MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Thermotoga maritima MSB8 chromosome

Total Repeats: 38422

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000853	ATG	2	6	25936	25941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642802
502	NC_000853	CT	3	6	25956	25961	0 %	50 %	0 %	50 %	15642802
503	NC_000853	GAG	2	6	25971	25976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642802
504	NC_000853	CCT	2	6	25987	25992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642802
505	NC_000853	GGA	2	6	25995	26000	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642802
506	NC_000853	CCA	2	6	26089	26094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642802
507	NC_000853	CTT	2	6	26177	26182	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642802
508	NC_000853	AG	3	6	26225	26230	50 %	0 %	50 %	0 %	15642802
509	NC_000853	TC	3	6	26232	26237	0 %	50 %	0 %	50 %	15642802
510	NC_000853	CCTT	2	8	26291	26298	0 %	50 %	0 %	50 %	15642802
511	NC_000853	ATC	2	6	26395	26400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642802
512	NC_000853	GGT	2	6	26406	26411	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642802
513	NC_000853	TTTC	2	8	26450	26457	0 %	75 %	0 %	25 %	15642802
514	NC_000853	TTC	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642802
515	NC_000853	ACG	2	6	26496	26501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642802
516	NC_000853	GAA	2	6	26508	26513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642802
517	NC_000853	TTC	2	6	26539	26544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642802
518	NC_000853	ACG	2	6	26545	26550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642802
519	NC_000853	CT	3	6	26563	26568	0 %	50 %	0 %	50 %	15642803
520	NC_000853	CTT	2	6	26595	26600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642803
521	NC_000853	GGT	2	6	26622	26627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642803
522	NC_000853	CATC	2	8	26644	26651	25 %	25 %	0 %	50 %	15642803
523	NC_000853	GGA	2	6	26688	26693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642803
524	NC_000853	TGG	2	6	26722	26727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642803
525	NC_000853	CT	3	6	26734	26739	0 %	50 %	0 %	50 %	15642803
526	NC_000853	ATG	2	6	26856	26861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642803
527	NC_000853	TCTG	2	8	26867	26874	0 %	50 %	25 %	25 %	15642803
528	NC_000853	TGA	2	6	26905	26910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642803
529	NC_000853	TCA	2	6	27003	27008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642803
530	NC_000853	CCA	2	6	27069	27074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642803
531	NC_000853	TCT	3	9	27131	27139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642803
532	NC_000853	TGG	2	6	27214	27219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642803
533	NC_000853	TAT	2	6	27248	27253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642803
534	NC_000853	TTTTC	2	10	27275	27284	0 %	80 %	0 %	20 %	15642803
535	NC_000853	GAC	2	6	27303	27308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642803
536	NC_000853	GA	3	6	27396	27401	50 %	0 %	50 %	0 %	15642803
537	NC_000853	TAG	2	6	27507	27512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642803
538	NC_000853	TTTC	2	8	27541	27548	0 %	75 %	0 %	25 %	15642803
539	NC_000853	TTC	2	6	27550	27555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642803
540	NC_000853	CTC	2	6	27557	27562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642804
541	NC_000853	TGA	2	6	27601	27606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642804
542	NC_000853	CAG	2	6	27608	27613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642804
543	NC_000853	TGG	2	6	27644	27649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642804
544	NC_000853	ACC	3	9	27655	27663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642804
545	NC_000853	TGGG	2	8	27729	27736	0 %	25 %	75 %	0 %	15642804
546	NC_000853	TCC	2	6	27776	27781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642804
547	NC_000853	TCT	2	6	27837	27842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642804
548	NC_000853	TGTT	2	8	28051	28058	0 %	75 %	25 %	0 %	15642804
549	NC_000853	CAT	2	6	28072	28077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642804
550	NC_000853	CGG	2	6	28096	28101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15642804
551	NC_000853	GAT	2	6	28136	28141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642804
552	NC_000853	GAA	2	6	28167	28172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642804
553	NC_000853	CGTA	2	8	28210	28217	25 %	25 %	25 %	25 %	15642804
554	NC_000853	AGG	2	6	28244	28249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642804
555	NC_000853	AGAA	2	8	28320	28327	75 %	0 %	25 %	0 %	15642804
556	NC_000853	TAT	2	6	28346	28351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15642804
557	NC_000853	TTTTTG	2	12	28356	28367	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	15642804
558	NC_000853	ATC	2	6	28380	28385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642804
559	NC_000853	CCT	2	6	28405	28410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642805
560	NC_000853	GATA	2	8	28471	28478	50 %	25 %	25 %	0 %	15642805
561	NC_000853	TGA	2	6	28585	28590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642805
562	NC_000853	CTC	2	6	28594	28599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642805
563	NC_000853	GAG	2	6	28643	28648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642805
564	NC_000853	ACG	2	6	28782	28787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642805
