MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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13109	NC_021179	CTG	2	6	618742	618747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657990
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13123	NC_021179	TACA	2	8	619535	619542	50 %	25 %	0 %	25 %	488657991
13124	NC_021179	CGC	3	9	619700	619708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657991
13125	NC_021179	TCC	2	6	619713	619718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657991
13126	NC_021179	TCCC	2	8	619721	619728	0 %	25 %	0 %	75 %	488657991
13127	NC_021179	TCCT	2	8	619730	619737	0 %	50 %	0 %	50 %	488657991
13128	NC_021179	CA	4	8	619740	619747	50 %	0 %	0 %	50 %	488657991
13129	NC_021179	ACC	2	6	619773	619778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657991
13130	NC_021179	AGCC	2	8	619810	619817	25 %	0 %	25 %	50 %	488657991
13131	NC_021179	CGC	2	6	619868	619873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657991
13132	NC_021179	CTC	2	6	619874	619879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657991
13133	NC_021179	A	7	7	619882	619888	100 %	0 %	0 %	0 %	488657991
13134	NC_021179	GGA	2	6	619890	619895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657991
13135	NC_021179	TCC	2	6	619931	619936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657991
13136	NC_021179	ACCC	2	8	619994	620001	25 %	0 %	0 %	75 %	488657991
13137	NC_021179	GC	3	6	620096	620101	0 %	0 %	50 %	50 %	488657991
13138	NC_021179	GGT	2	6	620195	620200	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657991
13139	NC_021179	GC	3	6	620215	620220	0 %	0 %	50 %	50 %	488657991
13140	NC_021179	AAT	2	6	620229	620234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	488657991
13141	NC_021179	A	6	6	620235	620240	100 %	0 %	0 %	0 %	488657991
13142	NC_021179	CG	4	8	620244	620251	0 %	0 %	50 %	50 %	488657991
13143	NC_021179	TGC	2	6	620258	620263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13144	NC_021179	GCA	2	6	620274	620279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13145	NC_021179	TGC	2	6	620321	620326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13146	NC_021179	TTC	2	6	620360	620365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657991
13147	NC_021179	GCA	2	6	620391	620396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13148	NC_021179	TCA	2	6	620421	620426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657991
13149	NC_021179	GCT	2	6	620446	620451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13150	NC_021179	GCTC	2	8	620517	620524	0 %	25 %	25 %	50 %	488657991
13151	NC_021179	CTC	2	6	620603	620608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657991
13152	NC_021179	CTG	2	6	620629	620634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13153	NC_021179	CTG	2	6	620682	620687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13154	NC_021179	AGA	2	6	620720	620725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657991
13155	NC_021179	AC	3	6	620765	620770	50 %	0 %	0 %	50 %	488657991
13156	NC_021179	GCG	2	6	620773	620778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657991
13157	NC_021179	CCA	2	6	620794	620799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657991
13158	NC_021179	GCA	2	6	620802	620807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13159	NC_021179	CAA	2	6	620825	620830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657991
13160	NC_021179	CAC	2	6	620831	620836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657991
13161	NC_021179	CTGC	2	8	620844	620851	0 %	25 %	25 %	50 %	488657991
13162	NC_021179	GC	3	6	620915	620920	0 %	0 %	50 %	50 %	488657991
13163	NC_021179	AC	3	6	620921	620926	50 %	0 %	0 %	50 %	488657991
13164	NC_021179	A	7	7	620933	620939	100 %	0 %	0 %	0 %	488657991
13165	NC_021179	ATGCA	2	10	620984	620993	40 %	20 %	20 %	20 %	488657991
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13168	NC_021179	GAC	2	6	621041	621046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657991
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13171	NC_021179	CA	3	6	621108	621113	50 %	0 %	0 %	50 %	488657991
13172	NC_021179	ACA	2	6	621127	621132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657991
