MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021508	GTTC	2	8	124292	124299	0 %	50 %	25 %	25 %	512443603
2502	NC_021508	T	7	7	124324	124330	0 %	100 %	0 %	0 %	512443603
2503	NC_021508	GCG	2	6	124347	124352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443603
2504	NC_021508	CGCAG	2	10	124397	124406	20 %	0 %	40 %	40 %	512443603
2505	NC_021508	AGCAC	2	10	124433	124442	40 %	0 %	20 %	40 %	512443603
2506	NC_021508	TG	3	6	124447	124452	0 %	50 %	50 %	0 %	512443603
2507	NC_021508	GC	3	6	124501	124506	0 %	0 %	50 %	50 %	512443603
2508	NC_021508	ATA	2	6	124519	124524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443603
2509	NC_021508	CACG	2	8	124536	124543	25 %	0 %	25 %	50 %	512443603
2510	NC_021508	TTG	2	6	124549	124554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443603
2511	NC_021508	T	6	6	124565	124570	0 %	100 %	0 %	0 %	512443603
2512	NC_021508	GCA	2	6	124595	124600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443603
2513	NC_021508	GC	4	8	124605	124612	0 %	0 %	50 %	50 %	512443603
2514	NC_021508	TCC	2	6	124666	124671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_021508	GC	3	6	124687	124692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_021508	ACTG	2	8	124707	124714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_021508	TG	3	6	124753	124758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021508	GCT	2	6	124788	124793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_021508	TGAG	2	8	124850	124857	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021508	CCTC	2	8	124904	124911	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2521	NC_021508	TG	4	8	124949	124956	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021508	TCC	2	6	124967	124972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_021508	AGA	2	6	125032	125037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021508	GAG	2	6	125085	125090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021508	TCTCAA	2	12	125130	125141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_021508	GT	3	6	125175	125180	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_021508	GAAC	2	8	125214	125221	50 %	0 %	25 %	25 %	512443604
2528	NC_021508	TGG	2	6	125243	125248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443604
2529	NC_021508	GC	3	6	125352	125357	0 %	0 %	50 %	50 %	512443604
2530	NC_021508	AG	3	6	125377	125382	50 %	0 %	50 %	0 %	512443604
2531	NC_021508	GGCG	2	8	125391	125398	0 %	0 %	75 %	25 %	512443604
2532	NC_021508	T	8	8	125404	125411	0 %	100 %	0 %	0 %	512443604
2533	NC_021508	T	6	6	125437	125442	0 %	100 %	0 %	0 %	512443604
2534	NC_021508	TCG	2	6	125449	125454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2535	NC_021508	A	6	6	125540	125545	100 %	0 %	0 %	0 %	512443604
2536	NC_021508	T	6	6	125558	125563	0 %	100 %	0 %	0 %	512443604
2537	NC_021508	T	6	6	125599	125604	0 %	100 %	0 %	0 %	512443604
2538	NC_021508	CCT	2	6	125649	125654	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443604
2539	NC_021508	AGC	2	6	125687	125692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2540	NC_021508	TGC	2	6	125715	125720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2541	NC_021508	TGCG	2	8	125747	125754	0 %	25 %	50 %	25 %	512443604
2542	NC_021508	CCT	2	6	125757	125762	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443604
2543	NC_021508	GGC	2	6	125823	125828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443604
2544	NC_021508	GC	4	8	125827	125834	0 %	0 %	50 %	50 %	512443604
2545	NC_021508	T	6	6	125852	125857	0 %	100 %	0 %	0 %	512443604
2546	NC_021508	CTG	2	6	125881	125886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2547	NC_021508	GT	3	6	125917	125922	0 %	50 %	50 %	0 %	512443604
2548	NC_021508	GT	3	6	125961	125966	0 %	50 %	50 %	0 %	512443604
2549	NC_021508	AGCA	2	8	125977	125984	50 %	0 %	25 %	25 %	512443604
2550	NC_021508	GCT	2	6	126070	126075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2551	NC_021508	AGG	2	6	126086	126091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443604
2552	NC_021508	GTT	2	6	126106	126111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443604
2553	NC_021508	GGT	2	6	126199	126204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443604
2554	NC_021508	A	6	6	126238	126243	100 %	0 %	0 %	0 %	512443604
2555	NC_021508	TCT	2	6	126315	126320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443604
2556	NC_021508	GA	3	6	126392	126397	50 %	0 %	50 %	0 %	512443604
2557	NC_021508	A	6	6	126414	126419	100 %	0 %	0 %	0 %	512443604
2558	NC_021508	GC	3	6	126439	126444	0 %	0 %	50 %	50 %	512443604
2559	NC_021508	CCG	2	6	126454	126459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443604
2560	NC_021508	TCG	2	6	126492	126497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443604
2561	NC_021508	CA	3	6	126628	126633	50 %	0 %	0 %	50 %	512443604
2562	NC_021508	CTTG	2	8	126699	126706	0 %	50 %	25 %	25 %	512443604
