MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_021490	AGGA	2	8	100521	100528	50 %	0 %	50 %	0 %	512556173
2002	NC_021490	GCG	2	6	100535	100540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556173
2003	NC_021490	CG	5	10	100539	100548	0 %	0 %	50 %	50 %	512556173
2004	NC_021490	GTA	2	6	100605	100610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556173
2005	NC_021490	GC	3	6	100852	100857	0 %	0 %	50 %	50 %	512556173
2006	NC_021490	GGT	2	6	100882	100887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556173
2007	NC_021490	GTC	2	6	100888	100893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556173
2008	NC_021490	TTC	2	6	100936	100941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556173
2009	NC_021490	CAGC	2	8	100961	100968	25 %	0 %	25 %	50 %	512556173
2010	NC_021490	CTT	2	6	100978	100983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556173
2011	NC_021490	TTG	2	6	100985	100990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556173
2012	NC_021490	CGCA	2	8	101003	101010	25 %	0 %	25 %	50 %	512556173
2013	NC_021490	GCC	2	6	101048	101053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556173
2014	NC_021490	GCG	2	6	101068	101073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556173
2015	NC_021490	GCT	2	6	101093	101098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556173
2016	NC_021490	GT	3	6	101153	101158	0 %	50 %	50 %	0 %	512556173
2017	NC_021490	CG	3	6	101163	101168	0 %	0 %	50 %	50 %	512556173
2018	NC_021490	GCT	2	6	101182	101187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556173
2019	NC_021490	TGC	2	6	101203	101208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556173
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2021	NC_021490	GCC	2	6	101278	101283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556173
2022	NC_021490	TG	3	6	101289	101294	0 %	50 %	50 %	0 %	512556173
2023	NC_021490	ATA	2	6	101336	101341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556173
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2028	NC_021490	GAT	2	6	101613	101618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2029	NC_021490	AGC	2	6	101641	101646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556174
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2031	NC_021490	GAG	2	6	101688	101693	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556174
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2034	NC_021490	CGT	2	6	101826	101831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556174
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2036	NC_021490	TG	3	6	101873	101878	0 %	50 %	50 %	0 %	512556174
2037	NC_021490	GC	3	6	101933	101938	0 %	0 %	50 %	50 %	512556174
2038	NC_021490	GC	3	6	102069	102074	0 %	0 %	50 %	50 %	512556174
2039	NC_021490	GA	3	6	102097	102102	50 %	0 %	50 %	0 %	512556174
2040	NC_021490	TGC	2	6	102126	102131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556175
2041	NC_021490	GC	3	6	102185	102190	0 %	0 %	50 %	50 %	512556175
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2043	NC_021490	GT	3	6	102219	102224	0 %	50 %	50 %	0 %	512556175
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2052	NC_021490	TGC	2	6	102593	102598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556175
2053	NC_021490	GTA	2	6	102767	102772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2054	NC_021490	AAT	2	6	102775	102780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2055	NC_021490	CG	3	6	102786	102791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2056	NC_021490	TTGA	2	8	102850	102857	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_021490	GCG	2	6	102914	102919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556176
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2062	NC_021490	GCT	2	6	103218	103223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556176
2063	NC_021490	ATG	2	6	103224	103229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556176
2064	NC_021490	CG	4	8	103280	103287	0 %	0 %	50 %	50 %	512556176
2065	NC_021490	TTC	2	6	103288	103293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556176
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2091	NC_021490	G	7	7	104275	104281	0 %	0 %	100 %	0 %	512556177
2092	NC_021490	CT	3	6	104326	104331	0 %	50 %	0 %	50 %	512556177
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2095	NC_021490	AGCA	2	8	104403	104410	50 %	0 %	25 %	25 %	512556177
2096	NC_021490	GCA	2	6	104479	104484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556177
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2108	NC_021490	CGA	2	6	105328	105333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556177
