MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021179	GA	3	6	50594	50599	50 %	0 %	50 %	0 %	488657454
1002	NC_021179	CGC	2	6	50651	50656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657454
1003	NC_021179	GAA	2	6	50712	50717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657454
1004	NC_021179	GCGCA	2	10	50740	50749	20 %	0 %	40 %	40 %	488657454
1005	NC_021179	CA	3	6	50785	50790	50 %	0 %	0 %	50 %	488657454
1006	NC_021179	GCAG	2	8	50850	50857	25 %	0 %	50 %	25 %	488657454
1007	NC_021179	GCA	2	6	50876	50881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1008	NC_021179	CTA	2	6	50930	50935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657454
1009	NC_021179	GTT	2	6	50949	50954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657454
1010	NC_021179	TGC	2	6	51005	51010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1011	NC_021179	GA	3	6	51105	51110	50 %	0 %	50 %	0 %	488657454
1012	NC_021179	TTG	3	9	51117	51125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657454
1013	NC_021179	TC	3	6	51167	51172	0 %	50 %	0 %	50 %	488657454
1014	NC_021179	AGC	2	6	51185	51190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1015	NC_021179	GCG	2	6	51318	51323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657454
1016	NC_021179	AAG	2	6	51351	51356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657454
1017	NC_021179	GGC	2	6	51400	51405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657454
1018	NC_021179	TTCT	2	8	51464	51471	0 %	75 %	0 %	25 %	488657454
1019	NC_021179	TTG	2	6	51481	51486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657454
1020	NC_021179	CAC	2	6	51493	51498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657454
1021	NC_021179	GCA	2	6	51560	51565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1022	NC_021179	CG	4	8	51629	51636	0 %	0 %	50 %	50 %	488657454
1023	NC_021179	AGA	2	6	51671	51676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657454
1024	NC_021179	GC	3	6	51681	51686	0 %	0 %	50 %	50 %	488657454
1025	NC_021179	TTC	2	6	51719	51724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657454
1026	NC_021179	TGC	2	6	51743	51748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1027	NC_021179	CA	3	6	51949	51954	50 %	0 %	0 %	50 %	488657454
1028	NC_021179	GC	3	6	52017	52022	0 %	0 %	50 %	50 %	488657454
1029	NC_021179	GAG	2	6	52104	52109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657454
1030	NC_021179	CTG	2	6	52113	52118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1031	NC_021179	TC	3	6	52162	52167	0 %	50 %	0 %	50 %	488657454
1032	NC_021179	GGGC	2	8	52168	52175	0 %	0 %	75 %	25 %	488657454
1033	NC_021179	TGA	2	6	52195	52200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657454
1034	NC_021179	TCG	2	6	52307	52312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657454
1035	NC_021179	CG	3	6	52363	52368	0 %	0 %	50 %	50 %	488657454
1036	NC_021179	A	6	6	52380	52385	100 %	0 %	0 %	0 %	488657454
1037	NC_021179	GAT	2	6	52404	52409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657454
1038	NC_021179	GGA	2	6	52453	52458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657454
1039	NC_021179	TAT	2	6	52494	52499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657454
1040	NC_021179	TGT	2	6	52517	52522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657454
1041	NC_021179	GT	3	6	52521	52526	0 %	50 %	50 %	0 %	488657454
1042	NC_021179	TCT	2	6	52579	52584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_021179	TCG	3	9	52630	52638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657455
1044	NC_021179	GTG	2	6	52639	52644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657455
1045	NC_021179	GCG	2	6	52662	52667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657455
1046	NC_021179	TCA	2	6	52702	52707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657455
1047	NC_021179	GGA	2	6	52755	52760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657455
1048	NC_021179	CGG	2	6	52799	52804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657455
1049	NC_021179	ATGC	2	8	52825	52832	25 %	25 %	25 %	25 %	488657455
1050	NC_021179	CAA	2	6	52853	52858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657455
