MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000853	GA	3	6	51132	51137	50 %	0 %	50 %	0 %	15642829
1002	NC_000853	AGTA	2	8	51154	51161	50 %	25 %	25 %	0 %	15642829
1003	NC_000853	CAA	2	6	51189	51194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642829
1004	NC_000853	TAC	2	6	51196	51201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642829
1005	NC_000853	TGT	2	6	51202	51207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642829
1006	NC_000853	ACA	2	6	51210	51215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642829
1007	NC_000853	CTT	2	6	51261	51266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642829
1008	NC_000853	TCA	2	6	51285	51290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642829
1009	NC_000853	AAG	2	6	51308	51313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642829
1010	NC_000853	AGA	2	6	51379	51384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642829
1011	NC_000853	GAA	2	6	51413	51418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642829
1012	NC_000853	CGG	2	6	51421	51426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642829
1013	NC_000853	CTCA	2	8	51433	51440	25 %	25 %	0 %	50 %	15642829
1014	NC_000853	GAC	2	6	51478	51483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642829
1015	NC_000853	AT	3	6	51602	51607	50 %	50 %	0 %	0 %	15642829
1016	NC_000853	AAG	3	9	51609	51617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642829
1017	NC_000853	GAG	2	6	51618	51623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642829
1018	NC_000853	AT	3	6	51638	51643	50 %	50 %	0 %	0 %	15642830
1019	NC_000853	TTC	2	6	51646	51651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1020	NC_000853	TCA	2	6	51657	51662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642830
1021	NC_000853	CT	3	6	51751	51756	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1022	NC_000853	TCC	2	6	51789	51794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642830
1023	NC_000853	TTC	2	6	51809	51814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1024	NC_000853	TCC	2	6	51819	51824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642830
1025	NC_000853	GAT	2	6	51883	51888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642830
1026	NC_000853	GAA	2	6	51905	51910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642830
1027	NC_000853	AAG	3	9	51911	51919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642830
1028	NC_000853	ATC	2	6	51941	51946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642830
1029	NC_000853	GTG	2	6	52088	52093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642830
1030	NC_000853	CCAT	2	8	52105	52112	25 %	25 %	0 %	50 %	15642830
1031	NC_000853	GTG	2	6	52128	52133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642830
1032	NC_000853	TCA	2	6	52159	52164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642830
1033	NC_000853	TTC	2	6	52223	52228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1034	NC_000853	TTC	2	6	52244	52249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1035	NC_000853	GTT	2	6	52355	52360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642830
1036	NC_000853	AG	3	6	52372	52377	50 %	0 %	50 %	0 %	15642830
1037	NC_000853	TCCA	2	8	52379	52386	25 %	25 %	0 %	50 %	15642830
1038	NC_000853	A	6	6	52461	52466	100 %	0 %	0 %	0 %	15642830
1039	NC_000853	CTG	2	6	52478	52483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642830
1040	NC_000853	ATTTG	2	10	52518	52527	20 %	60 %	20 %	0 %	15642830
1041	NC_000853	TCT	2	6	52528	52533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1042	NC_000853	TCC	2	6	52538	52543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642830
1043	NC_000853	TC	3	6	52563	52568	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1044	NC_000853	GTC	2	6	52613	52618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642830
1045	NC_000853	GCC	2	6	52653	52658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642830
1046	NC_000853	TC	3	6	52680	52685	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1047	NC_000853	TAC	2	6	52724	52729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642830
1048	NC_000853	TTC	2	6	52783	52788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1049	NC_000853	TCC	2	6	52838	52843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642830
1050	NC_000853	TC	3	6	52881	52886	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1051	NC_000853	GC	3	6	52892	52897	0 %	0 %	50 %	50 %	15642830
1052	NC_000853	TCG	2	6	52905	52910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642830
1053	NC_000853	TAGA	2	8	52967	52974	50 %	25 %	25 %	0 %	15642830
1054	NC_000853	CT	3	6	52988	52993	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1055	NC_000853	T	6	6	53018	53023	0 %	100 %	0 %	0 %	15642830
1056	NC_000853	TAGA	2	8	53028	53035	50 %	25 %	25 %	0 %	15642830
1057	NC_000853	GTT	2	6	53072	53077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642830
1058	NC_000853	AAC	2	6	53081	53086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642830
1059	NC_000853	TGT	2	6	53152	53157	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642830
1060	NC_000853	A	7	7	53163	53169	100 %	0 %	0 %	0 %	15642830
1061	NC_000853	CT	3	6	53188	53193	0 %	50 %	0 %	50 %	15642830
1062	NC_000853	TCT	2	6	53266	53271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1063	NC_000853	TCA	2	6	53299	53304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642830
1064	NC_000853	CTT	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1065	NC_000853	ATG	2	6	53454	53459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642830
