MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021508	GCG	2	6	194323	194328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443664
4002	NC_021508	GGC	2	6	194462	194467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443664
4003	NC_021508	GCCA	2	8	194468	194475	25 %	0 %	25 %	50 %	512443664
4004	NC_021508	A	6	6	194496	194501	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
4005	NC_021508	GAA	2	6	194508	194513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
4006	NC_021508	CCT	2	6	194544	194549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443664
4007	NC_021508	GT	3	6	194655	194660	0 %	50 %	50 %	0 %	512443664
4008	NC_021508	A	7	7	194693	194699	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
4009	NC_021508	AC	3	6	194723	194728	50 %	0 %	0 %	50 %	512443664
4010	NC_021508	T	6	6	194782	194787	0 %	100 %	0 %	0 %	512443664
4011	NC_021508	A	6	6	195005	195010	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
4012	NC_021508	A	7	7	195038	195044	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
4013	NC_021508	GAT	2	6	195053	195058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443664
4014	NC_021508	GAA	2	6	195112	195117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
4015	NC_021508	ATA	2	6	195138	195143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443664
4016	NC_021508	GCA	2	6	195206	195211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443664
4017	NC_021508	A	6	6	195268	195273	100 %	0 %	0 %	0 %	512443664
4018	NC_021508	GCAG	2	8	195291	195298	25 %	0 %	50 %	25 %	512443664
4019	NC_021508	TTCT	2	8	195301	195308	0 %	75 %	0 %	25 %	512443664
4020	NC_021508	GAGTG	2	10	195333	195342	20 %	20 %	60 %	0 %	512443664
4021	NC_021508	AAG	2	6	195357	195362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443664
4022	NC_021508	TG	4	8	195377	195384	0 %	50 %	50 %	0 %	512443664
4023	NC_021508	T	8	8	195474	195481	0 %	100 %	0 %	0 %	512443664
4024	NC_021508	T	6	6	195572	195577	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021508	AGT	2	6	195693	195698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_021508	CGG	2	6	195733	195738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_021508	GTAC	2	8	195806	195813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4028	NC_021508	GGT	2	6	195821	195826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_021508	GAAG	2	8	195976	195983	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021508	CGTG	2	8	195992	195999	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_021508	AAAT	2	8	196037	196044	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021508	AGAA	2	8	196139	196146	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_021508	AC	3	6	196197	196202	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_021508	GGA	2	6	196205	196210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_021508	ACA	2	6	196230	196235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_021508	CCGT	2	8	196283	196290	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4037	NC_021508	GAG	2	6	196343	196348	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_021508	CA	4	8	196405	196412	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4039	NC_021508	A	6	6	196456	196461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_021508	GC	3	6	196577	196582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_021508	ATTA	2	8	196648	196655	50 %	50 %	0 %	0 %	512443665
4042	NC_021508	AGAA	2	8	196656	196663	75 %	0 %	25 %	0 %	512443665
4043	NC_021508	TTA	2	6	196812	196817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_021508	GCG	2	6	196825	196830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_021508	CTT	2	6	196868	196873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_021508	GGA	2	6	196934	196939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443666
4047	NC_021508	CGTC	2	8	196940	196947	0 %	25 %	25 %	50 %	512443666
4048	NC_021508	GC	3	6	196949	196954	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
4049	NC_021508	AGT	2	6	196956	196961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
4050	NC_021508	TGA	2	6	196973	196978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
4051	NC_021508	GAA	2	6	197065	197070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
4052	NC_021508	CAG	2	6	197158	197163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443666
4053	NC_021508	GAA	2	6	197189	197194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
4054	NC_021508	CGG	2	6	197195	197200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443666
4055	NC_021508	G	6	6	197199	197204	0 %	0 %	100 %	0 %	512443666
4056	NC_021508	AGC	2	6	197279	197284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443666
4057	NC_021508	GC	3	6	197343	197348	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
4058	NC_021508	ACGC	2	8	197370	197377	25 %	0 %	25 %	50 %	512443666
