MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_021490	AC	3	6	194683	194688	50 %	0 %	0 %	50 %	512556253
4002	NC_021490	T	6	6	194742	194747	0 %	100 %	0 %	0 %	512556253
4003	NC_021490	A	6	6	194965	194970	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
4004	NC_021490	A	7	7	194998	195004	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
4005	NC_021490	GAT	2	6	195013	195018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556253
4006	NC_021490	GAA	2	6	195072	195077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556253
4007	NC_021490	ATA	2	6	195098	195103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556253
4008	NC_021490	GCA	2	6	195166	195171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556253
4009	NC_021490	A	6	6	195228	195233	100 %	0 %	0 %	0 %	512556253
4010	NC_021490	GCAG	2	8	195251	195258	25 %	0 %	50 %	25 %	512556253
4011	NC_021490	TTCT	2	8	195261	195268	0 %	75 %	0 %	25 %	512556253
4012	NC_021490	GAGTG	2	10	195293	195302	20 %	20 %	60 %	0 %	512556253
4013	NC_021490	AAG	2	6	195317	195322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556253
4014	NC_021490	TG	4	8	195337	195344	0 %	50 %	50 %	0 %	512556253
4015	NC_021490	T	8	8	195434	195441	0 %	100 %	0 %	0 %	512556253
4016	NC_021490	T	6	6	195532	195537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_021490	AGT	2	6	195653	195658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_021490	CGG	2	6	195693	195698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_021490	GTAC	2	8	195766	195773	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4020	NC_021490	GGT	2	6	195781	195786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_021490	GAAG	2	8	195936	195943	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4022	NC_021490	CGTG	2	8	195952	195959	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_021490	AAAT	2	8	195997	196004	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4024	NC_021490	AGAA	2	8	196099	196106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_021490	AC	3	6	196157	196162	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_021490	GGA	2	6	196165	196170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_021490	ACA	2	6	196190	196195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_021490	CCGT	2	8	196243	196250	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_021490	GAG	2	6	196303	196308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_021490	CA	4	8	196365	196372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4031	NC_021490	A	6	6	196416	196421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_021490	GC	3	6	196537	196542	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_021490	ATTA	2	8	196608	196615	50 %	50 %	0 %	0 %	512556254
4034	NC_021490	AGAA	2	8	196616	196623	75 %	0 %	25 %	0 %	512556254
4035	NC_021490	TTA	2	6	196772	196777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_021490	GCG	2	6	196785	196790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_021490	CTT	2	6	196828	196833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_021490	GGA	2	6	196894	196899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556255
4039	NC_021490	CGTC	2	8	196900	196907	0 %	25 %	25 %	50 %	512556255
4040	NC_021490	GC	3	6	196909	196914	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
4041	NC_021490	AGT	2	6	196916	196921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
4042	NC_021490	TGA	2	6	196933	196938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
4043	NC_021490	GAA	2	6	197025	197030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
4044	NC_021490	CAG	2	6	197118	197123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556255
4045	NC_021490	GAA	2	6	197149	197154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
4046	NC_021490	CGG	2	6	197155	197160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556255
4047	NC_021490	G	6	6	197159	197164	0 %	0 %	100 %	0 %	512556255
4048	NC_021490	AGC	2	6	197239	197244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556255
4049	NC_021490	GC	3	6	197303	197308	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
4050	NC_021490	ACGC	2	8	197330	197337	25 %	0 %	25 %	50 %	512556255
4051	NC_021490	CTC	2	6	197339	197344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556255
4052	NC_021490	CCTG	2	8	197518	197525	0 %	25 %	25 %	50 %	512556255
4053	NC_021490	GTC	2	6	197532	197537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556255
4054	NC_021490	GCAG	2	8	197547	197554	25 %	0 %	50 %	25 %	512556255
4055	NC_021490	AGG	2	6	197565	197570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556255
4056	NC_021490	GTG	3	9	197598	197606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556255
