCTCC	2	10	56498	56507	0 %	20 %	20 %	60 %	42525566
48	NC_002967	GGCTT	2	10	57099	57108	0 %	40 %	40 %	20 %	42525566
49	NC_002967	AGTTT	2	10	58383	58392	20 %	60 %	20 %	0 %	42525568
50	NC_002967	ATTGT	2	10	58953	58962	20 %	60 %	20 %	0 %	42525568
51	NC_002967	TTTAA	2	10	59367	59376	40 %	60 %	0 %	0 %	42525569
52	NC_002967	AAATC	2	10	59861	59870	60 %	20 %	0 %	20 %	42525569
53	NC_002967	CATTG	2	10	60754	60763	20 %	40 %	20 %	20 %	42525570
54	NC_002967	ATTTT	2	10	62000	62009	20 %	80 %	0 %	0 %	42525572
55	NC_002967	GCCTT	2	10	64636	64645	0 %	40 %	20 %	40 %	42525574
56	NC_002967	AAGAA	2	10	64865	64874	80 %	0 %	20 %	0 %	42525574
57	NC_002967	AGCAA	2	10	65989	65998	60 %	0 %	20 %	20 %	42525575
58	NC_002967	AGCTT	2	10	66123	66132	20 %	40 %	20 %	20 %	42525576
59	NC_002967	CGGCT	2	10	66254	66263	0 %	20 %	40 %	40 %	42525576
60	NC_002967	GGCCC	3	15	70058	70072	0 %	0 %	40 %	60 %	42525582
61	NC_002967	ATCTT	2	10	70491	70500	20 %	60 %	0 %	20 %	42525582
62	NC_002967	TCTCT	2	10	73319	73328	0 %	60 %	0 %	40 %	42525584
63	NC_002967	ATTTT	2	10	73363	73372	20 %	80 %	0 %	0 %	42525584
64	NC_002967	CTTCT	2	10	73900	73909	0 %	60 %	0 %	40 %	42525585
65	NC_002967	AAAGC	2	10	73967	73976	60 %	0 %	20 %	20 %	42525585
66	NC_002967	GTTGA	2	10	74426	74435	20 %	40 %	40 %	0 %	42525586
67	NC_002967	CAAAT	2	10	74835	74844	60 %	20 %	0 %	20 %	42525586
68	NC_002967	TATAA	2	10	75192	75201	60 %	40 %	0 %	0 %	42525586
69	NC_002967	AAGAA	2	10	78203	78212	80 %	0 %	20 %	0 %	42525589
70	NC_002967	TAAAA	2	10	78251	78260	80 %	20 %	0 %	0 %	42525589
71	NC_002967	GATTC	2	10	79795	79804	20 %	40 %	20 %	20 %	42525590
72	NC_002967	TCAAA	2	10	81220	81229	60 %	20 %	0 %	20 %	42525591
73	NC_002967	CTTAC	2	10	81379	81388	20 %	40 %	0 %	40 %	42525591
74	NC_002967	GATAA	2	10	83651	83660	60 %	20 %	20 %	0 %	42525592
75	NC_002967	ATAAA	2	10	84302	84311	80 %	20 %	0 %	0 %	42525593
76	NC_002967	TTAAG	2	10	85154	85163	40 %	40 %	20 %	0 %	42525593
77	NC_002967	TGCTT	2	10	86856	86865	0 %	60 %	20 %	20 %	42525595
78	NC_002967	CCATA	2	10	89872	89881	40 %	20 %	0 %	40 %	42525597
79	NC_002967	TAAAT	2	10	90270	90279	60 %	40 %	0 %	0 %	42525598
80	NC_002967	AAGAA	2	10	90569	90578	80 %	0 %	20 %	0 %	42525598
81	NC_002967	CTTTT	2	10	92892	92901	0 %	80 %	0 %	20 %	42525600
82	NC_002967	CTTTT	2	10	93327	93336	0 %	80 %	0 %	20 %	42525600
83	NC_002967	ATTTT	2	10	94426	94435	20 %	80 %	0 %	0 %	42525602
84	NC_002967	CTGTT	2	10	94854	94863	0 %	60 %	20 %	20 %	42525602
85	NC_002967	AATTT	2	10	95823	95832	40 %	60 %	0 %	0 %	42525603
86	NC_002967	AGAAA	2	10	96154	96163	80 %	0 %	20 %	0 %	42525603
87	NC_002967	AGCAT	2	10	99337	99346	40 %	20 %	20 %	20 %	42525604
88	NC_002967	CTTTG	2	10	99439	99448	0 %	60 %	20 %	20 %	42525604
89	NC_002967	TCTTT	2	10	101410	101419	0 %	80 %	0 %	20 %	42525605
90	NC_002967	TTCAT	2	10	103539	103548	20 %	60 %	0 %	20 %	42525605
91	NC_002967	AGACA	2	10	103786	103795	60 %	0 %	20 %	20 %	42525605
92	NC_002967	TCTTT	2	10	104847	104856	0 %	80 %	0 %	20 %	42525606
93	NC_002967	TTTTC	2	10	106844	106853	0 %	80 %	0 %	20 %	42525607