4059	NC_021508	CTC	2	6	197379	197384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443666
4060	NC_021508	CCTG	2	8	197558	197565	0 %	25 %	25 %	50 %	512443666
4061	NC_021508	GTC	2	6	197572	197577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443666
4062	NC_021508	GCAG	2	8	197587	197594	25 %	0 %	50 %	25 %	512443666
4063	NC_021508	AGG	2	6	197605	197610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443666
4064	NC_021508	GTG	3	9	197638	197646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443666
4065	NC_021508	GAGAAA	2	12	197691	197702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443666
4066	NC_021508	CG	3	6	197706	197711	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
4067	NC_021508	GA	3	6	197721	197726	50 %	0 %	50 %	0 %	512443666
4068	NC_021508	GTA	2	6	197760	197765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443666
4069	NC_021508	GC	4	8	197803	197810	0 %	0 %	50 %	50 %	512443666
4070	NC_021508	CTC	2	6	197885	197890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443667
4071	NC_021508	TCT	2	6	197893	197898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443667
4072	NC_021508	AGC	2	6	197916	197921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4073	NC_021508	TCG	2	6	197952	197957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4074	NC_021508	GTC	4	12	198182	198193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4075	NC_021508	GCT	2	6	198217	198222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4076	NC_021508	GGA	2	6	198248	198253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443667
4077	NC_021508	CG	3	6	198412	198417	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
4078	NC_021508	GTC	2	6	198428	198433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4079	NC_021508	CAC	2	6	198499	198504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443667
4080	NC_021508	TGA	2	6	198556	198561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443667
4081	NC_021508	TCGTC	2	10	198595	198604	0 %	40 %	20 %	40 %	512443667
4082	NC_021508	ATC	2	6	198608	198613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443667
4083	NC_021508	TTCC	2	8	198646	198653	0 %	50 %	0 %	50 %	512443667
4084	NC_021508	CTG	2	6	198744	198749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4085	NC_021508	GAA	2	6	198900	198905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443667
4086	NC_021508	CGT	2	6	198958	198963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4087	NC_021508	GTC	2	6	198983	198988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4088	NC_021508	GTG	2	6	198996	199001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443667
4089	NC_021508	TGC	2	6	199027	199032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4090	NC_021508	CG	3	6	199036	199041	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
4091	NC_021508	GGC	2	6	199047	199052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443667
4092	NC_021508	GTC	2	6	199097	199102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4093	NC_021508	TCG	2	6	199131	199136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4094	NC_021508	ACG	2	6	199138	199143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4095	NC_021508	GCC	2	6	199182	199187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443667
4096	NC_021508	GGA	3	9	199193	199201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443667
4097	NC_021508	CGAG	2	8	199230	199237	25 %	0 %	50 %	25 %	512443667
4098	NC_021508	TCC	2	6	199245	199250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443667
4099	NC_021508	CAA	2	6	199261	199266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443667
4100	NC_021508	CCGCA	2	10	199322	199331	20 %	0 %	20 %	60 %	512443667
4101	NC_021508	CG	3	6	199336	199341	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
4102	NC_021508	CGG	2	6	199418	199423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443667
4103	NC_021508	CTG	2	6	199510	199515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443667
4104	NC_021508	CA	3	6	199558	199563	50 %	0 %	0 %	50 %	512443667
4105	NC_021508	T	6	6	199615	199620	0 %	100 %	0 %	0 %	512443667
4106	NC_021508	CAA	2	6	199621	199626	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443667
4107	NC_021508	CG	3	6	199668	199673	0 %	0 %	50 %	50 %	512443667
4108	NC_021508	CCT	2	6	199708	199713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443667
4109	NC_021508	G	11	11	199717	199727	0 %	0 %	100 %	0 %	512443667
4110	NC_021508	GTA	2	6	199818	199823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443668
4111	NC_021508	G	6	6	199882	199887	0 %	0 %	100 %	0 %	512443668
4112	NC_021508	TG	3	6	199888	199893	0 %	50 %	50 %	0 %	512443668
4113	NC_021508	GGT	2	6	199976	199981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443668
4114	NC_021508	CG	3	6	200043	200048	0 %	0 %	50 %	50 %	512443668
