MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_002578	GAA	2	6	1065465	1065470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082032
17002	NC_002578	A	6	6	1065543	1065548	100 %	0 %	0 %	0 %	16082032
17003	NC_002578	ACTT	2	8	1065591	1065598	25 %	50 %	0 %	25 %	16082032
17004	NC_002578	TCC	2	6	1065694	1065699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082032
17005	NC_002578	ATC	2	6	1065733	1065738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082032
17006	NC_002578	TGC	2	6	1065779	1065784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082032
17007	NC_002578	CGCTT	2	10	1065815	1065824	0 %	40 %	20 %	40 %	16082032
17008	NC_002578	GCG	2	6	1065835	1065840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082032
17009	NC_002578	GAA	2	6	1066018	1066023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082032
17010	NC_002578	GTT	2	6	1066095	1066100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082032
17011	NC_002578	GCT	2	6	1066104	1066109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082032
17012	NC_002578	CCT	2	6	1066236	1066241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082033
17013	NC_002578	GCC	2	6	1066346	1066351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082033
17014	NC_002578	AAC	2	6	1066414	1066419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082033
17015	NC_002578	TC	3	6	1066422	1066427	0 %	50 %	0 %	50 %	16082033
17016	NC_002578	GGC	2	6	1066489	1066494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082033
17017	NC_002578	T	6	6	1066515	1066520	0 %	100 %	0 %	0 %	16082033
17018	NC_002578	TCA	2	6	1066523	1066528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082033
17019	NC_002578	TCT	2	6	1066602	1066607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082033
17020	NC_002578	AG	3	6	1066621	1066626	50 %	0 %	50 %	0 %	16082033
17021	NC_002578	ACG	2	6	1066655	1066660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082033
17022	NC_002578	GAA	2	6	1066693	1066698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082033
17023	NC_002578	ATC	2	6	1066721	1066726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082033
17024	NC_002578	ACG	2	6	1066728	1066733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082033
17025	NC_002578	CTAT	2	8	1066805	1066812	25 %	50 %	0 %	25 %	16082033
17026	NC_002578	CTT	2	6	1066860	1066865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082033
17027	NC_002578	GC	4	8	1066873	1066880	0 %	0 %	50 %	50 %	16082033
17028	NC_002578	GGC	2	6	1066889	1066894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082033
17029	NC_002578	TCA	2	6	1066968	1066973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082033
17030	NC_002578	ATG	2	6	1066991	1066996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082578
17031	NC_002578	AAG	2	6	1067160	1067165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082578
17032	NC_002578	TAT	2	6	1067169	1067174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082578
17033	NC_002578	ATA	2	6	1067183	1067188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082578
17034	NC_002578	TCC	2	6	1067251	1067256	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082578
17035	NC_002578	AAAG	2	8	1067300	1067307	75 %	0 %	25 %	0 %	16082578
17036	NC_002578	TCT	2	6	1067405	1067410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082578
17037	NC_002578	CAG	2	6	1067433	1067438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082578
17038	NC_002578	A	7	7	1067508	1067514	100 %	0 %	0 %	0 %	16082578
17039	NC_002578	TCT	2	6	1067537	1067542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082578
17040	NC_002578	AG	3	6	1067544	1067549	50 %	0 %	50 %	0 %	16082578
17041	NC_002578	TAT	2	6	1067616	1067621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082578
17042	NC_002578	TTA	2	6	1067759	1067764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082578
17043	NC_002578	CAT	2	6	1067849	1067854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082034
17044	NC_002578	CCA	2	6	1067863	1067868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082034
17045	NC_002578	TG	3	6	1067978	1067983	0 %	50 %	50 %	0 %	16082034
17046	NC_002578	AGA	2	6	1068013	1068018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082034
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17048	NC_002578	CAT	2	6	1068182	1068187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082034
17049	NC_002578	GCCAT	2	10	1068242	1068251	20 %	20 %	20 %	40 %	16082034
