MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermoplasma acidophilum DSM 1728 chromosome

Total Repeats: 25044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_002578	ATG	2	6	278664	278669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081411
4502	NC_002578	TA	3	6	278677	278682	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
4503	NC_002578	TATTG	2	10	278779	278788	20 %	60 %	20 %	0 %	16081411
4504	NC_002578	TTTA	2	8	278797	278804	25 %	75 %	0 %	0 %	16081411
4505	NC_002578	AGTA	2	8	278839	278846	50 %	25 %	25 %	0 %	16081411
4506	NC_002578	ATG	2	6	278898	278903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081411
4507	NC_002578	AT	3	6	278911	278916	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
4508	NC_002578	AGT	2	6	278939	278944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081411
4509	NC_002578	TTG	2	6	279039	279044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081411
4510	NC_002578	AT	3	6	279059	279064	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
4511	NC_002578	CAC	2	6	279139	279144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16081411
4512	NC_002578	GTT	3	9	279209	279217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081411
4513	NC_002578	TCGC	2	8	279305	279312	0 %	25 %	25 %	50 %	16081411
4514	NC_002578	TA	3	6	279506	279511	50 %	50 %	0 %	0 %	16081411
4515	NC_002578	GCC	2	6	279587	279592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081411
4516	NC_002578	ACT	2	6	279672	279677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081411
4517	NC_002578	TGG	2	6	279698	279703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081411
4518	NC_002578	TCC	2	6	279709	279714	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16081411
4519	NC_002578	CT	3	6	279729	279734	0 %	50 %	0 %	50 %	16081411
4520	NC_002578	TTA	2	6	280014	280019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081412
4521	NC_002578	ATG	2	6	280032	280037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4522	NC_002578	ATCT	2	8	280047	280054	25 %	50 %	0 %	25 %	16081412
4523	NC_002578	AAT	2	6	280089	280094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081412
4524	NC_002578	AGA	2	6	280099	280104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081412
4525	NC_002578	AGA	2	6	280212	280217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081412
4526	NC_002578	AC	3	6	280241	280246	50 %	0 %	0 %	50 %	16081412
4527	NC_002578	ATG	2	6	280258	280263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4528	NC_002578	A	7	7	280270	280276	100 %	0 %	0 %	0 %	16081412
4529	NC_002578	TGGC	2	8	280297	280304	0 %	25 %	50 %	25 %	16081412
4530	NC_002578	ATA	2	6	280455	280460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081412
4531	NC_002578	TAAAA	2	10	280490	280499	80 %	20 %	0 %	0 %	16081412
4532	NC_002578	GAA	3	9	280779	280787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081412
4533	NC_002578	ATT	2	6	280816	280821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081412
4534	NC_002578	AAG	2	6	280848	280853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081412
4535	NC_002578	A	6	6	280981	280986	100 %	0 %	0 %	0 %	16081412
4536	NC_002578	TTG	2	6	281047	281052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081412
4537	NC_002578	ATCAGG	2	12	281057	281068	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	16081412
4538	NC_002578	TGA	2	6	281185	281190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4539	NC_002578	GAT	2	6	281216	281221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4540	NC_002578	TAG	2	6	281272	281277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4541	NC_002578	GAT	2	6	281325	281330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4542	NC_002578	AT	4	8	281329	281336	50 %	50 %	0 %	0 %	16081412
4543	NC_002578	ATT	2	6	281407	281412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081412
4544	NC_002578	GGA	2	6	281439	281444	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081412
4545	NC_002578	ATA	2	6	281496	281501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081412
4546	NC_002578	ATG	2	6	281556	281561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081412
4547	NC_002578	AAG	2	6	281578	281583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081412
4548	NC_002578	CTG	2	6	281683	281688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081412
4549	NC_002578	TAA	2	6	281695	281700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081412
4550	NC_002578	ATT	2	6	281784	281789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081412
4551	NC_002578	AT	3	6	281847	281852	50 %	50 %	0 %	0 %	16081412
4552	NC_002578	A	6	6	281948	281953	100 %	0 %	0 %	0 %	16081412
4553	NC_002578	ATC	2	6	281982	281987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081413
4554	NC_002578	TTA	2	6	282013	282018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081413
4555	NC_002578	GATGC	2	10	282064	282073	20 %	20 %	40 %	20 %	16081413
4556	NC_002578	TTA	2	6	282077	282082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081413
4557	NC_002578	TTTA	2	8	282085	282092	25 %	75 %	0 %	0 %	16081413
4558	NC_002578	A	6	6	282139	282144	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
4559	NC_002578	A	6	6	282180	282185	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
4560	NC_002578	TA	5	10	282195	282204	50 %	50 %	0 %	0 %	16081413
4561	NC_002578	A	6	6	282208	282213	100 %	0 %	0 %	0 %	16081413
4562	NC_002578	TATG	2	8	282254	282261	25 %	50 %	25 %	0 %	16081413
4563	NC_002578	TA	3	6	282271	282276	50 %	50 %	0 %	0 %	16081413
4564	NC_002578	T	6	6	282282	282287	0 %	100 %	0 %	0 %	16081413
4565	NC_002578	CTTC	2	8	283333	283340	0 %	50 %	0 %	50 %	16081414
4566	NC_002578	CAGT	2	8	283362	283369	25 %	25 %	25 %	25 %	16081414
4567	NC_002578	GCAA	2	8	283397	283404	50 %	0 %	25 %	25 %	16081414
4568	NC_002578	CGG	2	6	283451	283456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081414
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4570	NC_002578	CAT	2	6	283513	283518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4571	NC_002578	TGA	2	6	283538	283543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
4572	NC_002578	AT	3	6	283545	283550	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4573	NC_002578	TTC	2	6	283566	283571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081414
4574	NC_002578	CTT	2	6	283600	283605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081414
4575	NC_002578	TAC	2	6	283640	283645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4576	NC_002578	AT	3	6	283686	283691	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4577	NC_002578	CAGGC	2	10	283703	283712	20 %	0 %	40 %	40 %	16081414