2563	NC_021508	CATTG	2	10	126727	126736	20 %	40 %	20 %	20 %	512443604
2564	NC_021508	TAG	2	6	126887	126892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443604
2565	NC_021508	GTG	2	6	126976	126981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021508	GCA	2	6	126986	126991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443605
2567	NC_021508	CAG	2	6	127002	127007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443605
2568	NC_021508	G	6	6	127063	127068	0 %	0 %	100 %	0 %	512443605
2569	NC_021508	CCGTG	2	10	127088	127097	0 %	20 %	40 %	40 %	512443605
2570	NC_021508	TCG	2	6	127136	127141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443605
2571	NC_021508	GC	3	6	127190	127195	0 %	0 %	50 %	50 %	512443605
2572	NC_021508	T	6	6	127276	127281	0 %	100 %	0 %	0 %	512443605
2573	NC_021508	GAT	2	6	127338	127343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443605
2574	NC_021508	T	8	8	127349	127356	0 %	100 %	0 %	0 %	512443605
2575	NC_021508	TG	3	6	127384	127389	0 %	50 %	50 %	0 %	512443605
2576	NC_021508	GTA	2	6	127390	127395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443605
2577	NC_021508	A	6	6	127414	127419	100 %	0 %	0 %	0 %	512443605
2578	NC_021508	TTTTAA	2	12	127472	127483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443605
2579	NC_021508	CTA	2	6	127557	127562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443605
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2581	NC_021508	TG	3	6	127600	127605	0 %	50 %	50 %	0 %	512443605
2582	NC_021508	GAC	2	6	127631	127636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443605
2583	NC_021508	TG	3	6	127659	127664	0 %	50 %	50 %	0 %	512443605
2584	NC_021508	CTC	2	6	127701	127706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443605
2585	NC_021508	GT	4	8	127736	127743	0 %	50 %	50 %	0 %	512443605
2586	NC_021508	TGCA	2	8	127872	127879	25 %	25 %	25 %	25 %	512443605
2587	NC_021508	A	7	7	127894	127900	100 %	0 %	0 %	0 %	512443605
2588	NC_021508	GCAT	2	8	127914	127921	25 %	25 %	25 %	25 %	512443605
2589	NC_021508	ACG	2	6	127924	127929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443605
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2591	NC_021508	GAA	2	6	128184	128189	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443605
2592	NC_021508	CCGA	2	8	128308	128315	25 %	0 %	25 %	50 %	512443605
2593	NC_021508	TTC	3	9	128399	128407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443605
2594	NC_021508	TAT	2	6	128471	128476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443606
2595	NC_021508	CTT	2	6	128516	128521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443606
2596	NC_021508	T	6	6	128583	128588	0 %	100 %	0 %	0 %	512443606
2597	NC_021508	GT	3	6	128675	128680	0 %	50 %	50 %	0 %	512443606
2598	NC_021508	TCA	2	6	128791	128796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443606
2599	NC_021508	AACCA	2	10	128812	128821	60 %	0 %	0 %	40 %	512443606
2600	NC_021508	CTT	2	6	128857	128862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443606
2601	NC_021508	CGA	2	6	129007	129012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443606
2602	NC_021508	A	7	7	129019	129025	100 %	0 %	0 %	0 %	512443606
2603	NC_021508	GCG	2	6	129031	129036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443606
2604	NC_021508	T	8	8	129059	129066	0 %	100 %	0 %	0 %	512443606
2605	NC_021508	GAA	2	6	129138	129143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443606
2606	NC_021508	CTT	2	6	129187	129192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443606
2607	NC_021508	CGA	2	6	129231	129236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443606
2608	NC_021508	AAG	2	6	129248	129253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443606
2609	NC_021508	TAA	2	6	129320	129325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443606
2610	NC_021508	TCA	2	6	129405	129410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443606
2611	NC_021508	AAAAG	2	10	129463	129472	80 %	0 %	20 %	0 %	512443606
2612	NC_021508	CG	3	6	129528	129533	0 %	0 %	50 %	50 %	512443606
2613	NC_021508	GCA	2	6	129543	129548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443606
2614	NC_021508	CAG	2	6	129555	129560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443606
2615	NC_021508	T	6	6	129571	129576	0 %	100 %	0 %	0 %	512443606
2616	NC_021508	A	6	6	129610	129615	100 %	0 %	0 %	0 %	512443606
2617	NC_021508	TG	4	8	129618	129625	0 %	50 %	50 %	0 %	512443606
2618	NC_021508	CTT	2	6	129655	129660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443606
2619	NC_021508	CG	3	6	129670	129675	0 %	0 %	50 %	50 %	512443606
2620	NC_021508	GCG	2	6	129711	129716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443606
2621	NC_021508	AGT	2	6	129738	129743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443606
2622	NC_021508	CAT	2	6	129758	129763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443606