17050	NC_002578	CT	3	6	1068292	1068297	0 %	50 %	0 %	50 %	16082034
17051	NC_002578	AT	3	6	1068303	1068308	50 %	50 %	0 %	0 %	16082034
17052	NC_002578	T	6	6	1068351	1068356	0 %	100 %	0 %	0 %	16082034
17053	NC_002578	TGA	2	6	1068556	1068561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082034
17054	NC_002578	TTTC	2	8	1068579	1068586	0 %	75 %	0 %	25 %	16082034
17055	NC_002578	CCG	2	6	1068687	1068692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082034
17056	NC_002578	ATCC	2	8	1068694	1068701	25 %	25 %	0 %	50 %	16082034
17057	NC_002578	T	6	6	1068723	1068728	0 %	100 %	0 %	0 %	16082034
17058	NC_002578	TCT	2	6	1068757	1068762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082034
17059	NC_002578	CT	3	6	1068787	1068792	0 %	50 %	0 %	50 %	16082034
17060	NC_002578	CCCT	2	8	1068837	1068844	0 %	25 %	0 %	75 %	16082034
17061	NC_002578	TCT	2	6	1069019	1069024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082035
17062	NC_002578	TGCA	2	8	1069030	1069037	25 %	25 %	25 %	25 %	16082035
17063	NC_002578	TC	3	6	1069095	1069100	0 %	50 %	0 %	50 %	16082035
17064	NC_002578	TCC	2	6	1069130	1069135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082035
17065	NC_002578	TTGT	2	8	1069256	1069263	0 %	75 %	25 %	0 %	16082035
17066	NC_002578	TCT	2	6	1069323	1069328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082035
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17068	NC_002578	CAA	2	6	1069448	1069453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082579
17069	NC_002578	CAT	2	6	1069463	1069468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082579
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17071	NC_002578	CTT	2	6	1069533	1069538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082579
17072	NC_002578	GTT	2	6	1069539	1069544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082579
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17074	NC_002578	ATG	2	6	1069663	1069668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082579
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17076	NC_002578	TCA	2	6	1069752	1069757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082579
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17078	NC_002578	TA	3	6	1070077	1070082	50 %	50 %	0 %	0 %	16082036
17079	NC_002578	CTG	2	6	1070102	1070107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082036
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17083	NC_002578	CCTC	2	8	1070274	1070281	0 %	25 %	0 %	75 %	16082036
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17087	NC_002578	AT	3	6	1070587	1070592	50 %	50 %	0 %	0 %	16082036
17088	NC_002578	C	6	6	1070729	1070734	0 %	0 %	0 %	100 %	16082036
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17101	NC_002578	GAC	2	6	1071562	1071567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082036
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17103	NC_002578	CAG	2	6	1071703	1071708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082036
17104	NC_002578	CTC	2	6	1071756	1071761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082036
17105	NC_002578	TA	3	6	1071803	1071808	50 %	50 %	0 %	0 %	16082036
17106	NC_002578	CCA	2	6	1071867	1071872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082036
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17112	NC_002578	CT	3	6	1072042	1072047	0 %	50 %	0 %	50 %	16082036
17113	NC_002578	TC	3	6	1072062	1072067	0 %	50 %	0 %	50 %	16082036
17114	NC_002578	TTC	2	6	1072084	1072089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082036
17115	NC_002578	TC	4	8	1072175	1072182	0 %	50 %	0 %	50 %	16082036
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17118	NC_002578	TAT	2	6	1072357	1072362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082036
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17477	NC_002578	CT	3	6	1094567	1094572	0 %	50 %	0 %	50 %	16082057
17478	NC_002578	TTA	2	6	1094573	1094578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082057
17479	NC_002578	TTC	2	6	1094629	1094634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082057
17480	NC_002578	GATG	2	8	1094667	1094674	25 %	25 %	50 %	0 %	16082057
17481	NC_002578	TCC	2	6	1094677	1094682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082057
17482	NC_002578	TCA	2	6	1094684	1094689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082057
17483	NC_002578	TCCA	2	8	1094859	1094866	25 %	25 %	0 %	50 %	16082057
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