4578	NC_002578	GAT	2	6	283722	283727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
4579	NC_002578	TACG	2	8	283751	283758	25 %	25 %	25 %	25 %	16081414
4580	NC_002578	A	6	6	283818	283823	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
4581	NC_002578	A	6	6	283844	283849	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
4582	NC_002578	ATT	2	6	283922	283927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081414
4583	NC_002578	TGT	2	6	283970	283975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16081414
4584	NC_002578	TTTA	2	8	284024	284031	25 %	75 %	0 %	0 %	16081414
4585	NC_002578	ACG	2	6	284037	284042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4586	NC_002578	AT	3	6	284213	284218	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4587	NC_002578	GCT	2	6	284379	284384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4588	NC_002578	GTG	2	6	284401	284406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081414
4589	NC_002578	CAA	2	6	284446	284451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081414
4590	NC_002578	CAG	2	6	284508	284513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4591	NC_002578	CGT	2	6	284603	284608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4592	NC_002578	GAA	2	6	284705	284710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081414
4593	NC_002578	GAT	2	6	284720	284725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
4594	NC_002578	TAT	2	6	284811	284816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081414
4595	NC_002578	ATA	2	6	284892	284897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081414
4596	NC_002578	ATAC	2	8	284922	284929	50 %	25 %	0 %	25 %	16081414
4597	NC_002578	CAT	2	6	284998	285003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4598	NC_002578	CAAT	2	8	285071	285078	50 %	25 %	0 %	25 %	16081414
4599	NC_002578	AAC	2	6	285173	285178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081414
4600	NC_002578	AGAT	2	8	285193	285200	50 %	25 %	25 %	0 %	16081414
4601	NC_002578	ATG	2	6	285225	285230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
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4604	NC_002578	GATA	2	8	285341	285348	50 %	25 %	25 %	0 %	16081414
4605	NC_002578	AAT	2	6	285365	285370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081414
4606	NC_002578	CAT	2	6	285485	285490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4607	NC_002578	CAAA	2	8	285493	285500	75 %	0 %	0 %	25 %	16081414
4608	NC_002578	ATG	2	6	285511	285516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
4609	NC_002578	CTT	2	6	285625	285630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16081414
4610	NC_002578	AT	3	6	285699	285704	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4611	NC_002578	GGATA	2	10	285775	285784	40 %	20 %	40 %	0 %	16081414
4612	NC_002578	GAA	2	6	285968	285973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081414
4613	NC_002578	CAG	2	6	285984	285989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4614	NC_002578	CGG	2	6	286004	286009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16081414
4615	NC_002578	ATATGA	2	12	286051	286062	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	16081414
4616	NC_002578	ACG	2	6	286158	286163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16081414
4617	NC_002578	GCC	2	6	286185	286190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081414
4618	NC_002578	AT	3	6	286324	286329	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4619	NC_002578	TGA	2	6	286339	286344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081414
4620	NC_002578	A	6	6	286348	286353	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
4621	NC_002578	AAT	3	9	286376	286384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081414
4622	NC_002578	TAA	2	6	286745	286750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081414
4623	NC_002578	ACT	2	6	286752	286757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4624	NC_002578	TAC	2	6	286838	286843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
4625	NC_002578	CCG	2	6	286924	286929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081414
4626	NC_002578	ACA	2	6	286953	286958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16081414
4627	NC_002578	GGA	3	9	287043	287051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081414
4628	NC_002578	TA	3	6	287052	287057	50 %	50 %	0 %	0 %	16081414
4629	NC_002578	A	6	6	287137	287142	100 %	0 %	0 %	0 %	16081414
4630	NC_002578	CAT	2	6	287155	287160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16081414
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4632	NC_002578	ATA	2	6	287240	287245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081414
4633	NC_002578	ATA	2	6	287532	287537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081415
4634	NC_002578	TGCA	2	8	287736	287743	25 %	25 %	25 %	25 %	16081415
4635	NC_002578	GAG	2	6	287834	287839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16081415
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4637	NC_002578	CATA	2	8	288030	288037	50 %	25 %	0 %	25 %	16081416
4638	NC_002578	AT	3	6	288057	288062	50 %	50 %	0 %	0 %	16081416
4639	NC_002578	CATTC	2	10	288095	288104	20 %	40 %	0 %	40 %	16081416
4640	NC_002578	ATA	2	6	288107	288112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081416
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4645	NC_002578	TC	3	6	288937	288942	0 %	50 %	0 %	50 %	16081417
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4655	NC_002578	GGT	2	6	289502	289507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16081417
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4864	NC_002578	GC	3	6	302162	302167	0 %	0 %	50 %	50 %	16081426
4865	NC_002578	GCC	2	6	302205	302210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16081426
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4867	NC_002578	GTA	2	6	302280	302285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081426
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4870	NC_002578	A	7	7	302427	302433	100 %	0 %	0 %	0 %	16081426
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4996	NC_002578	ATT	2	6	310525	310530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16081429
4997	NC_002578	GAA	2	6	310565	310570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16081429
4998	NC_002578	ATA	2	6	310701	310706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16081429
4999	NC_002578	GAT	2	6	310728	310733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16081429
5000	NC_002578	GAAGA	2	10	310935	310944	60 %	0 %	40 %	0 %	16081429

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