MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002578	CCTG	2	8	91772	91779	0 %	25 %	25 %	50 %	16081266
1502	NC_002578	TAT	3	9	91788	91796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081266
1503	NC_002578	TTC	2	6	91908	91913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081266
1504	NC_002578	TTC	2	6	91931	91936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081266
1505	NC_002578	CTTG	2	8	91938	91945	0 %	50 %	25 %	25 %	16081266
1506	NC_002578	AT	3	6	92238	92243	50 %	50 %	0 %	0 %	16082482
1507	NC_002578	GGT	2	6	92252	92257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082482
1508	NC_002578	TGGT	2	8	92272	92279	0 %	50 %	50 %	0 %	16082482
1509	NC_002578	AGA	2	6	92338	92343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1510	NC_002578	GCA	2	6	92451	92456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082482
1511	NC_002578	AGA	2	6	92533	92538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1512	NC_002578	AGA	2	6	92542	92547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1513	NC_002578	AAG	2	6	92562	92567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1514	NC_002578	GAA	2	6	92631	92636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1515	NC_002578	CGATTC	2	12	92699	92710	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16082482
1516	NC_002578	GTA	2	6	92718	92723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082482
1517	NC_002578	ACG	2	6	92734	92739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082482
1518	NC_002578	AAG	2	6	92811	92816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1519	NC_002578	ACA	2	6	93082	93087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082482
1520	NC_002578	AGA	2	6	93113	93118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1521	NC_002578	GAG	2	6	93144	93149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082482
1522	NC_002578	GCA	2	6	93167	93172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082482
1523	NC_002578	AGG	2	6	93187	93192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082482
1524	NC_002578	CTG	2	6	93204	93209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082482
1525	NC_002578	GA	3	6	93283	93288	50 %	0 %	50 %	0 %	16082482
1526	NC_002578	TTTCC	2	10	93295	93304	0 %	60 %	0 %	40 %	16082482
1527	NC_002578	AT	3	6	93418	93423	50 %	50 %	0 %	0 %	16082482
1528	NC_002578	GAA	2	6	93449	93454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082482
1529	NC_002578	CAA	2	6	93540	93545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081267
1530	NC_002578	TAG	2	6	93627	93632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081267
1531	NC_002578	GCC	2	6	93634	93639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081267
1532	NC_002578	CCGA	2	8	93692	93699	25 %	0 %	25 %	50 %	16081267
1533	NC_002578	GAG	3	9	93785	93793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081267
1534	NC_002578	ACATCA	2	12	93794	93805	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16081267
1535	NC_002578	TAA	2	6	93810	93815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081267
1536	NC_002578	GCA	2	6	93867	93872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081267
1537	NC_002578	GCG	2	6	93983	93988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081267
1538	NC_002578	AAC	2	6	94001	94006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081267
1539	NC_002578	ATG	2	6	94044	94049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081267
1540	NC_002578	ATC	2	6	94052	94057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081267
1541	NC_002578	TGA	2	6	94093	94098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081267
1542	NC_002578	GAA	2	6	94129	94134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081267
1543	NC_002578	CAAG	2	8	94140	94147	50 %	0 %	25 %	25 %	16081267
1544	NC_002578	GCGA	2	8	94193	94200	25 %	0 %	50 %	25 %	16081267
1545	NC_002578	CGG	2	6	94237	94242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081267
1546	NC_002578	A	6	6	94380	94385	100 %	0 %	0 %	0 %	16081267
1547	NC_002578	CAGG	2	8	94398	94405	25 %	0 %	50 %	25 %	16081267
1548	NC_002578	ATGG	2	8	94622	94629	25 %	25 %	50 %	0 %	16081267
1549	NC_002578	ATC	2	6	94667	94672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081267
1550	NC_002578	AGA	2	6	94683	94688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081267
1551	NC_002578	AAG	2	6	94706	94711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081267
1552	NC_002578	AAC	2	6	94712	94717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081267
1553	NC_002578	GGT	2	6	94745	94750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081267
1554	NC_002578	GGC	2	6	94759	94764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081267
1555	NC_002578	GAAGA	2	10	94847	94856	60 %	0 %	40 %	0 %	16081267
1556	NC_002578	GCA	2	6	94872	94877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081267
1557	NC_002578	GGC	2	6	94879	94884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081267
1558	NC_002578	CTACAA	2	12	94924	94935	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	16081267
1559	NC_002578	GAC	2	6	94940	94945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081267
1560	NC_002578	A	6	6	95073	95078	100 %	0 %	0 %	0 %	16081268
1561	NC_002578	AGG	2	6	95145	95150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081268
1562	NC_002578	GCA	2	6	95239	95244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1563	NC_002578	ATTC	2	8	95250	95257	25 %	50 %	0 %	25 %	16081268
1564	NC_002578	AAGG	2	8	95329	95336	50 %	0 %	50 %	0 %	16081268
