MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_002578	TTA	2	6	217221	217226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081364
3502	NC_002578	TCG	2	6	217280	217285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081364
3503	NC_002578	TAT	2	6	217318	217323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081364
3504	NC_002578	TAT	2	6	217369	217374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081364
3505	NC_002578	GAT	2	6	217380	217385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081364
3506	NC_002578	CCCT	2	8	217457	217464	0 %	25 %	0 %	75 %	16081364
3507	NC_002578	GAAA	2	8	217504	217511	75 %	0 %	25 %	0 %	16081364
3508	NC_002578	CTT	2	6	217525	217530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081364
3509	NC_002578	CCTAT	2	10	217619	217628	20 %	40 %	0 %	40 %	16081364
3510	NC_002578	ATT	2	6	217640	217645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081364
3511	NC_002578	TCCAG	2	10	217736	217745	20 %	20 %	20 %	40 %	16081364
3512	NC_002578	TC	3	6	217748	217753	0 %	50 %	0 %	50 %	16081364
3513	NC_002578	GAAAT	2	10	217796	217805	60 %	20 %	20 %	0 %	16081364
3514	NC_002578	GTA	2	6	217879	217884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081364
3515	NC_002578	TAT	2	6	218068	218073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081364
3516	NC_002578	TCGTCT	2	12	218177	218188	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081364
3517	NC_002578	CGAT	2	8	218201	218208	25 %	25 %	25 %	25 %	16081364
3518	NC_002578	CTT	2	6	218209	218214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081364
3519	NC_002578	GATG	2	8	218218	218225	25 %	25 %	50 %	0 %	16081364
3520	NC_002578	GATC	2	8	218299	218306	25 %	25 %	25 %	25 %	16081365
3521	NC_002578	CCT	2	6	218326	218331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081365
3522	NC_002578	CCT	2	6	218336	218341	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081365
3523	NC_002578	TA	3	6	218351	218356	50 %	50 %	0 %	0 %	16081365
3524	NC_002578	GTGAG	2	10	218369	218378	20 %	20 %	60 %	0 %	16081365
3525	NC_002578	TGTT	2	8	218389	218396	0 %	75 %	25 %	0 %	16081365
3526	NC_002578	TTA	2	6	218492	218497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081365
3527	NC_002578	CAT	2	6	218564	218569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081365
3528	NC_002578	TCC	2	6	218587	218592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081365
3529	NC_002578	TA	3	6	218659	218664	50 %	50 %	0 %	0 %	16081365
3530	NC_002578	CTT	2	6	218883	218888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081365
3531	NC_002578	TC	3	6	218919	218924	0 %	50 %	0 %	50 %	16081365
3532	NC_002578	ATC	2	6	218928	218933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081365
3533	NC_002578	TCA	2	6	218971	218976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081365
3534	NC_002578	TCG	2	6	219043	219048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081365
3535	NC_002578	TCAG	2	8	219064	219071	25 %	25 %	25 %	25 %	16081365
3536	NC_002578	CAA	2	6	219155	219160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081365
3537	NC_002578	CGA	2	6	219203	219208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081365
3538	NC_002578	CCG	2	6	219271	219276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081365
3539	NC_002578	TTC	2	6	219388	219393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081365
3540	NC_002578	GAA	2	6	219411	219416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081365
3541	NC_002578	TCC	2	6	219454	219459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081365
3542	NC_002578	ATC	2	6	219463	219468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081365
3543	NC_002578	CAA	2	6	219518	219523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081365
3544	NC_002578	TCCT	2	8	219607	219614	0 %	50 %	0 %	50 %	16081365
3545	NC_002578	GGA	2	6	219624	219629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081365
3546	NC_002578	GCC	2	6	219633	219638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081365
3547	NC_002578	GT	3	6	219703	219708	0 %	50 %	50 %	0 %	16081365
3548	NC_002578	CAC	2	6	219900	219905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081365
3549	NC_002578	GA	3	6	220198	220203	50 %	0 %	50 %	0 %	16081366
3550	NC_002578	TGA	2	6	220268	220273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081366
3551	NC_002578	ACT	2	6	220352	220357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081366
3552	NC_002578	GAT	2	6	220440	220445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081366
3553	NC_002578	AGA	2	6	220469	220474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081366
3554	NC_002578	AGG	2	6	220723	220728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081366
3555	NC_002578	GGA	2	6	220770	220775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081366
3556	NC_002578	ATA	2	6	220783	220788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081366
