MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 3027

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021490	TTTG	2	8	237	244	0 %	75 %	25 %	0 %	512556091
2	NC_021490	TACC	2	8	297	304	25 %	25 %	0 %	50 %	512556091
3	NC_021490	TTCC	2	8	329	336	0 %	50 %	0 %	50 %	512556091
4	NC_021490	CATT	2	8	672	679	25 %	50 %	0 %	25 %	512556091
5	NC_021490	GATA	2	8	1047	1054	50 %	25 %	25 %	0 %	512556091
6	NC_021490	TTTG	2	8	1530	1537	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021490	AACT	2	8	1633	1640	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_021490	CAAA	2	8	1939	1946	75 %	0 %	0 %	25 %	512556092
9	NC_021490	CTAT	2	8	2612	2619	25 %	50 %	0 %	25 %	512556092
10	NC_021490	GGTT	2	8	3587	3594	0 %	50 %	50 %	0 %	512556093
11	NC_021490	AAAG	2	8	4039	4046	75 %	0 %	25 %	0 %	512556094
12	NC_021490	GTAC	2	8	4104	4111	25 %	25 %	25 %	25 %	512556094
13	NC_021490	GCCC	2	8	4382	4389	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_021490	CGTC	2	8	4650	4657	0 %	25 %	25 %	50 %	512556095
15	NC_021490	TCAT	2	8	4707	4714	25 %	50 %	0 %	25 %	512556095
16	NC_021490	GTGC	2	8	5540	5547	0 %	25 %	50 %	25 %	512556095
17	NC_021490	TTAC	2	8	5771	5778	25 %	50 %	0 %	25 %	512556095
18	NC_021490	AAGA	2	8	5807	5814	75 %	0 %	25 %	0 %	512556095
19	NC_021490	GGGC	2	8	6092	6099	0 %	0 %	75 %	25 %	512556095
20	NC_021490	GACG	2	8	6181	6188	25 %	0 %	50 %	25 %	512556095
21	NC_021490	GAGG	2	8	6427	6434	25 %	0 %	75 %	0 %	512556095
22	NC_021490	GCGT	2	8	6765	6772	0 %	25 %	50 %	25 %	512556095
23	NC_021490	AGTT	2	8	7082	7089	25 %	50 %	25 %	0 %	512556096
24	NC_021490	TTAC	2	8	7267	7274	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021490	TTGC	2	8	7317	7324	0 %	50 %	25 %	25 %	512556097
26	NC_021490	GTCA	2	8	7488	7495	25 %	25 %	25 %	25 %	512556097
27	NC_021490	GGTT	2	8	8562	8569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021490	CCGT	2	8	9126	9133	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_021490	GGTA	2	8	9207	9214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021490	GCAT	2	8	10132	10139	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_021490	ATGT	2	8	10211	10218	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021490	GTGG	2	8	10238	10245	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021490	GCTT	2	8	10621	10628	0 %	50 %	25 %	25 %	512556098
34	NC_021490	TGGA	2	8	11618	11625	25 %	25 %	50 %	0 %	512556098
35	NC_021490	AAGT	2	8	11842	11849	50 %	25 %	25 %	0 %	512556098
36	NC_021490	GAGC	2	8	12343	12350	25 %	0 %	50 %	25 %	512556098
37	NC_021490	GCGT	2	8	13220	13227	0 %	25 %	50 %	25 %	512556099
38	NC_021490	GTTT	2	8	13597	13604	0 %	75 %	25 %	0 %	512556099
39	NC_021490	GAAG	2	8	13655	13662	50 %	0 %	50 %	0 %	512556099
40	NC_021490	ACAT	2	8	13690	13697	50 %	25 %	0 %	25 %	512556099
41	NC_021490	AGGG	2	8	14108	14115	25 %	0 %	75 %	0 %	512556100
42	NC_021490	TTTC	2	8	14323	14330	0 %	75 %	0 %	25 %	512556100
43	NC_021490	AGAT	2	8	14981	14988	50 %	25 %	25 %	0 %	512556100
44	NC_021490	GCTC	2	8	15783	15790	0 %	25 %	25 %	50 %	512556100
45	NC_021490	GCTG	2	8	16213	16220	0 %	25 %	50 %	25 %	512556101
46	NC_021490	GTAC	2	8	16311	16318	25 %	25 %	25 %	25 %	512556101
47	NC_021490	TGCG	2	8	16695	16702	0 %	25 %	50 %	25 %	512556101
