MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002578	CAG	3	9	30076	30084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081215
502	NC_002578	TCA	2	6	30101	30106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081215
503	NC_002578	TGT	2	6	30111	30116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081215
504	NC_002578	TTG	2	6	30147	30152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081215
505	NC_002578	GC	3	6	30158	30163	0 %	0 %	50 %	50 %	16081215
506	NC_002578	CAT	2	6	30175	30180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081215
507	NC_002578	TATG	2	8	30377	30384	25 %	50 %	25 %	0 %	16081216
508	NC_002578	TAT	2	6	30443	30448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081216
509	NC_002578	CCT	2	6	30457	30462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081216
510	NC_002578	TTC	2	6	30495	30500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081216
511	NC_002578	A	6	6	30556	30561	100 %	0 %	0 %	0 %	16081216
512	NC_002578	ATC	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081216
513	NC_002578	TCC	2	6	30690	30695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081216
514	NC_002578	TCT	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081216
515	NC_002578	AG	3	6	31059	31064	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
516	NC_002578	GA	3	6	31149	31154	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
517	NC_002578	CAG	3	9	31205	31213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
518	NC_002578	GAG	2	6	31224	31229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
519	NC_002578	GCC	2	6	31257	31262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082473
520	NC_002578	TCG	2	6	31339	31344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082473
521	NC_002578	GA	3	6	31487	31492	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
522	NC_002578	GGA	2	6	31520	31525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
523	NC_002578	AG	3	6	31532	31537	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
524	NC_002578	AGG	3	9	31660	31668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
525	NC_002578	TGA	2	6	31796	31801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
526	NC_002578	GAA	2	6	31850	31855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
527	NC_002578	GCAG	2	8	31884	31891	25 %	0 %	50 %	25 %	16082473
528	NC_002578	CCAGG	2	10	31912	31921	20 %	0 %	40 %	40 %	16082473
529	NC_002578	GCC	2	6	31965	31970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082473
530	NC_002578	GGC	2	6	32054	32059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
531	NC_002578	CGAT	2	8	32080	32087	25 %	25 %	25 %	25 %	16082473
532	NC_002578	GAT	2	6	32160	32165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
533	NC_002578	GA	3	6	32188	32193	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
534	NC_002578	TGG	2	6	32262	32267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082473
535	NC_002578	TAC	2	6	32361	32366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
536	NC_002578	ATT	2	6	32368	32373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082473
537	NC_002578	AT	3	6	32383	32388	50 %	50 %	0 %	0 %	16082473
538	NC_002578	AGA	2	6	32505	32510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
539	NC_002578	TCA	3	9	32524	32532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
540	NC_002578	TAC	2	6	32538	32543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
541	NC_002578	CTT	2	6	32547	32552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
542	NC_002578	A	6	6	32598	32603	100 %	0 %	0 %	0 %	16082473
543	NC_002578	AAGG	2	8	32609	32616	50 %	0 %	50 %	0 %	16082473
544	NC_002578	ATA	2	6	32655	32660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
545	NC_002578	AGA	2	6	32778	32783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
546	NC_002578	CAT	2	6	32786	32791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
547	NC_002578	CAA	2	6	32798	32803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082473
548	NC_002578	TTC	2	6	32835	32840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
549	NC_002578	GCA	2	6	32929	32934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
550	NC_002578	AAG	2	6	33015	33020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
551	NC_002578	TGA	2	6	33167	33172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
552	NC_002578	GGC	2	6	33251	33256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
553	NC_002578	CGA	2	6	33287	33292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
554	NC_002578	TCT	2	6	33293	33298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
555	NC_002578	TAC	2	6	33306	33311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
556	NC_002578	ATA	2	6	33366	33371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
557	NC_002578	CGG	2	6	33392	33397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
558	NC_002578	ATA	2	6	33411	33416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082473
559	NC_002578	TTC	2	6	33453	33458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
560	NC_002578	AGG	2	6	33471	33476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
561	NC_002578	TGA	2	6	33488	33493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
562	NC_002578	GATG	2	8	33512	33519	25 %	25 %	50 %	0 %	16082473
563	NC_002578	G	6	6	33561	33566	0 %	0 %	100 %	0 %	16082473
564	NC_002578	TGTCC	2	10	33584	33593	0 %	40 %	20 %	40 %	16082473
565	NC_002578	GGC	2	6	33674	33679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082473
566	NC_002578	GAT	2	6	33716	33721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
567	NC_002578	AAG	2	6	33741	33746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
568	NC_002578	ATC	2	6	33764	33769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082473
569	NC_002578	AGC	2	6	33856	33861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082473
570	NC_002578	GAA	2	6	33872	33877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082473
571	NC_002578	CCGTG	2	10	33881	33890	0 %	20 %	40 %	40 %	16082473
572	NC_002578	TGA	2	6	33896	33901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082473
573	NC_002578	TGC	2	6	33905	33910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082473
574	NC_002578	TTC	2	6	33963	33968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082473
575	NC_002578	TGCAA	2	10	33993	34002	40 %	20 %	20 %	20 %	16082473
576	NC_002578	CAA	2	6	34048	34053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082473
577	NC_002578	GTG	2	6	34083	34088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082473
578	NC_002578	GAG	3	9	34200	34208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082473
579	NC_002578	TGATA	2	10	34257	34266	40 %	40 %	20 %	0 %	16082473
580	NC_002578	CAG	2	6	34289	34294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081217
