MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23501	NC_021490	CAC	2	6	1114887	1114892	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557047
23502	NC_021490	GAG	2	6	1115026	1115031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557047
23503	NC_021490	AC	3	6	1115091	1115096	50 %	0 %	0 %	50 %	512557048
23504	NC_021490	ATT	2	6	1115123	1115128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512557048
23505	NC_021490	CTGTGC	2	12	1115173	1115184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557048
23506	NC_021490	AGG	2	6	1115194	1115199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557048
23507	NC_021490	GT	4	8	1115214	1115221	0 %	50 %	50 %	0 %	512557048
23508	NC_021490	TG	3	6	1115224	1115229	0 %	50 %	50 %	0 %	512557048
23509	NC_021490	GC	3	6	1115287	1115292	0 %	0 %	50 %	50 %	512557048
23510	NC_021490	ACG	2	6	1115391	1115396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557048
23511	NC_021490	GCG	2	6	1115452	1115457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557048
23512	NC_021490	GGA	3	9	1115482	1115490	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557048
23513	NC_021490	TGC	2	6	1115509	1115514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557048
23514	NC_021490	AGG	2	6	1115598	1115603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557048
23515	NC_021490	AGA	2	6	1115668	1115673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557048
23516	NC_021490	TGCGA	2	10	1115682	1115691	20 %	20 %	40 %	20 %	512557048
23517	NC_021490	TCGTA	2	10	1115768	1115777	20 %	40 %	20 %	20 %	512557048
23518	NC_021490	AGA	2	6	1115851	1115856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557048
23519	NC_021490	CACT	2	8	1115924	1115931	25 %	25 %	0 %	50 %	512557048
23520	NC_021490	ACCTG	2	10	1115965	1115974	20 %	20 %	20 %	40 %	512557048
23521	NC_021490	TC	3	6	1116001	1116006	0 %	50 %	0 %	50 %	512557048
23522	NC_021490	GCG	2	6	1116034	1116039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557048
23523	NC_021490	CGA	2	6	1116152	1116157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557048
23524	NC_021490	GTA	2	6	1116191	1116196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557048
23525	NC_021490	GAA	2	6	1116202	1116207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557048
23526	NC_021490	AT	3	6	1116303	1116308	50 %	50 %	0 %	0 %	512557048
23527	NC_021490	GAA	2	6	1116386	1116391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557048
23528	NC_021490	GC	3	6	1116511	1116516	0 %	0 %	50 %	50 %	512557048
23529	NC_021490	CCA	2	6	1116544	1116549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557048
23530	NC_021490	CT	3	6	1116554	1116559	0 %	50 %	0 %	50 %	512557048
23531	NC_021490	GCG	2	6	1116593	1116598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23532	NC_021490	TC	3	6	1116600	1116605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23533	NC_021490	GCCCG	2	10	1116617	1116626	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23534	NC_021490	GAA	2	6	1116640	1116645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23535	NC_021490	CTA	2	6	1116661	1116666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557049
23536	NC_021490	CGCCTT	2	12	1116667	1116678	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	512557049
23537	NC_021490	CAC	2	6	1116715	1116720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557049
23538	NC_021490	AGG	2	6	1116733	1116738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557049
23539	NC_021490	GT	3	6	1116741	1116746	0 %	50 %	50 %	0 %	512557049
23540	NC_021490	AT	3	6	1116769	1116774	50 %	50 %	0 %	0 %	512557049
23541	NC_021490	A	6	6	1117065	1117070	100 %	0 %	0 %	0 %	512557049
23542	NC_021490	CG	3	6	1117071	1117076	0 %	0 %	50 %	50 %	512557049
23543	NC_021490	ACT	2	6	1117081	1117086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557049
23544	NC_021490	CA	3	6	1117140	1117145	50 %	0 %	0 %	50 %	512557049
23545	NC_021490	CCTG	2	8	1117179	1117186	0 %	25 %	25 %	50 %	512557049
23546	NC_021490	TAA	2	6	1117191	1117196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	512557049
23547	NC_021490	A	6	6	1117195	1117200	100 %	0 %	0 %	0 %	512557049
23548	NC_021490	TCA	2	6	1117259	1117264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557049
23549	NC_021490	A	6	6	1117295	1117300	100 %	0 %	0 %	0 %	512557049
23550	NC_021490	CCA	2	6	1117341	1117346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557049
23551	NC_021490	ACT	2	6	1117355	1117360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557049
23552	NC_021490	A	6	6	1117402	1117407	100 %	0 %	0 %	0 %	512557049
23553	NC_021490	TGAT	2	8	1117466	1117473	25 %	50 %	25 %	0 %	512557049
23554	NC_021490	A	6	6	1117503	1117508	100 %	0 %	0 %	0 %	512557049
23555	NC_021490	GAATC	2	10	1117515	1117524	40 %	20 %	20 %	20 %	512557049
23556	NC_021490	TTC	2	6	1117657	1117662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557049
23557	NC_021490	CCG	2	6	1117778	1117783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557049
23558	NC_021490	GC	4	8	1117833	1117840	0 %	0 %	50 %	50 %	512557049
23559	NC_021490	CA	3	6	1117845	1117850	50 %	0 %	0 %	50 %	512557049
23560	NC_021490	GAA	2	6	1117871	1117876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557049
23561	NC_021490	T	6	6	1117883	1117888	0 %	100 %	0 %	0 %	512557049
23562	NC_021490	GGA	2	6	1117906	1117911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512557049
23563	NC_021490	AGAA	2	8	1118049	1118056	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23564	NC_021490	CGG	2	6	1118068	1118073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23565	NC_021490	CGA	2	6	1118109	1118114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557050
23566	NC_021490	TTC	2	6	1118216	1118221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557050
23567	NC_021490	TCTGCA	2	12	1118256	1118267	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	512557050