4115	NC_021508	TTG	2	6	200125	200130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443668
4116	NC_021508	CTT	2	6	200183	200188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443668
4117	NC_021508	GTC	2	6	200190	200195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443668
4118	NC_021508	GCT	2	6	200204	200209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443668
4119	NC_021508	GC	3	6	200218	200223	0 %	0 %	50 %	50 %	512443668
4120	NC_021508	GCT	2	6	200260	200265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443669
4121	NC_021508	GA	3	6	200403	200408	50 %	0 %	50 %	0 %	512443669
4122	NC_021508	TGGCC	2	10	200497	200506	0 %	20 %	40 %	40 %	512443669
4123	NC_021508	TGC	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443669
4124	NC_021508	CTG	2	6	200561	200566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443669
4125	NC_021508	GCC	2	6	200640	200645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443669
4126	NC_021508	GCG	2	6	200782	200787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443669
4127	NC_021508	TCCC	2	8	200827	200834	0 %	25 %	0 %	75 %	512443669
4128	NC_021508	CTC	2	6	200880	200885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443670
4129	NC_021508	GTT	2	6	200964	200969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443670
4130	NC_021508	CCT	2	6	201008	201013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443670
4131	NC_021508	CTGTG	2	10	201194	201203	0 %	40 %	40 %	20 %	512443670
4132	NC_021508	TTC	2	6	201240	201245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443670
4133	NC_021508	GC	3	6	201250	201255	0 %	0 %	50 %	50 %	512443670
4134	NC_021508	TCTG	2	8	201277	201284	0 %	50 %	25 %	25 %	512443670
4135	NC_021508	GC	3	6	201351	201356	0 %	0 %	50 %	50 %	512443670
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4139	NC_021508	GAAA	2	8	201555	201562	75 %	0 %	25 %	0 %	512443670
4140	NC_021508	CGT	2	6	201569	201574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443670
4141	NC_021508	TG	3	6	201588	201593	0 %	50 %	50 %	0 %	512443670
4142	NC_021508	GAG	2	6	201635	201640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443670
4143	NC_021508	AGC	2	6	201679	201684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443670
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4147	NC_021508	GC	4	8	201777	201784	0 %	0 %	50 %	50 %	512443671
4148	NC_021508	CTT	2	6	201796	201801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443671
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4150	NC_021508	ATCCG	2	10	201938	201947	20 %	20 %	20 %	40 %	512443671
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4152	NC_021508	AAAG	2	8	202043	202050	75 %	0 %	25 %	0 %	512443671
4153	NC_021508	CG	3	6	202057	202062	0 %	0 %	50 %	50 %	512443671
4154	NC_021508	A	6	6	202130	202135	100 %	0 %	0 %	0 %	512443671
4155	NC_021508	GGGA	2	8	202250	202257	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4156	NC_021508	GGCGC	2	10	202299	202308	0 %	0 %	60 %	40 %	512443672
4157	NC_021508	CGG	2	6	202315	202320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443672
4158	NC_021508	CTT	2	6	202353	202358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443672
4159	NC_021508	G	6	6	202490	202495	0 %	0 %	100 %	0 %	512443672
4160	NC_021508	GTG	2	6	202642	202647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443672
4161	NC_021508	AGTG	2	8	202734	202741	25 %	25 %	50 %	0 %	512443672
4162	NC_021508	ACG	2	6	202751	202756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443672
4163	NC_021508	GTA	2	6	202907	202912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443672
4164	NC_021508	GT	3	6	202974	202979	0 %	50 %	50 %	0 %	512443672
4165	NC_021508	GTGC	2	8	202996	203003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4166	NC_021508	TCT	2	6	203032	203037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443673
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4169	NC_021508	GCT	2	6	203166	203171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443673
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4171	NC_021508	TG	3	6	203366	203371	0 %	50 %	50 %	0 %	512443673
4172	NC_021508	TGA	2	6	203424	203429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443673
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4185	NC_021508	CTTT	2	8	203854	203861	0 %	75 %	0 %	25 %	512443673
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4201	NC_021508	CCG	2	6	204534	204539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443674
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4223	NC_021508	CT	3	6	205213	205218	0 %	50 %	0 %	50 %	512443674
4224	NC_021508	TGAA	2	8	205292	205299	50 %	25 %	25 %	0 %	512443674
4225	NC_021508	TCG	2	6	205310	205315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443674
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4228	NC_021508	A	6	6	205426	205431	100 %	0 %	0 %	0 %	512443674
