MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021490	TGT	2	6	25325	25330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556105
502	NC_021490	GCT	2	6	25358	25363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556105
503	NC_021490	T	9	9	25369	25377	0 %	100 %	0 %	0 %	512556105
504	NC_021490	AGA	2	6	25423	25428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556106
505	NC_021490	ACA	2	6	25631	25636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556106
506	NC_021490	T	6	6	25664	25669	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
507	NC_021490	TTA	2	6	25685	25690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556106
508	NC_021490	AG	3	6	25791	25796	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
509	NC_021490	GGA	2	6	25801	25806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556106
510	NC_021490	GATT	2	8	25860	25867	25 %	50 %	25 %	0 %	512556106
511	NC_021490	CTT	2	6	25911	25916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556106
512	NC_021490	T	6	6	25915	25920	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
513	NC_021490	AGCG	2	8	25998	26005	25 %	0 %	50 %	25 %	512556106
514	NC_021490	TG	3	6	26027	26032	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
515	NC_021490	GTATC	2	10	26077	26086	20 %	40 %	20 %	20 %	512556106
516	NC_021490	TGG	2	6	26088	26093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556106
517	NC_021490	GCA	2	6	26099	26104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556106
518	NC_021490	TGC	2	6	26113	26118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556106
519	NC_021490	T	6	6	26122	26127	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
520	NC_021490	CTT	2	6	26130	26135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556106
521	NC_021490	TGC	2	6	26157	26162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556106
522	NC_021490	T	6	6	26196	26201	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
523	NC_021490	GTT	2	6	26248	26253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556106
524	NC_021490	GT	3	6	26254	26259	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
525	NC_021490	A	7	7	26447	26453	100 %	0 %	0 %	0 %	512556106
526	NC_021490	GC	3	6	26471	26476	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
527	NC_021490	TCT	2	6	26549	26554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556106
528	NC_021490	T	7	7	26635	26641	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
529	NC_021490	T	6	6	26699	26704	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
530	NC_021490	TGT	2	6	26724	26729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556106
531	NC_021490	CG	3	6	26740	26745	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
532	NC_021490	CCTT	2	8	26834	26841	0 %	50 %	0 %	50 %	512556106
533	NC_021490	GCAC	2	8	26940	26947	25 %	0 %	25 %	50 %	512556106
534	NC_021490	TGC	2	6	26950	26955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556106
535	NC_021490	GGTGG	2	10	26984	26993	0 %	20 %	80 %	0 %	512556106
536	NC_021490	CAA	2	6	27137	27142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556106
537	NC_021490	GA	3	6	27242	27247	50 %	0 %	50 %	0 %	512556106
538	NC_021490	AGCG	2	8	27253	27260	25 %	0 %	50 %	25 %	512556106
539	NC_021490	T	6	6	27268	27273	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
540	NC_021490	TTGAGA	2	12	27321	27332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556106
541	NC_021490	CAGT	2	8	27344	27351	25 %	25 %	25 %	25 %	512556106
542	NC_021490	GT	4	8	27413	27420	0 %	50 %	50 %	0 %	512556106
543	NC_021490	GC	4	8	27455	27462	0 %	0 %	50 %	50 %	512556106
544	NC_021490	T	6	6	27492	27497	0 %	100 %	0 %	0 %	512556106
545	NC_021490	GTG	2	6	27611	27616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
546	NC_021490	GTT	2	6	27658	27663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556107
547	NC_021490	TGG	2	6	27675	27680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
548	NC_021490	TGG	2	6	27685	27690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
549	NC_021490	TATTT	2	10	27710	27719	20 %	80 %	0 %	0 %	512556107
550	NC_021490	CTGCG	2	10	27776	27785	0 %	20 %	40 %	40 %	512556107
551	NC_021490	TGCG	2	8	27792	27799	0 %	25 %	50 %	25 %	512556107
552	NC_021490	GT	4	8	27807	27814	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
553	NC_021490	CATC	2	8	27821	27828	25 %	25 %	0 %	50 %	512556107
554	NC_021490	T	6	6	27832	27837	0 %	100 %	0 %	0 %	512556107
555	NC_021490	GGT	2	6	27858	27863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
556	NC_021490	GTA	2	6	27932	27937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556107
