MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum SS14

Total Repeats: 23984

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021508	CAGG	2	8	219825	219832	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4502	NC_021508	GC	3	6	219891	219896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_021508	GCAG	2	8	219900	219907	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_021508	ATT	2	6	219949	219954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443703
4505	NC_021508	G	8	8	219999	220006	0 %	0 %	100 %	0 %	512443703
4506	NC_021508	TGG	2	6	220074	220079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443703
4507	NC_021508	CGT	2	6	220083	220088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4508	NC_021508	CAGC	2	8	220093	220100	25 %	0 %	25 %	50 %	512443703
4509	NC_021508	A	6	6	220101	220106	100 %	0 %	0 %	0 %	512443703
4510	NC_021508	CTAT	2	8	220133	220140	25 %	50 %	0 %	25 %	512443703
4511	NC_021508	A	6	6	220191	220196	100 %	0 %	0 %	0 %	512443703
4512	NC_021508	GAC	2	6	220225	220230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4513	NC_021508	A	6	6	220292	220297	100 %	0 %	0 %	0 %	512443703
4514	NC_021508	GAA	2	6	220299	220304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443703
4515	NC_021508	ATT	2	6	220316	220321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443703
4516	NC_021508	TAT	2	6	220431	220436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443703
4517	NC_021508	CTG	2	6	220448	220453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4518	NC_021508	AG	4	8	220487	220494	50 %	0 %	50 %	0 %	512443703
4519	NC_021508	ATT	2	6	220498	220503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443703
4520	NC_021508	G	8	8	220519	220526	0 %	0 %	100 %	0 %	512443703
4521	NC_021508	AAGTC	2	10	220571	220580	40 %	20 %	20 %	20 %	512443703
4522	NC_021508	G	6	6	220602	220607	0 %	0 %	100 %	0 %	512443703
4523	NC_021508	GA	3	6	220707	220712	50 %	0 %	50 %	0 %	512443703
4524	NC_021508	GCG	2	6	220714	220719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443703
4525	NC_021508	TTC	2	6	220740	220745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443703
4526	NC_021508	CT	4	8	220817	220824	0 %	50 %	0 %	50 %	512443703
4527	NC_021508	TGA	2	6	220848	220853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443703
4528	NC_021508	TGG	2	6	220941	220946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443703
4529	NC_021508	AAG	2	6	220997	221002	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443703
4530	NC_021508	AGG	2	6	221055	221060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443703
4531	NC_021508	G	7	7	221068	221074	0 %	0 %	100 %	0 %	512443703
4532	NC_021508	ACC	2	6	221167	221172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512443703
4533	NC_021508	TGC	2	6	221240	221245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4534	NC_021508	TAG	2	6	221297	221302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443703
4535	NC_021508	AGC	2	6	221408	221413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4536	NC_021508	AGG	2	6	221573	221578	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443703
4537	NC_021508	CG	4	8	221605	221612	0 %	0 %	50 %	50 %	512443703
4538	NC_021508	CGA	2	6	221655	221660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4539	NC_021508	GCA	2	6	221694	221699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4540	NC_021508	GGA	2	6	221718	221723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443703
4541	NC_021508	AGC	3	9	221739	221747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443703
4542	NC_021508	AAG	2	6	221764	221769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443703
4543	NC_021508	GGT	2	6	221800	221805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443703
4544	NC_021508	GGGA	2	8	221863	221870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_021508	TG	3	6	221890	221895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4546	NC_021508	TG	4	8	222047	222054	0 %	50 %	50 %	0 %	512443704
4547	NC_021508	ATT	2	6	222107	222112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443704
4548	NC_021508	GAA	2	6	222148	222153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443704
4549	NC_021508	CGG	2	6	222169	222174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443704
4550	NC_021508	GGA	2	6	222222	222227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443704
4551	NC_021508	AGG	2	6	222236	222241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443704
4552	NC_021508	CGC	2	6	222427	222432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443704
4553	NC_021508	ACG	2	6	222446	222451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443704
4554	NC_021508	GAA	2	6	222508	222513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443704
4555	NC_021508	CGA	2	6	222552	222557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443704
4556	NC_021508	GTA	2	6	222644	222649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443704
4557	NC_021508	T	6	6	222654	222659	0 %	100 %	0 %	0 %	512443704
4558	NC_021508	GC	3	6	222679	222684	0 %	0 %	50 %	50 %	512443704
4559	NC_021508	TGG	2	6	222687	222692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443704
4560	NC_021508	A	6	6	222758	222763	100 %	0 %	0 %	0 %	512443704
4561	NC_021508	AGA	2	6	222789	222794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443704
4562	NC_021508	GCG	2	6	222798	222803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443704
4563	NC_021508	GTGTTT	2	12	222865	222876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443704
4564	NC_021508	GC	3	6	222959	222964	0 %	0 %	50 %	50 %	512443704
4565	NC_021508	GCA	2	6	222996	223001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443704
4566	NC_021508	CCGG	2	8	223012	223019	0 %	0 %	50 %	50 %	512443704
4567	NC_021508	GC	3	6	223069	223074	0 %	0 %	50 %	50 %	512443704
4568	NC_021508	CCG	2	6	223186	223191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512443704
4569	NC_021508	ATT	2	6	223249	223254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_021508	CGTG	2	8	223259	223266	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4571	NC_021508	TTTC	2	8	223270	223277	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_021508	GT	3	6	223280	223285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4573	NC_021508	TTC	2	6	223335	223340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4574	NC_021508	AGC	2	6	223370	223375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_021508	T	9	9	223450	223458	0 %	100 %	0 %	0 %	512443705
4576	NC_021508	TCGTT	2	10	223502	223511	0 %	60 %	20 %	20 %	512443705
4577	NC_021508	GC	3	6	223515	223520	0 %	0 %	50 %	50 %	512443705
4578	NC_021508	TTC	2	6	223565	223570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443705
4579	NC_021508	TGCGCT	2	12	223613	223624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4580	NC_021508	TTG	2	6	223663	223668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443705
