MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23502	NC_021179	CTG	2	6	1114622	1114627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658456
23503	NC_021179	TC	3	6	1114664	1114669	0 %	50 %	0 %	50 %	488658456
23504	NC_021179	CG	4	8	1114726	1114733	0 %	0 %	50 %	50 %	488658456
23505	NC_021179	TGCG	2	8	1114837	1114844	0 %	25 %	50 %	25 %	488658457
23506	NC_021179	AC	3	6	1114867	1114872	50 %	0 %	0 %	50 %	488658457
23507	NC_021179	GGA	2	6	1114919	1114924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658457
23508	NC_021179	CG	3	6	1114928	1114933	0 %	0 %	50 %	50 %	488658457
23509	NC_021179	G	6	6	1114992	1114997	0 %	0 %	100 %	0 %	488658457
23510	NC_021179	GAAAG	2	10	1115057	1115066	60 %	0 %	40 %	0 %	488658457
23511	NC_021179	GTT	2	6	1115124	1115129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488658457
23512	NC_021179	GC	3	6	1115130	1115135	0 %	0 %	50 %	50 %	488658457
23513	NC_021179	GC	3	6	1115138	1115143	0 %	0 %	50 %	50 %	488658457
23514	NC_021179	GAAC	2	8	1115167	1115174	50 %	0 %	25 %	25 %	488658457
23515	NC_021179	CGG	2	6	1115270	1115275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658457
23516	NC_021179	GCC	2	6	1115283	1115288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658457
23517	NC_021179	GCT	2	6	1115352	1115357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658457
23518	NC_021179	GGT	2	6	1115411	1115416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658457
23519	NC_021179	CTC	2	6	1115426	1115431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658457
23520	NC_021179	T	6	6	1115448	1115453	0 %	100 %	0 %	0 %	488658457
23521	NC_021179	GCCCTC	2	12	1115475	1115486	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	488658457
23522	NC_021179	C	6	6	1115531	1115536	0 %	0 %	0 %	100 %	488658457
23523	NC_021179	TGC	2	6	1115609	1115614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658457
23524	NC_021179	TAG	2	6	1115629	1115634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658457
23525	NC_021179	AGA	2	6	1115714	1115719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658457
23526	NC_021179	GGC	2	6	1115741	1115746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658457
23527	NC_021179	TAT	2	6	1115757	1115762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658457
23528	NC_021179	GCC	2	6	1115781	1115786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658457
23529	NC_021179	TAC	2	6	1115856	1115861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658457
23530	NC_021179	CCGT	2	8	1115866	1115873	0 %	25 %	25 %	50 %	488658457
23531	NC_021179	ATT	2	6	1115950	1115955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658457
23532	NC_021179	CTC	2	6	1116006	1116011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658457
23533	NC_021179	TTGT	2	8	1116028	1116035	0 %	75 %	25 %	0 %	488658457
23534	NC_021179	CAC	2	6	1116113	1116118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658457
23535	NC_021179	GAG	2	6	1116252	1116257	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658457
23536	NC_021179	AC	3	6	1116317	1116322	50 %	0 %	0 %	50 %	488658458
23537	NC_021179	ATT	2	6	1116349	1116354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488658458
23538	NC_021179	CTGTGC	2	12	1116399	1116410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658458
23539	NC_021179	AGG	2	6	1116420	1116425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658458
23540	NC_021179	GT	4	8	1116440	1116447	0 %	50 %	50 %	0 %	488658458
23541	NC_021179	TG	3	6	1116450	1116455	0 %	50 %	50 %	0 %	488658458
23542	NC_021179	GC	3	6	1116513	1116518	0 %	0 %	50 %	50 %	488658458
23543	NC_021179	ACG	2	6	1116617	1116622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658458
23544	NC_021179	GCG	2	6	1116678	1116683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658458
23545	NC_021179	GGA	3	9	1116708	1116716	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658458
23546	NC_021179	TGC	2	6	1116735	1116740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658458
23547	NC_021179	AGG	2	6	1116824	1116829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658458
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23549	NC_021179	TGCGA	2	10	1116908	1116917	20 %	20 %	40 %	20 %	488658458
23550	NC_021179	TCGTA	2	10	1116994	1117003	20 %	40 %	20 %	20 %	488658458
23551	NC_021179	AGA	2	6	1117077	1117082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658458
23552	NC_021179	CACT	2	8	1117150	1117157	25 %	25 %	0 %	50 %	488658458
23553	NC_021179	ACCTG	2	10	1117191	1117200	20 %	20 %	20 %	40 %	488658458
