MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_021508	TGC	2	6	171819	171824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3502	NC_021508	TAG	2	6	171846	171851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443640
3503	NC_021508	ATTCC	2	10	171897	171906	20 %	40 %	0 %	40 %	512443640
3504	NC_021508	GCG	2	6	171932	171937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443640
3505	NC_021508	AGC	2	6	171960	171965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3506	NC_021508	GAGG	2	8	172038	172045	25 %	0 %	75 %	0 %	512443640
3507	NC_021508	CCG	2	6	172070	172075	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443640
3508	NC_021508	TTG	2	6	172109	172114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443640
3509	NC_021508	ATAAG	2	10	172115	172124	60 %	20 %	20 %	0 %	512443640
3510	NC_021508	T	7	7	172139	172145	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3511	NC_021508	A	7	7	172156	172162	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3512	NC_021508	GTT	2	6	172191	172196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443640
3513	NC_021508	A	7	7	172215	172221	100 %	0 %	0 %	0 %	512443640
3514	NC_021508	GCA	2	6	172286	172291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443640
3515	NC_021508	T	6	6	172321	172326	0 %	100 %	0 %	0 %	512443640
3516	NC_021508	CGC	2	6	172347	172352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443641
3517	NC_021508	CG	3	6	172482	172487	0 %	0 %	50 %	50 %	512443641
3518	NC_021508	TGG	2	6	172493	172498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443641
3519	NC_021508	ACGCA	2	10	172704	172713	40 %	0 %	20 %	40 %	512443641
3520	NC_021508	GA	3	6	172811	172816	50 %	0 %	50 %	0 %	512443641
3521	NC_021508	GAT	2	6	173030	173035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3522	NC_021508	ATG	2	6	173115	173120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3523	NC_021508	CAT	2	6	173225	173230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443642
3524	NC_021508	CATA	2	8	173266	173273	50 %	25 %	0 %	25 %	512443642
3525	NC_021508	TGG	2	6	173275	173280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443642
3526	NC_021508	AGAC	2	8	173292	173299	50 %	0 %	25 %	25 %	512443642
3527	NC_021508	A	6	6	173330	173335	100 %	0 %	0 %	0 %	512443642
3528	NC_021508	GA	3	6	173340	173345	50 %	0 %	50 %	0 %	512443642
3529	NC_021508	CAG	2	6	173354	173359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443642
3530	NC_021508	A	7	7	173365	173371	100 %	0 %	0 %	0 %	512443642
3531	NC_021508	AGT	2	6	173394	173399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443642
3532	NC_021508	CG	3	6	173465	173470	0 %	0 %	50 %	50 %	512443642
3533	NC_021508	TACT	2	8	173481	173488	25 %	50 %	0 %	25 %	512443642
3534	NC_021508	GC	3	6	173541	173546	0 %	0 %	50 %	50 %	512443643
3535	NC_021508	T	6	6	173622	173627	0 %	100 %	0 %	0 %	512443643
3536	NC_021508	A	7	7	173635	173641	100 %	0 %	0 %	0 %	512443643
3537	NC_021508	T	6	6	173710	173715	0 %	100 %	0 %	0 %	512443643
3538	NC_021508	CGTGA	2	10	173770	173779	20 %	20 %	40 %	20 %	512443643
3539	NC_021508	CTTGC	2	10	173795	173804	0 %	40 %	20 %	40 %	512443643
3540	NC_021508	GCG	2	6	173815	173820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443643
3541	NC_021508	TGA	2	6	173825	173830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443643
3542	NC_021508	CTTTT	2	10	173835	173844	0 %	80 %	0 %	20 %	512443643
3543	NC_021508	A	6	6	173845	173850	100 %	0 %	0 %	0 %	512443643
3544	NC_021508	GC	3	6	173859	173864	0 %	0 %	50 %	50 %	512443643
3545	NC_021508	TAG	2	6	173969	173974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443644
3546	NC_021508	AGT	2	6	174020	174025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443644
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3549	NC_021508	GC	3	6	174195	174200	0 %	0 %	50 %	50 %	512443644
3550	NC_021508	GTGTGC	2	12	174232	174243	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512443644
3551	NC_021508	A	8	8	174248	174255	100 %	0 %	0 %	0 %	512443644
3552	NC_021508	AC	3	6	174320	174325	50 %	0 %	0 %	50 %	512443644
3553	NC_021508	GCA	2	6	174329	174334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443644
3554	NC_021508	AC	3	6	174384	174389	50 %	0 %	0 %	50 %	512443644
3555	NC_021508	AGGG	2	8	174409	174416	25 %	0 %	75 %	0 %	512443644
