MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 24984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000853	CTG	2	6	525	530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
2	NC_000853	TCG	2	6	535	540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642777
3	NC_000853	GGA	2	6	1793	1798	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642778
4	NC_000853	AAT	2	6	1818	1823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
5	NC_000853	TCT	2	6	1854	1859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642778
6	NC_000853	AAT	2	6	1885	1890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642778
7	NC_000853	AAT	2	6	1951	1956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
8	NC_000853	AAT	2	6	2018	2023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642779
9	NC_000853	CTT	2	6	3176	3181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
10	NC_000853	TCT	2	6	3200	3205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
11	NC_000853	TCT	2	6	3287	3292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
12	NC_000853	GAT	3	9	3344	3352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
13	NC_000853	ATC	2	6	3437	3442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
14	NC_000853	TGA	2	6	3451	3456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
15	NC_000853	TCC	2	6	3468	3473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
16	NC_000853	ACA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
17	NC_000853	CGT	2	6	3718	3723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
18	NC_000853	TTC	2	6	3728	3733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
19	NC_000853	TTC	2	6	3815	3820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
20	NC_000853	TCT	2	6	3849	3854	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
21	NC_000853	CAA	2	6	3961	3966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642780
22	NC_000853	TAT	2	6	4061	4066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642780
23	NC_000853	TTC	2	6	4176	4181	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
24	NC_000853	TCT	2	6	4198	4203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
25	NC_000853	TTC	2	6	4277	4282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
26	NC_000853	TCT	2	6	4288	4293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
27	NC_000853	CTT	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
28	NC_000853	GAA	2	6	4686	4691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642780
29	NC_000853	TCA	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642780
30	NC_000853	TCT	2	6	4715	4720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
31	NC_000853	TGA	2	6	4798	4803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642780
32	NC_000853	TCT	2	6	4903	4908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
33	NC_000853	TTC	3	9	4909	4917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
34	NC_000853	TTC	2	6	4943	4948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
35	NC_000853	TCC	2	6	5001	5006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642780
36	NC_000853	CTT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642780
37	NC_000853	CTG	2	6	5093	5098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642780
38	NC_000853	CTT	2	6	5160	5165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
39	NC_000853	CTT	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
40	NC_000853	TCA	2	6	5388	5393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
41	NC_000853	CCG	2	6	5421	5426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642781
42	NC_000853	CTC	2	6	5480	5485	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
43	NC_000853	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642781
44	NC_000853	CCT	2	6	5550	5555	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
45	NC_000853	TCT	2	6	5694	5699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642781
46	NC_000853	CCT	2	6	5703	5708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
47	NC_000853	TCC	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642781
48	NC_000853	GCT	2	6	5840	5845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642781
49	NC_000853	ATC	2	6	5921	5926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642781
50	NC_000853	AAG	2	6	5950	5955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642781
51	NC_000853	AGG	2	6	5985	5990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642781
52	NC_000853	CCT	2	6	6150	6155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642782
53	NC_000853	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15642782
54	NC_000853	CGT	2	6	6285	6290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642782
55	NC_000853	CCA	2	6	6294	6299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
56	NC_000853	GAG	2	6	6426	6431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
57	NC_000853	GTT	2	6	6541	6546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642782
58	NC_000853	CAC	2	6	6547	6552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
59	NC_000853	CAC	2	6	6667	6672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
60	NC_000853	ACC	2	6	6684	6689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642782
61	NC_000853	CTT	2	6	6723	6728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
62	NC_000853	GTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642782
63	NC_000853	GGA	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
64	NC_000853	TTC	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
65	NC_000853	CTT	2	6	7085	7090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
66	NC_000853	GAA	2	6	7144	7149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642782
67	NC_000853	ACG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642782
68	NC_000853	CTT	2	6	7269	7274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
69	NC_000853	GAG	2	6	7297	7302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642782
70	NC_000853	TCT	2	6	7415	7420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642782
