MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021508	GTCA	2	8	76435	76442	25 %	25 %	25 %	25 %	512443565
1502	NC_021508	TCG	2	6	76451	76456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1503	NC_021508	AT	3	6	76470	76475	50 %	50 %	0 %	0 %	512443565
1504	NC_021508	TCA	2	6	76505	76510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443565
1505	NC_021508	AAG	2	6	76513	76518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443565
1506	NC_021508	CGT	2	6	76535	76540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1507	NC_021508	C	6	6	76559	76564	0 %	0 %	0 %	100 %	512443565
1508	NC_021508	GC	3	6	76590	76595	0 %	0 %	50 %	50 %	512443565
1509	NC_021508	GAAAA	2	10	76669	76678	80 %	0 %	20 %	0 %	512443565
1510	NC_021508	ACGT	2	8	76686	76693	25 %	25 %	25 %	25 %	512443565
1511	NC_021508	TTA	2	6	76775	76780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443565
1512	NC_021508	CGA	2	6	76781	76786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1513	NC_021508	CAT	2	6	76882	76887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443565
1514	NC_021508	AAT	2	6	76918	76923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443565
1515	NC_021508	CA	3	6	76941	76946	50 %	0 %	0 %	50 %	512443565
1516	NC_021508	T	6	6	76981	76986	0 %	100 %	0 %	0 %	512443565
1517	NC_021508	AAG	2	6	77002	77007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443565
1518	NC_021508	T	9	9	77013	77021	0 %	100 %	0 %	0 %	512443565
1519	NC_021508	CTC	2	6	77116	77121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443565
1520	NC_021508	GCG	2	6	77128	77133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1521	NC_021508	TCC	2	6	77145	77150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443565
1522	NC_021508	GCA	2	6	77180	77185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1523	NC_021508	CTTT	2	8	77252	77259	0 %	75 %	0 %	25 %	512443565
1524	NC_021508	GA	3	6	77263	77268	50 %	0 %	50 %	0 %	512443565
1525	NC_021508	GGC	2	6	77349	77354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1526	NC_021508	TGC	2	6	77356	77361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1527	NC_021508	CCA	2	6	77367	77372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443565
1528	NC_021508	TGC	2	6	77431	77436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1529	NC_021508	TCC	2	6	77516	77521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443565
1530	NC_021508	GCG	2	6	77554	77559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1531	NC_021508	AT	3	6	77582	77587	50 %	50 %	0 %	0 %	512443565
1532	NC_021508	CG	3	6	77634	77639	0 %	0 %	50 %	50 %	512443565
1533	NC_021508	GT	3	6	77705	77710	0 %	50 %	50 %	0 %	512443565
1534	NC_021508	TCA	2	6	77714	77719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443565
1535	NC_021508	AATAA	2	10	77723	77732	80 %	20 %	0 %	0 %	512443565
1536	NC_021508	TTC	2	6	77779	77784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443565
1537	NC_021508	T	6	6	77951	77956	0 %	100 %	0 %	0 %	512443565
1538	NC_021508	ACG	2	6	77959	77964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1539	NC_021508	TCA	2	6	77996	78001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443565
1540	NC_021508	T	6	6	78021	78026	0 %	100 %	0 %	0 %	512443565
1541	NC_021508	GTA	2	6	78041	78046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443565
1542	NC_021508	TGC	2	6	78111	78116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443565
1543	NC_021508	GGC	2	6	78133	78138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1544	NC_021508	GGC	2	6	78313	78318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1545	NC_021508	GCG	2	6	78340	78345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443565
1546	NC_021508	T	6	6	78393	78398	0 %	100 %	0 %	0 %	512443565
1547	NC_021508	GA	3	6	78408	78413	50 %	0 %	50 %	0 %	512443565
1548	NC_021508	TCC	2	6	78455	78460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443565
1549	NC_021508	GCTT	2	8	78517	78524	0 %	50 %	25 %	25 %	512443565
1550	NC_021508	CTGT	2	8	78536	78543	0 %	50 %	25 %	25 %	512443565
1551	NC_021508	T	6	6	78576	78581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_021508	T	6	6	78597	78602	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_021508	AGT	2	6	78628	78633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_021508	A	6	6	78757	78762	100 %	0 %	0 %	0 %	512443566
1555	NC_021508	GAA	2	6	78869	78874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443566
1556	NC_021508	T	6	6	78884	78889	0 %	100 %	0 %	0 %	512443566
1557	NC_021508	TGA	2	6	78917	78922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443566
1558	NC_021508	GAA	2	6	78926	78931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443566
1559	NC_021508	ACG	2	6	78967	78972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443566
1560	NC_021508	GT	3	6	79040	79045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_021508	GTC	2	6	79059	79064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_021508	GCT	2	6	79119	79124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1563	NC_021508	GCT	2	6	79151	79156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1564	NC_021508	GAA	2	6	79173	79178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443567
1565	NC_021508	GAG	2	6	79182	79187	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443567
1566	NC_021508	GCGCC	2	10	79358	79367	0 %	0 %	40 %	60 %	512443567
1567	NC_021508	ATG	2	6	79393	79398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443567
1568	NC_021508	TGA	2	6	79451	79456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443567
1569	NC_021508	AGG	2	6	79504	79509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443567
