MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002578	ATGCC	2	10	4134	4143	20 %	20 %	20 %	40 %	16081190
2	NC_002578	AGGGA	2	10	5528	5537	40 %	0 %	60 %	0 %	16081191
3	NC_002578	TGGGA	2	10	5746	5755	20 %	20 %	60 %	0 %	16081191
4	NC_002578	GCAAA	2	10	6860	6869	60 %	0 %	20 %	20 %	16082633
5	NC_002578	TTCCG	2	10	10962	10971	0 %	40 %	20 %	40 %	16081195
6	NC_002578	ACCTT	2	10	12619	12628	20 %	40 %	0 %	40 %	16081197
7	NC_002578	TATCA	2	10	14813	14822	40 %	40 %	0 %	20 %	16081199
8	NC_002578	CTGTT	2	10	17478	17487	0 %	60 %	20 %	20 %	16081202
9	NC_002578	CCTTC	2	10	17840	17849	0 %	40 %	0 %	60 %	16081203
10	NC_002578	CAGAT	2	10	17883	17892	40 %	20 %	20 %	20 %	16081203
11	NC_002578	CTGTC	2	10	24090	24099	0 %	40 %	20 %	40 %	16081207
12	NC_002578	TAGAT	2	10	26089	26098	40 %	40 %	20 %	0 %	16081209
13	NC_002578	GAGAA	2	10	28545	28554	60 %	0 %	40 %	0 %	16081212
14	NC_002578	TCTAT	2	10	28627	28636	20 %	60 %	0 %	20 %	16081213
15	NC_002578	CCAGG	2	10	31912	31921	20 %	0 %	40 %	40 %	16082473
16	NC_002578	TGTCC	2	10	33584	33593	0 %	40 %	20 %	40 %	16082473
17	NC_002578	CCGTG	2	10	33881	33890	0 %	20 %	40 %	40 %	16082473
18	NC_002578	TGCAA	2	10	33993	34002	40 %	20 %	20 %	20 %	16082473
19	NC_002578	TGATA	2	10	34257	34266	40 %	40 %	20 %	0 %	16082473
20	NC_002578	ATGAT	2	10	37361	37370	40 %	40 %	20 %	0 %	16081220
21	NC_002578	TCAAG	2	10	37748	37757	40 %	20 %	20 %	20 %	16081220
22	NC_002578	CGGTA	2	10	38103	38112	20 %	20 %	40 %	20 %	16081220
23	NC_002578	TCTTT	2	10	39854	39863	0 %	80 %	0 %	20 %	16081222
24	NC_002578	TATCT	2	10	40074	40083	20 %	60 %	0 %	20 %	16082635
25	NC_002578	CTTGA	2	10	41047	41056	20 %	40 %	20 %	20 %	16082474
26	NC_002578	CTCTG	2	10	41320	41329	0 %	40 %	20 %	40 %	16082474
27	NC_002578	ACAGA	2	10	43609	43618	60 %	0 %	20 %	20 %	16082475
28	NC_002578	CCATT	2	10	44743	44752	20 %	40 %	0 %	40 %	16082475
29	NC_002578	ATGGA	2	10	46254	46263	40 %	20 %	40 %	0 %	16081224
30	NC_002578	CAGAA	2	10	50654	50663	60 %	0 %	20 %	20 %	16081230
31	NC_002578	GTCCT	2	10	51721	51730	0 %	40 %	20 %	40 %	16082476
32	NC_002578	ATCCG	2	10	51830	51839	20 %	20 %	20 %	40 %	16081232
33	NC_002578	TCTCC	2	10	51958	51967	0 %	40 %	0 %	60 %	16081232
34	NC_002578	GCAGG	2	10	52638	52647	20 %	0 %	60 %	20 %	16082477
35	NC_002578	GAGAA	2	10	59577	59586	60 %	0 %	40 %	0 %	16081237
36	NC_002578	TCCTT	2	10	60099	60108	0 %	60 %	0 %	40 %	16081238
37	NC_002578	TCATT	2	10	60407	60416	20 %	60 %	0 %	20 %	16081238
38	NC_002578	ATGCC	2	10	60506	60515	20 %	20 %	20 %	40 %	16081238