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2110	NC_021490	GA	3	6	105419	105424	50 %	0 %	50 %	0 %	512556177
2111	NC_021490	GGT	2	6	105432	105437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556177
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2118	NC_021490	AC	3	6	105724	105729	50 %	0 %	0 %	50 %	512556177
2119	NC_021490	CG	3	6	105761	105766	0 %	0 %	50 %	50 %	512556177
2120	NC_021490	AGCG	2	8	105796	105803	25 %	0 %	50 %	25 %	512556177
2121	NC_021490	GC	3	6	105854	105859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2122	NC_021490	TTC	2	6	105860	105865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2123	NC_021490	CGC	2	6	105931	105936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556178
2124	NC_021490	CG	3	6	105946	105951	0 %	0 %	50 %	50 %	512556178
2125	NC_021490	GC	3	6	105988	105993	0 %	0 %	50 %	50 %	512556178
2126	NC_021490	CGC	2	6	106016	106021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556178
2127	NC_021490	TGT	2	6	106078	106083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556178
2128	NC_021490	TCA	2	6	106135	106140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556178
2129	NC_021490	TTG	2	6	106201	106206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556178
2130	NC_021490	AGCG	2	8	106225	106232	25 %	0 %	50 %	25 %	512556178
2131	NC_021490	CTA	2	6	106241	106246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556178
2132	NC_021490	CAA	2	6	106265	106270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556178
2133	NC_021490	CACC	2	8	106317	106324	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2134	NC_021490	CTG	2	6	106359	106364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2135	NC_021490	AGA	2	6	106461	106466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556179
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2137	NC_021490	CT	3	6	106676	106681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2138	NC_021490	GA	3	6	106687	106692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_021490	TGCT	2	8	106695	106702	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2140	NC_021490	AGC	2	6	106710	106715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2142	NC_021490	CG	3	6	106771	106776	0 %	0 %	50 %	50 %	512556180
2143	NC_021490	CAGG	2	8	106778	106785	25 %	0 %	50 %	25 %	512556180
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2147	NC_021490	GC	3	6	106880	106885	0 %	0 %	50 %	50 %	512556180
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2152	NC_021490	CG	3	6	107022	107027	0 %	0 %	50 %	50 %	512556180
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2154	NC_021490	TG	4	8	107050	107057	0 %	50 %	50 %	0 %	512556180
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2157	NC_021490	GCGTC	2	10	107121	107130	0 %	20 %	40 %	40 %	512556180
2158	NC_021490	AG	3	6	107198	107203	50 %	0 %	50 %	0 %	512556180
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2162	NC_021490	GCA	2	6	107331	107336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556180
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2164	NC_021490	TGG	2	6	107392	107397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556181
2165	NC_021490	T	6	6	107481	107486	0 %	100 %	0 %	0 %	512556181
2166	NC_021490	AGG	3	9	107550	107558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556181
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2168	NC_021490	TAA	2	6	107647	107652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556181
2169	NC_021490	GTCGGT	2	12	107690	107701	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556181
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2178	NC_021490	GAACG	2	10	108052	108061	40 %	0 %	40 %	20 %	512556181
2179	NC_021490	TG	3	6	108192	108197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2180	NC_021490	AGTG	2	8	108316	108323	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2181	NC_021490	CG	3	6	108364	108369	0 %	0 %	50 %	50 %	512556182
2182	NC_021490	GTTCC	2	10	108381	108390	0 %	40 %	20 %	40 %	512556182
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2188	NC_021490	CTAT	2	8	108767	108774	25 %	50 %	0 %	25 %	512556182
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2193	NC_021490	CT	3	6	108908	108913	0 %	50 %	0 %	50 %	512556182
2194	NC_021490	CTTT	2	8	108974	108981	0 %	75 %	0 %	25 %	512556183
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2203	NC_021490	GGGT	2	8	109296	109303	0 %	25 %	75 %	0 %	512556183
2204	NC_021490	GT	3	6	109302	109307	0 %	50 %	50 %	0 %	512556183
2205	NC_021490	CGTG	2	8	109353	109360	0 %	25 %	50 %	25 %	512556183
2206	NC_021490	TC	3	6	109369	109374	0 %	50 %	0 %	50 %	512556183
2207	NC_021490	TGT	2	6	109380	109385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556183