4229	NC_021508	CA	3	6	205478	205483	50 %	0 %	0 %	50 %	512443674
4230	NC_021508	CT	3	6	205510	205515	0 %	50 %	0 %	50 %	512443674
4231	NC_021508	T	7	7	205542	205548	0 %	100 %	0 %	0 %	512443674
4232	NC_021508	TTTTA	2	10	205567	205576	20 %	80 %	0 %	0 %	512443674
4233	NC_021508	ACT	2	6	205579	205584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443674
4234	NC_021508	G	6	6	205714	205719	0 %	0 %	100 %	0 %	512443674
4235	NC_021508	TGT	2	6	205754	205759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443674
4236	NC_021508	GCG	2	6	205768	205773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4237	NC_021508	GT	3	6	205778	205783	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4238	NC_021508	GGTG	2	8	205801	205808	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4239	NC_021508	GA	3	6	205842	205847	50 %	0 %	50 %	0 %	512443675
4240	NC_021508	CG	4	8	205897	205904	0 %	0 %	50 %	50 %	512443675
4241	NC_021508	GGCG	2	8	205925	205932	0 %	0 %	75 %	25 %	512443675
4242	NC_021508	CTC	2	6	205993	205998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443675
4243	NC_021508	AAG	2	6	206007	206012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443675
4244	NC_021508	TGAT	2	8	206050	206057	25 %	50 %	25 %	0 %	512443675
4245	NC_021508	ATC	2	6	206058	206063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443675
4246	NC_021508	TGA	2	6	206080	206085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443675
4247	NC_021508	GT	4	8	206145	206152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4248	NC_021508	AGGT	2	8	206179	206186	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4249	NC_021508	TGGT	2	8	206189	206196	0 %	50 %	50 %	0 %	512443676
4250	NC_021508	CGGTGA	2	12	206255	206266	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512443676
4251	NC_021508	GTG	2	6	206284	206289	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443676
4252	NC_021508	GAA	2	6	206352	206357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443676
4253	NC_021508	CCG	2	6	206404	206409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443676
4254	NC_021508	TG	4	8	206505	206512	0 %	50 %	50 %	0 %	512443676
4255	NC_021508	CT	3	6	206513	206518	0 %	50 %	0 %	50 %	512443676
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4358	NC_021508	TACGC	2	10	212273	212282	20 %	20 %	20 %	40 %	512443689
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4372	NC_021508	GGCA	2	8	212771	212778	25 %	0 %	50 %	25 %	512443690
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4374	NC_021508	GTGG	2	8	212795	212802	0 %	25 %	75 %	0 %	512443690
4375	NC_021508	TCT	2	6	212894	212899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443691
4376	NC_021508	GGT	2	6	212902	212907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443691
4377	NC_021508	TTG	2	6	212988	212993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443691
4378	NC_021508	TGA	2	6	213001	213006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443691
4379	NC_021508	GC	4	8	213013	213020	0 %	0 %	50 %	50 %	512443691
4380	NC_021508	GTAA	2	8	213242	213249	50 %	25 %	25 %	0 %	512443691
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4383	NC_021508	GAC	3	9	213523	213531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443692
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4387	NC_021508	GTA	2	6	213843	213848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443693
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4390	NC_021508	CCTG	2	8	214065	214072	0 %	25 %	25 %	50 %	512443693
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4404	NC_021508	ACAG	2	8	214742	214749	50 %	0 %	25 %	25 %	512443695
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4434	NC_021508	TTA	2	6	216335	216340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4435	NC_021508	TAT	2	6	216351	216356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4436	NC_021508	TG	3	6	216367	216372	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4440	NC_021508	GTC	2	6	216617	216622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443697
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4443	NC_021508	AGG	2	6	216790	216795	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4444	NC_021508	AAG	2	6	216813	216818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443698
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4485	NC_021508	GGT	2	6	218999	219004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_021508	GCG	2	6	219098	219103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4488	NC_021508	A	6	6	219146	219151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4489	NC_021508	GAA	2	6	219155	219160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4490	NC_021508	GCG	3	9	219166	219174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443702
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