565	NC_000853	CGA	2	6	28825	28830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642805
566	NC_000853	AGCC	2	8	28887	28894	25 %	0 %	25 %	50 %	15642805
567	NC_000853	AAAG	2	8	28909	28916	75 %	0 %	25 %	0 %	15642805
568	NC_000853	GAA	4	12	29062	29073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642805
569	NC_000853	TGA	2	6	29167	29172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642805
570	NC_000853	TTC	2	6	29213	29218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642805
571	NC_000853	TTCT	2	8	29227	29234	0 %	75 %	0 %	25 %	15642805
572	NC_000853	AG	3	6	29282	29287	50 %	0 %	50 %	0 %	15642805
573	NC_000853	TCC	2	6	29533	29538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642806
574	NC_000853	TCA	2	6	29540	29545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642806
575	NC_000853	CTT	2	6	29584	29589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
576	NC_000853	GAT	2	6	29593	29598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
577	NC_000853	AG	3	6	29601	29606	50 %	0 %	50 %	0 %	15642806
578	NC_000853	CTCG	2	8	29659	29666	0 %	25 %	25 %	50 %	15642806
579	NC_000853	TCG	2	6	29685	29690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642806
580	NC_000853	GAT	2	6	29746	29751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
581	NC_000853	CTG	2	6	29752	29757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642806
582	NC_000853	CCTCA	2	10	29779	29788	20 %	20 %	0 %	60 %	15642806
583	NC_000853	GAG	2	6	29815	29820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15642806
584	NC_000853	ACT	2	6	29825	29830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642806
585	NC_000853	GAT	2	6	29928	29933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
586	NC_000853	ATG	2	6	29960	29965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
587	NC_000853	CA	3	6	30069	30074	50 %	0 %	0 %	50 %	15642806
588	NC_000853	TCA	2	6	30075	30080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642806
589	NC_000853	TTC	2	6	30222	30227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
590	NC_000853	TCT	2	6	30246	30251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
591	NC_000853	ATCA	2	8	30295	30302	50 %	25 %	0 %	25 %	15642806
592	NC_000853	TCT	2	6	30501	30506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
593	NC_000853	GTC	2	6	30655	30660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642806
594	NC_000853	CT	3	6	30663	30668	0 %	50 %	0 %	50 %	15642806
595	NC_000853	GTA	3	9	30691	30699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642806
596	NC_000853	AAC	2	6	30718	30723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642806
597	NC_000853	TTC	2	6	30727	30732	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
598	NC_000853	AGGAA	2	10	30822	30831	60 %	0 %	40 %	0 %	15642806
599	NC_000853	TCT	2	6	30851	30856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642806
600	NC_000853	CCG	2	6	30923	30928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642806
601	NC_000853	ATC	2	6	30973	30978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15642806
602	NC_000853	GTC	2	6	31042	31047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15642806
603	NC_000853	GGT	2	6	31171	31176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15642806
604	NC_000853	CTC	2	6	31194	31199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642806
605	NC_000853	AGA	2	6	31259	31264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642806
606	NC_000853	TCC	2	6	31366	31371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642807
607	NC_000853	TCTG	2	8	31432	31439	0 %	50 %	25 %	25 %	15642807
608	NC_000853	ACA	2	6	31496	31501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642807
609	NC_000853	CCG	2	6	31502	31507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15642807
610	NC_000853	GAT	2	6	31537	31542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15642807
611	NC_000853	TTC	2	6	31544	31549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642807
612	NC_000853	AAC	2	6	31552	31557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642807
613	NC_000853	GAA	2	6	31569	31574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642807
614	NC_000853	TTC	2	6	31576	31581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642807
615	NC_000853	TTTC	2	8	31587	31594	0 %	75 %	0 %	25 %	15642807
616	NC_000853	GA	3	6	31706	31711	50 %	0 %	50 %	0 %	15642807
617	NC_000853	CTC	2	6	31714	31719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15642807
618	NC_000853	CTT	2	6	31722	31727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642807
619	NC_000853	T	6	6	31733	31738	0 %	100 %	0 %	0 %	15642807
620	NC_000853	ACA	2	6	31748	31753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15642807
621	NC_000853	CAG	2	6	31767	31772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15642807
622	NC_000853	AGAA	2	8	31841	31848	75 %	0 %	25 %	0 %	15642807
623	NC_000853	TTC	2	6	31885	31890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15642807
624	NC_000853	CCA	2	6	31920	31925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15642807
625	NC_000853	TCCAGA	2	12	31931	31942	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	15642807
626	NC_000853	CT	3	6	31951	31956	0 %	50 %	0 %	50 %	15642807
627	NC_000853	TCCA	2	8	31974	31981	25 %	25 %	0 %	50 %	15642807
628	NC_000853	ACTT	2	8	32004	32011	25 %	50 %	0 %	25 %	15642807
629	NC_000853	AAG	3	9	32094	32102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15642807
630	NC_000853	TTTG	2	8	32109	32116	0 %	75 %	25 %	0 %	15642807
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