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2212	NC_021490	CTG	2	6	109574	109579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556183
2213	NC_021490	CTT	2	6	109688	109693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556183
2214	NC_021490	GGGT	2	8	109748	109755	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2215	NC_021490	T	6	6	109773	109778	0 %	100 %	0 %	0 %	512556184
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2217	NC_021490	GC	3	6	109837	109842	0 %	0 %	50 %	50 %	512556184
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2220	NC_021490	CGT	2	6	109975	109980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556184
2221	NC_021490	TTCG	2	8	110012	110019	0 %	50 %	25 %	25 %	512556184
2222	NC_021490	T	7	7	110263	110269	0 %	100 %	0 %	0 %	512556184
2223	NC_021490	CAA	2	6	110309	110314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556184
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2226	NC_021490	CCTCG	2	10	110527	110536	0 %	20 %	20 %	60 %	512556184
2227	NC_021490	ATG	2	6	110545	110550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556184
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2229	NC_021490	TTTC	2	8	110615	110622	0 %	75 %	0 %	25 %	512556184
2230	NC_021490	A	6	6	110628	110633	100 %	0 %	0 %	0 %	512556184
2231	NC_021490	GCC	2	6	110640	110645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556184
2232	NC_021490	ACT	2	6	110730	110735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556184
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2234	NC_021490	TG	3	6	110882	110887	0 %	50 %	50 %	0 %	512556184
2235	NC_021490	AG	3	6	110982	110987	50 %	0 %	50 %	0 %	512556184
2236	NC_021490	GTG	2	6	110997	111002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556184
2237	NC_021490	ATTG	2	8	111022	111029	25 %	50 %	25 %	0 %	512556184
2238	NC_021490	ATC	2	6	111030	111035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556184
2239	NC_021490	CTA	2	6	111041	111046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556184
2240	NC_021490	CTG	2	6	111087	111092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556184
2241	NC_021490	AAT	2	6	111223	111228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556184
2242	NC_021490	TGC	2	6	111372	111377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556184
2243	NC_021490	TCA	2	6	111406	111411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556184
2244	NC_021490	TTC	2	6	111424	111429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556184
2245	NC_021490	GC	3	6	111624	111629	0 %	0 %	50 %	50 %	512556184
2246	NC_021490	CG	3	6	111638	111643	0 %	0 %	50 %	50 %	512556184
2247	NC_021490	AG	3	6	111726	111731	50 %	0 %	50 %	0 %	512556184
2248	NC_021490	A	6	6	111764	111769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2249	NC_021490	GATG	2	8	111825	111832	25 %	25 %	50 %	0 %	512556185
2250	NC_021490	GCG	2	6	112006	112011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556185
2251	NC_021490	TTC	2	6	112050	112055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556185
2252	NC_021490	TCG	2	6	112112	112117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556185
2253	NC_021490	AC	3	6	112130	112135	50 %	0 %	0 %	50 %	512556185
2254	NC_021490	GTG	2	6	112171	112176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556185
2255	NC_021490	GTG	2	6	112249	112254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556185
2256	NC_021490	GCAG	2	8	112296	112303	25 %	0 %	50 %	25 %	512556185
2257	NC_021490	GTG	2	6	112328	112333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556185
2258	NC_021490	GC	3	6	112350	112355	0 %	0 %	50 %	50 %	512556185
2259	NC_021490	CCT	2	6	112417	112422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556185
2260	NC_021490	TGA	2	6	112485	112490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556185
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2262	NC_021490	CAT	2	6	112569	112574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556185
2263	NC_021490	CA	3	6	112593	112598	50 %	0 %	0 %	50 %	512556185
2264	NC_021490	CTGCG	2	10	112601	112610	0 %	20 %	40 %	40 %	512556185
2265	NC_021490	CGTG	2	8	112617	112624	0 %	25 %	50 %	25 %	512556185
2266	NC_021490	TGA	2	6	112650	112655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556185
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2271	NC_021490	TG	3	6	112915	112920	0 %	50 %	50 %	0 %	512556185
2272	NC_021490	T	6	6	112934	112939	0 %	100 %	0 %	0 %	512556185
2273	NC_021490	TCG	2	6	112944	112949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556185
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2279	NC_021490	ACTG	2	8	113160	113167	25 %	25 %	25 %	25 %	512556185
