MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_002578	TA	3	6	342304	342309	50 %	50 %	0 %	0 %	16081455
5502	NC_002578	ATT	2	6	342318	342323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081456
5503	NC_002578	CCTA	2	8	342376	342383	25 %	25 %	0 %	50 %	16081456
5504	NC_002578	TGC	2	6	342406	342411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081456
5505	NC_002578	AAC	2	6	342460	342465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081456
5506	NC_002578	CT	3	6	342555	342560	0 %	50 %	0 %	50 %	16081456
5507	NC_002578	GGA	2	6	342599	342604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081456
5508	NC_002578	TCCT	2	8	342627	342634	0 %	50 %	0 %	50 %	16081456
5509	NC_002578	GTG	2	6	342749	342754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081456
5510	NC_002578	GTT	2	6	342757	342762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081456
5511	NC_002578	ATT	2	6	343028	343033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081456
5512	NC_002578	TGC	2	6	343050	343055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081456
5513	NC_002578	GCTC	2	8	343094	343101	0 %	25 %	25 %	50 %	16081456
5514	NC_002578	ATCT	2	8	343114	343121	25 %	50 %	0 %	25 %	16081456
5515	NC_002578	TAT	3	9	343132	343140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081456
5516	NC_002578	T	6	6	343142	343147	0 %	100 %	0 %	0 %	16081456
5517	NC_002578	CGAT	2	8	343296	343303	25 %	25 %	25 %	25 %	16081456
5518	NC_002578	CT	3	6	343419	343424	0 %	50 %	0 %	50 %	16081456
5519	NC_002578	TCC	2	6	343430	343435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081456
5520	NC_002578	ATC	2	6	343550	343555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081456
5521	NC_002578	TCT	2	6	343558	343563	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082513
5522	NC_002578	AT	3	6	343612	343617	50 %	50 %	0 %	0 %	16082513
5523	NC_002578	CTT	2	6	343682	343687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082513
5524	NC_002578	CTT	2	6	343706	343711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082513
5525	NC_002578	GCC	2	6	343760	343765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082513
5526	NC_002578	CCA	2	6	343786	343791	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082513
5527	NC_002578	ATCT	2	8	343808	343815	25 %	50 %	0 %	25 %	16082513
5528	NC_002578	TTC	2	6	343828	343833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082513
5529	NC_002578	TC	3	6	343850	343855	0 %	50 %	0 %	50 %	16082513
5530	NC_002578	CTT	2	6	343868	343873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082513
5531	NC_002578	ATA	2	6	344113	344118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081457
5532	NC_002578	CAT	2	6	344200	344205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081457
5533	NC_002578	CCG	2	6	344330	344335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081457
5534	NC_002578	AGGC	2	8	344406	344413	25 %	0 %	50 %	25 %	16081457
5535	NC_002578	CGAT	2	8	344426	344433	25 %	25 %	25 %	25 %	16081457
5536	NC_002578	GGC	2	6	344455	344460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081457
5537	NC_002578	TGG	2	6	344577	344582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081457
5538	NC_002578	GGAT	2	8	344648	344655	25 %	25 %	50 %	0 %	16081457
5539	NC_002578	GCT	2	6	344680	344685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081457
5540	NC_002578	GGCCA	2	10	344704	344713	20 %	0 %	40 %	40 %	16081457
5541	NC_002578	TGG	2	6	344817	344822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081457
5542	NC_002578	GAG	2	6	344983	344988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081457
5543	NC_002578	CGG	2	6	344990	344995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081457
5544	NC_002578	AGG	2	6	345092	345097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081457
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5547	NC_002578	AGT	2	6	345246	345251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081457
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5549	NC_002578	CAT	2	6	345360	345365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081457
5550	NC_002578	TCA	2	6	345443	345448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081457
5551	NC_002578	AT	3	6	345500	345505	50 %	50 %	0 %	0 %	16081457
5552	NC_002578	AAG	2	6	345630	345635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081457
5553	NC_002578	GTAT	2	8	345645	345652	25 %	50 %	25 %	0 %	16081457
5554	NC_002578	GAG	2	6	345683	345688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081458
5555	NC_002578	GCC	2	6	345701	345706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081458
5556	NC_002578	GAG	2	6	345746	345751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081458
5557	NC_002578	GAT	2	6	345758	345763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081458