39	NC_002578	TCTCT	2	10	60665	60674	0 %	60 %	0 %	40 %	16081238
40	NC_002578	ATGTC	2	10	65963	65972	20 %	40 %	20 %	20 %	16081240
41	NC_002578	TGGAG	2	10	66720	66729	20 %	20 %	60 %	0 %	16081241
42	NC_002578	AAGAT	2	10	73001	73010	60 %	20 %	20 %	0 %	16081247
43	NC_002578	GGCGT	2	10	79076	79085	0 %	20 %	60 %	20 %	16081252
44	NC_002578	GATCG	2	10	86673	86682	20 %	20 %	40 %	20 %	16082481
45	NC_002578	GGATC	2	10	87244	87253	20 %	20 %	40 %	20 %	16082481
46	NC_002578	AAGAG	2	10	88515	88524	60 %	0 %	40 %	0 %	16081261
47	NC_002578	GTCAT	2	10	91078	91087	20 %	40 %	20 %	20 %	16081266
48	NC_002578	TTTCC	2	10	93295	93304	0 %	60 %	0 %	40 %	16082482
49	NC_002578	GAAGA	2	10	94847	94856	60 %	0 %	40 %	0 %	16081267
50	NC_002578	GATCT	2	10	99389	99398	20 %	40 %	20 %	20 %	16082484
51	NC_002578	ACTAT	2	10	99911	99920	40 %	40 %	0 %	20 %	16081272
52	NC_002578	CAGAT	2	10	100612	100621	40 %	20 %	20 %	20 %	16081273
53	NC_002578	TGATC	2	10	100944	100953	20 %	40 %	20 %	20 %	16081273
54	NC_002578	GATAA	2	10	101913	101922	60 %	20 %	20 %	0 %	16081275
55	NC_002578	TACGG	2	10	103462	103471	20 %	20 %	40 %	20 %	16081277
56	NC_002578	CTGGG	2	10	105224	105233	0 %	20 %	60 %	20 %	161760540
57	NC_002578	AGCGA	2	10	107357	107366	40 %	0 %	40 %	20 %	16081279
58	NC_002578	TTCTT	2	10	108642	108651	0 %	80 %	0 %	20 %	16081280
59	NC_002578	ATACG	2	10	108861	108870	40 %	20 %	20 %	20 %	16081280
60	NC_002578	GCCAG	2	10	108962	108971	20 %	0 %	40 %	40 %	16081280
61	NC_002578	AGCAT	2	10	109374	109383	40 %	20 %	20 %	20 %	16081281
62	NC_002578	TGCCG	2	10	109958	109967	0 %	20 %	40 %	40 %	16081282
63	NC_002578	TATGG	2	10	119902	119911	20 %	40 %	40 %	0 %	16081289
64	NC_002578	CAACG	2	10	122923	122932	40 %	0 %	20 %	40 %	16081292
65	NC_002578	AACAC	2	10	123713	123722	60 %	0 %	0 %	40 %	16081292
66	NC_002578	TATCA	2	10	124290	124299	40 %	40 %	0 %	20 %	16081292
67	NC_002578	GCAAT	2	10	125818	125827	40 %	20 %	20 %	20 %	16081292
68	NC_002578	ACACA	2	10	125902	125911	60 %	0 %	0 %	40 %	16081292
69	NC_002578	TTCAA	2	10	128196	128205	40 %	40 %	0 %	20 %	16081293
70	NC_002578	CTTTT	2	10	129931	129940	0 %	80 %	0 %	20 %	16082488
71	NC_002578	GGAGA	2	10	130158	130167	40 %	0 %	60 %	0 %	16082488
72	NC_002578	TCCAT	2	10	132045	132054	20 %	40 %	0 %	40 %	16081297
73	NC_002578	TGAGG	2	10	135426	135435	20 %	20 %	60 %	0 %	16081300
74	NC_002578	GCAGC	2	10	139219	139228	20 %	0 %	40 %	40 %	16081304
75	NC_002578	TTCCT	2	10	139545	139554	0 %	60 %	0 %	40 %	16081304
