MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_002578	AGG	2	6	310945	310950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081429
5002	NC_002578	CAGCAT	2	12	310951	310962	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16081429
5003	NC_002578	TAA	2	6	310984	310989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081429
5004	NC_002578	ATA	2	6	311026	311031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081429
5005	NC_002578	GAA	2	6	311033	311038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081429
5006	NC_002578	ATGG	2	8	311061	311068	25 %	25 %	50 %	0 %	16081429
5007	NC_002578	AAC	2	6	311097	311102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081429
5008	NC_002578	TCT	2	6	311143	311148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081429
5009	NC_002578	TTC	2	6	311172	311177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081429
5010	NC_002578	AGC	2	6	311178	311183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081429
5011	NC_002578	AC	3	6	311278	311283	50 %	0 %	0 %	50 %	16081429
5012	NC_002578	CGG	2	6	311285	311290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081429
5013	NC_002578	CA	3	6	311393	311398	50 %	0 %	0 %	50 %	16081429
5014	NC_002578	GCT	2	6	311430	311435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081429
5015	NC_002578	TA	3	6	311439	311444	50 %	50 %	0 %	0 %	16081429
5016	NC_002578	TCG	2	6	311491	311496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081429
5017	NC_002578	CTG	2	6	311578	311583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081429
5018	NC_002578	GAT	2	6	311628	311633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081429
5019	NC_002578	AGG	2	6	311689	311694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081429
5020	NC_002578	TATC	2	8	311777	311784	25 %	50 %	0 %	25 %	16081430
5021	NC_002578	CT	3	6	311932	311937	0 %	50 %	0 %	50 %	16081430
5022	NC_002578	CATC	2	8	312089	312096	25 %	25 %	0 %	50 %	16081430
5023	NC_002578	CGCCA	2	10	312125	312134	20 %	0 %	20 %	60 %	16081430
5024	NC_002578	CTT	2	6	312149	312154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5025	NC_002578	TTC	2	6	312157	312162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5026	NC_002578	AAC	2	6	312192	312197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081430
5027	NC_002578	TCT	2	6	312212	312217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5028	NC_002578	T	6	6	312300	312305	0 %	100 %	0 %	0 %	16081430
5029	NC_002578	TCT	2	6	312485	312490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5030	NC_002578	TCG	2	6	312715	312720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081430
5031	NC_002578	GAT	2	6	312736	312741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081430
5032	NC_002578	TCA	2	6	312875	312880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081430
5033	NC_002578	ATC	2	6	312882	312887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081430
5034	NC_002578	ATCC	2	8	312943	312950	25 %	25 %	0 %	50 %	16081430
5035	NC_002578	TTC	2	6	312976	312981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5036	NC_002578	GTATA	2	10	313042	313051	40 %	40 %	20 %	0 %	16081430
5037	NC_002578	CTT	2	6	313170	313175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081430
5038	NC_002578	GT	3	6	313205	313210	0 %	50 %	50 %	0 %	16081430
5039	NC_002578	TAT	2	6	313263	313268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081430
5040	NC_002578	GAA	2	6	313511	313516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081431
5041	NC_002578	ATGG	2	8	313527	313534	25 %	25 %	50 %	0 %	16081431
5042	NC_002578	CTTC	2	8	313535	313542	0 %	50 %	0 %	50 %	16081431
5043	NC_002578	CGG	2	6	313640	313645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081431
5044	NC_002578	AAT	2	6	313649	313654	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081431
5045	NC_002578	AGC	2	6	313779	313784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081431
5046	NC_002578	TGC	2	6	313823	313828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081431
5047	NC_002578	ATT	2	6	314196	314201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081432
5048	NC_002578	TCT	2	6	314253	314258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081432
5049	NC_002578	GCCATG	2	12	314271	314282	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16081432
5050	NC_002578	CTG	2	6	314355	314360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081432
5051	NC_002578	CCTTG	2	10	314378	314387	0 %	40 %	20 %	40 %	16081432
5052	NC_002578	ATCT	2	8	314447	314454	25 %	50 %	0 %	25 %	16081432
5053	NC_002578	CACT	2	8	314464	314471	25 %	25 %	0 %	50 %	16081432
5054	NC_002578	TCA	2	6	314475	314480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081432
5055	NC_002578	TGC	2	6	314582	314587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081432
5056	NC_002578	TTC	2	6	314604	314609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081432
5057	NC_002578	GGA	2	6	314654	314659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081432
5058	NC_002578	GA	3	6	314676	314681	50 %	0 %	50 %	0 %	16081432
5059	NC_002578	GCAT	2	8	314718	314725	25 %	25 %	25 %	25 %	16081432
5060	NC_002578	ATG	2	6	314766	314771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081432
5061	NC_002578	CCGTT	2	10	314779	314788	0 %	40 %	20 %	40 %	16081432
5062	NC_002578	GCC	2	6	314819	314824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081432
5063	NC_002578	CTT	2	6	314912	314917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081432
5064	NC_002578	TCC	2	6	314997	315002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081432
5065	NC_002578	CTG	2	6	315049	315054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081432
5066	NC_002578	CAT	2	6	315200	315205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082509