3557	NC_002578	CCA	2	6	220814	220819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081366
3558	NC_002578	TCAT	2	8	220909	220916	25 %	50 %	0 %	25 %	16081366
3559	NC_002578	CTT	2	6	220948	220953	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081366
3560	NC_002578	TGG	2	6	221100	221105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081366
3561	NC_002578	AGG	2	6	221161	221166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081366
3562	NC_002578	AGGC	2	8	221203	221210	25 %	0 %	50 %	25 %	16081366
3563	NC_002578	ACA	2	6	221243	221248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081366
3564	NC_002578	CA	3	6	221284	221289	50 %	0 %	0 %	50 %	16081367
3565	NC_002578	GAA	2	6	221495	221500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081367
3566	NC_002578	GAA	2	6	221510	221515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081367
3567	NC_002578	ATCTCG	2	12	221563	221574	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16081367
3568	NC_002578	CTG	2	6	221637	221642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081367
3569	NC_002578	CTG	2	6	221661	221666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081367
3570	NC_002578	ATA	2	6	221709	221714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081367
3571	NC_002578	TGT	2	6	221822	221827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081367
3572	NC_002578	GC	3	6	221856	221861	0 %	0 %	50 %	50 %	16081367
3573	NC_002578	ACT	2	6	221905	221910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081367
3574	NC_002578	ATA	2	6	221919	221924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081367
3575	NC_002578	TACGAT	2	12	221925	221936	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	16081367
3576	NC_002578	TCA	2	6	221962	221967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081367
3577	NC_002578	GAT	2	6	222019	222024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081367
3578	NC_002578	AG	3	6	222085	222090	50 %	0 %	50 %	0 %	16081368
3579	NC_002578	TGA	2	6	222123	222128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081368
3580	NC_002578	TGT	3	9	222171	222179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081368
3581	NC_002578	CAT	2	6	222363	222368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081368
3582	NC_002578	TGT	2	6	222456	222461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081368
3583	NC_002578	GAT	2	6	222466	222471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081368
3584	NC_002578	TCG	2	6	222476	222481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081368
3585	NC_002578	GAA	2	6	222513	222518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081368
3586	NC_002578	TCA	2	6	222554	222559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081368
3587	NC_002578	CAT	2	6	222678	222683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081368
3588	NC_002578	TCC	2	6	222847	222852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081368
3589	NC_002578	AAG	2	6	222856	222861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081368
3590	NC_002578	TGGC	2	8	222998	223005	0 %	25 %	50 %	25 %	16081368
3591	NC_002578	GGCA	2	8	223161	223168	25 %	0 %	50 %	25 %	16081368
3592	NC_002578	GAT	2	6	223191	223196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081368
3593	NC_002578	TGA	2	6	223341	223346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081368
3594	NC_002578	CCA	2	6	223403	223408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081368
3595	NC_002578	ATA	2	6	223546	223551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081369
3596	NC_002578	A	6	6	223551	223556	100 %	0 %	0 %	0 %	16081369
3597	NC_002578	TCC	2	6	223602	223607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081369
3598	NC_002578	GCA	2	6	223633	223638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081369
3599	NC_002578	GTC	2	6	223887	223892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081369
3600	NC_002578	CCAT	2	8	223903	223910	25 %	25 %	0 %	50 %	16081369
3601	NC_002578	TCC	2	6	223916	223921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081369
3602	NC_002578	TCC	2	6	223999	224004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081369
3603	NC_002578	GTTC	2	8	224018	224025	0 %	50 %	25 %	25 %	16081369
3604	NC_002578	CGG	2	6	224037	224042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081369
3605	NC_002578	G	6	6	224143	224148	0 %	0 %	100 %	0 %	16081369
3606	NC_002578	CGT	2	6	224160	224165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081369
3607	NC_002578	TGG	2	6	224204	224209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081369
3608	NC_002578	GTG	2	6	224251	224256	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081369
3609	NC_002578	TCCA	2	8	224304	224311	25 %	25 %	0 %	50 %	16081369
3610	NC_002578	TCA	2	6	224375	224380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081369