1565	NC_002578	CAG	2	6	95542	95547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1566	NC_002578	GGC	2	6	95570	95575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081268
1567	NC_002578	TCA	2	6	95582	95587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081268
1568	NC_002578	ATCG	2	8	95612	95619	25 %	25 %	25 %	25 %	16081268
1569	NC_002578	TTG	2	6	95646	95651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081268
1570	NC_002578	GGA	2	6	95677	95682	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081268
1571	NC_002578	TGA	2	6	95728	95733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081268
1572	NC_002578	AGC	2	6	95756	95761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1573	NC_002578	GAG	2	6	95762	95767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081268
1574	NC_002578	GATC	2	8	95888	95895	25 %	25 %	25 %	25 %	16081268
1575	NC_002578	TC	3	6	95945	95950	0 %	50 %	0 %	50 %	16081268
1576	NC_002578	CTG	3	9	96008	96016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1577	NC_002578	GAA	2	6	96046	96051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081268
1578	NC_002578	AATG	2	8	96094	96101	50 %	25 %	25 %	0 %	16081268
1579	NC_002578	CGT	2	6	96244	96249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1580	NC_002578	CGT	2	6	96301	96306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081268
1581	NC_002578	CTGA	2	8	96430	96437	25 %	25 %	25 %	25 %	16081269
1582	NC_002578	CTGT	2	8	96448	96455	0 %	50 %	25 %	25 %	16081269
1583	NC_002578	AAAC	2	8	96524	96531	75 %	0 %	0 %	25 %	16081269
1584	NC_002578	AAG	2	6	96532	96537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081269
1585	NC_002578	AAG	2	6	96544	96549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081269
1586	NC_002578	ATT	2	6	96634	96639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082483
1587	NC_002578	TAT	2	6	96669	96674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082483
1588	NC_002578	GGCT	2	8	96695	96702	0 %	25 %	50 %	25 %	16082483
1589	NC_002578	TTA	2	6	96709	96714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082483
1590	NC_002578	TC	3	6	96746	96751	0 %	50 %	0 %	50 %	16082483
1591	NC_002578	ATT	2	6	96763	96768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082483
1592	NC_002578	TC	3	6	96785	96790	0 %	50 %	0 %	50 %	16082483
1593	NC_002578	GTAT	2	8	96833	96840	25 %	50 %	25 %	0 %	16082483
1594	NC_002578	CTC	2	6	96850	96855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082483
1595	NC_002578	TAT	2	6	96867	96872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082483
1596	NC_002578	TCT	2	6	96908	96913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082483
1597	NC_002578	CATC	2	8	97088	97095	25 %	25 %	0 %	50 %	16082483
1598	NC_002578	TTC	2	6	97222	97227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081270
1599	NC_002578	CGG	2	6	97283	97288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081270
1600	NC_002578	CCG	2	6	97336	97341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081270
1601	NC_002578	TAA	2	6	97372	97377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081270
1602	NC_002578	TCT	2	6	97430	97435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081270
1603	NC_002578	TCCT	2	8	97447	97454	0 %	50 %	0 %	50 %	16081270
1604	NC_002578	TC	3	6	97536	97541	0 %	50 %	0 %	50 %	16081270
1605	NC_002578	CTG	2	6	97552	97557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081270
1606	NC_002578	TAT	2	6	97581	97586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081270
1607	NC_002578	TA	4	8	97714	97721	50 %	50 %	0 %	0 %	16081270
1608	NC_002578	GCG	2	6	97769	97774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081270
1609	NC_002578	CAA	2	6	97847	97852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081270
1610	NC_002578	CCG	2	6	97898	97903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081270
1611	NC_002578	TGA	2	6	97956	97961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081270
1612	NC_002578	T	7	7	97983	97989	0 %	100 %	0 %	0 %	16081270
1613	NC_002578	TTC	2	6	98118	98123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081270
1614	NC_002578	ATC	2	6	98137	98142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081270
1615	NC_002578	ATGA	2	8	98157	98164	50 %	25 %	25 %	0 %	16081271
1616	NC_002578	CT	3	6	98187	98192	0 %	50 %	0 %	50 %	16081271
1617	NC_002578	GCT	2	6	98231	98236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081271
1618	NC_002578	CTT	2	6	98261	98266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081271
1619	NC_002578	CCG	2	6	98274	98279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081271
1620	NC_002578	CAG	2	6	98414	98419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081271
1621	NC_002578	GTC	2	6	98441	98446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081271
1622	NC_002578	TA	3	6	98454	98459	50 %	50 %	0 %	0 %	16081271
1623	NC_002578	TA	4	8	98480	98487	50 %	50 %	0 %	0 %	16081271
1624	NC_002578	CCG	3	9	98739	98747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081271
1625	NC_002578	ATC	3	9	98868	98876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081271
1626	NC_002578	GTA	2	6	98905	98910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082484
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1628	NC_002578	CCCA	2	8	99101	99108	25 %	0 %	0 %	75 %	16082484
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1998	NC_002578	AC	3	6	121948	121953	50 %	0 %	0 %	50 %	16081291
1999	NC_002578	AAT	2	6	121997	122002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081291
2000	NC_002578	AAG	2	6	122040	122045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081291

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