MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_021508	ATC	2	6	267594	267599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443739
5502	NC_021508	TGC	2	6	267618	267623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443739
5503	NC_021508	TCT	2	6	267686	267691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443739
5504	NC_021508	GC	3	6	267745	267750	0 %	0 %	50 %	50 %	512443739
5505	NC_021508	GTG	2	6	267779	267784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443739
5506	NC_021508	G	6	6	267859	267864	0 %	0 %	100 %	0 %	512443739
5507	NC_021508	CTT	2	6	267898	267903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443739
5508	NC_021508	GGA	2	6	267922	267927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443739
5509	NC_021508	AGG	2	6	267928	267933	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443739
5510	NC_021508	GGAT	2	8	267978	267985	25 %	25 %	50 %	0 %	512443739
5511	NC_021508	GAG	2	6	267998	268003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443739
5512	NC_021508	TCG	2	6	268039	268044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443739
5513	NC_021508	GGA	2	6	268120	268125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443739
5514	NC_021508	AATC	2	8	268159	268166	50 %	25 %	0 %	25 %	512443739
5515	NC_021508	AAC	2	6	268223	268228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443739
5516	NC_021508	TCC	2	6	268265	268270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443739
5517	NC_021508	GT	3	6	268290	268295	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_021508	GCGCG	2	10	268354	268363	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5519	NC_021508	GAG	2	6	268419	268424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443740
5520	NC_021508	GGT	2	6	268430	268435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443740
5521	NC_021508	GT	3	6	268434	268439	0 %	50 %	50 %	0 %	512443740
5522	NC_021508	T	6	6	268515	268520	0 %	100 %	0 %	0 %	512443740
5523	NC_021508	CAG	2	6	268546	268551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443740
5524	NC_021508	CTTT	2	8	268689	268696	0 %	75 %	0 %	25 %	512443741
5525	NC_021508	GTT	2	6	268721	268726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443741
5526	NC_021508	CTG	2	6	268737	268742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443741
5527	NC_021508	GTG	2	6	268757	268762	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443741
5528	NC_021508	TGC	2	6	268776	268781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443741
5529	NC_021508	TTTTC	2	10	268783	268792	0 %	80 %	0 %	20 %	512443741
5530	NC_021508	TTA	2	6	268819	268824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443741
5531	NC_021508	CG	3	6	268825	268830	0 %	0 %	50 %	50 %	512443741
5532	NC_021508	TTTTTC	2	12	268938	268949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	512443741
5533	NC_021508	ATG	2	6	268976	268981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443741
5534	NC_021508	T	6	6	269073	269078	0 %	100 %	0 %	0 %	512443741
5535	NC_021508	CTT	2	6	269081	269086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443741
5536	NC_021508	TGGC	2	8	269112	269119	0 %	25 %	50 %	25 %	512443741
5537	NC_021508	TGCG	2	8	269139	269146	0 %	25 %	50 %	25 %	512443741
5538	NC_021508	GCC	2	6	269151	269156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443741
5539	NC_021508	GTG	2	6	269165	269170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443741
5540	NC_021508	CTT	2	6	269190	269195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443741
5541	NC_021508	T	8	8	269194	269201	0 %	100 %	0 %	0 %	512443741
5542	NC_021508	T	6	6	269215	269220	0 %	100 %	0 %	0 %	512443741
5543	NC_021508	GT	3	6	269237	269242	0 %	50 %	50 %	0 %	512443741
5544	NC_021508	GCG	2	6	269325	269330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_021508	CTA	2	6	269333	269338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_021508	GAG	2	6	269373	269378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_021508	TG	3	6	269402	269407	0 %	50 %	50 %	0 %	512443742
5548	NC_021508	G	9	9	269415	269423	0 %	0 %	100 %	0 %	512443742
5549	NC_021508	GCA	2	6	269554	269559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443742
5550	NC_021508	ATA	2	6	269616	269621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512443742
5551	NC_021508	TGAC	2	8	269622	269629	25 %	25 %	25 %	25 %	512443742
5552	NC_021508	AGA	2	6	269695	269700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443742
5553	NC_021508	CTC	2	6	269708	269713	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512443742
5554	NC_021508	CG	3	6	269736	269741	0 %	0 %	50 %	50 %	512443742
5555	NC_021508	TCA	3	9	269899	269907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443742
5556	NC_021508	GGAA	2	8	269908	269915	50 %	0 %	50 %	0 %	512443742
5557	NC_021508	A	6	6	269948	269953	100 %	0 %	0 %	0 %	512443742
5558	NC_021508	TACAAT	2	12	270134	270145	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	512443742
5559	NC_021508	GGT	2	6	270161	270166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443742
5560	NC_021508	GGA	2	6	270210	270215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443742
5561	NC_021508	GAAT	2	8	270226	270233	50 %	25 %	25 %	0 %	512443742
5562	NC_021508	GAAA	2	8	270319	270326	75 %	0 %	25 %	0 %	512443742
5563	NC_021508	CG	3	6	270340	270345	0 %	0 %	50 %	50 %	512443742
5564	NC_021508	GTG	2	6	270395	270400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443742
5565	NC_021508	CCCG	2	8	270443	270450	0 %	0 %	25 %	75 %	512443742
5566	NC_021508	GTTC	2	8	270515	270522	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5567	NC_021508	GCAC	2	8	270554	270561	25 %	0 %	25 %	50 %	512443743
5568	NC_021508	CG	3	6	270582	270587	0 %	0 %	50 %	50 %	512443743
5569	NC_021508	CG	4	8	270615	270622	0 %	0 %	50 %	50 %	512443743