557	NC_021490	GT	3	6	28048	28053	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
558	NC_021490	AGTG	2	8	28054	28061	25 %	25 %	50 %	0 %	512556107
559	NC_021490	ATG	2	6	28100	28105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556107
560	NC_021490	T	6	6	28110	28115	0 %	100 %	0 %	0 %	512556107
561	NC_021490	TTA	2	6	28131	28136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556107
562	NC_021490	AT	4	8	28141	28148	50 %	50 %	0 %	0 %	512556107
563	NC_021490	TCA	2	6	28202	28207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556107
564	NC_021490	T	6	6	28250	28255	0 %	100 %	0 %	0 %	512556107
565	NC_021490	G	6	6	28267	28272	0 %	0 %	100 %	0 %	512556107
566	NC_021490	T	6	6	28354	28359	0 %	100 %	0 %	0 %	512556107
567	NC_021490	CAG	2	6	28420	28425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556107
568	NC_021490	TTTG	2	8	28438	28445	0 %	75 %	25 %	0 %	512556107
569	NC_021490	TGA	2	6	28485	28490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556107
570	NC_021490	GT	3	6	28494	28499	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
571	NC_021490	TG	3	6	28509	28514	0 %	50 %	50 %	0 %	512556107
572	NC_021490	GTG	2	6	28691	28696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
573	NC_021490	TGA	2	6	28734	28739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556107
574	NC_021490	GGT	2	6	28883	28888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556107
575	NC_021490	TGA	2	6	28897	28902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_021490	AT	3	6	28936	28941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021490	CTC	2	6	29027	29032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_021490	AGG	2	6	29054	29059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_021490	G	6	6	29058	29063	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021490	GCT	2	6	29130	29135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556108
581	NC_021490	TCC	2	6	29156	29161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556108
582	NC_021490	GC	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	512556108
583	NC_021490	GAT	2	6	29253	29258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556108
584	NC_021490	ATC	2	6	29307	29312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556108
585	NC_021490	AAC	2	6	29322	29327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556108
586	NC_021490	A	7	7	29334	29340	100 %	0 %	0 %	0 %	512556108
587	NC_021490	A	6	6	29446	29451	100 %	0 %	0 %	0 %	512556108
588	NC_021490	TCT	2	6	29475	29480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556108
589	NC_021490	GAA	2	6	29549	29554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556108
590	NC_021490	TC	3	6	29585	29590	0 %	50 %	0 %	50 %	512556108
591	NC_021490	AG	3	6	29865	29870	50 %	0 %	50 %	0 %	512556109
592	NC_021490	ACC	2	6	29942	29947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556109
593	NC_021490	TGCGC	2	10	29964	29973	0 %	20 %	40 %	40 %	512556109
594	NC_021490	AGT	2	6	29978	29983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556109
595	NC_021490	CCG	2	6	30120	30125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556109
596	NC_021490	TCT	2	6	30159	30164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556109
597	NC_021490	CAC	2	6	30318	30323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556109
598	NC_021490	T	6	6	30336	30341	0 %	100 %	0 %	0 %	512556109
599	NC_021490	TC	3	6	30394	30399	0 %	50 %	0 %	50 %	512556109
600	NC_021490	AGC	2	6	30461	30466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556109
601	NC_021490	TGC	2	6	30491	30496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556109
602	NC_021490	TGT	2	6	30536	30541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556109
603	NC_021490	GTG	2	6	30565	30570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556109
604	NC_021490	TG	3	6	30634	30639	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
605	NC_021490	TCCAG	2	10	30790	30799	20 %	20 %	20 %	40 %	512556109
606	NC_021490	TTC	2	6	30802	30807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556109
607	NC_021490	TGC	2	6	30817	30822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556109
608	NC_021490	CGT	2	6	30923	30928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556109
609	NC_021490	AAAG	2	8	30938	30945	75 %	0 %	25 %	0 %	512556109
610	NC_021490	CA	3	6	30960	30965	50 %	0 %	0 %	50 %	512556109
611	NC_021490	GT	3	6	31053	31058	0 %	50 %	50 %	0 %	512556109
612	NC_021490	CTA	2	6	31104	31109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556109
613	NC_021490	GCGG	2	8	31114	31121	0 %	0 %	75 %	25 %	512556109