2623	NC_021508	CCT	2	6	129765	129770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_021508	TGAG	2	8	129783	129790	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_021508	TG	3	6	129818	129823	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2627	NC_021508	GTG	2	6	129938	129943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443607
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2748	NC_021508	CTC	2	6	136717	136722	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2749	NC_021508	C	8	8	136737	136744	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2750	NC_021508	AGA	2	6	136753	136758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_021508	AC	3	6	136787	136792	50 %	0 %	0 %	50 %	512443612
2752	NC_021508	GACA	2	8	136809	136816	50 %	0 %	25 %	25 %	512443612
2753	NC_021508	AG	3	6	136827	136832	50 %	0 %	50 %	0 %	512443612
2754	NC_021508	CCT	2	6	136880	136885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443612
2755	NC_021508	CTG	2	6	136935	136940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443612
2756	NC_021508	ATC	2	6	136951	136956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443612
2757	NC_021508	CA	3	6	137014	137019	50 %	0 %	0 %	50 %	512443612
2758	NC_021508	GCT	2	6	137021	137026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443612
2759	NC_021508	CTGA	2	8	137027	137034	25 %	25 %	25 %	25 %	512443612
2760	NC_021508	GTCTT	2	10	137144	137153	0 %	60 %	20 %	20 %	512443612
2761	NC_021508	AGG	2	6	137163	137168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443612
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2763	NC_021508	AAC	2	6	137195	137200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443612
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2769	NC_021508	GC	3	6	137322	137327	0 %	0 %	50 %	50 %	512443612
2770	NC_021508	CTT	2	6	137336	137341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443612
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2786	NC_021508	AGC	2	6	138376	138381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443613
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2794	NC_021508	GCT	2	6	138716	138721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443613
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2825	NC_021508	GCA	2	6	139673	139678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2827	NC_021508	GCAT	2	8	139709	139716	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2828	NC_021508	TGA	2	6	139802	139807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443615
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2840	NC_021508	GGT	2	6	140915	140920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2841	NC_021508	CCG	2	6	140943	140948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2842	NC_021508	C	11	11	140949	140959	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2843	NC_021508	CG	3	6	140979	140984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2844	NC_021508	CT	3	6	141024	141029	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2845	NC_021508	GCT	2	6	141112	141117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443616
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2849	NC_021508	AGT	2	6	141463	141468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443616
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2851	NC_021508	CTG	2	6	141544	141549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443616
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2855	NC_021508	CAAT	2	8	141807	141814	50 %	25 %	0 %	25 %	512443616
2856	NC_021508	CAC	2	6	141849	141854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443616
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2859	NC_021508	TCCA	2	8	142048	142055	25 %	25 %	0 %	50 %	512443616
2860	NC_021508	ATC	2	6	142068	142073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443616
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2863	NC_021508	ACCAA	2	10	142270	142279	60 %	0 %	0 %	40 %	512443616
2864	NC_021508	GA	3	6	142297	142302	50 %	0 %	50 %	0 %	512443616
2865	NC_021508	ATG	2	6	142446	142451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443616
2866	NC_021508	ACG	2	6	142464	142469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443616
2867	NC_021508	T	6	6	142593	142598	0 %	100 %	0 %	0 %	512443616
2868	NC_021508	CAT	2	6	142636	142641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443616
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2870	NC_021508	CG	3	6	142678	142683	0 %	0 %	50 %	50 %	512443616
2871	NC_021508	T	7	7	142727	142733	0 %	100 %	0 %	0 %	512443616
2872	NC_021508	AGCCA	2	10	142742	142751	40 %	0 %	20 %	40 %	512443616
2873	NC_021508	CCA	2	6	142756	142761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443616
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