1570	NC_021508	GCT	2	6	79604	79609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1571	NC_021508	TCG	2	6	79618	79623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1572	NC_021508	GCA	2	6	79631	79636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1573	NC_021508	ACA	2	6	79658	79663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443567
1574	NC_021508	AAC	2	6	79715	79720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443567
1575	NC_021508	GC	3	6	79737	79742	0 %	0 %	50 %	50 %	512443567
1576	NC_021508	AGT	2	6	79852	79857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443567
1577	NC_021508	GTC	2	6	79878	79883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443567
1578	NC_021508	TGAGCA	2	12	80021	80032	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	512443567
1579	NC_021508	GGCC	2	8	80051	80058	0 %	0 %	50 %	50 %	512443567
1580	NC_021508	GC	3	6	80112	80117	0 %	0 %	50 %	50 %	512443567
1581	NC_021508	TGT	2	6	80239	80244	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443567
1582	NC_021508	TGAT	2	8	80260	80267	25 %	50 %	25 %	0 %	512443567
1583	NC_021508	TTC	2	6	80280	80285	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443567
1584	NC_021508	AAT	2	6	80414	80419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443567
1585	NC_021508	GGT	2	6	80505	80510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443567
1586	NC_021508	T	6	6	80549	80554	0 %	100 %	0 %	0 %	512443567
1587	NC_021508	CAA	2	6	80561	80566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443567
1588	NC_021508	CA	3	6	80579	80584	50 %	0 %	0 %	50 %	512443567
1589	NC_021508	ACA	2	6	80617	80622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443567
1590	NC_021508	CG	3	6	80623	80628	0 %	0 %	50 %	50 %	512443567
1591	NC_021508	TTG	2	6	80686	80691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_021508	GC	3	6	80799	80804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_021508	GCGT	2	8	80860	80867	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1594	NC_021508	TGGTG	2	10	80872	80881	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_021508	GTT	2	6	80961	80966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443568
1596	NC_021508	GTG	2	6	80972	80977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443568
1597	NC_021508	TGC	2	6	80992	80997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1598	NC_021508	TGT	2	6	81002	81007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443568
1599	NC_021508	CGTGT	2	10	81014	81023	0 %	40 %	40 %	20 %	512443568
1600	NC_021508	CTT	2	6	81032	81037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443568
1601	NC_021508	GGC	2	6	81098	81103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443568
1602	NC_021508	GT	3	6	81127	81132	0 %	50 %	50 %	0 %	512443568
1603	NC_021508	CTT	2	6	81146	81151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443568
1604	NC_021508	GC	3	6	81229	81234	0 %	0 %	50 %	50 %	512443568
1605	NC_021508	GTG	2	6	81272	81277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443568
1606	NC_021508	CG	3	6	81326	81331	0 %	0 %	50 %	50 %	512443568
1607	NC_021508	T	6	6	81355	81360	0 %	100 %	0 %	0 %	512443568
1608	NC_021508	ATG	2	6	81569	81574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443568
1609	NC_021508	CG	3	6	81607	81612	0 %	0 %	50 %	50 %	512443568
1610	NC_021508	CAG	2	6	81649	81654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1611	NC_021508	TAC	2	6	81671	81676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443568
1612	NC_021508	CGC	2	6	81678	81683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443568
1613	NC_021508	GTGC	2	8	81955	81962	0 %	25 %	50 %	25 %	512443568
1614	NC_021508	GGC	2	6	81973	81978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443568
1615	NC_021508	CA	3	6	81995	82000	50 %	0 %	0 %	50 %	512443568
1616	NC_021508	TGC	2	6	82005	82010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1617	NC_021508	AGC	2	6	82017	82022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1618	NC_021508	GTG	2	6	82069	82074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443568
1619	NC_021508	G	6	6	82208	82213	0 %	0 %	100 %	0 %	512443568
1620	NC_021508	GTGA	2	8	82261	82268	25 %	25 %	50 %	0 %	512443568
1621	NC_021508	TGC	2	6	82295	82300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1622	NC_021508	CGT	2	6	82306	82311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1623	NC_021508	CGT	2	6	82318	82323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443568
1624	NC_021508	CGCA	2	8	82328	82335	25 %	0 %	25 %	50 %	512443568
1625	NC_021508	TCT	3	9	82357	82365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1626	NC_021508	AG	3	6	82373	82378	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_021508	T	7	7	82588	82594	0 %	100 %	0 %	0 %	512443569
1628	NC_021508	ACG	2	6	82694	82699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443569
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1663	NC_021508	GCA	2	6	84253	84258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1744	NC_021508	ATGG	2	8	88073	88080	25 %	25 %	50 %	0 %	512443573
1745	NC_021508	AT	3	6	88142	88147	50 %	50 %	0 %	0 %	512443573
1746	NC_021508	TG	3	6	88223	88228	0 %	50 %	50 %	0 %	512443573
1747	NC_021508	AGGA	2	8	88229	88236	50 %	0 %	50 %	0 %	512443573
1748	NC_021508	TCG	2	6	88242	88247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443573
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1751	NC_021508	GGA	2	6	88494	88499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443573
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1753	NC_021508	AGT	2	6	88516	88521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443573
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1997	NC_021508	ACTGC	2	10	100331	100340	20 %	20 %	20 %	40 %	512443585
1998	NC_021508	CG	3	6	100420	100425	0 %	0 %	50 %	50 %	512443585
1999	NC_021508	AGG	2	6	100444	100449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443585
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