4057	NC_021490	GAGAAA	2	12	197651	197662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556255
4058	NC_021490	CG	3	6	197666	197671	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
4059	NC_021490	GA	3	6	197681	197686	50 %	0 %	50 %	0 %	512556255
4060	NC_021490	GTA	2	6	197720	197725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556255
4061	NC_021490	GC	4	8	197763	197770	0 %	0 %	50 %	50 %	512556255
4062	NC_021490	CTC	2	6	197845	197850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556256
4063	NC_021490	TCT	2	6	197853	197858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556256
4064	NC_021490	AGC	2	6	197876	197881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4065	NC_021490	TCG	2	6	197912	197917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4066	NC_021490	GGC	2	6	198037	198042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556256
4067	NC_021490	TCG	3	9	198146	198154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4068	NC_021490	GCT	2	6	198177	198182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4069	NC_021490	GGA	2	6	198208	198213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556256
4070	NC_021490	TGT	2	6	198347	198352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556256
4071	NC_021490	CG	3	6	198372	198377	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
4072	NC_021490	GTC	2	6	198388	198393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4073	NC_021490	CTC	2	6	198394	198399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556256
4074	NC_021490	CAC	2	6	198459	198464	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556256
4075	NC_021490	TGA	2	6	198516	198521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556256
4076	NC_021490	TCGTC	2	10	198555	198564	0 %	40 %	20 %	40 %	512556256
4077	NC_021490	ATC	2	6	198568	198573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556256
4078	NC_021490	TTCC	2	8	198606	198613	0 %	50 %	0 %	50 %	512556256
4079	NC_021490	CTG	2	6	198704	198709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4080	NC_021490	GAA	2	6	198860	198865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556256
4081	NC_021490	CGT	2	6	198918	198923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4082	NC_021490	GTC	2	6	198943	198948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4083	NC_021490	GTG	2	6	198956	198961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556256
4084	NC_021490	TGC	2	6	198987	198992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4085	NC_021490	CG	3	6	198996	199001	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
4086	NC_021490	GGC	2	6	199007	199012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556256
4087	NC_021490	GTC	2	6	199057	199062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4088	NC_021490	TCG	2	6	199091	199096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4089	NC_021490	ACG	2	6	199098	199103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4090	NC_021490	GCC	2	6	199142	199147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556256
4091	NC_021490	GGA	3	9	199153	199161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556256
4092	NC_021490	CGAG	2	8	199190	199197	25 %	0 %	50 %	25 %	512556256
4093	NC_021490	TCC	2	6	199205	199210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556256
4094	NC_021490	CAA	2	6	199221	199226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556256
4095	NC_021490	CCGCA	2	10	199282	199291	20 %	0 %	20 %	60 %	512556256
4096	NC_021490	CG	3	6	199296	199301	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
4097	NC_021490	CGG	2	6	199378	199383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556256
4098	NC_021490	CTG	2	6	199470	199475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556256
4099	NC_021490	CA	3	6	199518	199523	50 %	0 %	0 %	50 %	512556256
4100	NC_021490	T	6	6	199575	199580	0 %	100 %	0 %	0 %	512556256
4101	NC_021490	CAA	2	6	199581	199586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556256
4102	NC_021490	CG	3	6	199628	199633	0 %	0 %	50 %	50 %	512556256
4103	NC_021490	CCT	2	6	199668	199673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556257
4104	NC_021490	G	9	9	199677	199685	0 %	0 %	100 %	0 %	512556257
4105	NC_021490	GTA	2	6	199776	199781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556258
4106	NC_021490	G	6	6	199840	199845	0 %	0 %	100 %	0 %	512556258
4107	NC_021490	TG	3	6	199846	199851	0 %	50 %	50 %	0 %	512556258
4108	NC_021490	GGT	2	6	199934	199939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556258
4109	NC_021490	CG	3	6	200001	200006	0 %	0 %	50 %	50 %	512556258
4110	NC_021490	TTG	2	6	200083	200088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556258
4111	NC_021490	CTT	2	6	200141	200146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556258