3611	NC_002578	GAG	2	6	224406	224411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081369
3612	NC_002578	CAT	2	6	224421	224426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081369
3613	NC_002578	CAT	2	6	224451	224456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081369
3614	NC_002578	AC	3	6	224507	224512	50 %	0 %	0 %	50 %	16081369
3615	NC_002578	TCC	2	6	224536	224541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081369
3616	NC_002578	GGA	2	6	224544	224549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081369
3617	NC_002578	TCA	2	6	224784	224789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081370
3618	NC_002578	GCA	2	6	224829	224834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081370
3619	NC_002578	GAA	2	6	224872	224877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081370
3620	NC_002578	AT	3	6	224886	224891	50 %	50 %	0 %	0 %	16081370
3621	NC_002578	ATC	2	6	224990	224995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081370
3622	NC_002578	CTG	2	6	225078	225083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081370
3623	NC_002578	TGC	2	6	225139	225144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081370
3624	NC_002578	GAA	2	6	225193	225198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081370
3625	NC_002578	ATT	2	6	225200	225205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081370
3626	NC_002578	CGA	2	6	225282	225287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081370
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3628	NC_002578	TC	3	6	225345	225350	0 %	50 %	0 %	50 %	16081370
3629	NC_002578	GAA	2	6	225352	225357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081370
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3632	NC_002578	TCA	2	6	225489	225494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081370
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3634	NC_002578	TA	3	6	225541	225546	50 %	50 %	0 %	0 %	16081370
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3640	NC_002578	TGA	2	6	226151	226156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081371
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3643	NC_002578	GAG	2	6	226297	226302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081371
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3645	NC_002578	GCA	2	6	226349	226354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081371
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3744	NC_002578	CT	3	6	232882	232887	0 %	50 %	0 %	50 %	16081376
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3746	NC_002578	TCA	2	6	232928	232933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081376
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3870	NC_002578	ATA	2	6	241339	241344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082641
3871	NC_002578	GTGG	2	8	241345	241352	0 %	25 %	75 %	0 %	16082641
3872	NC_002578	ATA	2	6	241459	241464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082641
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3875	NC_002578	TTC	2	6	241621	241626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081382
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3878	NC_002578	TAT	2	6	241735	241740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081382
3879	NC_002578	CGAT	2	8	241853	241860	25 %	25 %	25 %	25 %	16081382
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3881	NC_002578	GTCT	2	8	242074	242081	0 %	50 %	25 %	25 %	16081382
3882	NC_002578	GAT	2	6	242199	242204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081382
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3891	NC_002578	CTTC	2	8	242481	242488	0 %	50 %	0 %	50 %	16081382
3892	NC_002578	GGT	2	6	242495	242500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081382
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3896	NC_002578	TAT	2	6	242712	242717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081383
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3899	NC_002578	GAT	2	6	242913	242918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081383
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3993	NC_002578	CCTT	2	8	248659	248666	0 %	50 %	0 %	50 %	16081386
3994	NC_002578	ATT	2	6	248669	248674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081386
3995	NC_002578	ATA	2	6	248710	248715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081386
3996	NC_002578	TTC	2	6	248927	248932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081386
3997	NC_002578	TGC	2	6	248934	248939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
3998	NC_002578	CTG	2	6	248944	248949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081386
3999	NC_002578	TCA	2	6	248992	248997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081386
4000	NC_002578	TCA	2	6	249001	249006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081386

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