MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Treponema denticola ATCC 35405 chromosome

Total Repeats: 57768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002967	T	6	6	27259	27264	0 %	100 %	0 %	0 %	42525540
502	NC_002967	CTT	2	6	27284	27289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525540
503	NC_002967	T	6	6	27336	27341	0 %	100 %	0 %	0 %	42525540
504	NC_002967	TCTTTT	2	12	27473	27484	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	42525540
505	NC_002967	GA	4	8	27487	27494	50 %	0 %	50 %	0 %	42525540
506	NC_002967	A	6	6	27502	27507	100 %	0 %	0 %	0 %	42525540
507	NC_002967	T	8	8	27510	27517	0 %	100 %	0 %	0 %	42525540
508	NC_002967	CATA	2	8	27531	27538	50 %	25 %	0 %	25 %	42525540
509	NC_002967	AGC	2	6	27559	27564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525540
510	NC_002967	A	8	8	27598	27605	100 %	0 %	0 %	0 %	42525540
511	NC_002967	TCTTT	2	10	27628	27637	0 %	80 %	0 %	20 %	42525540
512	NC_002967	ATT	2	6	27701	27706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525540
513	NC_002967	ATT	2	6	27836	27841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525540
514	NC_002967	AAT	2	6	27874	27879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525540
515	NC_002967	TTG	2	6	27916	27921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525540
516	NC_002967	A	6	6	27946	27951	100 %	0 %	0 %	0 %	42525540
517	NC_002967	TGA	2	6	28032	28037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525541
518	NC_002967	TGC	2	6	28098	28103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525541
519	NC_002967	TGC	2	6	28116	28121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525541
520	NC_002967	CTT	2	6	28160	28165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525541
521	NC_002967	A	7	7	28202	28208	100 %	0 %	0 %	0 %	42525541
522	NC_002967	CTT	2	6	28240	28245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525541
523	NC_002967	A	6	6	28250	28255	100 %	0 %	0 %	0 %	42525541
524	NC_002967	GAT	2	6	28270	28275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525541
525	NC_002967	GAA	2	6	28276	28281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525541
526	NC_002967	AGA	2	6	28287	28292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525541
527	NC_002967	TGT	2	6	28395	28400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525541
528	NC_002967	CTT	2	6	28405	28410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525541
529	NC_002967	T	7	7	28477	28483	0 %	100 %	0 %	0 %	42525541
530	NC_002967	TAT	2	6	28486	28491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525541
531	NC_002967	GAA	2	6	28525	28530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525541
532	NC_002967	CTTG	2	8	28548	28555	0 %	50 %	25 %	25 %	42525541
533	NC_002967	T	7	7	28657	28663	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
534	NC_002967	TGC	2	6	28676	28681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525542
535	NC_002967	CAT	3	9	28745	28753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525542
536	NC_002967	T	7	7	28868	28874	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
537	NC_002967	GTT	2	6	28892	28897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525542
538	NC_002967	T	8	8	28903	28910	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
539	NC_002967	A	7	7	29068	29074	100 %	0 %	0 %	0 %	42525542
540	NC_002967	GTTTT	2	10	29089	29098	0 %	80 %	20 %	0 %	42525542
541	NC_002967	TTA	2	6	29155	29160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525542
542	NC_002967	AAAT	2	8	29169	29176	75 %	25 %	0 %	0 %	42525542
543	NC_002967	T	7	7	29184	29190	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
544	NC_002967	TG	3	6	29213	29218	0 %	50 %	50 %	0 %	42525542
545	NC_002967	A	6	6	29223	29228	100 %	0 %	0 %	0 %	42525542
546	NC_002967	T	6	6	29232	29237	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
547	NC_002967	AT	3	6	29238	29243	50 %	50 %	0 %	0 %	42525542
548	NC_002967	GCT	2	6	29298	29303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525542
549	NC_002967	A	9	9	29338	29346	100 %	0 %	0 %	0 %	42525542
550	NC_002967	A	6	6	29387	29392	100 %	0 %	0 %	0 %	42525542
551	NC_002967	T	6	6	29395	29400	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
552	NC_002967	T	7	7	29402	29408	0 %	100 %	0 %	0 %	42525542
553	NC_002967	GAA	2	6	29446	29451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525542
554	NC_002967	TAT	2	6	29452	29457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525542
555	NC_002967	GCA	2	6	29573	29578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	42525543
556	NC_002967	T	6	6	29677	29682	0 %	100 %	0 %	0 %	42525543
557	NC_002967	TAGGA	2	10	29685	29694	40 %	20 %	40 %	0 %	42525543
558	NC_002967	ATT	2	6	29699	29704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525543
559	NC_002967	T	6	6	29703	29708	0 %	100 %	0 %	0 %	42525543
560	NC_002967	ATT	2	6	29795	29800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525543
561	NC_002967	A	7	7	29833	29839	100 %	0 %	0 %	0 %	42525543
