MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum subsp. pallidum str. Nichols

Total Repeats: 23994

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021490	TGG	2	6	220032	220037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556293
4502	NC_021490	CGT	2	6	220041	220046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4503	NC_021490	CAGC	2	8	220051	220058	25 %	0 %	25 %	50 %	512556293
4504	NC_021490	A	6	6	220059	220064	100 %	0 %	0 %	0 %	512556293
4505	NC_021490	CTAT	2	8	220091	220098	25 %	50 %	0 %	25 %	512556293
4506	NC_021490	A	6	6	220149	220154	100 %	0 %	0 %	0 %	512556293
4507	NC_021490	GAC	2	6	220183	220188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4508	NC_021490	A	6	6	220250	220255	100 %	0 %	0 %	0 %	512556293
4509	NC_021490	GAA	2	6	220257	220262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556293
4510	NC_021490	ATT	2	6	220274	220279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556293
4511	NC_021490	TAT	2	6	220389	220394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556293
4512	NC_021490	CTG	2	6	220406	220411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4513	NC_021490	AG	4	8	220445	220452	50 %	0 %	50 %	0 %	512556293
4514	NC_021490	ATT	2	6	220456	220461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556293
4515	NC_021490	G	8	8	220477	220484	0 %	0 %	100 %	0 %	512556293
4516	NC_021490	AAGTC	2	10	220529	220538	40 %	20 %	20 %	20 %	512556293
4517	NC_021490	G	6	6	220560	220565	0 %	0 %	100 %	0 %	512556293
4518	NC_021490	GA	3	6	220665	220670	50 %	0 %	50 %	0 %	512556293
4519	NC_021490	GCG	2	6	220672	220677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556293
4520	NC_021490	TTC	2	6	220698	220703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556293
4521	NC_021490	CT	4	8	220775	220782	0 %	50 %	0 %	50 %	512556293
4522	NC_021490	TGA	2	6	220806	220811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556293
4523	NC_021490	TGG	2	6	220899	220904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556293
4524	NC_021490	AAG	2	6	220955	220960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556293
4525	NC_021490	AGG	2	6	221013	221018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556293
4526	NC_021490	G	7	7	221026	221032	0 %	0 %	100 %	0 %	512556293
4527	NC_021490	ACC	2	6	221125	221130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	512556293
4528	NC_021490	TGC	2	6	221198	221203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4529	NC_021490	TAG	2	6	221255	221260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556293
4530	NC_021490	AGC	2	6	221366	221371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4531	NC_021490	AGG	2	6	221531	221536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556293
4532	NC_021490	CG	4	8	221563	221570	0 %	0 %	50 %	50 %	512556293
4533	NC_021490	CGA	2	6	221613	221618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4534	NC_021490	GCA	2	6	221652	221657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4535	NC_021490	GGA	2	6	221676	221681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556293
4536	NC_021490	AGC	3	9	221697	221705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556293
4537	NC_021490	AAG	2	6	221722	221727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556293
4538	NC_021490	GGT	2	6	221758	221763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556293
4539	NC_021490	GGGA	2	8	221821	221828	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_021490	TG	3	6	221848	221853	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_021490	TG	4	8	222005	222012	0 %	50 %	50 %	0 %	512556294
4542	NC_021490	ATT	2	6	222065	222070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556294
4543	NC_021490	GAA	2	6	222106	222111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556294
4544	NC_021490	CGG	2	6	222127	222132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556294
4545	NC_021490	GGA	2	6	222180	222185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556294
4546	NC_021490	AGG	2	6	222194	222199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556294
4547	NC_021490	CGC	2	6	222385	222390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556294
4548	NC_021490	ACG	2	6	222404	222409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556294
4549	NC_021490	GAA	2	6	222466	222471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556294
4550	NC_021490	CGA	2	6	222510	222515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556294
4551	NC_021490	GTA	2	6	222602	222607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556294
4552	NC_021490	T	6	6	222612	222617	0 %	100 %	0 %	0 %	512556294
4553	NC_021490	GC	3	6	222637	222642	0 %	0 %	50 %	50 %	512556294
4554	NC_021490	TGG	2	6	222645	222650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556294
4555	NC_021490	A	6	6	222716	222721	100 %	0 %	0 %	0 %	512556294
4556	NC_021490	AGA	2	6	222747	222752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556294
4557	NC_021490	GCG	2	6	222756	222761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556294
4558	NC_021490	GTGTTT	2	12	222823	222834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556294
4559	NC_021490	GC	3	6	222917	222922	0 %	0 %	50 %	50 %	512556294
4560	NC_021490	GCA	2	6	222954	222959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556294
4561	NC_021490	CCGG	2	8	222970	222977	0 %	0 %	50 %	50 %	512556294
4562	NC_021490	GC	3	6	223027	223032	0 %	0 %	50 %	50 %	512556294
4563	NC_021490	CCG	2	6	223144	223149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	512556294
