MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 4512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021179	TC	3	6	795	800	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
2	NC_021179	CT	3	6	1062	1067	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
3	NC_021179	CT	3	6	1084	1089	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
4	NC_021179	TC	3	6	1221	1226	0 %	50 %	0 %	50 %	488657417
5	NC_021179	TG	3	6	1519	1524	0 %	50 %	50 %	0 %	488657418
6	NC_021179	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	488657419
7	NC_021179	TA	3	6	2175	2180	50 %	50 %	0 %	0 %	488657419
8	NC_021179	AT	3	6	2819	2824	50 %	50 %	0 %	0 %	488657420
9	NC_021179	CG	3	6	2952	2957	0 %	0 %	50 %	50 %	488657420
10	NC_021179	CA	3	6	3004	3009	50 %	0 %	0 %	50 %	488657420
11	NC_021179	AG	3	6	3247	3252	50 %	0 %	50 %	0 %	488657420
12	NC_021179	AT	3	6	3877	3882	50 %	50 %	0 %	0 %	488657421
13	NC_021179	GT	3	6	3929	3934	0 %	50 %	50 %	0 %	488657421
14	NC_021179	TC	3	6	4346	4351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_021179	GA	3	6	6214	6219	50 %	0 %	50 %	0 %	488657422
16	NC_021179	CG	3	6	6306	6311	0 %	0 %	50 %	50 %	488657422
17	NC_021179	AC	3	6	6624	6629	50 %	0 %	0 %	50 %	488657422
18	NC_021179	GT	3	6	6728	6733	0 %	50 %	50 %	0 %	488657422
19	NC_021179	GT	3	6	6771	6776	0 %	50 %	50 %	0 %	488657422
20	NC_021179	GC	3	6	7548	7553	0 %	0 %	50 %	50 %	488657424
21	NC_021179	GA	3	6	7912	7917	50 %	0 %	50 %	0 %	488657424
22	NC_021179	GC	3	6	8016	8021	0 %	0 %	50 %	50 %	488657424
23	NC_021179	AT	4	8	8573	8580	50 %	50 %	0 %	0 %	488657425
24	NC_021179	CG	3	6	8707	8712	0 %	0 %	50 %	50 %	488657425
25	NC_021179	AG	4	8	9425	9432	50 %	0 %	50 %	0 %	488657425
26	NC_021179	AC	3	6	9825	9830	50 %	0 %	0 %	50 %	488657425
27	NC_021179	AG	3	6	9888	9893	50 %	0 %	50 %	0 %	488657425
28	NC_021179	TC	3	6	9945	9950	0 %	50 %	0 %	50 %	488657425
29	NC_021179	GC	3	6	10085	10090	0 %	0 %	50 %	50 %	488657425
30	NC_021179	TC	3	6	10702	10707	0 %	50 %	0 %	50 %	488657426
31	NC_021179	GC	3	6	11291	11296	0 %	0 %	50 %	50 %	488657426
32	NC_021179	GT	3	6	11332	11337	0 %	50 %	50 %	0 %	488657426
33	NC_021179	GT	3	6	11522	11527	0 %	50 %	50 %	0 %	488657426
34	NC_021179	TA	3	6	11909	11914	50 %	50 %	0 %	0 %	488657426
35	NC_021179	CA	3	6	12029	12034	50 %	0 %	0 %	50 %	488657426
36	NC_021179	GT	3	6	12355	12360	0 %	50 %	50 %	0 %	488657426
37	NC_021179	GA	3	6	12512	12517	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021179	GT	3	6	12520	12525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021179	GC	3	6	12614	12619	0 %	0 %	50 %	50 %	488657427
40	NC_021179	GC	3	6	13061	13066	0 %	0 %	50 %	50 %	488657427
41	NC_021179	GT	3	6	13144	13149	0 %	50 %	50 %	0 %	488657427
42	NC_021179	CA	4	8	13236	13243	50 %	0 %	0 %	50 %	488657427
43	NC_021179	GA	3	6	13320	13325	50 %	0 %	50 %	0 %	488657427
44	NC_021179	GC	3	6	13531	13536	0 %	0 %	50 %	50 %	488657427
45	NC_021179	CT	4	8	13580	13587	0 %	50 %	0 %	50 %	488657427
46	NC_021179	GC	3	6	14267	14272	0 %	0 %	50 %	50 %	488657428
47	NC_021179	CG	3	6	14301	14306	0 %	0 %	50 %	50 %	488657428
48	NC_021179	AT	3	6	14544	14549	50 %	50 %	0 %	0 %	488657428
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50	NC_021179	CG	3	6	16389	16394	0 %	0 %	50 %	50 %	488657429
51	NC_021179	CG	3	6	16496	16501	0 %	0 %	50 %	50 %	488657429
52	NC_021179	GT	4	8	16827	16834	0 %	50 %	50 %	0 %	488657429
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54	NC_021179	GT	3	6	17217	17222	0 %	50 %	50 %	0 %	488657429
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60	NC_021179	AT	3	6	18650	18655	50 %	50 %	0 %	0 %	488657430
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62	NC_021179	GC	3	6	18756	18761	0 %	0 %	50 %	50 %	488657430
