MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_002578	ATG	2	6	122058	122063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081291
2002	NC_002578	TGT	2	6	122087	122092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081291
2003	NC_002578	CGG	2	6	122171	122176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081291
2004	NC_002578	GAA	2	6	122238	122243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081291
2005	NC_002578	GCA	2	6	122244	122249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081291
2006	NC_002578	ATA	2	6	122316	122321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081291
2007	NC_002578	AC	3	6	122401	122406	50 %	0 %	0 %	50 %	16081291
2008	NC_002578	TAC	2	6	122421	122426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081291
2009	NC_002578	CTT	2	6	122507	122512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081291
2010	NC_002578	AGT	2	6	122687	122692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081292
2011	NC_002578	GAT	2	6	122698	122703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081292
2012	NC_002578	TC	4	8	122721	122728	0 %	50 %	0 %	50 %	16081292
2013	NC_002578	CAG	2	6	122760	122765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081292
2014	NC_002578	TAA	3	9	122890	122898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081292
2015	NC_002578	ATC	2	6	122902	122907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
2016	NC_002578	CAACG	2	10	122923	122932	40 %	0 %	20 %	40 %	16081292
2017	NC_002578	CAG	2	6	122962	122967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081292
2018	NC_002578	ACT	2	6	123078	123083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
2019	NC_002578	GCA	2	6	123089	123094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081292
2020	NC_002578	TGG	2	6	123100	123105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081292
2021	NC_002578	ATA	2	6	123108	123113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081292
2022	NC_002578	TCA	2	6	123141	123146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
2023	NC_002578	CT	3	6	123151	123156	0 %	50 %	0 %	50 %	16081292
2024	NC_002578	GTG	2	6	123302	123307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081292
2025	NC_002578	TGGG	2	8	123323	123330	0 %	25 %	75 %	0 %	16081292
2026	NC_002578	ATC	2	6	123345	123350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
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2030	NC_002578	ATA	2	6	123467	123472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081292
2031	NC_002578	ATC	2	6	123480	123485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
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2034	NC_002578	CA	3	6	123579	123584	50 %	0 %	0 %	50 %	16081292
2035	NC_002578	AAAT	2	8	123594	123601	75 %	25 %	0 %	0 %	16081292
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2039	NC_002578	AT	3	6	123828	123833	50 %	50 %	0 %	0 %	16081292
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2044	NC_002578	AT	3	6	124152	124157	50 %	50 %	0 %	0 %	16081292
2045	NC_002578	TTA	2	6	124189	124194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081292
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2049	NC_002578	GAT	2	6	124420	124425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081292
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2054	NC_002578	ATC	2	6	124605	124610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081292
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2056	NC_002578	AT	3	6	124729	124734	50 %	50 %	0 %	0 %	16081292
2057	NC_002578	GCT	2	6	124844	124849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081292
2058	NC_002578	AT	3	6	124863	124868	50 %	50 %	0 %	0 %	16081292
2059	NC_002578	GGCA	2	8	124911	124918	25 %	0 %	50 %	25 %	16081292
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2093	NC_002578	CGGA	2	8	126646	126653	25 %	0 %	50 %	25 %	16081292
2094	NC_002578	TTC	2	6	126706	126711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081292
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2103	NC_002578	ACA	2	6	127413	127418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081292
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2106	NC_002578	TTA	2	6	127600	127605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081292
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2110	NC_002578	TTC	2	6	127738	127743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081293
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2113	NC_002578	ATA	2	6	127799	127804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081293
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2118	NC_002578	CCT	2	6	128273	128278	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081293
2119	NC_002578	C	6	6	128316	128321	0 %	0 %	0 %	100 %	16081293
2120	NC_002578	TCT	2	6	128413	128418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081293
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2122	NC_002578	AT	3	6	128545	128550	50 %	50 %	0 %	0 %	16081293
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2124	NC_002578	A	6	6	128630	128635	100 %	0 %	0 %	0 %	16081293
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2248	NC_002578	CAA	2	6	135863	135868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081300
2249	NC_002578	CTA	2	6	135870	135875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
2250	NC_002578	GAC	2	6	135913	135918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081300
2251	NC_002578	CTT	2	6	135963	135968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081300
2252	NC_002578	GA	3	6	135987	135992	50 %	0 %	50 %	0 %	16081300
2253	NC_002578	CAT	2	6	136043	136048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081300
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2255	NC_002578	TA	4	8	136180	136187	50 %	50 %	0 %	0 %	16081300
2256	NC_002578	CCATAT	2	12	136339	136350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081301
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2261	NC_002578	ATA	2	6	136812	136817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081301
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2269	NC_002578	AGA	2	6	137084	137089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081301
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2273	NC_002578	GCG	2	6	137644	137649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081303
2274	NC_002578	ATG	2	6	137657	137662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081303
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2278	NC_002578	ATG	2	6	137756	137761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081303
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2282	NC_002578	GCT	2	6	137932	137937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081303
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2323	NC_002578	TGGT	2	8	140139	140146	0 %	50 %	50 %	0 %	16081304
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2334	NC_002578	AGCC	2	8	140529	140536	25 %	0 %	25 %	50 %	16081304
2335	NC_002578	ACC	2	6	140549	140554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081304
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2338	NC_002578	ATA	2	6	141068	141073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081305
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2340	NC_002578	ACA	2	6	141207	141212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081305
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2351	NC_002578	AT	3	6	141697	141702	50 %	50 %	0 %	0 %	16081305
2352	NC_002578	GGA	2	6	141763	141768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081305
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2354	NC_002578	GAA	2	6	141851	141856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081305
2355	NC_002578	GAA	2	6	142026	142031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081306
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2357	NC_002578	GGAT	2	8	142047	142054	25 %	25 %	50 %	0 %	16081306
2358	NC_002578	TCCAT	2	10	142103	142112	20 %	40 %	0 %	40 %	16081306
2359	NC_002578	AGC	2	6	142166	142171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081306
2360	NC_002578	CAGGA	2	10	142324	142333	40 %	0 %	40 %	20 %	16081306
2361	NC_002578	TGA	2	6	142381	142386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081306
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2369	NC_002578	ATT	2	6	142846	142851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081306
2370	NC_002578	TGG	2	6	142976	142981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081306
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2372	NC_002578	CTG	2	6	143076	143081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081306
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2374	NC_002578	TA	3	6	143328	143333	50 %	50 %	0 %	0 %	16081306
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2495	NC_002578	CTTGG	2	10	152717	152726	0 %	40 %	40 %	20 %	16082489
2496	NC_002578	TAC	2	6	152770	152775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082489
2497	NC_002578	AT	4	8	152841	152848	50 %	50 %	0 %	0 %	16082489
2498	NC_002578	TTA	2	6	152850	152855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082489
2499	NC_002578	A	7	7	152863	152869	100 %	0 %	0 %	0 %	16082489
2500	NC_002578	TGGT	2	8	152899	152906	0 %	50 %	50 %	0 %	16081313

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