4564	NC_021490	ATT	2	6	223207	223212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4565	NC_021490	CGTG	2	8	223217	223224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4566	NC_021490	TTTC	2	8	223228	223235	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4567	NC_021490	GT	3	6	223238	223243	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_021490	TTC	2	6	223293	223298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_021490	AGC	2	6	223328	223333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_021490	T	9	9	223408	223416	0 %	100 %	0 %	0 %	512556295
4571	NC_021490	TCGTT	2	10	223460	223469	0 %	60 %	20 %	20 %	512556295
4572	NC_021490	GC	3	6	223473	223478	0 %	0 %	50 %	50 %	512556295
4573	NC_021490	TTC	2	6	223523	223528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556295
4574	NC_021490	TGCGCT	2	12	223571	223582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4575	NC_021490	TTG	2	6	223621	223626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556295
4576	NC_021490	CTG	2	6	223671	223676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4577	NC_021490	AAC	2	6	223696	223701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556295
4578	NC_021490	TTG	2	6	223702	223707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556295
4579	NC_021490	AGG	2	6	223717	223722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556295
4580	NC_021490	ACA	2	6	223786	223791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556295
4581	NC_021490	TGC	2	6	223793	223798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4582	NC_021490	AC	3	6	223813	223818	50 %	0 %	0 %	50 %	512556295
4583	NC_021490	TA	3	6	223880	223885	50 %	50 %	0 %	0 %	512556295
4584	NC_021490	T	7	7	223886	223892	0 %	100 %	0 %	0 %	512556295
4585	NC_021490	GAT	3	9	223893	223901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556295
4586	NC_021490	TGT	3	9	224071	224079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556295
4587	NC_021490	ATG	2	6	224106	224111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556295
4588	NC_021490	GC	3	6	224123	224128	0 %	0 %	50 %	50 %	512556295
4589	NC_021490	ATT	2	6	224209	224214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556295
4590	NC_021490	ACG	2	6	224215	224220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4591	NC_021490	TGA	2	6	224231	224236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556295
4592	NC_021490	CGT	2	6	224287	224292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4593	NC_021490	ATC	2	6	224521	224526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	512556295
4594	NC_021490	AGT	2	6	224639	224644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556295
4595	NC_021490	GAC	2	6	224784	224789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556295
4596	NC_021490	AGGT	2	8	224817	224824	25 %	25 %	50 %	0 %	512556295
4597	NC_021490	T	7	7	224838	224844	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4598	NC_021490	GC	3	6	224903	224908	0 %	0 %	50 %	50 %	512556296
4599	NC_021490	CTG	2	6	224916	224921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556296
4600	NC_021490	T	6	6	224954	224959	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4601	NC_021490	TTTA	2	8	225014	225021	25 %	75 %	0 %	0 %	512556296
4602	NC_021490	T	6	6	225036	225041	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4603	NC_021490	A	8	8	225093	225100	100 %	0 %	0 %	0 %	512556296
4604	NC_021490	ACG	2	6	225123	225128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556296
4605	NC_021490	TTTG	2	8	225134	225141	0 %	75 %	25 %	0 %	512556296
4606	NC_021490	ATT	2	6	225214	225219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556296
4607	NC_021490	TCT	2	6	225225	225230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556296
4608	NC_021490	T	8	8	225259	225266	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4609	NC_021490	A	6	6	225303	225308	100 %	0 %	0 %	0 %	512556296
4610	NC_021490	ATG	2	6	225315	225320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556296
4611	NC_021490	CAA	2	6	225339	225344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556296
4612	NC_021490	TTA	2	6	225391	225396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	512556296
4613	NC_021490	TCTTGT	2	12	225397	225408	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	512556296
4614	NC_021490	GTGTTT	2	12	225426	225437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556296
4615	NC_021490	T	6	6	225435	225440	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4616	NC_021490	AGG	2	6	225446	225451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556296
4617	NC_021490	GTG	2	6	225516	225521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556296
4618	NC_021490	CAG	2	6	225568	225573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556296
4619	NC_021490	T	7	7	225635	225641	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4620	NC_021490	T	6	6	225696	225701	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4621	NC_021490	AGGC	2	8	225850	225857	25 %	0 %	50 %	25 %	512556296
4622	NC_021490	T	6	6	225929	225934	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4623	NC_021490	T	7	7	226016	226022	0 %	100 %	0 %	0 %	512556296
4624	NC_021490	ACGC	2	8	226029	226036	25 %	0 %	25 %	50 %	512556296
4625	NC_021490	GAT	2	6	226040	226045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556296