63	NC_021179	CG	3	6	19429	19434	0 %	0 %	50 %	50 %	488657431
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68	NC_021179	GC	3	6	21125	21130	0 %	0 %	50 %	50 %	488657431
69	NC_021179	GA	3	6	21665	21670	50 %	0 %	50 %	0 %	488657431
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71	NC_021179	CG	3	6	22424	22429	0 %	0 %	50 %	50 %	488657432
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74	NC_021179	CG	3	6	23214	23219	0 %	0 %	50 %	50 %	488657432
75	NC_021179	GA	3	6	23682	23687	50 %	0 %	50 %	0 %	488657432
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85	NC_021179	CG	3	6	26741	26746	0 %	0 %	50 %	50 %	488657434
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91	NC_021179	AT	4	8	28142	28149	50 %	50 %	0 %	0 %	488657435
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94	NC_021179	AT	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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104	NC_021179	GT	3	6	32402	32407	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
105	NC_021179	AC	3	6	32443	32448	50 %	0 %	0 %	50 %	488657437
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107	NC_021179	AG	3	6	33099	33104	50 %	0 %	50 %	0 %	488657438
108	NC_021179	AG	3	6	33108	33113	50 %	0 %	50 %	0 %	488657438
109	NC_021179	CG	3	6	33309	33314	0 %	0 %	50 %	50 %	488657438
110	NC_021179	AC	3	6	33734	33739	50 %	0 %	0 %	50 %	488657438
111	NC_021179	CG	3	6	34000	34005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_021179	GT	3	6	34189	34194	0 %	50 %	50 %	0 %	488657439
113	NC_021179	CG	4	8	34813	34820	0 %	0 %	50 %	50 %	488657439
114	NC_021179	GC	3	6	34996	35001	0 %	0 %	50 %	50 %	488657439
115	NC_021179	GC	3	6	35051	35056	0 %	0 %	50 %	50 %	488657439
116	NC_021179	AT	3	6	35125	35130	50 %	50 %	0 %	0 %	488657439
117	NC_021179	TA	3	6	35214	35219	50 %	50 %	0 %	0 %	488657439
118	NC_021179	TG	3	6	35370	35375	0 %	50 %	50 %	0 %	488657439
119	NC_021179	GC	3	6	35440	35445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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121	NC_021179	CT	3	6	35668	35673	0 %	50 %	0 %	50 %	488657440
122	NC_021179	GT	4	8	35868	35875	0 %	50 %	50 %	0 %	488657440
123	NC_021179	GC	3	6	36015	36020	0 %	0 %	50 %	50 %	488657440
124	NC_021179	CA	4	8	36064	36071	50 %	0 %	0 %	50 %	488657440
125	NC_021179	AC	3	6	36092	36097	50 %	0 %	0 %	50 %	488657440
126	NC_021179	TG	3	6	36108	36113	0 %	50 %	50 %	0 %	488657440
127	NC_021179	CG	3	6	36635	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	488657440
128	NC_021179	TG	3	6	36892	36897	0 %	50 %	50 %	0 %	488657441
129	NC_021179	GT	3	6	36966	36971	0 %	50 %	50 %	0 %	488657441
130	NC_021179	CA	3	6	37016	37021	50 %	0 %	0 %	50 %	488657441
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132	NC_021179	TG	3	6	37975	37980	0 %	50 %	50 %	0 %	488657441
133	NC_021179	GC	3	6	38085	38090	0 %	0 %	50 %	50 %	488657441
134	NC_021179	AG	3	6	38183	38188	50 %	0 %	50 %	0 %	488657441
135	NC_021179	CT	3	6	39421	39426	0 %	50 %	0 %	50 %	488657442
136	NC_021179	GT	3	6	40575	40580	0 %	50 %	50 %	0 %	488657444
137	NC_021179	GT	3	6	40600	40605	0 %	50 %	50 %	0 %	488657444
138	NC_021179	TG	3	6	41096	41101	0 %	50 %	50 %	0 %	488657445
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140	NC_021179	CA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	0 %	50 %	488657445
141	NC_021179	CA	3	6	41648	41653	50 %	0 %	0 %	50 %	488657445
142	NC_021179	CA	3	6	41695	41700	50 %	0 %	0 %	50 %	488657445
143	NC_021179	GT	3	6	42368	42373	0 %	50 %	50 %	0 %	488657446
144	NC_021179	CT	3	6	42794	42799	0 %	50 %	0 %	50 %	488657446
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