23568	NC_021490	CG	3	6	1118352	1118357	0 %	0 %	50 %	50 %	512557050
23569	NC_021490	ATC	2	6	1118366	1118371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557050
23570	NC_021490	GCT	2	6	1118455	1118460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557050
23571	NC_021490	CGAG	2	8	1118478	1118485	25 %	0 %	50 %	25 %	512557050
23572	NC_021490	TCA	2	6	1118550	1118555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557050
23573	NC_021490	CTC	2	6	1118576	1118581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23574	NC_021490	GC	3	6	1118596	1118601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23575	NC_021490	CACC	2	8	1118632	1118639	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23576	NC_021490	TCC	2	6	1118661	1118666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23577	NC_021490	CTT	2	6	1118748	1118753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557051
23578	NC_021490	GCAC	2	8	1118824	1118831	25 %	0 %	25 %	50 %	512557051
23579	NC_021490	GC	4	8	1118836	1118843	0 %	0 %	50 %	50 %	512557051
23580	NC_021490	CCG	2	6	1118881	1118886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557051
23581	NC_021490	CGC	2	6	1118914	1118919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557051
23582	NC_021490	CCG	2	6	1118966	1118971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512557051
23583	NC_021490	AC	3	6	1119033	1119038	50 %	0 %	0 %	50 %	512557051
23584	NC_021490	GCGA	2	8	1119039	1119046	25 %	0 %	50 %	25 %	512557051
23585	NC_021490	TTC	2	6	1119082	1119087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557051
23586	NC_021490	C	6	6	1119285	1119290	0 %	0 %	0 %	100 %	512557052
23587	NC_021490	GTA	2	6	1119309	1119314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512557052
23588	NC_021490	CG	4	8	1119440	1119447	0 %	0 %	50 %	50 %	512557052
23589	NC_021490	GA	3	6	1119611	1119616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23590	NC_021490	CCG	2	6	1119636	1119641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23591	NC_021490	GCA	2	6	1119648	1119653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23592	NC_021490	AGA	2	6	1119717	1119722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23593	NC_021490	CCG	2	6	1119730	1119735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23594	NC_021490	CAG	2	6	1119743	1119748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23595	NC_021490	ACCA	2	8	1119752	1119759	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23596	NC_021490	CAC	2	6	1119770	1119775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23597	NC_021490	GAA	2	6	1119891	1119896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23598	NC_021490	CTG	2	6	1119902	1119907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23599	NC_021490	TGA	2	6	1119946	1119951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23600	NC_021490	CA	3	6	1120000	1120005	50 %	0 %	0 %	50 %	512557053
23601	NC_021490	ATGCGT	2	12	1120072	1120083	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	512557053
23602	NC_021490	TTC	2	6	1120194	1120199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557053
23603	NC_021490	GCT	3	9	1120247	1120255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512557053
23604	NC_021490	CAC	2	6	1120261	1120266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557053
23605	NC_021490	AGA	2	6	1120364	1120369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557053
23606	NC_021490	CTC	2	6	1120398	1120403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512557053
23607	NC_021490	CA	3	6	1120411	1120416	50 %	0 %	0 %	50 %	512557053
23608	NC_021490	CCA	2	6	1120430	1120435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557053
23609	NC_021490	AC	3	6	1120469	1120474	50 %	0 %	0 %	50 %	512557053
23610	NC_021490	GCG	2	6	1120487	1120492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557053
23611	NC_021490	CTT	2	6	1120517	1120522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512557053
23612	NC_021490	CGCA	2	8	1120586	1120593	25 %	0 %	25 %	50 %	512557053
23613	NC_021490	AAC	2	6	1120726	1120731	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512557053
23614	NC_021490	TGTA	2	8	1120845	1120852	25 %	50 %	25 %	0 %	512557053
23615	NC_021490	ACC	2	6	1120903	1120908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512557053
23616	NC_021490	AGCG	2	8	1120937	1120944	25 %	0 %	50 %	25 %	512557053
23617	NC_021490	TG	3	6	1121105	1121110	0 %	50 %	50 %	0 %	512557053
23618	NC_021490	T	6	6	1121181	1121186	0 %	100 %	0 %	0 %	512557053
23619	NC_021490	AGAA	2	8	1121194	1121201	75 %	0 %	25 %	0 %	512557053
23620	NC_021490	AAG	2	6	1121316	1121321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512557053
23621	NC_021490	GC	3	6	1121327	1121332	0 %	0 %	50 %	50 %	512557053
23622	NC_021490	GCA	2	6	1121372	1121377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512557053
23623	NC_021490	TAC	2	6	1121436	1121441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512557053
23624	NC_021490	GGC	2	6	1121604	1121609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512557053
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23627	NC_021490	TTC	2	6	1121807	1121812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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23634	NC_021490	TGCA	2	8	1122417	1122424	25 %	25 %	25 %	25 %	512557054
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23707	NC_021490	G	11	11	1125670	1125680	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23708	NC_021490	TGT	2	6	1125681	1125686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23710	NC_021490	T	7	7	1125727	1125733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23863	NC_021490	CG	3	6	1132821	1132826	0 %	0 %	50 %	50 %	512557062
23864	NC_021490	TGCC	2	8	1132840	1132847	0 %	25 %	25 %	50 %	512557062
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