5067	NC_002578	CACC	2	8	315213	315220	25 %	0 %	0 %	75 %	16082509
5068	NC_002578	CGC	2	6	315439	315444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082509
5069	NC_002578	CAG	2	6	315454	315459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082509
5070	NC_002578	CTGG	2	8	315513	315520	0 %	25 %	50 %	25 %	16082509
5071	NC_002578	GAA	2	6	315622	315627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082509
5072	NC_002578	CCTG	2	8	315649	315656	0 %	25 %	25 %	50 %	16082509
5073	NC_002578	CAG	2	6	315675	315680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082509
5074	NC_002578	TCT	2	6	315810	315815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082509
5075	NC_002578	GAA	2	6	315844	315849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082509
5076	NC_002578	CTG	2	6	315918	315923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082509
5077	NC_002578	CAC	2	6	315951	315956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082509
5078	NC_002578	A	6	6	315996	316001	100 %	0 %	0 %	0 %	16082509
5079	NC_002578	CTT	3	9	316015	316023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082509
5080	NC_002578	A	7	7	316063	316069	100 %	0 %	0 %	0 %	16082509
5081	NC_002578	CAA	2	6	316125	316130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082509
5082	NC_002578	ATC	2	6	316172	316177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082509
5083	NC_002578	CTC	2	6	316258	316263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082509
5084	NC_002578	CTT	2	6	316267	316272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082509
5085	NC_002578	TCA	2	6	316292	316297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082509
5086	NC_002578	CCT	2	6	316347	316352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081433
5087	NC_002578	CA	3	6	316355	316360	50 %	0 %	0 %	50 %	16081433
5088	NC_002578	CTT	3	9	316382	316390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081433
5089	NC_002578	TCAT	2	8	316392	316399	25 %	50 %	0 %	25 %	16081433
5090	NC_002578	TCC	2	6	316488	316493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081433
5091	NC_002578	CATC	2	8	316573	316580	25 %	25 %	0 %	50 %	16081433
5092	NC_002578	TTC	2	6	316599	316604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081433
5093	NC_002578	ATT	2	6	316629	316634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081433
5094	NC_002578	CTT	2	6	316703	316708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081433
5095	NC_002578	CAT	2	6	316777	316782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081433
5096	NC_002578	CTT	2	6	316802	316807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081433
5097	NC_002578	TTC	2	6	316827	316832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081433
5098	NC_002578	TC	3	6	316897	316902	0 %	50 %	0 %	50 %	16081433
5099	NC_002578	AAGC	2	8	316933	316940	50 %	0 %	25 %	25 %	16081433
5100	NC_002578	CCG	2	6	317008	317013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081433
5101	NC_002578	AG	3	6	317202	317207	50 %	0 %	50 %	0 %	16081433
5102	NC_002578	CCA	2	6	317280	317285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081433
5103	NC_002578	CAT	2	6	317329	317334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081433
5104	NC_002578	ACG	2	6	317370	317375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081433
5105	NC_002578	CATC	2	8	317398	317405	25 %	25 %	0 %	50 %	16081433
5106	NC_002578	CT	3	6	317427	317432	0 %	50 %	0 %	50 %	16081433
5107	NC_002578	GAA	2	6	317846	317851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081434
5108	NC_002578	TTG	2	6	317898	317903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081434
5109	NC_002578	GCAG	2	8	317945	317952	25 %	0 %	50 %	25 %	16081434
5110	NC_002578	TAA	2	6	317961	317966	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081434
5111	NC_002578	TAA	2	6	318012	318017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081434
5112	NC_002578	ATA	2	6	318018	318023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081434
5113	NC_002578	GGAA	2	8	318032	318039	50 %	0 %	50 %	0 %	16081434
5114	NC_002578	CTG	2	6	318176	318181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081434
5115	NC_002578	ATA	2	6	318197	318202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081434
5116	NC_002578	CAGG	2	8	318213	318220	25 %	0 %	50 %	25 %	16081434
5117	NC_002578	GAT	2	6	318317	318322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081434
5118	NC_002578	ATG	2	6	318332	318337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081434
5119	NC_002578	CTG	2	6	318341	318346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081434
5120	NC_002578	AG	3	6	318347	318352	50 %	0 %	50 %	0 %	16081434
5121	NC_002578	GGA	2	6	318388	318393	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081434
5122	NC_002578	ACT	2	6	318480	318485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081434
5123	NC_002578	TGC	2	6	318519	318524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081434
5124	NC_002578	AGA	2	6	318552	318557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081434
5125	NC_002578	CAT	2	6	318559	318564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081434
5126	NC_002578	GAGCCA	2	12	318652	318663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081434
5127	NC_002578	GGA	2	6	318859	318864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081434
5128	NC_002578	AG	3	6	318870	318875	50 %	0 %	50 %	0 %	16081434
5129	NC_002578	ATT	2	6	319084	319089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081435
5130	NC_002578	TTC	2	6	319120	319125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081435
5131	NC_002578	GAAA	2	8	319157	319164	75 %	0 %	25 %	0 %	16081435
5132	NC_002578	ACGA	2	8	319170	319177	50 %	0 %	25 %	25 %	16081435
