MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_021490	GTTC	2	8	124293	124300	0 %	50 %	25 %	25 %	512556191
2502	NC_021490	T	7	7	124325	124331	0 %	100 %	0 %	0 %	512556191
2503	NC_021490	GCG	2	6	124348	124353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556191
2504	NC_021490	CGCAG	2	10	124398	124407	20 %	0 %	40 %	40 %	512556191
2505	NC_021490	AGCAC	2	10	124434	124443	40 %	0 %	20 %	40 %	512556191
2506	NC_021490	TG	3	6	124448	124453	0 %	50 %	50 %	0 %	512556191
2507	NC_021490	GC	3	6	124502	124507	0 %	0 %	50 %	50 %	512556191
2508	NC_021490	ATA	2	6	124520	124525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556191
2509	NC_021490	CACG	2	8	124537	124544	25 %	0 %	25 %	50 %	512556191
2510	NC_021490	TTG	2	6	124550	124555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556191
2511	NC_021490	T	6	6	124566	124571	0 %	100 %	0 %	0 %	512556191
2512	NC_021490	GCA	2	6	124596	124601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556191
2513	NC_021490	GC	4	8	124606	124613	0 %	0 %	50 %	50 %	512556191
2514	NC_021490	TCC	2	6	124667	124672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_021490	GC	3	6	124688	124693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2516	NC_021490	ACTG	2	8	124708	124715	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_021490	TG	3	6	124754	124759	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_021490	GCT	2	6	124789	124794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2519	NC_021490	TGAG	2	8	124851	124858	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_021490	CCTC	2	8	124905	124912	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2521	NC_021490	TG	4	8	124950	124957	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_021490	TCC	2	6	124968	124973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_021490	AGA	2	6	125033	125038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_021490	GAG	2	6	125086	125091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_021490	TCTCAA	2	12	125131	125142	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2526	NC_021490	GT	3	6	125176	125181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_021490	GAAC	2	8	125215	125222	50 %	0 %	25 %	25 %	512556192
2528	NC_021490	TGG	2	6	125244	125249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556192
2529	NC_021490	GC	3	6	125353	125358	0 %	0 %	50 %	50 %	512556192
2530	NC_021490	AG	3	6	125378	125383	50 %	0 %	50 %	0 %	512556192
2531	NC_021490	GGCG	2	8	125392	125399	0 %	0 %	75 %	25 %	512556192
2532	NC_021490	T	8	8	125405	125412	0 %	100 %	0 %	0 %	512556192
2533	NC_021490	T	6	6	125438	125443	0 %	100 %	0 %	0 %	512556192
2534	NC_021490	TCG	2	6	125450	125455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2535	NC_021490	A	6	6	125541	125546	100 %	0 %	0 %	0 %	512556192
2536	NC_021490	T	6	6	125559	125564	0 %	100 %	0 %	0 %	512556192
2537	NC_021490	T	6	6	125600	125605	0 %	100 %	0 %	0 %	512556192
2538	NC_021490	CCT	2	6	125650	125655	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556192
2539	NC_021490	AGC	2	6	125688	125693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2540	NC_021490	TGC	2	6	125716	125721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2541	NC_021490	TGCG	2	8	125748	125755	0 %	25 %	50 %	25 %	512556192
2542	NC_021490	CCT	2	6	125758	125763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556192
2543	NC_021490	GGC	2	6	125824	125829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556192
2544	NC_021490	GC	4	8	125828	125835	0 %	0 %	50 %	50 %	512556192
2545	NC_021490	T	6	6	125853	125858	0 %	100 %	0 %	0 %	512556192
2546	NC_021490	CTG	2	6	125882	125887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2547	NC_021490	GT	3	6	125918	125923	0 %	50 %	50 %	0 %	512556192
2548	NC_021490	GT	3	6	125962	125967	0 %	50 %	50 %	0 %	512556192
2549	NC_021490	AGCA	2	8	125978	125985	50 %	0 %	25 %	25 %	512556192
2550	NC_021490	GCT	2	6	126071	126076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2551	NC_021490	AGG	2	6	126087	126092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556192
2552	NC_021490	GTT	2	6	126107	126112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556192
2553	NC_021490	GGT	2	6	126200	126205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556192
2554	NC_021490	A	6	6	126239	126244	100 %	0 %	0 %	0 %	512556192
2555	NC_021490	TCT	2	6	126316	126321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556192
2556	NC_021490	GA	3	6	126393	126398	50 %	0 %	50 %	0 %	512556192
2557	NC_021490	A	6	6	126415	126420	100 %	0 %	0 %	0 %	512556192
2558	NC_021490	GC	3	6	126440	126445	0 %	0 %	50 %	50 %	512556192
2559	NC_021490	CCG	2	6	126455	126460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556192