71	NC_000853	AGA	2	6	7521	7526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
72	NC_000853	CGC	2	6	7596	7601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642783
73	NC_000853	GAT	3	9	7608	7616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642783
74	NC_000853	TCA	2	6	7617	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
75	NC_000853	GAA	2	6	7743	7748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
76	NC_000853	GAA	2	6	7780	7785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
77	NC_000853	TCT	2	6	7806	7811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642783
78	NC_000853	GAA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
79	NC_000853	GAA	2	6	8016	8021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
80	NC_000853	CAG	2	6	8025	8030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642783
81	NC_000853	ATC	2	6	8041	8046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642783
82	NC_000853	AGA	2	6	8084	8089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642783
83	NC_000853	GAT	2	6	8253	8258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
84	NC_000853	ATC	2	6	8361	8366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642784
85	NC_000853	TTC	2	6	8376	8381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642784
86	NC_000853	GTA	2	6	8568	8573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642784
87	NC_000853	AGA	2	6	8611	8616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642784
88	NC_000853	CCT	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
89	NC_000853	CTT	2	6	8852	8857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
90	NC_000853	TCC	2	6	9006	9011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
91	NC_000853	TCT	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
92	NC_000853	TCT	2	6	9055	9060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
93	NC_000853	TTC	2	6	9098	9103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
94	NC_000853	GAA	2	6	9119	9124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642785
95	NC_000853	GTC	2	6	9146	9151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642785
96	NC_000853	CCA	2	6	9171	9176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642785
97	NC_000853	TCC	3	9	9305	9313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
98	NC_000853	TTC	2	6	9372	9377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
99	NC_000853	TGA	2	6	9457	9462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642785
100	NC_000853	GTT	2	6	9491	9496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642785
101	NC_000853	CAC	2	6	9601	9606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642785
102	NC_000853	TCC	2	6	9671	9676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
103	NC_000853	GGC	2	6	9785	9790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642785
104	NC_000853	TCT	2	6	9892	9897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
105	NC_000853	CTC	3	9	9949	9957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
106	NC_000853	CTC	2	6	10055	10060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642785
107	NC_000853	GAA	2	6	10118	10123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642785
108	NC_000853	TTC	2	6	10211	10216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
109	NC_000853	TGC	2	6	10229	10234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642785
110	NC_000853	TTC	3	9	10361	10369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642785
111	NC_000853	CGG	2	6	10396	10401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642785
112	NC_000853	ACC	2	6	10491	10496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642786
113	NC_000853	CGA	2	6	10504	10509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642786
114	NC_000853	AAC	2	6	10649	10654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642786
115	NC_000853	TGT	2	6	10669	10674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642786
116	NC_000853	CGC	2	6	10721	10726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642786
117	NC_000853	TTC	2	6	10826	10831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642786
118	NC_000853	GAT	2	6	10879	10884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642787
119	NC_000853	CCA	2	6	10932	10937	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642787
120	NC_000853	TGG	2	6	11004	11009	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642787
121	NC_000853	TTC	2	6	11032	11037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642787
122	NC_000853	GAA	2	6	11131	11136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642787
123	NC_000853	CTT	2	6	11269	11274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642787
124	NC_000853	TCT	2	6	11291	11296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642787
125	NC_000853	TCC	2	6	11324	11329	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642787
126	NC_000853	CCT	2	6	11352	11357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642787
127	NC_000853	GAT	2	6	12081	12086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642788
128	NC_000853	AGA	2	6	12178	12183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642788
129	NC_000853	GAA	2	6	12236	12241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642788
130	NC_000853	GAA	2	6	12424	12429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642789
131	NC_000853	TGG	2	6	12493	12498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642789
132	NC_000853	CAT	2	6	12566	12571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642789
133	NC_000853	GGA	2	6	12572	12577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642789
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280	NC_000853	TCC	2	6	22828	22833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642799
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382	NC_000853	GAT	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
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385	NC_000853	CTG	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642806
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