76	NC_002578	TCCAT	2	10	142103	142112	20 %	40 %	0 %	40 %	16081306
77	NC_002578	CAGGA	2	10	142324	142333	40 %	0 %	40 %	20 %	16081306
78	NC_002578	GCCAA	2	10	143347	143356	40 %	0 %	20 %	40 %	16081306
79	NC_002578	TGTAT	2	10	143487	143496	20 %	60 %	20 %	0 %	16081307
80	NC_002578	TTCTT	2	10	148531	148540	0 %	80 %	0 %	20 %	16081310
81	NC_002578	GGAAC	2	10	149077	149086	40 %	0 %	40 %	20 %	16081310
82	NC_002578	TCTCC	2	10	151776	151785	0 %	40 %	0 %	60 %	16081312
83	NC_002578	CTTGG	2	10	152717	152726	0 %	40 %	40 %	20 %	16082489
84	NC_002578	GTACG	2	10	156623	156632	20 %	20 %	40 %	20 %	16081316
85	NC_002578	ATCTC	2	10	159041	159050	20 %	40 %	0 %	40 %	16081317
86	NC_002578	TGAGA	2	10	159784	159793	40 %	20 %	40 %	0 %	16081317
87	NC_002578	TCCTA	2	10	163418	163427	20 %	40 %	0 %	40 %	16081320
88	NC_002578	GATCT	2	10	164740	164749	20 %	40 %	20 %	20 %	16081321
89	NC_002578	GGTGC	2	10	166183	166192	0 %	20 %	60 %	20 %	16082491
90	NC_002578	TATGG	2	10	171293	171302	20 %	40 %	40 %	0 %	16081325
91	NC_002578	TATTC	2	10	171334	171343	20 %	60 %	0 %	20 %	16081325
92	NC_002578	AACAT	2	10	172236	172245	60 %	20 %	0 %	20 %	16081325
93	NC_002578	GCACT	2	10	174935	174944	20 %	20 %	20 %	40 %	16082492
94	NC_002578	TTATC	2	10	177182	177191	20 %	60 %	0 %	20 %	16081329
95	NC_002578	GTGCT	2	10	177337	177346	0 %	40 %	40 %	20 %	16081329
96	NC_002578	CAGAT	2	10	178143	178152	40 %	20 %	20 %	20 %	16081330
97	NC_002578	TACGG	2	10	185417	185426	20 %	20 %	40 %	20 %	16081336
98	NC_002578	TTCTT	2	10	185817	185826	0 %	80 %	0 %	20 %	16081337
99	NC_002578	CTGCT	2	10	187388	187397	0 %	40 %	20 %	40 %	16081338
100	NC_002578	GAGAC	2	10	194913	194922	40 %	0 %	40 %	20 %	16082496
101	NC_002578	TTTCT	2	10	196730	196739	0 %	80 %	0 %	20 %	16081347
102	NC_002578	ATCAG	2	10	197122	197131	40 %	20 %	20 %	20 %	16081347
103	NC_002578	ACTTT	2	10	198312	198321	20 %	60 %	0 %	20 %	16081348
104	NC_002578	CAGGG	2	10	202606	202615	20 %	0 %	60 %	20 %	16081352
105	NC_002578	CCTCT	2	10	208113	208122	0 %	40 %	0 %	60 %	16081356
106	NC_002578	TTATA	2	10	211661	211670	40 %	60 %	0 %	0 %	16081360
107	NC_002578	CCTAT	2	10	217619	217628	20 %	40 %	0 %	40 %	16081364
108	NC_002578	TCCAG	2	10	217736	217745	20 %	20 %	20 %	40 %	16081364
109	NC_002578	GAAAT	2	10	217796	217805	60 %	20 %	20 %	0 %	16081364
110	NC_002578	GTGAG	2	10	218369	218378	20 %	20 %	60 %	0 %	16081365
111	NC_002578	TTAGA	2	10	225384	225393	40 %	40 %	20 %	0 %	16081370
112	NC_002578	TACCG	2	10	226277	226286	20 %	20 %	20 %	40 %	16081371