2560	NC_021490	TCG	2	6	126493	126498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556192
2561	NC_021490	CA	3	6	126629	126634	50 %	0 %	0 %	50 %	512556192
2562	NC_021490	CTTG	2	8	126700	126707	0 %	50 %	25 %	25 %	512556192
2563	NC_021490	CATTG	2	10	126728	126737	20 %	40 %	20 %	20 %	512556192
2564	NC_021490	TAG	2	6	126888	126893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556192
2565	NC_021490	GTG	2	6	126977	126982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2566	NC_021490	GCA	2	6	126987	126992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556193
2567	NC_021490	CAG	2	6	127003	127008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556193
2568	NC_021490	G	6	6	127064	127069	0 %	0 %	100 %	0 %	512556193
2569	NC_021490	CCGTG	2	10	127089	127098	0 %	20 %	40 %	40 %	512556193
2570	NC_021490	TCG	2	6	127137	127142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556193
2571	NC_021490	GC	3	6	127191	127196	0 %	0 %	50 %	50 %	512556193
2572	NC_021490	T	6	6	127277	127282	0 %	100 %	0 %	0 %	512556193
2573	NC_021490	GAT	2	6	127339	127344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556193
2574	NC_021490	T	8	8	127350	127357	0 %	100 %	0 %	0 %	512556193
2575	NC_021490	TG	3	6	127385	127390	0 %	50 %	50 %	0 %	512556193
2576	NC_021490	GTA	2	6	127391	127396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556193
2577	NC_021490	A	6	6	127415	127420	100 %	0 %	0 %	0 %	512556193
2578	NC_021490	TTTTAA	2	12	127473	127484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556193
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2581	NC_021490	TG	3	6	127601	127606	0 %	50 %	50 %	0 %	512556193
2582	NC_021490	GAC	2	6	127632	127637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556193
2583	NC_021490	TG	3	6	127660	127665	0 %	50 %	50 %	0 %	512556193
2584	NC_021490	CTC	2	6	127702	127707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556193
2585	NC_021490	GT	4	8	127737	127744	0 %	50 %	50 %	0 %	512556193
2586	NC_021490	TGCA	2	8	127873	127880	25 %	25 %	25 %	25 %	512556193
2587	NC_021490	A	7	7	127895	127901	100 %	0 %	0 %	0 %	512556193
2588	NC_021490	GCAT	2	8	127915	127922	25 %	25 %	25 %	25 %	512556193
2589	NC_021490	ACG	2	6	127925	127930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556193
2590	NC_021490	CA	3	6	128066	128071	50 %	0 %	0 %	50 %	512556193
2591	NC_021490	GAA	2	6	128185	128190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556193
2592	NC_021490	CCGA	2	8	128309	128316	25 %	0 %	25 %	50 %	512556193
2593	NC_021490	TTC	3	9	128400	128408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556193
2594	NC_021490	TAT	2	6	128472	128477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556194
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2596	NC_021490	T	6	6	128584	128589	0 %	100 %	0 %	0 %	512556194
2597	NC_021490	GT	3	6	128676	128681	0 %	50 %	50 %	0 %	512556194
2598	NC_021490	TCA	2	6	128792	128797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556194
2599	NC_021490	AACCA	2	10	128813	128822	60 %	0 %	0 %	40 %	512556194
2600	NC_021490	CTT	2	6	128858	128863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556194
2601	NC_021490	CGA	2	6	129008	129013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556194
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2603	NC_021490	GCG	2	6	129032	129037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556194
2604	NC_021490	T	8	8	129060	129067	0 %	100 %	0 %	0 %	512556194
2605	NC_021490	GAA	2	6	129139	129144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556194
2606	NC_021490	CTT	2	6	129188	129193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556194
2607	NC_021490	CGA	2	6	129232	129237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556194
2608	NC_021490	AAG	2	6	129249	129254	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556194
2609	NC_021490	TAA	2	6	129321	129326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556194
2610	NC_021490	TCA	2	6	129406	129411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556194
2611	NC_021490	AAAAG	2	10	129464	129473	80 %	0 %	20 %	0 %	512556194
2612	NC_021490	CG	3	6	129529	129534	0 %	0 %	50 %	50 %	512556194
2613	NC_021490	GCA	2	6	129544	129549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556194
2614	NC_021490	CAG	2	6	129556	129561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556194
2615	NC_021490	T	6	6	129572	129577	0 %	100 %	0 %	0 %	512556194
2616	NC_021490	A	6	6	129611	129616	100 %	0 %	0 %	0 %	512556194
2617	NC_021490	TG	4	8	129619	129626	0 %	50 %	50 %	0 %	512556194
2618	NC_021490	CTT	2	6	129656	129661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556194
2619	NC_021490	CG	3	6	129671	129676	0 %	0 %	50 %	50 %	512556194