13173	NC_021179	GC	3	6	621165	621170	0 %	0 %	50 %	50 %	488657991
13174	NC_021179	CAA	2	6	621218	621223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657991
13175	NC_021179	GGAA	2	8	621233	621240	50 %	0 %	50 %	0 %	488657991
13176	NC_021179	CTG	2	6	621317	621322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13177	NC_021179	CGCC	2	8	621445	621452	0 %	0 %	25 %	75 %	488657991
13178	NC_021179	CAC	3	9	621551	621559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657991
13179	NC_021179	ATCT	2	8	621605	621612	25 %	50 %	0 %	25 %	488657991
13180	NC_021179	CATC	2	8	621703	621710	25 %	25 %	0 %	50 %	488657991
13181	NC_021179	TC	3	6	621715	621720	0 %	50 %	0 %	50 %	488657991
13182	NC_021179	AC	3	6	621746	621751	50 %	0 %	0 %	50 %	488657991
13183	NC_021179	CAG	2	6	621757	621762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657991
13184	NC_021179	T	7	7	621862	621868	0 %	100 %	0 %	0 %	488657992
13185	NC_021179	ACG	2	6	621938	621943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657992
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13187	NC_021179	GGCA	2	8	621992	621999	25 %	0 %	50 %	25 %	488657992
13188	NC_021179	CGC	2	6	622038	622043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657992
13189	NC_021179	CA	3	6	622092	622097	50 %	0 %	0 %	50 %	488657992
13190	NC_021179	CG	4	8	622121	622128	0 %	0 %	50 %	50 %	488657992
13191	NC_021179	TGC	2	6	622140	622145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657992
13192	NC_021179	GC	3	6	622165	622170	0 %	0 %	50 %	50 %	488657992
13193	NC_021179	A	7	7	622200	622206	100 %	0 %	0 %	0 %	488657992
13194	NC_021179	AC	3	6	622209	622214	50 %	0 %	0 %	50 %	488657992
13195	NC_021179	GGC	2	6	622260	622265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	488657992
13196	NC_021179	AGCG	2	8	622397	622404	25 %	0 %	50 %	25 %	488657992
13197	NC_021179	GT	3	6	622419	622424	0 %	50 %	50 %	0 %	488657992
13198	NC_021179	GCA	2	6	622456	622461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657992
13199	NC_021179	AGTCC	2	10	622471	622480	20 %	20 %	20 %	40 %	488657992
13200	NC_021179	AGC	2	6	622487	622492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657992
13201	NC_021179	TCC	3	9	622524	622532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657992
13202	NC_021179	GC	3	6	622555	622560	0 %	0 %	50 %	50 %	488657992
13203	NC_021179	GA	3	6	622626	622631	50 %	0 %	50 %	0 %	488657992
13204	NC_021179	CA	3	6	622683	622688	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13205	NC_021179	GCA	2	6	622709	622714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657993
13206	NC_021179	CGGG	2	8	622741	622748	0 %	0 %	75 %	25 %	488657993
13207	NC_021179	GC	3	6	622904	622909	0 %	0 %	50 %	50 %	488657993
13208	NC_021179	CAA	2	6	622936	622941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657993
13209	NC_021179	AG	3	6	623005	623010	50 %	0 %	50 %	0 %	488657993
13210	NC_021179	CACC	2	8	623019	623026	25 %	0 %	0 %	75 %	488657993
13211	NC_021179	TCA	2	6	623186	623191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657993
13212	NC_021179	ACC	2	6	623234	623239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657993
13213	NC_021179	AC	3	6	623301	623306	50 %	0 %	0 %	50 %	488657993
13214	NC_021179	ACAA	2	8	623337	623344	75 %	0 %	0 %	25 %	488657993
13215	NC_021179	CCG	2	6	623355	623360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657993
13216	NC_021179	CTT	2	6	623363	623368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13217	NC_021179	CGGTTG	2	12	623376	623387	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488657994
13218	NC_021179	ATT	2	6	623413	623418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657994
13219	NC_021179	CTCA	2	8	623439	623446	25 %	25 %	0 %	50 %	488657994
13220	NC_021179	GCC	2	6	623482	623487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657994
13221	NC_021179	AGG	2	6	623507	623512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657994
13222	NC_021179	ATC	2	6	623520	623525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657994
13223	NC_021179	ACG	2	6	623539	623544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657994
13224	NC_021179	GC	3	6	623609	623614	0 %	0 %	50 %	50 %	488657994