4581	NC_021508	CTG	2	6	223713	223718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4582	NC_021508	AAC	2	6	223738	223743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443705
4583	NC_021508	TTG	2	6	223744	223749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443705
4584	NC_021508	AGG	2	6	223759	223764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443705
4585	NC_021508	ACA	2	6	223828	223833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443705
4586	NC_021508	TGC	2	6	223835	223840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4587	NC_021508	AC	3	6	223855	223860	50 %	0 %	0 %	50 %	512443705
4588	NC_021508	TA	3	6	223922	223927	50 %	50 %	0 %	0 %	512443705
4589	NC_021508	T	7	7	223928	223934	0 %	100 %	0 %	0 %	512443705
4590	NC_021508	GAT	3	9	223935	223943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443705
4591	NC_021508	TGT	3	9	224113	224121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443705
4592	NC_021508	ATG	2	6	224148	224153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443705
4593	NC_021508	GC	3	6	224165	224170	0 %	0 %	50 %	50 %	512443705
4594	NC_021508	ATT	2	6	224251	224256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443705
4595	NC_021508	ACG	2	6	224257	224262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4596	NC_021508	TGA	2	6	224273	224278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443705
4597	NC_021508	CGT	2	6	224329	224334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4598	NC_021508	ATC	2	6	224563	224568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443705
4599	NC_021508	AGT	2	6	224681	224686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443705
4600	NC_021508	GAC	2	6	224826	224831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443705
4601	NC_021508	AGGT	2	8	224859	224866	25 %	25 %	50 %	0 %	512443705
4602	NC_021508	T	7	7	224880	224886	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
4603	NC_021508	GC	3	6	224945	224950	0 %	0 %	50 %	50 %	512443706
4604	NC_021508	CTG	2	6	224958	224963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443706
4605	NC_021508	T	6	6	224996	225001	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
4606	NC_021508	TTTA	2	8	225056	225063	25 %	75 %	0 %	0 %	512443706
4607	NC_021508	T	6	6	225078	225083	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
4608	NC_021508	A	8	8	225135	225142	100 %	0 %	0 %	0 %	512443706
4609	NC_021508	ACG	2	6	225165	225170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443706
4610	NC_021508	TTTG	2	8	225176	225183	0 %	75 %	25 %	0 %	512443706
4611	NC_021508	ATT	2	6	225256	225261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443706
4612	NC_021508	TCT	2	6	225267	225272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512443706
4613	NC_021508	T	8	8	225301	225308	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
4614	NC_021508	A	6	6	225345	225350	100 %	0 %	0 %	0 %	512443706
4615	NC_021508	ATG	2	6	225357	225362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512443706
4616	NC_021508	CAA	2	6	225381	225386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512443706
4617	NC_021508	TTA	2	6	225433	225438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443706
4618	NC_021508	TCTTGT	2	12	225439	225450	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512443706
4619	NC_021508	GTGTTT	2	12	225468	225479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443706
4620	NC_021508	T	6	6	225477	225482	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
4621	NC_021508	AGG	2	6	225488	225493	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443706
4622	NC_021508	GTG	2	6	225558	225563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443706
4623	NC_021508	CAG	2	6	225610	225615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443706
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4625	NC_021508	T	6	6	225738	225743	0 %	100 %	0 %	0 %	512443706
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4754	NC_021508	CCT	2	6	232838	232843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4755	NC_021508	GCATG	2	10	232864	232873	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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4883	NC_021508	GGT	2	6	238930	238935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443715
4884	NC_021508	GCAGAC	2	12	238949	238960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512443715
4885	NC_021508	TCG	2	6	238965	238970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443715
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4887	NC_021508	GTC	2	6	239007	239012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512443715
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4890	NC_021508	TGT	2	6	239153	239158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512443715
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4904	NC_021508	ATC	2	6	239640	239645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512443716
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4907	NC_021508	GGT	2	6	239747	239752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443716
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4952	NC_021508	CGG	2	6	241360	241365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512443716
4953	NC_021508	CTG	2	6	241436	241441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4954	NC_021508	GTA	2	6	241462	241467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4956	NC_021508	ATT	2	6	241522	241527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512443717
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4972	NC_021508	GT	3	6	242258	242263	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4973	NC_021508	GAGGG	2	10	242292	242301	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4974	NC_021508	CTG	3	9	242312	242320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4982	NC_021508	T	6	6	242746	242751	0 %	100 %	0 %	0 %	512443718
4983	NC_021508	AAG	2	6	242857	242862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512443718
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4987	NC_021508	TG	3	6	243019	243024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4990	NC_021508	CTGT	2	8	243076	243083	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4991	NC_021508	GAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4992	NC_021508	GGT	2	6	243182	243187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4996	NC_021508	AG	3	6	243338	243343	50 %	0 %	50 %	0 %	512443719
4997	NC_021508	GTC	2	6	243362	243367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4998	NC_021508	TCCT	2	8	243472	243479	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4999	NC_021508	AGG	2	6	243553	243558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512443720
5000	NC_021508	GTG	2	6	243559	243564	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512443720

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