1066	NC_000853	TCTT	2	8	53466	53473	0 %	75 %	0 %	25 %	15642830
1067	NC_000853	TCT	2	6	53525	53530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642830
1068	NC_000853	GAA	2	6	53550	53555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642830
1069	NC_000853	CCAG	2	8	53632	53639	25 %	0 %	25 %	50 %	15642830
1070	NC_000853	GAA	2	6	53728	53733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642831
1071	NC_000853	GGCAT	2	10	53741	53750	20 %	20 %	40 %	20 %	15642831
1072	NC_000853	GTT	2	6	53806	53811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642831
1073	NC_000853	TCT	2	6	53834	53839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1074	NC_000853	ATC	2	6	53852	53857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642831
1075	NC_000853	TCG	2	6	53880	53885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1076	NC_000853	GTA	2	6	53938	53943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642831
1077	NC_000853	GAC	2	6	53962	53967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1078	NC_000853	TGG	2	6	53971	53976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642831
1079	NC_000853	CTT	2	6	53994	53999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1080	NC_000853	GTA	2	6	54031	54036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642831
1081	NC_000853	AG	3	6	54112	54117	50 %	0 %	50 %	0 %	15642831
1082	NC_000853	AGA	2	6	54183	54188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642831
1083	NC_000853	GA	3	6	54187	54192	50 %	0 %	50 %	0 %	15642831
1084	NC_000853	GA	3	6	54448	54453	50 %	0 %	50 %	0 %	15642831
1085	NC_000853	GCCT	2	8	54455	54462	0 %	25 %	25 %	50 %	15642831
1086	NC_000853	TTC	2	6	54499	54504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1087	NC_000853	GA	3	6	54521	54526	50 %	0 %	50 %	0 %	15642831
1088	NC_000853	GCCT	2	8	54527	54534	0 %	25 %	25 %	50 %	15642831
1089	NC_000853	TCG	2	6	54569	54574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1090	NC_000853	CTG	2	6	54599	54604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1091	NC_000853	TCC	2	6	54643	54648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642831
1092	NC_000853	GCTCCC	2	12	54686	54697	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	15642831
1093	NC_000853	TCC	2	6	54700	54705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642831
1094	NC_000853	TCG	2	6	54761	54766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1095	NC_000853	TC	3	6	54847	54852	0 %	50 %	0 %	50 %	15642831
1096	NC_000853	CTGTT	2	10	54865	54874	0 %	60 %	20 %	20 %	15642831
1097	NC_000853	CCA	2	6	54978	54983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642831
1098	NC_000853	TCT	3	9	54984	54992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1099	NC_000853	TTC	2	6	54997	55002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1100	NC_000853	GT	3	6	55008	55013	0 %	50 %	50 %	0 %	15642831
1101	NC_000853	TGGA	2	8	55018	55025	25 %	25 %	50 %	0 %	15642831
1102	NC_000853	TCG	2	6	55127	55132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1103	NC_000853	TGT	2	6	55155	55160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15642831
1104	NC_000853	TCG	2	6	55187	55192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1105	NC_000853	ACC	2	6	55435	55440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642831
1106	NC_000853	TCC	2	6	55481	55486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642831
1107	NC_000853	CTT	2	6	55518	55523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1108	NC_000853	CGA	2	6	55524	55529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1109	NC_000853	TCT	2	6	55566	55571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642831
1110	NC_000853	GTA	2	6	55585	55590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642831
1111	NC_000853	AGA	2	6	55608	55613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642831
1112	NC_000853	GCA	2	6	55628	55633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642831
1113	NC_000853	AAC	2	6	55642	55647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642831
1114	NC_000853	ACAA	2	8	55670	55677	75 %	0 %	0 %	25 %	15642831
1115	NC_000853	TGGA	2	8	55838	55845	25 %	25 %	50 %	0 %	15642832
1116	NC_000853	TGG	2	6	55859	55864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642832
1117	NC_000853	TTC	2	6	55904	55909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642832
1118	NC_000853	CTC	2	6	55985	55990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642832
1119	NC_000853	GT	3	6	56069	56074	0 %	50 %	50 %	0 %	15642832
1120	NC_000853	TTC	2	6	56099	56104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642832
1121	NC_000853	TCA	2	6	56169	56174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642832
1122	NC_000853	CA	3	6	56173	56178	50 %	0 %	0 %	50 %	15642832
1123	NC_000853	CCA	2	6	56179	56184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642832
1124	NC_000853	TCTCTG	2	12	56222	56233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	15642832
1125	NC_000853	ACC	2	6	56234	56239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642832
1126	NC_000853	GA	3	6	56393	56398	50 %	0 %	50 %	0 %	15642832
1127	NC_000853	ATC	2	6	56418	56423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642832
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1129	NC_000853	GAA	2	6	56497	56502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642832
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