13225	NC_021179	CCG	2	6	623756	623761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657994
13226	NC_021179	GCA	2	6	623813	623818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657994
13227	NC_021179	ACA	2	6	623846	623851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657994
13228	NC_021179	GAC	2	6	623859	623864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657994
13229	NC_021179	CGGT	2	8	623888	623895	0 %	25 %	50 %	25 %	488657994
13230	NC_021179	AGG	2	6	623896	623901	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657994
13231	NC_021179	AAAGG	2	10	623904	623913	60 %	0 %	40 %	0 %	488657994
13232	NC_021179	TCA	2	6	624023	624028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657994
13233	NC_021179	CGC	2	6	624153	624158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657994
13234	NC_021179	CGCA	2	8	624174	624181	25 %	0 %	25 %	50 %	488657994
13235	NC_021179	GCT	2	6	624194	624199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657994
13236	NC_021179	TTC	2	6	624211	624216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657994
13237	NC_021179	CACG	2	8	624290	624297	25 %	0 %	25 %	50 %	488657994
13238	NC_021179	AC	3	6	624352	624357	50 %	0 %	0 %	50 %	488657994
13239	NC_021179	CAGA	2	8	624373	624380	50 %	0 %	25 %	25 %	488657994
13240	NC_021179	GC	3	6	624407	624412	0 %	0 %	50 %	50 %	488657994
13241	NC_021179	CTC	2	6	624461	624466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13242	NC_021179	AC	3	6	624540	624545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13243	NC_021179	CGCA	2	8	624583	624590	25 %	0 %	25 %	50 %	488657995
13244	NC_021179	AACCT	2	10	624608	624617	40 %	20 %	0 %	40 %	488657995
13245	NC_021179	AG	3	6	624652	624657	50 %	0 %	50 %	0 %	488657995
13246	NC_021179	GCA	2	6	624728	624733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657995
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13433	NC_021179	AAGT	2	8	633926	633933	50 %	25 %	25 %	0 %	488658003
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13466	NC_021179	CTTT	2	8	635403	635410	0 %	75 %	0 %	25 %	488658004
13467	NC_021179	ATCG	2	8	635521	635528	25 %	25 %	25 %	25 %	488658004
13468	NC_021179	GTTATT	2	12	635558	635569	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	488658004
13469	NC_021179	TAG	2	6	635590	635595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658004
13470	NC_021179	TGG	2	6	635620	635625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488658004
13471	NC_021179	CTC	2	6	635677	635682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488658004
13472	NC_021179	AGG	2	6	635969	635974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488658004
13473	NC_021179	CAT	2	6	636002	636007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658004
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13475	NC_021179	AGA	2	6	636127	636132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13479	NC_021179	ACT	2	6	636459	636464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658005
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13482	NC_021179	GCT	2	6	636611	636616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658005
13483	NC_021179	CAGCA	2	10	636682	636691	40 %	0 %	20 %	40 %	488658005
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13488	NC_021179	TCT	2	6	636944	636949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658005
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13491	NC_021179	CTT	2	6	637099	637104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488658005
13492	NC_021179	GTC	3	9	637172	637180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488658005
13493	NC_021179	GT	3	6	637249	637254	0 %	50 %	50 %	0 %	488658005
13494	NC_021179	AGC	2	6	637323	637328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488658005
13495	NC_021179	TGA	2	6	637393	637398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658005
13496	NC_021179	TAC	2	6	637400	637405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488658005
13497	NC_021179	GC	3	6	637426	637431	0 %	0 %	50 %	50 %	488658005
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13500	NC_021179	GTA	2	6	637599	637604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488658006

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