48	NC_021490	TTGG	2	8	17147	17154	0 %	50 %	50 %	0 %	512556101
49	NC_021490	GCAG	2	8	17502	17509	25 %	0 %	50 %	25 %	512556101
50	NC_021490	AAGG	2	8	17681	17688	50 %	0 %	50 %	0 %	512556101
51	NC_021490	GTGC	2	8	18155	18162	0 %	25 %	50 %	25 %	512556101
52	NC_021490	TTTA	2	8	18326	18333	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021490	CGAT	2	8	18416	18423	25 %	25 %	25 %	25 %	512556102
54	NC_021490	CGTT	2	8	18639	18646	0 %	50 %	25 %	25 %	512556102
55	NC_021490	TATG	2	8	18685	18692	25 %	50 %	25 %	0 %	512556102
56	NC_021490	GTTA	2	8	19790	19797	25 %	50 %	25 %	0 %	512556103
57	NC_021490	GAAA	2	8	20642	20649	75 %	0 %	25 %	0 %	512556103
58	NC_021490	TGCG	2	8	20854	20861	0 %	25 %	50 %	25 %	512556103
59	NC_021490	GCTT	2	8	21174	21181	0 %	50 %	25 %	25 %	512556103
60	NC_021490	ACAA	2	8	22720	22727	75 %	0 %	0 %	25 %	512556104
61	NC_021490	GCAC	2	8	22859	22866	25 %	0 %	25 %	50 %	512556104
62	NC_021490	ATGT	2	8	23080	23087	25 %	50 %	25 %	0 %	512556104
63	NC_021490	CTTC	2	8	24291	24298	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_021490	AAAG	2	8	25261	25268	75 %	0 %	25 %	0 %	512556105
65	NC_021490	TTAT	2	8	25314	25321	25 %	75 %	0 %	0 %	512556105
66	NC_021490	GATT	2	8	25860	25867	25 %	50 %	25 %	0 %	512556106
67	NC_021490	AGCG	2	8	25998	26005	25 %	0 %	50 %	25 %	512556106
68	NC_021490	CCTT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	0 %	50 %	512556106
69	NC_021490	GCAC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	512556106
70	NC_021490	AGCG	2	8	27253	27260	25 %	0 %	50 %	25 %	512556106
71	NC_021490	CAGT	2	8	27344	27351	25 %	25 %	25 %	25 %	512556106
72	NC_021490	TGCG	2	8	27792	27799	0 %	25 %	50 %	25 %	512556107
73	NC_021490	CATC	2	8	27821	27828	25 %	25 %	0 %	50 %	512556107
74	NC_021490	AGTG	2	8	28054	28061	25 %	25 %	50 %	0 %	512556107
75	NC_021490	TTTG	2	8	28438	28445	0 %	75 %	25 %	0 %	512556107
76	NC_021490	AAAG	2	8	30938	30945	75 %	0 %	25 %	0 %	512556109
77	NC_021490	GCGG	2	8	31114	31121	0 %	0 %	75 %	25 %	512556109
78	NC_021490	TCGT	2	8	31280	31287	0 %	50 %	25 %	25 %	512556109
79	NC_021490	TGTC	2	8	31420	31427	0 %	50 %	25 %	25 %	512556109
80	NC_021490	ATCC	2	8	32110	32117	25 %	25 %	0 %	50 %	512556109
81	NC_021490	CTCG	2	8	32119	32126	0 %	25 %	25 %	50 %	512556109
82	NC_021490	GTAC	2	8	32143	32150	25 %	25 %	25 %	25 %	512556109
83	NC_021490	TTCA	2	8	32455	32462	25 %	50 %	0 %	25 %	512556109
84	NC_021490	GTTG	2	8	32484	32491	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
85	NC_021490	CAAA	2	8	32793	32800	75 %	0 %	0 %	25 %	512556109
86	NC_021490	TGCG	2	8	33240	33247	0 %	25 %	50 %	25 %	512556110
87	NC_021490	CCGC	2	8	33643	33650	0 %	0 %	25 %	75 %	512556110
88	NC_021490	GCCG	2	8	34515	34522	0 %	0 %	50 %	50 %	512556111
89	NC_021490	ATTG	2	8	34801	34808	25 %	50 %	25 %	0 %	512556111
90	NC_021490	GACG	2	8	34952	34959	25 %	0 %	50 %	25 %	512556111
91	NC_021490	CGTG	2	8	35746	35753	0 %	25 %	50 %	25 %	512556112
92	NC_021490	GGGT	2	8	36289	36296	0 %	25 %	75 %	0 %	512556112
93	NC_021490	GACA	2	8	36431	36438	50 %	0 %	25 %	25 %	512556112
94	NC_021490	TAAG	2	8	36814	36821	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021490	GTGC	2	8	37190	37197	0 %	25 %	50 %	25 %	512556113
96	NC_021490	GCGA	2	8	37472	37479	25 %	0 %	50 %	25 %	512556113