5558	NC_002578	CAA	2	6	345793	345798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081458
5559	NC_002578	TTG	2	6	345810	345815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081458
5560	NC_002578	GAT	2	6	345833	345838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081458
5561	NC_002578	ATC	2	6	345895	345900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081458
5562	NC_002578	GAC	2	6	345935	345940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081458
5563	NC_002578	TGA	2	6	345943	345948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081458
5564	NC_002578	GATCG	2	10	346092	346101	20 %	20 %	40 %	20 %	16081458
5565	NC_002578	AGCAT	2	10	346151	346160	40 %	20 %	20 %	20 %	16081458
5566	NC_002578	AT	3	6	346177	346182	50 %	50 %	0 %	0 %	16081458
5567	NC_002578	ATA	2	6	346207	346212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081458
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5569	NC_002578	TGG	2	6	346491	346496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081459
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5571	NC_002578	GA	3	6	346580	346585	50 %	0 %	50 %	0 %	16081459
5572	NC_002578	ACGTT	2	10	346600	346609	20 %	40 %	20 %	20 %	16081459
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5577	NC_002578	AAGG	2	8	346735	346742	50 %	0 %	50 %	0 %	16081459
5578	NC_002578	GAT	2	6	347042	347047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081459
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5580	NC_002578	CGG	2	6	347059	347064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081459
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5582	NC_002578	TGC	2	6	347334	347339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081459
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5588	NC_002578	ATG	2	6	347669	347674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081459
5589	NC_002578	AT	3	6	347693	347698	50 %	50 %	0 %	0 %	16081460
5590	NC_002578	GATC	2	8	347739	347746	25 %	25 %	25 %	25 %	16081460
5591	NC_002578	CGAT	2	8	347761	347768	25 %	25 %	25 %	25 %	16081460
5592	NC_002578	AT	3	6	347773	347778	50 %	50 %	0 %	0 %	16081460
5593	NC_002578	AC	3	6	347830	347835	50 %	0 %	0 %	50 %	16081460
5594	NC_002578	TGA	2	6	347967	347972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081460
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5597	NC_002578	GTA	2	6	348075	348080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081461
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5599	NC_002578	CCG	2	6	348165	348170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081461
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5602	NC_002578	GA	3	6	348449	348454	50 %	0 %	50 %	0 %	16081461
5603	NC_002578	GGTC	2	8	348620	348627	0 %	25 %	50 %	25 %	16081461
5604	NC_002578	CAA	2	6	348640	348645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081461
5605	NC_002578	GAT	2	6	348714	348719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081461
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5607	NC_002578	AGGT	2	8	348754	348761	25 %	25 %	50 %	0 %	16081461
5608	NC_002578	ATC	2	6	348865	348870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081462
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5612	NC_002578	ATA	2	6	349052	349057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081462
5613	NC_002578	AAGGA	2	10	349145	349154	60 %	0 %	40 %	0 %	16081462
5614	NC_002578	GCCAG	2	10	349286	349295	20 %	0 %	40 %	40 %	16081462
5615	NC_002578	GAA	3	9	349345	349353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081462
5616	NC_002578	AAAG	2	8	349405	349412	75 %	0 %	25 %	0 %	16081462
5617	NC_002578	TCG	2	6	349437	349442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081462
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5619	NC_002578	TGC	2	6	349485	349490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081462
5620	NC_002578	GCA	2	6	349639	349644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081462
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5622	NC_002578	TA	3	6	349724	349729	50 %	50 %	0 %	0 %	16081462
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5995	NC_002578	T	6	6	372271	372276	0 %	100 %	0 %	0 %	16082516
5996	NC_002578	GAT	2	6	372422	372427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081479
5997	NC_002578	TGC	2	6	372553	372558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081479
5998	NC_002578	ATC	2	6	372650	372655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081479
5999	NC_002578	CAA	2	6	372691	372696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081479
6000	NC_002578	AAT	2	6	372733	372738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081479

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