3556	NC_021508	CAC	2	6	174449	174454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443644
3557	NC_021508	CGG	2	6	174462	174467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443644
3558	NC_021508	ACA	2	6	174521	174526	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443644
3559	NC_021508	GGGA	2	8	174545	174552	25 %	0 %	75 %	0 %	512443644
3560	NC_021508	GGA	3	9	174573	174581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443644
3561	NC_021508	CG	3	6	174636	174641	0 %	0 %	50 %	50 %	512443644
3562	NC_021508	A	6	6	174643	174648	100 %	0 %	0 %	0 %	512443644
3563	NC_021508	A	6	6	174680	174685	100 %	0 %	0 %	0 %	512443644
3564	NC_021508	TG	3	6	174690	174695	0 %	50 %	50 %	0 %	512443644
3565	NC_021508	GA	3	6	174730	174735	50 %	0 %	50 %	0 %	512443644
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3567	NC_021508	A	6	6	174816	174821	100 %	0 %	0 %	0 %	512443644
3568	NC_021508	ACG	2	6	174848	174853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443644
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3570	NC_021508	TGT	2	6	174888	174893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443644
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3572	NC_021508	TG	3	6	174990	174995	0 %	50 %	50 %	0 %	512443645
3573	NC_021508	GGC	2	6	175094	175099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443645
3574	NC_021508	TGG	2	6	175116	175121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443645
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3576	NC_021508	GC	4	8	175214	175221	0 %	0 %	50 %	50 %	512443645
3577	NC_021508	CAC	2	6	175225	175230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443645
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3579	NC_021508	TGA	3	9	175354	175362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443645
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3582	NC_021508	G	6	6	175414	175419	0 %	0 %	100 %	0 %	512443645
3583	NC_021508	CG	4	8	175428	175435	0 %	0 %	50 %	50 %	512443645
3584	NC_021508	CTGA	2	8	175496	175503	25 %	25 %	25 %	25 %	512443645
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3591	NC_021508	CGT	3	9	175789	175797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443645
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3593	NC_021508	GC	3	6	175884	175889	0 %	0 %	50 %	50 %	512443645
3594	NC_021508	CTTCT	2	10	175917	175926	0 %	60 %	0 %	40 %	512443645
3595	NC_021508	CGTG	2	8	175963	175970	0 %	25 %	50 %	25 %	512443645
3596	NC_021508	ACT	2	6	176019	176024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443645
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3598	NC_021508	GTGCT	2	10	176061	176070	0 %	40 %	40 %	20 %	512443645
3599	NC_021508	TTGG	2	8	176083	176090	0 %	50 %	50 %	0 %	512443645
3600	NC_021508	GC	3	6	176136	176141	0 %	0 %	50 %	50 %	512443645
3601	NC_021508	GAC	2	6	176183	176188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443645
3602	NC_021508	AGC	2	6	176213	176218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443645
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3604	NC_021508	CGG	2	6	176287	176292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443645
3605	NC_021508	GAACG	2	10	176315	176324	40 %	0 %	40 %	20 %	512443645
3606	NC_021508	GC	5	10	176326	176335	0 %	0 %	50 %	50 %	512443645
3607	NC_021508	A	6	6	176340	176345	100 %	0 %	0 %	0 %	512443645
3608	NC_021508	C	6	6	176351	176356	0 %	0 %	0 %	100 %	512443645
3609	NC_021508	TGG	2	6	176376	176381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443645
3610	NC_021508	AC	3	6	176480	176485	50 %	0 %	0 %	50 %	512443645
3611	NC_021508	GA	3	6	176486	176491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_021508	TG	3	6	176517	176522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3613	NC_021508	CCG	2	6	176530	176535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3614	NC_021508	TGCA	2	8	176539	176546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3615	NC_021508	TC	3	6	176650	176655	0 %	50 %	0 %	50 %	512443646
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3622	NC_021508	AG	3	6	176990	176995	50 %	0 %	50 %	0 %	512443646
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3625	NC_021508	TG	3	6	177099	177104	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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