5133	NC_002578	ATAAAA	2	12	319185	319196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	16081435
5134	NC_002578	CAG	2	6	319228	319233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081435
5135	NC_002578	CTG	2	6	319344	319349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081435
5136	NC_002578	CAT	2	6	319414	319419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081435
5137	NC_002578	ATA	2	6	319464	319469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081435
5138	NC_002578	ATG	2	6	319534	319539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081435
5139	NC_002578	TA	3	6	319748	319753	50 %	50 %	0 %	0 %	16081435
5140	NC_002578	AGG	2	6	319846	319851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081435
5141	NC_002578	AAT	2	6	320021	320026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081435
5142	NC_002578	GCT	2	6	320145	320150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081435
5143	NC_002578	ATGA	2	8	320244	320251	50 %	25 %	25 %	0 %	16081435
5144	NC_002578	CCG	2	6	320296	320301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081435
5145	NC_002578	GCC	2	6	320314	320319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081435
5146	NC_002578	GAG	2	6	320322	320327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081435
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5148	NC_002578	ATC	2	6	320371	320376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081435
5149	NC_002578	GGAT	2	8	320439	320446	25 %	25 %	50 %	0 %	16081435
5150	NC_002578	GGAA	2	8	320473	320480	50 %	0 %	50 %	0 %	16081435
5151	NC_002578	CAT	2	6	320492	320497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081435
5152	NC_002578	AAT	2	6	320501	320506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081435
5153	NC_002578	CT	3	6	320617	320622	0 %	50 %	0 %	50 %	16081435
5154	NC_002578	TTCA	2	8	320629	320636	25 %	50 %	0 %	25 %	16081435
5155	NC_002578	AGG	2	6	320652	320657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081435
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5157	NC_002578	ATA	2	6	320700	320705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081435
5158	NC_002578	CA	3	6	320728	320733	50 %	0 %	0 %	50 %	16081435
5159	NC_002578	AGCGA	2	10	320739	320748	40 %	0 %	40 %	20 %	16081435
5160	NC_002578	ATC	3	9	320750	320758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081435
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5162	NC_002578	GAT	2	6	320829	320834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081435
5163	NC_002578	GCA	2	6	320851	320856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081435
5164	NC_002578	GGA	2	6	320876	320881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081435
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5166	NC_002578	GGA	2	6	320896	320901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081435
5167	NC_002578	TGA	2	6	320936	320941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081435
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5182	NC_002578	TA	3	6	322115	322120	50 %	50 %	0 %	0 %	16081437
5183	NC_002578	CGC	2	6	322167	322172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081437
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5204	NC_002578	GGTAT	2	10	323365	323374	20 %	40 %	40 %	0 %	16081438
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5221	NC_002578	CTTT	2	8	324193	324200	0 %	75 %	0 %	25 %	16081438
5222	NC_002578	GAA	2	6	324263	324268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081438
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5231	NC_002578	CGT	2	6	325277	325282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081438
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5233	NC_002578	GT	3	6	325327	325332	0 %	50 %	50 %	0 %	16081438
5234	NC_002578	TCTATG	2	12	325353	325364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	16081438
5235	NC_002578	AG	3	6	325457	325462	50 %	0 %	50 %	0 %	16081438
5236	NC_002578	CCAG	2	8	325497	325504	25 %	0 %	25 %	50 %	16081438
5237	NC_002578	GTCGAA	2	12	325544	325555	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081438
5238	NC_002578	TGG	2	6	325747	325752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081439
5239	NC_002578	GTA	2	6	325757	325762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081439
5240	NC_002578	AAG	2	6	325820	325825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081439
5241	NC_002578	ATC	2	6	325876	325881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081439
5242	NC_002578	TGA	2	6	325912	325917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081439
5243	NC_002578	TGGCC	2	10	325949	325958	0 %	20 %	40 %	40 %	16081439
5244	NC_002578	TGT	2	6	325966	325971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081439
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5246	NC_002578	CAG	2	6	326007	326012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081439
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5493	NC_002578	CATC	2	8	341725	341732	25 %	25 %	0 %	50 %	16081455
5494	NC_002578	TGCA	2	8	341781	341788	25 %	25 %	25 %	25 %	16081455
5495	NC_002578	TTC	2	6	341791	341796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081455
5496	NC_002578	CGC	2	6	341843	341848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081455
5497	NC_002578	ACC	2	6	342226	342231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081455
5498	NC_002578	CTG	2	6	342245	342250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081455
5499	NC_002578	CCA	2	6	342252	342257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081455
5500	NC_002578	ATC	2	6	342285	342290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081455

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