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4747	NC_021490	AGGG	2	8	232713	232720	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4748	NC_021490	AGG	2	6	232744	232749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4749	NC_021490	CCT	2	6	232796	232801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4752	NC_021490	CCCTT	2	10	232898	232907	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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4882	NC_021490	GTC	2	6	238965	238970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556305
4883	NC_021490	GCG	2	6	239012	239017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556305
4884	NC_021490	GCCG	2	8	239067	239074	0 %	0 %	50 %	50 %	512556305
4885	NC_021490	TGT	2	6	239111	239116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556305
4886	NC_021490	TCC	2	6	239124	239129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556305
4887	NC_021490	GCACA	2	10	239186	239195	40 %	0 %	20 %	40 %	512556305
4888	NC_021490	AAC	2	6	239203	239208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	512556305
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4890	NC_021490	GTT	2	6	239287	239292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556305
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4895	NC_021490	TGC	2	6	239459	239464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556306
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4901	NC_021490	TG	3	6	239698	239703	0 %	50 %	50 %	0 %	512556306
4902	NC_021490	GGT	2	6	239705	239710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	512556306
4903	NC_021490	TCT	2	6	239739	239744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556306
4904	NC_021490	CTT	2	6	239749	239754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556306
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4907	NC_021490	TATC	2	8	239933	239940	25 %	50 %	0 %	25 %	512556306
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4912	NC_021490	GAA	2	6	240150	240155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556306
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4924	NC_021490	GGCA	2	8	240582	240589	25 %	0 %	50 %	25 %	512556306
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4932	NC_021490	TGA	2	6	240910	240915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	512556306
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4947	NC_021490	CGG	2	6	241318	241323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556306
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4949	NC_021490	GTA	2	6	241420	241425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4958	NC_021490	GCA	2	6	241789	241794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	512556307
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4964	NC_021490	CGTG	2	8	241987	241994	0 %	25 %	50 %	25 %	512556307
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4966	NC_021490	GT	3	6	242148	242153	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4967	NC_021490	GT	3	6	242216	242221	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4968	NC_021490	GAGGG	2	10	242250	242259	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4969	NC_021490	CTG	3	9	242270	242278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4971	NC_021490	TGT	2	6	242373	242378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	512556308
4972	NC_021490	CGT	2	6	242451	242456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556308
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4974	NC_021490	T	6	6	242497	242502	0 %	100 %	0 %	0 %	512556308
4975	NC_021490	GTATT	2	10	242543	242552	20 %	60 %	20 %	0 %	512556308
4976	NC_021490	TCC	2	6	242578	242583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	512556308
4977	NC_021490	T	6	6	242704	242709	0 %	100 %	0 %	0 %	512556308
4978	NC_021490	AAG	2	6	242815	242820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556308
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4980	NC_021490	TC	3	6	242899	242904	0 %	50 %	0 %	50 %	512556308
4981	NC_021490	CTTT	2	8	242920	242927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4982	NC_021490	TG	3	6	242977	242982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4983	NC_021490	GGCC	2	8	243005	243012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4984	NC_021490	GGC	2	6	243018	243023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4985	NC_021490	CTGT	2	8	243034	243041	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4986	NC_021490	GAG	2	6	243133	243138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4987	NC_021490	GGT	2	6	243140	243145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_021490	CGG	2	6	243159	243164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	512556309
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4990	NC_021490	TGC	2	6	243288	243293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	512556309
4991	NC_021490	AG	3	6	243296	243301	50 %	0 %	50 %	0 %	512556309
4992	NC_021490	GTC	2	6	243320	243325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4993	NC_021490	TCCT	2	8	243430	243437	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4994	NC_021490	AGG	2	6	243511	243516	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	512556310
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4996	NC_021490	GC	3	6	243529	243534	0 %	0 %	50 %	50 %	512556310
4997	NC_021490	TCT	3	9	243635	243643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	512556310
4998	NC_021490	CA	3	6	243679	243684	50 %	0 %	0 %	50 %	512556311
4999	NC_021490	AACG	2	8	243750	243757	50 %	0 %	25 %	25 %	512556311
5000	NC_021490	AAG	2	6	243811	243816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	512556311

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