MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021508	TGT	2	6	25322	25327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443517
502	NC_021508	GCT	2	6	25355	25360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443517
503	NC_021508	T	9	9	25366	25374	0 %	100 %	0 %	0 %	512443517
504	NC_021508	AGA	2	6	25420	25425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443518
505	NC_021508	ACA	2	6	25628	25633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443518
506	NC_021508	T	6	6	25661	25666	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
507	NC_021508	TTA	2	6	25682	25687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443518
508	NC_021508	AG	3	6	25788	25793	50 %	0 %	50 %	0 %	512443518
509	NC_021508	GGA	2	6	25798	25803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443518
510	NC_021508	GATT	2	8	25857	25864	25 %	50 %	25 %	0 %	512443518
511	NC_021508	CTT	2	6	25908	25913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443518
512	NC_021508	T	6	6	25912	25917	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
513	NC_021508	AGCG	2	8	25995	26002	25 %	0 %	50 %	25 %	512443518
514	NC_021508	TG	3	6	26024	26029	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
515	NC_021508	GTATC	2	10	26074	26083	20 %	40 %	20 %	20 %	512443518
516	NC_021508	TGG	2	6	26085	26090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443518
517	NC_021508	GCA	2	6	26096	26101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443518
518	NC_021508	TGC	2	6	26110	26115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443518
519	NC_021508	T	6	6	26119	26124	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
520	NC_021508	CTT	2	6	26127	26132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443518
521	NC_021508	TGC	2	6	26154	26159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443518
522	NC_021508	T	6	6	26193	26198	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
523	NC_021508	GTT	2	6	26245	26250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443518
524	NC_021508	GT	3	6	26251	26256	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
525	NC_021508	A	7	7	26444	26450	100 %	0 %	0 %	0 %	512443518
526	NC_021508	GC	3	6	26468	26473	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
527	NC_021508	TCT	2	6	26546	26551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443518
528	NC_021508	T	7	7	26632	26638	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
529	NC_021508	T	6	6	26696	26701	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
530	NC_021508	TGT	2	6	26721	26726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443518
531	NC_021508	CG	3	6	26737	26742	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
532	NC_021508	CCTT	2	8	26831	26838	0 %	50 %	0 %	50 %	512443518
533	NC_021508	GCAC	2	8	26937	26944	25 %	0 %	25 %	50 %	512443518
534	NC_021508	TGC	2	6	26947	26952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443518
535	NC_021508	GGTGG	2	10	26981	26990	0 %	20 %	80 %	0 %	512443518
536	NC_021508	CAA	2	6	27134	27139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443518
537	NC_021508	GA	3	6	27239	27244	50 %	0 %	50 %	0 %	512443518
538	NC_021508	AGCG	2	8	27250	27257	25 %	0 %	50 %	25 %	512443518
539	NC_021508	T	6	6	27265	27270	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
540	NC_021508	TTGAGA	2	12	27318	27329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443518
541	NC_021508	CAGT	2	8	27341	27348	25 %	25 %	25 %	25 %	512443518
542	NC_021508	GT	4	8	27410	27417	0 %	50 %	50 %	0 %	512443518
543	NC_021508	GC	4	8	27452	27459	0 %	0 %	50 %	50 %	512443518
544	NC_021508	T	6	6	27489	27494	0 %	100 %	0 %	0 %	512443518
545	NC_021508	GTG	2	6	27608	27613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
546	NC_021508	GTT	2	6	27655	27660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443519
547	NC_021508	TGG	2	6	27672	27677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
548	NC_021508	TGG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
549	NC_021508	TATTT	2	10	27707	27716	20 %	80 %	0 %	0 %	512443519
550	NC_021508	CTGCG	2	10	27773	27782	0 %	20 %	40 %	40 %	512443519
551	NC_021508	TGCG	2	8	27789	27796	0 %	25 %	50 %	25 %	512443519
552	NC_021508	GT	4	8	27804	27811	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
553	NC_021508	CATC	2	8	27818	27825	25 %	25 %	0 %	50 %	512443519
554	NC_021508	T	6	6	27829	27834	0 %	100 %	0 %	0 %	512443519
555	NC_021508	GGT	2	6	27855	27860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
556	NC_021508	GTA	2	6	27929	27934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
557	NC_021508	GT	3	6	28045	28050	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
558	NC_021508	AGTG	2	8	28051	28058	25 %	25 %	50 %	0 %	512443519
559	NC_021508	ATG	2	6	28097	28102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
560	NC_021508	T	6	6	28107	28112	0 %	100 %	0 %	0 %	512443519
561	NC_021508	TTA	2	6	28128	28133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443519
562	NC_021508	AT	4	8	28138	28145	50 %	50 %	0 %	0 %	512443519
563	NC_021508	TCA	2	6	28199	28204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443519
564	NC_021508	T	6	6	28247	28252	0 %	100 %	0 %	0 %	512443519
565	NC_021508	G	6	6	28264	28269	0 %	0 %	100 %	0 %	512443519
566	NC_021508	T	6	6	28351	28356	0 %	100 %	0 %	0 %	512443519
567	NC_021508	CAG	2	6	28417	28422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443519
568	NC_021508	TTTG	2	8	28435	28442	0 %	75 %	25 %	0 %	512443519
569	NC_021508	TGA	2	6	28482	28487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
570	NC_021508	GT	3	6	28491	28496	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
571	NC_021508	TG	3	6	28506	28511	0 %	50 %	50 %	0 %	512443519
572	NC_021508	GTG	2	6	28688	28693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
573	NC_021508	TGA	2	6	28731	28736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443519
