MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_021490	TCAC	2	8	593128	593135	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12503	NC_021490	GAA	2	6	593151	593156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_021490	GC	3	6	593162	593167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12505	NC_021490	GCG	2	6	593203	593208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12506	NC_021490	TGG	2	6	593209	593214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_021490	TTC	3	9	593219	593227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12508	NC_021490	TATT	2	8	593231	593238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_021490	AGG	2	6	593315	593320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556598
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12512	NC_021490	CCA	2	6	593611	593616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556598
12513	NC_021490	CA	3	6	593634	593639	50 %	0 %	0 %	50 %	512556598
12514	NC_021490	GC	3	6	593695	593700	0 %	0 %	50 %	50 %	512556598
12515	NC_021490	CTTCT	2	10	593701	593710	0 %	60 %	0 %	40 %	512556598
12516	NC_021490	CTT	2	6	593728	593733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556598
12517	NC_021490	GTG	2	6	593745	593750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556598
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12520	NC_021490	AAAC	2	8	594024	594031	75 %	0 %	0 %	25 %	512556598
12521	NC_021490	CCGG	2	8	594082	594089	0 %	0 %	50 %	50 %	512556598
12522	NC_021490	GCA	2	6	594118	594123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556598
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12531	NC_021490	GCG	2	6	594430	594435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556598
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12538	NC_021490	CA	3	6	594628	594633	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12539	NC_021490	CCG	2	6	594653	594658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12540	NC_021490	AGGG	2	8	594660	594667	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_021490	GCA	2	6	594951	594956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556599
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12558	NC_021490	AGG	2	6	595532	595537	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556599
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12571	NC_021490	GC	5	10	595980	595989	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
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12594	NC_021490	CGTG	2	8	597031	597038	0 %	25 %	50 %	25 %	512556599
12595	NC_021490	GC	4	8	597055	597062	0 %	0 %	50 %	50 %	512556599
12596	NC_021490	A	6	6	597079	597084	100 %	0 %	0 %	0 %	512556599
12597	NC_021490	CA	3	6	597166	597171	50 %	0 %	0 %	50 %	512556600
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12605	NC_021490	GC	3	6	597467	597472	0 %	0 %	50 %	50 %	512556600
12606	NC_021490	CG	4	8	597531	597538	0 %	0 %	50 %	50 %	512556600
12607	NC_021490	GC	3	6	597547	597552	0 %	0 %	50 %	50 %	512556600
12608	NC_021490	ACA	2	6	597558	597563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556600
12609	NC_021490	AC	3	6	597595	597600	50 %	0 %	0 %	50 %	512556600
12610	NC_021490	AGACAT	2	12	597613	597624	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	512556600
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12624	NC_021490	TGC	3	9	598193	598201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556600
12625	NC_021490	CGTG	2	8	598210	598217	0 %	25 %	50 %	25 %	512556600
12626	NC_021490	GGC	2	6	598303	598308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556600
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12679	NC_021490	GTA	2	6	600106	600111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556602
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12681	NC_021490	CTG	2	6	600205	600210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556602
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12684	NC_021490	A	7	7	600449	600455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12685	NC_021490	AACC	2	8	600476	600483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12686	NC_021490	CTC	2	6	600568	600573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556603
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12691	NC_021490	A	7	7	600785	600791	100 %	0 %	0 %	0 %	512556603
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12715	NC_021490	TTA	2	6	601764	601769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12730	NC_021490	CGCC	2	8	602406	602413	0 %	0 %	25 %	75 %	512556604
12731	NC_021490	CTTT	2	8	602429	602436	0 %	75 %	0 %	25 %	512556604
12732	NC_021490	ACG	2	6	602470	602475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12733	NC_021490	GCA	2	6	602558	602563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556605
12734	NC_021490	GCAAA	2	10	602618	602627	60 %	0 %	20 %	20 %	512556605
12735	NC_021490	AACA	2	8	602746	602753	75 %	0 %	0 %	25 %	512556605
12736	NC_021490	AG	3	6	602776	602781	50 %	0 %	50 %	0 %	512556605
12737	NC_021490	ACA	2	6	602795	602800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556605
12738	NC_021490	A	7	7	602819	602825	100 %	0 %	0 %	0 %	512556605
12739	NC_021490	TG	3	6	602854	602859	0 %	50 %	50 %	0 %	512556605
12740	NC_021490	GCAG	2	8	602896	602903	25 %	0 %	50 %	25 %	512556605
12741	NC_021490	TGC	2	6	602946	602951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556605
12742	NC_021490	CGC	2	6	602982	602987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556605
12743	NC_021490	CCACC	2	10	603033	603042	20 %	0 %	0 %	80 %	512556605
12744	NC_021490	ACA	2	6	603047	603052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556605
12745	NC_021490	GAC	2	6	603081	603086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556605
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12871	NC_021490	CACACG	2	12	608232	608243	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	512556610
12872	NC_021490	CTC	2	6	608352	608357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556610
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12882	NC_021490	ACGC	2	8	608681	608688	25 %	0 %	25 %	50 %	512556610
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12937	NC_021490	GCA	3	9	611227	611235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556612
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12991	NC_021490	CCTT	2	8	613836	613843	0 %	50 %	0 %	50 %	512556614
12992	NC_021490	CCA	2	6	613888	613893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556614
12993	NC_021490	T	6	6	613904	613909	0 %	100 %	0 %	0 %	512556614
12994	NC_021490	CT	3	6	613947	613952	0 %	50 %	0 %	50 %	512556614
12995	NC_021490	T	6	6	613952	613957	0 %	100 %	0 %	0 %	512556614
12996	NC_021490	ACTG	2	8	614026	614033	25 %	25 %	25 %	25 %	512556614
12997	NC_021490	GCAC	2	8	614177	614184	25 %	0 %	25 %	50 %	512556614
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12999	NC_021490	CGG	2	6	614202	614207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556614
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