23554	NC_021179	TC	3	6	1117227	1117232	0 %	50 %	0 %	50 %	488658458
23555	NC_021179	GCG	2	6	1117260	1117265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488658458
23556	NC_021179	CGA	2	6	1117378	1117383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658458
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23560	NC_021179	GAA	2	6	1117612	1117617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658458
23561	NC_021179	GC	3	6	1117737	1117742	0 %	0 %	50 %	50 %	488658458
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23563	NC_021179	CT	3	6	1117780	1117785	0 %	50 %	0 %	50 %	488658458
23564	NC_021179	GCG	2	6	1117819	1117824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23565	NC_021179	TC	3	6	1117826	1117831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23566	NC_021179	GCCCG	2	10	1117843	1117852	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23567	NC_021179	GAA	2	6	1117866	1117871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23568	NC_021179	CTA	2	6	1117887	1117892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658459
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23573	NC_021179	AT	3	6	1117995	1118000	50 %	50 %	0 %	0 %	488658459
23574	NC_021179	A	6	6	1118291	1118296	100 %	0 %	0 %	0 %	488658459
23575	NC_021179	CG	3	6	1118297	1118302	0 %	0 %	50 %	50 %	488658459
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23578	NC_021179	CCTG	2	8	1118405	1118412	0 %	25 %	25 %	50 %	488658459
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23583	NC_021179	CCA	2	6	1118567	1118572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488658459
23584	NC_021179	ACT	2	6	1118581	1118586	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658459
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23586	NC_021179	ACCC	2	8	1118656	1118663	25 %	0 %	0 %	75 %	488658459
23587	NC_021179	TGAT	2	8	1118692	1118699	25 %	50 %	25 %	0 %	488658459
23588	NC_021179	A	6	6	1118729	1118734	100 %	0 %	0 %	0 %	488658459
23589	NC_021179	GAATC	2	10	1118741	1118750	40 %	20 %	20 %	20 %	488658459
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23592	NC_021179	GC	4	8	1119059	1119066	0 %	0 %	50 %	50 %	488658459
23593	NC_021179	CA	3	6	1119071	1119076	50 %	0 %	0 %	50 %	488658459
23594	NC_021179	GAA	2	6	1119097	1119102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488658459
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23596	NC_021179	GGA	2	6	1119132	1119137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658459
23597	NC_021179	AGAA	2	8	1119275	1119282	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23598	NC_021179	CGG	2	6	1119294	1119299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23599	NC_021179	GACG	2	8	1119336	1119343	25 %	0 %	50 %	25 %	488658460
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23602	NC_021179	CG	3	6	1119578	1119583	0 %	0 %	50 %	50 %	488658460
23603	NC_021179	ATC	2	6	1119592	1119597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658460
23604	NC_021179	GCT	2	6	1119681	1119686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658460
23605	NC_021179	CGAG	2	8	1119704	1119711	25 %	0 %	50 %	25 %	488658460
23606	NC_021179	TCA	2	6	1119776	1119781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658460
23607	NC_021179	CTC	2	6	1119802	1119807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658460
23608	NC_021179	GC	3	6	1119822	1119827	0 %	0 %	50 %	50 %	488658460
23609	NC_021179	CACC	2	8	1119858	1119865	25 %	0 %	0 %	75 %	488658460
23610	NC_021179	TCC	2	6	1119887	1119892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658460
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23612	NC_021179	GCAC	2	8	1120050	1120057	25 %	0 %	25 %	50 %	488658461
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23614	NC_021179	CCG	2	6	1120107	1120112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488658461
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23617	NC_021179	AC	4	8	1120257	1120264	50 %	0 %	0 %	50 %	488658461
23618	NC_021179	GCGA	2	8	1120265	1120272	25 %	0 %	50 %	25 %	488658461
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23620	NC_021179	C	6	6	1120511	1120516	0 %	0 %	0 %	100 %	488658462
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23982	NC_021179	TGA	2	6	1138160	1138165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658476
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23985	NC_021179	GAC	2	6	1138432	1138437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658476
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