97	NC_021490	ACGT	2	8	37680	37687	25 %	25 %	25 %	25 %	512556113
98	NC_021490	GAGC	2	8	37735	37742	25 %	0 %	50 %	25 %	512556113
99	NC_021490	TGCG	2	8	38049	38056	0 %	25 %	50 %	25 %	512556113
100	NC_021490	CTTG	2	8	38423	38430	0 %	50 %	25 %	25 %	512556114
101	NC_021490	ACGA	2	8	38550	38557	50 %	0 %	25 %	25 %	512556114
102	NC_021490	GACT	2	8	39607	39614	25 %	25 %	25 %	25 %	512556114
103	NC_021490	GGTT	2	8	39626	39633	0 %	50 %	50 %	0 %	512556114
104	NC_021490	GTAT	2	8	39937	39944	25 %	50 %	25 %	0 %	512556114
105	NC_021490	TTTC	2	8	40097	40104	0 %	75 %	0 %	25 %	512556115
106	NC_021490	TCGG	2	8	40170	40177	0 %	25 %	50 %	25 %	512556115
107	NC_021490	TCCA	2	8	40474	40481	25 %	25 %	0 %	50 %	512556116
108	NC_021490	GAAA	2	8	41027	41034	75 %	0 %	25 %	0 %	512556116
109	NC_021490	AGAA	2	8	41218	41225	75 %	0 %	25 %	0 %	512556117
110	NC_021490	GAAA	2	8	41626	41633	75 %	0 %	25 %	0 %	512556117
111	NC_021490	CATC	2	8	43823	43830	25 %	25 %	0 %	50 %	512556120
112	NC_021490	GCTC	2	8	44239	44246	0 %	25 %	25 %	50 %	512556120
113	NC_021490	GGGT	2	8	44281	44288	0 %	25 %	75 %	0 %	512556120
114	NC_021490	ACCC	2	8	44490	44497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
115	NC_021490	GCAC	2	8	45360	45367	25 %	0 %	25 %	50 %	512556121
116	NC_021490	AGGA	2	8	45742	45749	50 %	0 %	50 %	0 %	512556122
117	NC_021490	TTAC	2	8	47159	47166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_021490	TCCC	2	8	47203	47210	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_021490	TGGG	2	8	47827	47834	0 %	25 %	75 %	0 %	512556124
120	NC_021490	GTCG	2	8	48720	48727	0 %	25 %	50 %	25 %	512556124
121	NC_021490	GGAC	2	8	48770	48777	25 %	0 %	50 %	25 %	512556124
122	NC_021490	CGCC	2	8	49294	49301	0 %	0 %	25 %	75 %	512556124
123	NC_021490	AGCG	2	8	49426	49433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_021490	CGGG	2	8	49494	49501	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
125	NC_021490	GAGG	2	8	49931	49938	25 %	0 %	75 %	0 %	512556125
126	NC_021490	GCAG	2	8	50847	50854	25 %	0 %	50 %	25 %	512556126
127	NC_021490	TTCT	2	8	51461	51468	0 %	75 %	0 %	25 %	512556126
128	NC_021490	GGGC	2	8	52165	52172	0 %	0 %	75 %	25 %	512556126
129	NC_021490	ATGC	2	8	52822	52829	25 %	25 %	25 %	25 %	512556127
130	NC_021490	AATC	2	8	53324	53331	50 %	25 %	0 %	25 %	512556127
131	NC_021490	ATTA	2	8	53352	53359	50 %	50 %	0 %	0 %	512556127
132	NC_021490	CAAA	2	8	53694	53701	75 %	0 %	0 %	25 %	512556127
133	NC_021490	GGAA	2	8	54317	54324	50 %	0 %	50 %	0 %	512556127
134	NC_021490	CAGG	2	8	54521	54528	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_021490	GTAC	2	8	54534	54541	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021490	CATC	2	8	54678	54685	25 %	25 %	0 %	50 %	512556128
137	NC_021490	TTTC	2	8	54767	54774	0 %	75 %	0 %	25 %	512556128
138	NC_021490	CTTT	2	8	54897	54904	0 %	75 %	0 %	25 %	512556128
139	NC_021490	TCGT	2	8	55363	55370	0 %	50 %	25 %	25 %	512556128
140	NC_021490	CTAA	2	8	56043	56050	50 %	25 %	0 %	25 %	512556129
141	NC_021490	TATG	2	8	56200	56207	25 %	50 %	25 %	0 %	512556129
142	NC_021490	TCCT	2	8	56417	56424	0 %	50 %	0 %	50 %	512556129
143	NC_021490	ACGA	2	8	58548	58555	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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