581	NC_002578	TGAA	2	8	34325	34332	50 %	25 %	25 %	0 %	16081217
582	NC_002578	AAT	2	6	34362	34367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081217
583	NC_002578	TAT	2	6	34552	34557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081217
584	NC_002578	GTG	3	9	34558	34566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081217
585	NC_002578	CAT	2	6	34604	34609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081217
586	NC_002578	ATG	2	6	34648	34653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081217
587	NC_002578	AGA	2	6	34706	34711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081217
588	NC_002578	TTC	2	6	34738	34743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081217
589	NC_002578	ATG	2	6	34750	34755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081217
590	NC_002578	AGG	2	6	34799	34804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081217
591	NC_002578	AAG	2	6	34807	34812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081217
592	NC_002578	TCT	2	6	34830	34835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081217
593	NC_002578	GGA	2	6	34851	34856	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081217
594	NC_002578	TTG	2	6	34883	34888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081217
595	NC_002578	GAG	2	6	35029	35034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081217
596	NC_002578	GAT	2	6	35036	35041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081217
597	NC_002578	ATC	2	6	35200	35205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081218
598	NC_002578	CCT	2	6	35222	35227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081218
599	NC_002578	CTT	2	6	35276	35281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081218
600	NC_002578	TCA	2	6	35312	35317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081218
601	NC_002578	GTAGTT	2	12	35322	35333	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	16081218
602	NC_002578	CTT	2	6	35412	35417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081218
603	NC_002578	AGT	2	6	35462	35467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081218
604	NC_002578	TTC	2	6	35494	35499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081218
605	NC_002578	TGT	2	6	35516	35521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081218
606	NC_002578	AGT	2	6	35522	35527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081218
607	NC_002578	CTT	2	6	35661	35666	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081218
608	NC_002578	CCT	2	6	35681	35686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081218
609	NC_002578	CTT	2	6	35691	35696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081218
610	NC_002578	AAT	2	6	35702	35707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081218
611	NC_002578	ATC	2	6	35739	35744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081218
612	NC_002578	CTC	2	6	35772	35777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081218
613	NC_002578	TGC	2	6	35984	35989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081219
614	NC_002578	TAT	2	6	35994	35999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081219
615	NC_002578	ATT	2	6	36031	36036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081219
616	NC_002578	TTG	2	6	36058	36063	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081219
617	NC_002578	GGC	2	6	36365	36370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081219
618	NC_002578	GAT	2	6	36403	36408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081219
619	NC_002578	GAA	2	6	36417	36422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081219
620	NC_002578	TTC	2	6	36548	36553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081220
621	NC_002578	TGC	2	6	36597	36602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081220
622	NC_002578	CCT	2	6	36650	36655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081220
623	NC_002578	TCTT	2	8	36713	36720	0 %	75 %	0 %	25 %	16081220
624	NC_002578	ATT	2	6	36766	36771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081220
625	NC_002578	TAT	2	6	36867	36872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081220
626	NC_002578	ATC	2	6	36880	36885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081220
627	NC_002578	AGA	2	6	36914	36919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081220
628	NC_002578	GTG	2	6	36970	36975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081220
629	NC_002578	TCC	2	6	36997	37002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081220
630	NC_002578	CTTGCT	2	12	37242	37253	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	16081220
631	NC_002578	TCT	2	6	37256	37261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081220
632	NC_002578	GTC	2	6	37317	37322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081220
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634	NC_002578	GAT	2	6	37453	37458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081220
635	NC_002578	TCAAG	2	10	37748	37757	40 %	20 %	20 %	20 %	16081220
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638	NC_002578	TCT	2	6	37886	37891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081220
639	NC_002578	TTC	2	6	37987	37992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081220
640	NC_002578	CGGTA	2	10	38103	38112	20 %	20 %	40 %	20 %	16081220
641	NC_002578	CCT	2	6	38114	38119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081220
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644	NC_002578	CCTT	2	8	38348	38355	0 %	50 %	0 %	50 %	16081220
645	NC_002578	TAG	2	6	38413	38418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081220
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648	NC_002578	GGT	2	6	38701	38706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081220
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651	NC_002578	AAT	2	6	38901	38906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081221
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655	NC_002578	GGA	2	6	39132	39137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081221
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663	NC_002578	ATC	2	6	39630	39635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
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665	NC_002578	ATC	2	6	39658	39663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081222
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749	NC_002578	AAG	2	6	45540	45545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081223
750	NC_002578	TAC	2	6	45651	45656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081223
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754	NC_002578	AATG	2	8	46027	46034	50 %	25 %	25 %	0 %	16081224
755	NC_002578	AGGCAT	2	12	46074	46085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081224
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