MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_021508	GGA	2	6	293383	293388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443760
6002	NC_021508	GTAT	2	8	293400	293407	25 %	50 %	25 %	0 %	512443760
6003	NC_021508	TAC	2	6	293420	293425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443760
6004	NC_021508	CCG	2	6	293535	293540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443760
6005	NC_021508	ATA	2	6	293574	293579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443760
6006	NC_021508	GC	3	6	293592	293597	0 %	0 %	50 %	50 %	512443760
6007	NC_021508	ACA	2	6	293611	293616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443760
6008	NC_021508	TC	3	6	293632	293637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6009	NC_021508	AGT	2	6	293663	293668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6010	NC_021508	GCG	2	6	293669	293674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_021508	GCAC	2	8	293679	293686	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6012	NC_021508	GACC	2	8	293715	293722	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6013	NC_021508	CTT	2	6	293802	293807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443761
6014	NC_021508	T	7	7	293806	293812	0 %	100 %	0 %	0 %	512443761
6015	NC_021508	CCA	2	6	293855	293860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443761
6016	NC_021508	TG	3	6	293875	293880	0 %	50 %	50 %	0 %	512443761
6017	NC_021508	TCA	2	6	293911	293916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443761
6018	NC_021508	CCA	2	6	293978	293983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443761
6019	NC_021508	TCTGC	2	10	294059	294068	0 %	40 %	20 %	40 %	512443761
6020	NC_021508	CTT	2	6	294113	294118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443761
6021	NC_021508	CGG	2	6	294156	294161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443761
6022	NC_021508	GTA	2	6	294198	294203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443761
6023	NC_021508	TGC	2	6	294253	294258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443761
6024	NC_021508	GC	3	6	294298	294303	0 %	0 %	50 %	50 %	512443761
6025	NC_021508	TGA	2	6	294359	294364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443761
6026	NC_021508	GAAT	2	8	294473	294480	50 %	25 %	25 %	0 %	512443761
6027	NC_021508	GCG	2	6	294499	294504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443761
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6029	NC_021508	TTG	2	6	294523	294528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443761
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6034	NC_021508	GGC	2	6	294876	294881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443761
6035	NC_021508	GCC	2	6	294948	294953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443761
6036	NC_021508	CGC	2	6	294986	294991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443761
6037	NC_021508	CGA	2	6	295007	295012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443761
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6039	NC_021508	TCG	2	6	295087	295092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443761
6040	NC_021508	GTA	2	6	295095	295100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443761
6041	NC_021508	GGA	2	6	295106	295111	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443761
6042	NC_021508	ACA	2	6	295215	295220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6043	NC_021508	GAG	2	6	295224	295229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_021508	GAT	2	6	295259	295264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6045	NC_021508	TTTCC	2	10	295306	295315	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6046	NC_021508	GGA	2	6	295328	295333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6047	NC_021508	GC	3	6	295354	295359	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6048	NC_021508	GAG	2	6	295376	295381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6049	NC_021508	CTT	2	6	295422	295427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443762
6050	NC_021508	G	9	9	295448	295456	0 %	0 %	100 %	0 %	512443762
6051	NC_021508	AG	5	10	295457	295466	50 %	0 %	50 %	0 %	512443762
6052	NC_021508	CGTTG	2	10	295489	295498	0 %	40 %	40 %	20 %	512443762
6053	NC_021508	GTGC	2	8	295501	295508	0 %	25 %	50 %	25 %	512443762
6054	NC_021508	GCCG	2	8	295526	295533	0 %	0 %	50 %	50 %	512443762
6055	NC_021508	ATC	2	6	295546	295551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443762
6056	NC_021508	AGC	2	6	295582	295587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443762
6057	NC_021508	GTC	2	6	295592	295597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443762
6058	NC_021508	GC	3	6	295616	295621	0 %	0 %	50 %	50 %	512443762
6059	NC_021508	TTCT	2	8	295638	295645	0 %	75 %	0 %	25 %	512443762
6060	NC_021508	CGC	2	6	295662	295667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443762
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6062	NC_021508	CAA	2	6	295757	295762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443762
6063	NC_021508	CAT	2	6	295772	295777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443762
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6066	NC_021508	TGA	2	6	295815	295820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443762
6067	NC_021508	GC	3	6	295840	295845	0 %	0 %	50 %	50 %	512443762
6068	NC_021508	CTG	2	6	295906	295911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443762
6069	NC_021508	ACG	2	6	296038	296043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443762
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6074	NC_021508	G	7	7	296199	296205	0 %	0 %	100 %	0 %	512443762
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6089	NC_021508	GAG	2	6	296893	296898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443762
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6099	NC_021508	GC	3	6	297622	297627	0 %	0 %	50 %	50 %	512443762
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6103	NC_021508	G	6	6	297971	297976	0 %	0 %	100 %	0 %	512443762
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6108	NC_021508	CTC	3	9	298103	298111	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6109	NC_021508	GTT	2	6	298113	298118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6110	NC_021508	AGGT	2	8	298152	298159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6111	NC_021508	GT	3	6	298172	298177	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6114	NC_021508	CATG	2	8	298294	298301	25 %	25 %	25 %	25 %	512443763
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6498	NC_021508	GC	3	6	315311	315316	0 %	0 %	50 %	50 %	512443778
6499	NC_021508	GGT	2	6	315340	315345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443778
6500	NC_021508	TGC	2	6	315360	315365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443778

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