MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021508	AGGA	2	8	100521	100528	50 %	0 %	50 %	0 %	512443585
2002	NC_021508	GCG	2	6	100535	100540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443585
2003	NC_021508	CG	5	10	100539	100548	0 %	0 %	50 %	50 %	512443585
2004	NC_021508	GTA	2	6	100605	100610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443585
2005	NC_021508	GC	3	6	100852	100857	0 %	0 %	50 %	50 %	512443585
2006	NC_021508	GGT	2	6	100882	100887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443585
2007	NC_021508	GTC	2	6	100888	100893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443585
2008	NC_021508	TTC	2	6	100936	100941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443585
2009	NC_021508	CAGC	2	8	100961	100968	25 %	0 %	25 %	50 %	512443585
2010	NC_021508	CTT	2	6	100978	100983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443585
2011	NC_021508	TTG	2	6	100985	100990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443585
2012	NC_021508	CGCA	2	8	101003	101010	25 %	0 %	25 %	50 %	512443585
2013	NC_021508	GCC	2	6	101048	101053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443585
2014	NC_021508	GCG	2	6	101068	101073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443585
2015	NC_021508	GCT	2	6	101093	101098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443585
2016	NC_021508	GT	3	6	101153	101158	0 %	50 %	50 %	0 %	512443585
2017	NC_021508	CG	3	6	101163	101168	0 %	0 %	50 %	50 %	512443585
2018	NC_021508	GCT	2	6	101182	101187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443585
2019	NC_021508	TGC	2	6	101203	101208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443585
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2022	NC_021508	TG	3	6	101289	101294	0 %	50 %	50 %	0 %	512443585
2023	NC_021508	ATA	2	6	101336	101341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443585
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2028	NC_021508	GAT	2	6	101613	101618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_021508	AGC	2	6	101641	101646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443586
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2031	NC_021508	GAG	2	6	101688	101693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443586
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2034	NC_021508	CGT	2	6	101826	101831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443586
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2036	NC_021508	TG	3	6	101873	101878	0 %	50 %	50 %	0 %	512443586
2037	NC_021508	GC	3	6	101933	101938	0 %	0 %	50 %	50 %	512443586
2038	NC_021508	GC	3	6	102069	102074	0 %	0 %	50 %	50 %	512443586
2039	NC_021508	GA	3	6	102097	102102	50 %	0 %	50 %	0 %	512443586
2040	NC_021508	TGC	2	6	102126	102131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443587
2041	NC_021508	GC	3	6	102185	102190	0 %	0 %	50 %	50 %	512443587
2042	NC_021508	CA	3	6	102204	102209	50 %	0 %	0 %	50 %	512443587
2043	NC_021508	GT	3	6	102219	102224	0 %	50 %	50 %	0 %	512443587
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2047	NC_021508	TCCTC	2	10	102364	102373	0 %	40 %	0 %	60 %	512443587
2048	NC_021508	CTG	2	6	102377	102382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443587
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2052	NC_021508	TGC	2	6	102593	102598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443587
2053	NC_021508	GTA	2	6	102767	102772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_021508	AAT	2	6	102775	102780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_021508	CG	3	6	102786	102791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_021508	TTGA	2	8	102850	102857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021508	GCG	2	6	102914	102919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443588
2058	NC_021508	AGC	2	6	102964	102969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443588
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2062	NC_021508	GCT	2	6	103218	103223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443588
2063	NC_021508	ATG	2	6	103224	103229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443588
2064	NC_021508	CG	4	8	103280	103287	0 %	0 %	50 %	50 %	512443588
2065	NC_021508	TTC	2	6	103288	103293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443588
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2089	NC_021508	CG	3	6	104220	104225	0 %	0 %	50 %	50 %	512443589
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2091	NC_021508	G	7	7	104275	104281	0 %	0 %	100 %	0 %	512443589
2092	NC_021508	CT	3	6	104326	104331	0 %	50 %	0 %	50 %	512443589
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2095	NC_021508	AGCA	2	8	104403	104410	50 %	0 %	25 %	25 %	512443589
2096	NC_021508	GCA	2	6	104479	104484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443589
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2107	NC_021508	GCGT	2	8	105290	105297	0 %	25 %	50 %	25 %	512443589
2108	NC_021508	CGA	2	6	105328	105333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443589
2109	NC_021508	CG	5	10	105334	105343	0 %	0 %	50 %	50 %	512443589
2110	NC_021508	GA	3	6	105419	105424	50 %	0 %	50 %	0 %	512443589
2111	NC_021508	GGT	2	6	105432	105437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443589
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2114	NC_021508	CAGG	2	8	105535	105542	25 %	0 %	50 %	25 %	512443589
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2118	NC_021508	AC	3	6	105724	105729	50 %	0 %	0 %	50 %	512443589
2119	NC_021508	CG	3	6	105761	105766	0 %	0 %	50 %	50 %	512443589
2120	NC_021508	AGCG	2	8	105796	105803	25 %	0 %	50 %	25 %	512443589
2121	NC_021508	GC	3	6	105854	105859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_021508	TTC	2	6	105860	105865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_021508	CGC	2	6	105931	105936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443590