94	NC_002967	TCATT	2	10	110949	110958	20 %	60 %	0 %	20 %	42525611
95	NC_002967	ATCTT	2	10	111092	111101	20 %	60 %	0 %	20 %	42525611
96	NC_002967	GCCTT	2	10	111275	111284	0 %	40 %	20 %	40 %	42525611
97	NC_002967	ATCAG	2	10	113014	113023	40 %	20 %	20 %	20 %	42525615
98	NC_002967	AAGTG	2	10	114570	114579	40 %	20 %	40 %	0 %	42525616
99	NC_002967	GTTCC	2	10	115063	115072	0 %	40 %	20 %	40 %	42525617
100	NC_002967	AAAAC	2	10	115287	115296	80 %	0 %	0 %	20 %	42525617
101	NC_002967	AAGGA	2	10	115807	115816	60 %	0 %	40 %	0 %	42525618
102	NC_002967	AACAA	2	10	117167	117176	80 %	0 %	0 %	20 %	42525619
103	NC_002967	CTTTT	2	10	118780	118789	0 %	80 %	0 %	20 %	42525619
104	NC_002967	CATAA	2	10	119302	119311	60 %	20 %	0 %	20 %	42525620
105	NC_002967	CATTC	2	10	120000	120009	20 %	40 %	0 %	40 %	42525620
106	NC_002967	TTAAT	2	10	122625	122634	40 %	60 %	0 %	0 %	42525622
107	NC_002967	ACGGG	2	10	122767	122776	20 %	0 %	60 %	20 %	42525622
108	NC_002967	AAAGA	2	10	127403	127412	80 %	0 %	20 %	0 %	42525626
109	NC_002967	TATGA	2	10	129985	129994	40 %	40 %	20 %	0 %	42525628
110	NC_002967	GGTCA	2	10	131618	131627	20 %	20 %	40 %	20 %	42525629
111	NC_002967	ACGGT	2	10	132958	132967	20 %	20 %	40 %	20 %	42525632
112	NC_002967	GCCTT	2	10	135689	135698	0 %	40 %	20 %	40 %	42525635
113	NC_002967	ATTTT	2	10	135988	135997	20 %	80 %	0 %	0 %	42525636
114	NC_002967	CGGCT	2	10	136025	136034	0 %	20 %	40 %	40 %	42525636
115	NC_002967	TCTGA	2	10	136137	136146	20 %	40 %	20 %	20 %	42525636
116	NC_002967	GAAAA	2	10	139049	139058	80 %	0 %	20 %	0 %	42525640
117	NC_002967	TTCTT	2	10	139096	139105	0 %	80 %	0 %	20 %	42525640
118	NC_002967	CCCTT	2	10	141866	141875	0 %	40 %	0 %	60 %	42525642
119	NC_002967	CTTCT	2	10	143165	143174	0 %	60 %	0 %	40 %	42525644
120	NC_002967	TCCAT	2	10	144184	144193	20 %	40 %	0 %	40 %	42525645
121	NC_002967	TCAAT	2	10	147012	147021	40 %	40 %	0 %	20 %	42525647
122	NC_002967	ATAAA	2	10	147788	147797	80 %	20 %	0 %	0 %	42525647
123	NC_002967	TACTT	2	10	147805	147814	20 %	60 %	0 %	20 %	42525647
124	NC_002967	TTGTC	2	10	150305	150314	0 %	60 %	20 %	20 %	42525648
125	NC_002967	AGAAA	2	10	152035	152044	80 %	0 %	20 %	0 %	42525649
126	NC_002967	TTTTA	2	10	156204	156213	20 %	80 %	0 %	0 %	42525654
127	NC_002967	GCCTC	2	10	157797	157806	0 %	20 %	20 %	60 %	42525656
128	NC_002967	GAAGA	2	10	157903	157912	60 %	0 %	40 %	0 %	42525656
129	NC_002967	CGGAC	2	10	159197	159206	20 %	0 %	40 %	40 %	42525657
130	NC_002967	TTTTA	2	10	160209	160218	20 %	80 %	0 %	0 %	42525658
131	NC_002967	TTTTA	2	10	166215	166224	20 %	80 %	0 %	0 %	42525663
132	NC_002967	AACGG	2	10	166443	166452	40 %	0 %	40 %	20 %	42525663
133	NC_002967	CAGCA	2	10	167567	167576	40 %	0 %	20 %	40 %	42525665
134	NC_002967	GACAA	2	10	167667	167676	60 %	0 %	20 %	20 %	42525665
135	NC_002967	CTTTT	2	10	168524	168533	0 %	80 %	0 %	20 %	42525665
136	NC_002967	ATTAT	2	10	168714	168723	40 %	60 %	0 %	0 %	42525665
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138	NC_002967	ATATT	2	10	169928	169937	40 %	60 %	0 %	0 %	42525667
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