614	NC_021490	ATG	2	6	31168	31173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556109
615	NC_021490	CTT	2	6	31227	31232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556109
616	NC_021490	CTG	2	6	31248	31253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556109
617	NC_021490	TCGT	2	8	31280	31287	0 %	50 %	25 %	25 %	512556109
618	NC_021490	GAACAG	2	12	31305	31316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	512556109
619	NC_021490	A	6	6	31321	31326	100 %	0 %	0 %	0 %	512556109
620	NC_021490	TGGGG	2	10	31348	31357	0 %	20 %	80 %	0 %	512556109
621	NC_021490	GTT	2	6	31365	31370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556109
622	NC_021490	TCC	2	6	31403	31408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556109
623	NC_021490	TGTC	2	8	31420	31427	0 %	50 %	25 %	25 %	512556109
624	NC_021490	GC	3	6	31459	31464	0 %	0 %	50 %	50 %	512556109
625	NC_021490	GCT	2	6	31466	31471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556109
626	NC_021490	TCA	2	6	31520	31525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556109
627	NC_021490	T	7	7	31528	31534	0 %	100 %	0 %	0 %	512556109
628	NC_021490	GTCTGG	2	12	31540	31551	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	512556109
629	NC_021490	GCA	2	6	31584	31589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556109
630	NC_021490	TGG	2	6	31625	31630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556109
631	NC_021490	GA	3	6	31732	31737	50 %	0 %	50 %	0 %	512556109
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763	NC_021490	T	6	6	37934	37939	0 %	100 %	0 %	0 %	512556113
764	NC_021490	ATC	2	6	37970	37975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556113
765	NC_021490	TG	3	6	37977	37982	0 %	50 %	50 %	0 %	512556113
766	NC_021490	TGCAT	2	10	38014	38023	20 %	40 %	20 %	20 %	512556113
767	NC_021490	TGCG	2	8	38049	38056	0 %	25 %	50 %	25 %	512556113
768	NC_021490	GC	3	6	38087	38092	0 %	0 %	50 %	50 %	512556113
769	NC_021490	TAT	2	6	38198	38203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_021490	TGA	2	6	38213	38218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
771	NC_021490	T	9	9	38245	38253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_021490	AAG	2	6	38349	38354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556114
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785	NC_021490	CT	3	6	39423	39428	0 %	50 %	0 %	50 %	512556114
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795	NC_021490	TGC	2	6	39875	39880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556114
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797	NC_021490	GTG	2	6	40029	40034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556115
798	NC_021490	GGT	2	6	40080	40085	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556115
799	NC_021490	TTTC	2	8	40097	40104	0 %	75 %	0 %	25 %	512556115
800	NC_021490	T	6	6	40110	40115	0 %	100 %	0 %	0 %	512556115
801	NC_021490	TCGG	2	8	40170	40177	0 %	25 %	50 %	25 %	512556115
802	NC_021490	TTTTC	2	10	40337	40346	0 %	80 %	0 %	20 %	512556116
803	NC_021490	TCCA	2	8	40474	40481	25 %	25 %	0 %	50 %	512556116
804	NC_021490	GCG	2	6	40524	40529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556116
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806	NC_021490	GT	3	6	40602	40607	0 %	50 %	50 %	0 %	512556116
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826	NC_021490	CA	3	6	41697	41702	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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842	NC_021490	ACC	2	6	42705	42710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556118
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848	NC_021490	AG	3	6	42860	42865	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
849	NC_021490	T	6	6	42894	42899	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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883	NC_021490	CA	3	6	44432	44437	50 %	0 %	0 %	50 %	512556120
884	NC_021490	ACCC	2	8	44490	44497	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
885	NC_021490	GCA	2	6	44603	44608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556121
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894	NC_021490	GA	3	6	45142	45147	50 %	0 %	50 %	0 %	512556121
895	NC_021490	CG	3	6	45197	45202	0 %	0 %	50 %	50 %	512556121
896	NC_021490	CGG	2	6	45224	45229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556121
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932	NC_021490	TTAC	2	8	47159	47166	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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