5570	NC_021508	GC	3	6	270692	270697	0 %	0 %	50 %	50 %	512443743
5571	NC_021508	CGC	2	6	270709	270714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443743
5572	NC_021508	CGG	2	6	270753	270758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443743
5573	NC_021508	TTCTC	2	10	270776	270785	0 %	60 %	0 %	40 %	512443743
5574	NC_021508	CAT	2	6	270874	270879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443743
5575	NC_021508	T	7	7	270906	270912	0 %	100 %	0 %	0 %	512443743
5576	NC_021508	GC	3	6	270965	270970	0 %	0 %	50 %	50 %	512443743
5577	NC_021508	GT	3	6	271018	271023	0 %	50 %	50 %	0 %	512443743
5578	NC_021508	CGC	2	6	271080	271085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443743
5579	NC_021508	GTG	2	6	271100	271105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443743
5580	NC_021508	AGA	2	6	271106	271111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443743
5581	NC_021508	CGG	2	6	271119	271124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443743
5582	NC_021508	TG	3	6	271169	271174	0 %	50 %	50 %	0 %	512443743
5583	NC_021508	AG	3	6	271225	271230	50 %	0 %	50 %	0 %	512443743
5584	NC_021508	GCT	2	6	271234	271239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_021508	GT	3	6	271262	271267	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5586	NC_021508	TG	3	6	271337	271342	0 %	50 %	50 %	0 %	512443744
5587	NC_021508	GGA	3	9	271383	271391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443744
5588	NC_021508	GAT	2	6	271395	271400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443744
5589	NC_021508	CGG	2	6	271475	271480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443744
5590	NC_021508	GCC	2	6	271500	271505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443744
5591	NC_021508	GGA	2	6	271509	271514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443744
5592	NC_021508	GAA	2	6	271519	271524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443744
5593	NC_021508	GAG	2	6	271546	271551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443744
5594	NC_021508	ATT	2	6	271681	271686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443744
5595	NC_021508	TATC	2	8	271827	271834	25 %	50 %	0 %	25 %	512443744
5596	NC_021508	AGCT	2	8	271853	271860	25 %	25 %	25 %	25 %	512443744
5597	NC_021508	A	6	6	271883	271888	100 %	0 %	0 %	0 %	512443744
5598	NC_021508	GC	3	6	271932	271937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5599	NC_021508	CA	3	6	271985	271990	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5600	NC_021508	GCTC	2	8	271993	272000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5601	NC_021508	TCC	2	6	272002	272007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5602	NC_021508	CTT	2	6	272050	272055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443745
5603	NC_021508	GGTG	2	8	272140	272147	0 %	25 %	75 %	0 %	512443745
5604	NC_021508	C	6	6	272171	272176	0 %	0 %	0 %	100 %	512443745
5605	NC_021508	GC	3	6	272212	272217	0 %	0 %	50 %	50 %	512443745
5606	NC_021508	CCCTGC	2	12	272303	272314	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	512443745
5607	NC_021508	GC	5	10	272335	272344	0 %	0 %	50 %	50 %	512443745
5608	NC_021508	AT	3	6	272390	272395	50 %	50 %	0 %	0 %	512443745
5609	NC_021508	GCT	2	6	272455	272460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443745
5610	NC_021508	AG	3	6	272580	272585	50 %	0 %	50 %	0 %	512443745
5611	NC_021508	TGCG	2	8	272668	272675	0 %	25 %	50 %	25 %	512443745
5612	NC_021508	T	6	6	272681	272686	0 %	100 %	0 %	0 %	512443745
5613	NC_021508	T	6	6	272719	272724	0 %	100 %	0 %	0 %	512443745
5614	NC_021508	GCG	2	6	272735	272740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443745
5615	NC_021508	GTA	2	6	272759	272764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443745
5616	NC_021508	TCA	2	6	272856	272861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443745
5617	NC_021508	GGT	2	6	272894	272899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443745
5618	NC_021508	G	6	6	273022	273027	0 %	0 %	100 %	0 %	512443745
5619	NC_021508	CTTT	2	8	273127	273134	0 %	75 %	0 %	25 %	512443745
5620	NC_021508	TCT	2	6	273178	273183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443745
5621	NC_021508	GGGA	2	8	273264	273271	25 %	0 %	75 %	0 %	512443745
5622	NC_021508	GGA	2	6	273277	273282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443745
5623	NC_021508	CAG	2	6	273314	273319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443745
5624	NC_021508	CAG	2	6	273335	273340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443745
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5756	NC_021508	CTG	2	6	280380	280385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5757	NC_021508	GAA	2	6	280448	280453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5758	NC_021508	GAT	2	6	280482	280487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5760	NC_021508	GAT	2	6	280697	280702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5879	NC_021508	GGT	2	6	287090	287095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443753
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5882	NC_021508	TTG	2	6	287254	287259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5883	NC_021508	A	7	7	287264	287270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5884	NC_021508	CTGT	2	8	287315	287322	0 %	50 %	25 %	25 %	512443754
5885	NC_021508	GCT	2	6	287325	287330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443754
5886	NC_021508	AGTG	2	8	287337	287344	25 %	25 %	50 %	0 %	512443754
5887	NC_021508	TGT	2	6	287376	287381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443754
5888	NC_021508	ATT	2	6	287570	287575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443754
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