2280	NC_021490	CGTA	2	8	113174	113181	25 %	25 %	25 %	25 %	512556185
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2283	NC_021490	GCTC	2	8	113251	113258	0 %	25 %	25 %	50 %	512556185
2284	NC_021490	GTGC	2	8	113287	113294	0 %	25 %	50 %	25 %	512556185
2285	NC_021490	CGC	2	6	113332	113337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556185
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2287	NC_021490	GATGT	2	10	113381	113390	20 %	40 %	40 %	0 %	512556185
2288	NC_021490	GT	3	6	113389	113394	0 %	50 %	50 %	0 %	512556185
2289	NC_021490	GC	3	6	113458	113463	0 %	0 %	50 %	50 %	512556185
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2293	NC_021490	AAG	2	6	113657	113662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2294	NC_021490	T	6	6	113747	113752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2295	NC_021490	TA	3	6	113762	113767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2296	NC_021490	CGT	2	6	113774	113779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2300	NC_021490	ATC	2	6	113990	113995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556186
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2331	NC_021490	CG	3	6	115535	115540	0 %	0 %	50 %	50 %	512556186
2332	NC_021490	TGCG	2	8	115589	115596	0 %	25 %	50 %	25 %	512556186
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2363	NC_021490	GTG	2	6	116931	116936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556187
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2365	NC_021490	GGAT	2	8	117013	117020	25 %	25 %	50 %	0 %	512556187
2366	NC_021490	ATCTGC	2	12	117196	117207	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512556187
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2369	NC_021490	TCAGA	2	10	117439	117448	40 %	20 %	20 %	20 %	512556187
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2371	NC_021490	GGA	2	6	117529	117534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556187
2372	NC_021490	ATT	2	6	117561	117566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556187
2373	NC_021490	CAG	2	6	117585	117590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556187
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2375	NC_021490	T	7	7	117663	117669	0 %	100 %	0 %	0 %	512556187
2376	NC_021490	TGT	2	6	117679	117684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556187
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2380	NC_021490	GAA	2	6	117868	117873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556187
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2467	NC_021490	GA	3	6	121987	121992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2468	NC_021490	A	6	6	122150	122155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2469	NC_021490	CGCC	2	8	122191	122198	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2470	NC_021490	A	6	6	122210	122215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2471	NC_021490	C	10	10	122230	122239	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2472	NC_021490	CA	3	6	122253	122258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2473	NC_021490	GAG	2	6	122264	122269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2474	NC_021490	ATA	2	6	122290	122295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512556190
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2484	NC_021490	C	7	7	123125	123131	0 %	0 %	0 %	100 %	512556190
2485	NC_021490	CGA	2	6	123173	123178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556190
2486	NC_021490	C	6	6	123195	123200	0 %	0 %	0 %	100 %	512556190
2487	NC_021490	CG	3	6	123203	123208	0 %	0 %	50 %	50 %	512556190
2488	NC_021490	AGC	2	6	123217	123222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556190
2489	NC_021490	ACC	2	6	123225	123230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556190
2490	NC_021490	GAA	2	6	123444	123449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556190
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2492	NC_021490	TCC	2	6	123676	123681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2493	NC_021490	CTG	2	6	123818	123823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556191
2494	NC_021490	GTGC	2	8	123920	123927	0 %	25 %	50 %	25 %	512556191
2495	NC_021490	GCA	2	6	123928	123933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556191
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2498	NC_021490	ATG	2	6	124154	124159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556191
2499	NC_021490	GCGT	2	8	124260	124267	0 %	25 %	50 %	25 %	512556191
2500	NC_021490	AAC	2	6	124287	124292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556191

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