562	NC_002967	AAG	2	6	29857	29862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	42525543
563	NC_002967	TTC	2	6	29875	29880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525543
564	NC_002967	GCAC	2	8	29903	29910	25 %	0 %	25 %	50 %	42525543
565	NC_002967	CGGC	2	8	29924	29931	0 %	0 %	50 %	50 %	42525543
566	NC_002967	CCTT	2	8	29954	29961	0 %	50 %	0 %	50 %	42525543
567	NC_002967	CTTT	2	8	30074	30081	0 %	75 %	0 %	25 %	42525543
568	NC_002967	TCC	2	6	30092	30097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	42525543
569	NC_002967	CAT	3	9	30235	30243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525543
570	NC_002967	TGA	2	6	30343	30348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525543
571	NC_002967	TTC	2	6	30433	30438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525543
572	NC_002967	GGC	2	6	30550	30555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525543
573	NC_002967	TAT	2	6	30604	30609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525543
574	NC_002967	AGTTTA	2	12	30651	30662	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	42525543
575	NC_002967	ATA	2	6	30691	30696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525543
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577	NC_002967	CAA	2	6	30810	30815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	42525543
578	NC_002967	CTTC	2	8	30833	30840	0 %	50 %	0 %	50 %	42525543
579	NC_002967	T	8	8	30847	30854	0 %	100 %	0 %	0 %	42525543
580	NC_002967	AAATGG	2	12	30858	30869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	42525543
581	NC_002967	AAGT	2	8	30952	30959	50 %	25 %	25 %	0 %	42525543
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587	NC_002967	A	8	8	31136	31143	100 %	0 %	0 %	0 %	42525543
588	NC_002967	T	6	6	31154	31159	0 %	100 %	0 %	0 %	42525543
589	NC_002967	TTTA	2	8	31186	31193	25 %	75 %	0 %	0 %	42525544
590	NC_002967	CCAG	2	8	31196	31203	25 %	0 %	25 %	50 %	42525544
591	NC_002967	A	6	6	31234	31239	100 %	0 %	0 %	0 %	42525544
592	NC_002967	TGA	2	6	31254	31259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	42525544
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596	NC_002967	ATC	2	6	31365	31370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525544
597	NC_002967	TCT	2	6	31386	31391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525544
598	NC_002967	CTT	2	6	31438	31443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525544
599	NC_002967	CCG	2	6	31447	31452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	42525544
600	NC_002967	CTT	2	6	31566	31571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525544
601	NC_002967	TCT	2	6	31616	31621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525544
602	NC_002967	TTA	2	6	31622	31627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525544
603	NC_002967	T	6	6	31912	31917	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
604	NC_002967	GA	3	6	31976	31981	50 %	0 %	50 %	0 %	42525545
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606	NC_002967	CAT	2	6	32047	32052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525545
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610	NC_002967	TAT	2	6	32309	32314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	42525545
611	NC_002967	CGG	2	6	32360	32365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	42525545
612	NC_002967	GTT	2	6	32391	32396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525545
613	NC_002967	CGTTC	2	10	32427	32436	0 %	40 %	20 %	40 %	42525545
614	NC_002967	T	7	7	32470	32476	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
615	NC_002967	GCT	2	6	32480	32485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525545
616	NC_002967	TC	4	8	32514	32521	0 %	50 %	0 %	50 %	42525545
617	NC_002967	CAT	2	6	32570	32575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	42525545
618	NC_002967	T	6	6	32595	32600	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
619	NC_002967	CTT	2	6	32617	32622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	42525545
620	NC_002967	T	6	6	32691	32696	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
621	NC_002967	TGT	2	6	32714	32719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525545
622	NC_002967	TTCAT	2	10	32784	32793	20 %	60 %	0 %	20 %	42525545
623	NC_002967	T	8	8	32825	32832	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
624	NC_002967	TTCC	2	8	32875	32882	0 %	50 %	0 %	50 %	42525545
625	NC_002967	TGC	2	6	32907	32912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	42525545
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628	NC_002967	CTTT	2	8	33015	33022	0 %	75 %	0 %	25 %	42525545
629	NC_002967	AAT	2	6	33047	33052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	42525545
630	NC_002967	T	6	6	33085	33090	0 %	100 %	0 %	0 %	42525545
631	NC_002967	GTT	2	6	33108	33113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	42525546
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