4112	NC_021490	GTC	2	6	200148	200153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556258
4113	NC_021490	GCT	2	6	200162	200167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556258
4114	NC_021490	GC	3	6	200176	200181	0 %	0 %	50 %	50 %	512556258
4115	NC_021490	GCT	2	6	200218	200223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556259
4116	NC_021490	GA	3	6	200361	200366	50 %	0 %	50 %	0 %	512556259
4117	NC_021490	TGGCC	2	10	200455	200464	0 %	20 %	40 %	40 %	512556259
4118	NC_021490	TGC	2	6	200477	200482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556259
4119	NC_021490	CTG	2	6	200519	200524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556259
4120	NC_021490	GCC	2	6	200598	200603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556259
4121	NC_021490	GCG	2	6	200740	200745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556259
4122	NC_021490	TCCC	2	8	200785	200792	0 %	25 %	0 %	75 %	512556259
4123	NC_021490	CTC	2	6	200838	200843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556260
4124	NC_021490	GTT	2	6	200922	200927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556260
4125	NC_021490	CCT	2	6	200966	200971	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556260
4126	NC_021490	CTGTG	2	10	201152	201161	0 %	40 %	40 %	20 %	512556260
4127	NC_021490	TTC	2	6	201198	201203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556260
4128	NC_021490	GC	3	6	201208	201213	0 %	0 %	50 %	50 %	512556260
4129	NC_021490	TCTG	2	8	201235	201242	0 %	50 %	25 %	25 %	512556260
4130	NC_021490	GC	3	6	201309	201314	0 %	0 %	50 %	50 %	512556260
4131	NC_021490	AGC	2	6	201337	201342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556260
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4134	NC_021490	GAAA	2	8	201513	201520	75 %	0 %	25 %	0 %	512556260
4135	NC_021490	CGT	2	6	201527	201532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556260
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4147	NC_021490	AAAG	2	8	202001	202008	75 %	0 %	25 %	0 %	512556261
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4149	NC_021490	A	6	6	202088	202093	100 %	0 %	0 %	0 %	512556261
4150	NC_021490	GGGA	2	8	202208	202215	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4151	NC_021490	GGCGC	2	10	202257	202266	0 %	0 %	60 %	40 %	512556262
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4155	NC_021490	GTG	2	6	202600	202605	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556262
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4160	NC_021490	GTGC	2	8	202954	202961	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4161	NC_021490	TCT	2	6	202990	202995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556263
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4232	NC_021490	GT	3	6	205736	205741	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_021490	GGTG	2	8	205759	205766	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_021490	GA	3	6	205800	205805	50 %	0 %	50 %	0 %	512556265
4235	NC_021490	CG	4	8	205855	205862	0 %	0 %	50 %	50 %	512556265
4236	NC_021490	GGCG	2	8	205883	205890	0 %	0 %	75 %	25 %	512556265
4237	NC_021490	CTC	2	6	205951	205956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556265
4238	NC_021490	AAG	2	6	205965	205970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556265
4239	NC_021490	TGAT	2	8	206008	206015	25 %	50 %	25 %	0 %	512556265
4240	NC_021490	ATC	2	6	206016	206021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556265
4241	NC_021490	TGA	2	6	206038	206043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556265
4242	NC_021490	GT	4	8	206103	206110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_021490	AGGT	2	8	206137	206144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4244	NC_021490	TGGT	2	8	206147	206154	0 %	50 %	50 %	0 %	512556266
4245	NC_021490	CGGTGA	2	12	206213	206224	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	512556266
4246	NC_021490	GTG	2	6	206242	206247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556266
4247	NC_021490	GAA	2	6	206310	206315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556266
4248	NC_021490	CCG	2	6	206362	206367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556266
4249	NC_021490	TG	4	8	206463	206470	0 %	50 %	50 %	0 %	512556266
4250	NC_021490	CT	3	6	206471	206476	0 %	50 %	0 %	50 %	512556266
4251	NC_021490	AAAAGG	2	12	206478	206489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556266
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4375	NC_021490	GTAA	2	8	213200	213207	50 %	25 %	25 %	0 %	512556281
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4385	NC_021490	CCTG	2	8	214023	214030	0 %	25 %	25 %	50 %	512556283
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