2620	NC_021490	GCG	2	6	129712	129717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556194
2621	NC_021490	AGT	2	6	129739	129744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556194
2622	NC_021490	CAT	2	6	129759	129764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556194
2623	NC_021490	CCT	2	6	129766	129771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2624	NC_021490	TGAG	2	8	129784	129791	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_021490	TG	3	6	129819	129824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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2750	NC_021490	AGA	2	6	136756	136761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2751	NC_021490	AC	3	6	136790	136795	50 %	0 %	0 %	50 %	512556200
2752	NC_021490	GACA	2	8	136812	136819	50 %	0 %	25 %	25 %	512556200
2753	NC_021490	AG	3	6	136830	136835	50 %	0 %	50 %	0 %	512556200
2754	NC_021490	CCT	2	6	136883	136888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556200
2755	NC_021490	CTG	2	6	136938	136943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556200
2756	NC_021490	ATC	2	6	136954	136959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556200
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2758	NC_021490	GCT	2	6	137024	137029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556200
2759	NC_021490	CTGA	2	8	137030	137037	25 %	25 %	25 %	25 %	512556200
2760	NC_021490	GTCTT	2	10	137147	137156	0 %	60 %	20 %	20 %	512556200
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2763	NC_021490	AAC	2	6	137198	137203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556200
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2769	NC_021490	GC	3	6	137325	137330	0 %	0 %	50 %	50 %	512556200
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2794	NC_021490	GCT	2	6	138719	138724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556201
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2824	NC_021490	GT	3	6	139648	139653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2825	NC_021490	GCA	2	6	139676	139681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2827	NC_021490	GCAT	2	8	139712	139719	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2828	NC_021490	TGA	2	6	139805	139810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556203
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2840	NC_021490	GGT	2	6	140918	140923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2842	NC_021490	C	9	9	140952	140960	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2843	NC_021490	CG	3	6	140980	140985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2844	NC_021490	CT	3	6	141025	141030	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2845	NC_021490	GCT	2	6	141113	141118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556204
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2848	NC_021490	CTGC	2	8	141215	141222	0 %	25 %	25 %	50 %	512556204
2849	NC_021490	AGT	2	6	141464	141469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556204
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2851	NC_021490	CTG	2	6	141545	141550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556204
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2856	NC_021490	CAC	2	6	141850	141855	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556204
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2859	NC_021490	TCCA	2	8	142049	142056	25 %	25 %	0 %	50 %	512556204
2860	NC_021490	ATC	2	6	142069	142074	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556204
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2862	NC_021490	CAG	2	6	142136	142141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556204
2863	NC_021490	ACCAA	2	10	142271	142280	60 %	0 %	0 %	40 %	512556204
2864	NC_021490	GA	3	6	142298	142303	50 %	0 %	50 %	0 %	512556204
2865	NC_021490	ATG	2	6	142447	142452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556204
2866	NC_021490	ACG	2	6	142465	142470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556204
2867	NC_021490	T	6	6	142594	142599	0 %	100 %	0 %	0 %	512556204
2868	NC_021490	CAT	2	6	142637	142642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556204
2869	NC_021490	GC	3	6	142668	142673	0 %	0 %	50 %	50 %	512556204
2870	NC_021490	CG	3	6	142679	142684	0 %	0 %	50 %	50 %	512556204
2871	NC_021490	T	7	7	142728	142734	0 %	100 %	0 %	0 %	512556204
2872	NC_021490	AGCCA	2	10	142743	142752	40 %	0 %	20 %	40 %	512556204
2873	NC_021490	CCA	2	6	142757	142762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556204
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2875	NC_021490	TCT	2	6	142843	142848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556204
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