574	NC_021508	GGT	2	6	28880	28885	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443519
575	NC_021508	TGA	2	6	28894	28899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021508	AT	3	6	28933	28938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021508	CTC	2	6	29024	29029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_021508	AGG	2	6	29051	29056	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021508	G	6	6	29055	29060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021508	GCT	2	6	29127	29132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443520
581	NC_021508	TCC	2	6	29153	29158	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443520
582	NC_021508	GC	3	6	29211	29216	0 %	0 %	50 %	50 %	512443520
583	NC_021508	GAT	2	6	29250	29255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443520
584	NC_021508	ATC	2	6	29304	29309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443520
585	NC_021508	AAC	2	6	29319	29324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443520
586	NC_021508	A	7	7	29331	29337	100 %	0 %	0 %	0 %	512443520
587	NC_021508	A	6	6	29443	29448	100 %	0 %	0 %	0 %	512443520
588	NC_021508	TCT	2	6	29472	29477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443520
589	NC_021508	GAA	2	6	29546	29551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443520
590	NC_021508	TC	3	6	29582	29587	0 %	50 %	0 %	50 %	512443520
591	NC_021508	AG	3	6	29862	29867	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
592	NC_021508	ACC	2	6	29939	29944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443521
593	NC_021508	TGCGC	2	10	29961	29970	0 %	20 %	40 %	40 %	512443521
594	NC_021508	AGT	2	6	29975	29980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443521
595	NC_021508	CCG	2	6	30117	30122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443521
596	NC_021508	TCT	2	6	30156	30161	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
597	NC_021508	CAC	2	6	30315	30320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443521
598	NC_021508	T	6	6	30333	30338	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
599	NC_021508	TC	3	6	30391	30396	0 %	50 %	0 %	50 %	512443521
600	NC_021508	AGC	2	6	30458	30463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443521
601	NC_021508	TGC	2	6	30488	30493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
602	NC_021508	TGT	2	6	30533	30538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443521
603	NC_021508	GTG	2	6	30562	30567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443521
604	NC_021508	TG	3	6	30631	30636	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
605	NC_021508	TCCAG	2	10	30787	30796	20 %	20 %	20 %	40 %	512443521
606	NC_021508	TTC	2	6	30799	30804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
607	NC_021508	TGC	2	6	30814	30819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
608	NC_021508	CGT	2	6	30920	30925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
609	NC_021508	AAAG	2	8	30935	30942	75 %	0 %	25 %	0 %	512443521
610	NC_021508	CA	3	6	30957	30962	50 %	0 %	0 %	50 %	512443521
611	NC_021508	GT	3	6	31050	31055	0 %	50 %	50 %	0 %	512443521
612	NC_021508	CTA	2	6	31101	31106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443521
613	NC_021508	GCGG	2	8	31111	31118	0 %	0 %	75 %	25 %	512443521
614	NC_021508	ATG	2	6	31165	31170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443521
615	NC_021508	CTT	2	6	31224	31229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443521
616	NC_021508	CTG	2	6	31245	31250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
617	NC_021508	TCGT	2	8	31277	31284	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
618	NC_021508	GAACAG	2	12	31302	31313	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512443521
619	NC_021508	A	6	6	31318	31323	100 %	0 %	0 %	0 %	512443521
620	NC_021508	TGGGG	2	10	31345	31354	0 %	20 %	80 %	0 %	512443521
621	NC_021508	GTT	2	6	31362	31367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443521
622	NC_021508	TCC	2	6	31400	31405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443521
623	NC_021508	TGTC	2	8	31417	31424	0 %	50 %	25 %	25 %	512443521
624	NC_021508	GC	3	6	31456	31461	0 %	0 %	50 %	50 %	512443521
625	NC_021508	GCT	2	6	31463	31468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443521
626	NC_021508	TCA	2	6	31517	31522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443521
627	NC_021508	T	7	7	31525	31531	0 %	100 %	0 %	0 %	512443521
628	NC_021508	GTCTGG	2	12	31537	31548	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512443521
629	NC_021508	GCA	2	6	31581	31586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443521
630	NC_021508	TGG	2	6	31622	31627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443521
631	NC_021508	GA	3	6	31729	31734	50 %	0 %	50 %	0 %	512443521
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641	NC_021508	G	6	6	32179	32184	0 %	0 %	100 %	0 %	512443521
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764	NC_021508	ATC	2	6	37968	37973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443525
765	NC_021508	TG	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	512443525
766	NC_021508	TGCAT	2	10	38012	38021	20 %	40 %	20 %	20 %	512443525
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801	NC_021508	TCGG	2	8	40168	40175	0 %	25 %	50 %	25 %	512443527
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803	NC_021508	TCCA	2	8	40472	40479	25 %	25 %	0 %	50 %	512443528
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883	NC_021508	CA	3	6	44430	44435	50 %	0 %	0 %	50 %	512443532
884	NC_021508	ACCC	2	8	44488	44495	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
885	NC_021508	GCA	2	6	44601	44606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443533
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895	NC_021508	CG	3	6	45195	45200	0 %	0 %	50 %	50 %	512443533
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