1051	NC_021179	TGCAG	2	10	52871	52880	20 %	20 %	40 %	20 %	488657455
1052	NC_021179	GCA	2	6	52946	52951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657455
1053	NC_021179	TG	3	6	52985	52990	0 %	50 %	50 %	0 %	488657455
1054	NC_021179	GGT	2	6	53078	53083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657455
1055	NC_021179	GT	3	6	53113	53118	0 %	50 %	50 %	0 %	488657455
1056	NC_021179	A	6	6	53192	53197	100 %	0 %	0 %	0 %	488657455
1057	NC_021179	CG	4	8	53234	53241	0 %	0 %	50 %	50 %	488657455
1058	NC_021179	TAC	2	6	53242	53247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657455
1059	NC_021179	AAG	2	6	53281	53286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657455
1060	NC_021179	AATC	2	8	53327	53334	50 %	25 %	0 %	25 %	488657455
1061	NC_021179	ATTA	2	8	53355	53362	50 %	50 %	0 %	0 %	488657455
1062	NC_021179	GA	3	6	53370	53375	50 %	0 %	50 %	0 %	488657455
1063	NC_021179	TA	4	8	53545	53552	50 %	50 %	0 %	0 %	488657455
1064	NC_021179	CG	3	6	53622	53627	0 %	0 %	50 %	50 %	488657455
1065	NC_021179	TTA	2	6	53629	53634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657455
1066	NC_021179	CAAA	2	8	53697	53704	75 %	0 %	0 %	25 %	488657455
1067	NC_021179	GAA	2	6	53757	53762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657455
1068	NC_021179	TAT	2	6	53777	53782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657455
1069	NC_021179	CGCTG	2	10	53795	53804	0 %	20 %	40 %	40 %	488657455
1070	NC_021179	CG	3	6	53807	53812	0 %	0 %	50 %	50 %	488657455
1071	NC_021179	ATC	2	6	53836	53841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657455
1072	NC_021179	CGA	2	6	53858	53863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657455
1073	NC_021179	AT	3	6	53867	53872	50 %	50 %	0 %	0 %	488657455
1074	NC_021179	GAT	2	6	53886	53891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657455
1075	NC_021179	CG	3	6	53933	53938	0 %	0 %	50 %	50 %	488657455
1076	NC_021179	AGA	2	6	54016	54021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657455
1077	NC_021179	CTG	2	6	54025	54030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657455
1078	NC_021179	A	7	7	54043	54049	100 %	0 %	0 %	0 %	488657455
1079	NC_021179	CAA	2	6	54089	54094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657455
1080	NC_021179	GCTAC	2	10	54159	54168	20 %	20 %	20 %	40 %	488657455
1081	NC_021179	TCGCT	2	10	54196	54205	0 %	40 %	20 %	40 %	488657455
1082	NC_021179	GGAA	2	8	54320	54327	50 %	0 %	50 %	0 %	488657455
1083	NC_021179	CG	3	6	54353	54358	0 %	0 %	50 %	50 %	488657455
1084	NC_021179	TC	3	6	54368	54373	0 %	50 %	0 %	50 %	488657455
1085	NC_021179	AGC	2	6	54490	54495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657455
1086	NC_021179	AGA	2	6	54508	54513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021179	CAGG	2	8	54524	54531	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1088	NC_021179	GTAC	2	8	54537	54544	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1089	NC_021179	A	6	6	54637	54642	100 %	0 %	0 %	0 %	488657456
1090	NC_021179	CATC	2	8	54681	54688	25 %	25 %	0 %	50 %	488657456
1091	NC_021179	T	8	8	54690	54697	0 %	100 %	0 %	0 %	488657456
1092	NC_021179	TTTC	2	8	54770	54777	0 %	75 %	0 %	25 %	488657456
1093	NC_021179	CTTT	2	8	54900	54907	0 %	75 %	0 %	25 %	488657456
1094	NC_021179	T	6	6	54905	54910	0 %	100 %	0 %	0 %	488657456
1095	NC_021179	CAT	2	6	55012	55017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657456
1096	NC_021179	TTC	2	6	55147	55152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657456
1097	NC_021179	ACG	2	6	55193	55198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657456
1098	NC_021179	AAT	2	6	55288	55293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657456
1099	NC_021179	TCG	2	6	55304	55309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657456
1100	NC_021179	ACT	2	6	55343	55348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657456
1101	NC_021179	TCGT	2	8	55366	55373	0 %	50 %	25 %	25 %	488657456
1102	NC_021179	ATA	2	6	55426	55431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657456
1103	NC_021179	ATGCT	2	10	55487	55496	20 %	40 %	20 %	20 %	488657457
1104	NC_021179	A	6	6	55539	55544	100 %	0 %	0 %	0 %	488657457
1105	NC_021179	AGG	2	6	55587	55592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657457