2124	NC_021508	CG	3	6	105946	105951	0 %	0 %	50 %	50 %	512443590
2125	NC_021508	GC	3	6	105988	105993	0 %	0 %	50 %	50 %	512443590
2126	NC_021508	CGC	2	6	106016	106021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443590
2127	NC_021508	TGT	2	6	106078	106083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443590
2128	NC_021508	TCA	2	6	106135	106140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443590
2129	NC_021508	TTG	2	6	106201	106206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443590
2130	NC_021508	AGCG	2	8	106225	106232	25 %	0 %	50 %	25 %	512443590
2131	NC_021508	CTA	2	6	106241	106246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443590
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2134	NC_021508	CTG	2	6	106359	106364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2138	NC_021508	GA	3	6	106687	106692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_021508	TGCT	2	8	106695	106702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2140	NC_021508	AGC	2	6	106710	106715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2143	NC_021508	CAGG	2	8	106778	106785	25 %	0 %	50 %	25 %	512443592
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2152	NC_021508	CG	3	6	107022	107027	0 %	0 %	50 %	50 %	512443592
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2154	NC_021508	TG	4	8	107050	107057	0 %	50 %	50 %	0 %	512443592
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2166	NC_021508	AGG	3	9	107550	107558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443593
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2230	NC_021508	A	6	6	110628	110633	100 %	0 %	0 %	0 %	512443596
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2238	NC_021508	ATC	2	6	111030	111035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443596
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2241	NC_021508	AAT	2	6	111223	111228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443596
2242	NC_021508	TGC	2	6	111372	111377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443596
2243	NC_021508	TCA	2	6	111406	111411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443596
2244	NC_021508	TTC	2	6	111424	111429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443596
2245	NC_021508	GC	3	6	111624	111629	0 %	0 %	50 %	50 %	512443596
2246	NC_021508	CG	3	6	111638	111643	0 %	0 %	50 %	50 %	512443596
2247	NC_021508	AG	3	6	111726	111731	50 %	0 %	50 %	0 %	512443596
2248	NC_021508	A	6	6	111764	111769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_021508	GATG	2	8	111825	111832	25 %	25 %	50 %	0 %	512443597
2250	NC_021508	GCG	2	6	112006	112011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443597
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2252	NC_021508	TCG	2	6	112112	112117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443597
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2254	NC_021508	GTG	2	6	112171	112176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443597
2255	NC_021508	GTG	2	6	112249	112254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443597
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2376	NC_021508	TGT	2	6	117679	117684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443599
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2464	NC_021508	CAG	2	6	121870	121875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443601
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2467	NC_021508	GA	3	6	121987	121992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_021508	A	6	6	122150	122155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2469	NC_021508	CGCC	2	8	122191	122198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2470	NC_021508	A	6	6	122210	122215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2471	NC_021508	C	9	9	122230	122238	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2472	NC_021508	CA	3	6	122252	122257	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2473	NC_021508	GAG	2	6	122263	122268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2474	NC_021508	ATA	2	6	122289	122294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443602
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2479	NC_021508	TCTTT	2	10	122593	122602	0 %	80 %	0 %	20 %	512443602
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2484	NC_021508	C	7	7	123124	123130	0 %	0 %	0 %	100 %	512443602
2485	NC_021508	CGA	2	6	123172	123177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443602
2486	NC_021508	C	6	6	123194	123199	0 %	0 %	0 %	100 %	512443602
2487	NC_021508	CG	3	6	123202	123207	0 %	0 %	50 %	50 %	512443602
2488	NC_021508	AGC	2	6	123216	123221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443602
2489	NC_021508	ACC	2	6	123224	123229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443602
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2492	NC_021508	TCC	2	6	123675	123680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2493	NC_021508	CTG	2	6	123817	123822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443603
2494	NC_021508	GTGC	2	8	123919	123926	0 %	25 %	50 %	25 %	512443603
2495	NC_021508	GCA	2	6	123927	123932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443603
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2497	NC_021508	CCT	2	6	124142	124147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443603
2498	NC_021508	ATG	2	6	124153	124158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443603
2499	NC_021508	GCGT	2	8	124259	124266	0 %	25 %	50 %	25 %	512443603
2500	NC_021508	AAC	2	6	124286	124291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443603

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