113	NC_002578	GATCC	2	10	226403	226412	20 %	20 %	20 %	40 %	16081371
114	NC_002578	GGAAG	2	10	226698	226707	40 %	0 %	60 %	0 %	16081371
115	NC_002578	GGGCA	2	10	228440	228449	20 %	0 %	60 %	20 %	16081372
116	NC_002578	GATCT	2	10	231353	231362	20 %	40 %	20 %	20 %	16081374
117	NC_002578	ACAGA	2	10	231518	231527	60 %	0 %	20 %	20 %	16081375
118	NC_002578	TCCCT	2	10	234058	234067	0 %	40 %	0 %	60 %	16081377
119	NC_002578	ATCTC	2	10	242471	242480	20 %	40 %	0 %	40 %	16081382
120	NC_002578	TGCCG	2	10	243375	243384	0 %	20 %	40 %	40 %	16081383
121	NC_002578	GCATA	2	10	246864	246873	40 %	20 %	20 %	20 %	16082501
122	NC_002578	TGACG	2	10	249790	249799	20 %	20 %	40 %	20 %	16081387
123	NC_002578	ACCGC	2	10	251405	251414	20 %	0 %	20 %	60 %	16081388
124	NC_002578	AGATG	2	10	252410	252419	40 %	20 %	40 %	0 %	16081389
125	NC_002578	ACGGA	2	10	255143	255152	40 %	0 %	40 %	20 %	16081391
126	NC_002578	TGACC	2	10	258137	258146	20 %	20 %	20 %	40 %	16081394
127	NC_002578	GATAC	2	10	259242	259251	40 %	20 %	20 %	20 %	16081395
128	NC_002578	GGCTT	2	10	259664	259673	0 %	40 %	40 %	20 %	16081395
129	NC_002578	TACAG	2	10	262358	262367	40 %	20 %	20 %	20 %	16081398
130	NC_002578	ATCAG	2	10	264556	264565	40 %	20 %	20 %	20 %	16081400
131	NC_002578	CTGCC	2	10	265485	265494	0 %	20 %	20 %	60 %	16081401
132	NC_002578	TGGTA	2	10	271395	271404	20 %	40 %	40 %	0 %	16081403
133	NC_002578	TTGCT	2	10	272956	272965	0 %	60 %	20 %	20 %	16081405
134	NC_002578	GTTCC	2	10	275987	275996	0 %	40 %	20 %	40 %	16081408
135	NC_002578	GAAAG	2	10	277710	277719	60 %	0 %	40 %	0 %	16081411
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263	NC_002578	GTTAT	2	10	479880	479889	20 %	60 %	20 %	0 %	16081573
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267	NC_002578	TATCA	2	10	482902	482911	40 %	40 %	0 %	20 %	16081574
268	NC_002578	GTATA	2	10	483553	483562	40 %	40 %	20 %	0 %	16081575
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382	NC_002578	TTCAA	2	10	661667	661676	40 %	40 %	0 %	20 %	16082543
383	NC_002578	CCTTG	2	10	662964	662973	0 %	40 %	20 %	40 %	16081721
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391	NC_002578	CATTT	2	10	673402	673411	20 %	60 %	0 %	20 %	16081728
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393	NC_002578	GTTGA	2	10	677392	677401	20 %	40 %	40 %	0 %	16082545
394	NC_002578	GTATA	2	10	679580	679589	40 %	40 %	20 %	0 %	16081731
395	NC_002578	ATGAA	2	10	681730	681739	60 %	20 %	20 %	0 %	16081732
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