1106	NC_021179	GT	3	6	55630	55635	0 %	50 %	50 %	0 %	488657457
1107	NC_021179	ACG	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657457
1108	NC_021179	CAG	2	6	55660	55665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657457
1109	NC_021179	CAC	2	6	55701	55706	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657457
1110	NC_021179	AC	3	6	55730	55735	50 %	0 %	0 %	50 %	488657457
1111	NC_021179	GTG	2	6	55749	55754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021179	CA	3	6	55785	55790	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_021179	GT	3	6	55797	55802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021179	ACA	2	6	55826	55831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657458
1115	NC_021179	CAT	2	6	55853	55858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657458
1116	NC_021179	ATA	2	6	55873	55878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657458
1117	NC_021179	T	7	7	55881	55887	0 %	100 %	0 %	0 %	488657458
1118	NC_021179	CTG	2	6	55920	55925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657458
1119	NC_021179	CAA	2	6	55935	55940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657458
1120	NC_021179	GC	4	8	55945	55952	0 %	0 %	50 %	50 %	488657458
1121	NC_021179	GCA	2	6	55955	55960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657458
1122	NC_021179	CTA	2	6	55972	55977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657458
1123	NC_021179	CTT	2	6	55984	55989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657458
1124	NC_021179	CTAA	2	8	56046	56053	50 %	25 %	0 %	25 %	488657458
1125	NC_021179	CTT	2	6	56104	56109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657458
1126	NC_021179	GCA	2	6	56184	56189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657458
1127	NC_021179	TATG	2	8	56203	56210	25 %	50 %	25 %	0 %	488657458
1128	NC_021179	TCCT	2	8	56420	56427	0 %	50 %	0 %	50 %	488657458
1129	NC_021179	GCG	2	6	56440	56445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657458
1130	NC_021179	TCC	2	6	56561	56566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657459
1131	NC_021179	GTG	2	6	56720	56725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657459
1132	NC_021179	GCG	2	6	56777	56782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657459
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1141	NC_021179	CT	3	6	56982	56987	0 %	50 %	0 %	50 %	488657459
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1151	NC_021179	ACA	2	6	57412	57417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657460
1152	NC_021179	GAT	2	6	57627	57632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657461
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1233	NC_021179	ATC	2	6	61754	61759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657465
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1241	NC_021179	AAAT	2	8	62220	62227	75 %	25 %	0 %	0 %	488657465
1242	NC_021179	CAG	2	6	62261	62266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657465
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1245	NC_021179	TTC	2	6	62375	62380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657465
1246	NC_021179	TGTAAC	2	12	62404	62415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	488657465
1247	NC_021179	AAGG	2	8	62534	62541	50 %	0 %	50 %	0 %	488657465
1248	NC_021179	TTC	2	6	62618	62623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657465
1249	NC_021179	GTT	2	6	62636	62641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657465
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1251	NC_021179	C	6	6	62714	62719	0 %	0 %	0 %	100 %	488657465
1252	NC_021179	GC	3	6	62767	62772	0 %	0 %	50 %	50 %	488657465
1253	NC_021179	CAT	2	6	62798	62803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657465
1254	NC_021179	CCT	3	9	62811	62819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_021179	GTA	2	6	62835	62840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1256	NC_021179	GCG	2	6	62868	62873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1258	NC_021179	TG	3	6	62909	62914	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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