MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Treponema pallidum str. Fribourg-Blanc

Total Repeats: 24015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021179	TTAT	2	8	25315	25322	25 %	75 %	0 %	0 %	488657433
502	NC_021179	TGT	2	6	25326	25331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657433
503	NC_021179	GCT	2	6	25359	25364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657433
504	NC_021179	T	9	9	25370	25378	0 %	100 %	0 %	0 %	488657433
505	NC_021179	AGA	2	6	25424	25429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_021179	ACA	2	6	25632	25637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657434
507	NC_021179	T	6	6	25665	25670	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
508	NC_021179	TTA	2	6	25686	25691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657434
509	NC_021179	AG	3	6	25792	25797	50 %	0 %	50 %	0 %	488657434
510	NC_021179	GGA	2	6	25802	25807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	488657434
511	NC_021179	GATT	2	8	25861	25868	25 %	50 %	25 %	0 %	488657434
512	NC_021179	CTT	2	6	25912	25917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657434
513	NC_021179	T	6	6	25916	25921	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
514	NC_021179	AGCG	2	8	25999	26006	25 %	0 %	50 %	25 %	488657434
515	NC_021179	TG	3	6	26028	26033	0 %	50 %	50 %	0 %	488657434
516	NC_021179	GTATC	2	10	26078	26087	20 %	40 %	20 %	20 %	488657434
517	NC_021179	TGG	2	6	26089	26094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657434
518	NC_021179	GCA	2	6	26100	26105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657434
519	NC_021179	TGC	2	6	26114	26119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657434
520	NC_021179	T	6	6	26123	26128	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
521	NC_021179	CTT	2	6	26131	26136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657434
522	NC_021179	TGC	2	6	26158	26163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657434
523	NC_021179	T	6	6	26197	26202	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
524	NC_021179	GTT	2	6	26249	26254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657434
525	NC_021179	GT	3	6	26255	26260	0 %	50 %	50 %	0 %	488657434
526	NC_021179	A	7	7	26448	26454	100 %	0 %	0 %	0 %	488657434
527	NC_021179	GC	3	6	26472	26477	0 %	0 %	50 %	50 %	488657434
528	NC_021179	TCT	2	6	26550	26555	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657434
529	NC_021179	T	7	7	26636	26642	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
530	NC_021179	T	6	6	26700	26705	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
531	NC_021179	TGT	2	6	26725	26730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657434
532	NC_021179	CG	3	6	26741	26746	0 %	0 %	50 %	50 %	488657434
533	NC_021179	CCTT	2	8	26835	26842	0 %	50 %	0 %	50 %	488657434
534	NC_021179	GCAC	2	8	26941	26948	25 %	0 %	25 %	50 %	488657434
535	NC_021179	TGC	2	6	26951	26956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657434
536	NC_021179	GGTGG	2	10	26985	26994	0 %	20 %	80 %	0 %	488657434
537	NC_021179	CAA	2	6	27138	27143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657434
538	NC_021179	GA	3	6	27243	27248	50 %	0 %	50 %	0 %	488657434
539	NC_021179	AGCG	2	8	27254	27261	25 %	0 %	50 %	25 %	488657434
540	NC_021179	T	6	6	27269	27274	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
541	NC_021179	TTGAGA	2	12	27322	27333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657434
542	NC_021179	CAGT	2	8	27345	27352	25 %	25 %	25 %	25 %	488657434
543	NC_021179	GT	4	8	27414	27421	0 %	50 %	50 %	0 %	488657434
544	NC_021179	GC	4	8	27456	27463	0 %	0 %	50 %	50 %	488657434
545	NC_021179	T	6	6	27493	27498	0 %	100 %	0 %	0 %	488657434
546	NC_021179	GTG	2	6	27612	27617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
547	NC_021179	GTT	2	6	27659	27664	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657435
548	NC_021179	TGG	2	6	27676	27681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
549	NC_021179	TGG	2	6	27686	27691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
550	NC_021179	TATTT	2	10	27711	27720	20 %	80 %	0 %	0 %	488657435
551	NC_021179	CTGCG	2	10	27777	27786	0 %	20 %	40 %	40 %	488657435
552	NC_021179	TGCG	2	8	27793	27800	0 %	25 %	50 %	25 %	488657435
553	NC_021179	GT	4	8	27808	27815	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
554	NC_021179	CATC	2	8	27822	27829	25 %	25 %	0 %	50 %	488657435
555	NC_021179	T	6	6	27833	27838	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
556	NC_021179	GGT	2	6	27859	27864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
557	NC_021179	GTA	2	6	27933	27938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
558	NC_021179	GT	3	6	28049	28054	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
559	NC_021179	AGTG	2	8	28055	28062	25 %	25 %	50 %	0 %	488657435
560	NC_021179	ATG	2	6	28101	28106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
561	NC_021179	T	6	6	28111	28116	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
562	NC_021179	TTA	2	6	28132	28137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	488657435
563	NC_021179	AT	4	8	28142	28149	50 %	50 %	0 %	0 %	488657435
564	NC_021179	TCA	2	6	28203	28208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657435
565	NC_021179	T	6	6	28251	28256	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
566	NC_021179	G	6	6	28268	28273	0 %	0 %	100 %	0 %	488657435
567	NC_021179	T	6	6	28355	28360	0 %	100 %	0 %	0 %	488657435
568	NC_021179	CAG	2	6	28421	28426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657435
569	NC_021179	TTTG	2	8	28439	28446	0 %	75 %	25 %	0 %	488657435
570	NC_021179	TGA	2	6	28486	28491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
571	NC_021179	GT	3	6	28495	28500	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
572	NC_021179	TG	3	6	28510	28515	0 %	50 %	50 %	0 %	488657435
573	NC_021179	GTG	2	6	28692	28697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
574	NC_021179	TGA	2	6	28735	28740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657435
575	NC_021179	GGT	2	6	28884	28889	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657435
576	NC_021179	TGA	2	6	28898	28903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
577	NC_021179	AT	3	6	28937	28942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021179	CTC	2	6	29028	29033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
579	NC_021179	AGG	2	6	29055	29060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_021179	G	6	6	29059	29064	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
581	NC_021179	GCT	2	6	29131	29136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657436
582	NC_021179	TCC	2	6	29157	29162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657436
583	NC_021179	GC	3	6	29215	29220	0 %	0 %	50 %	50 %	488657436
584	NC_021179	GAT	2	6	29254	29259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657436
585	NC_021179	ATC	2	6	29308	29313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657436
586	NC_021179	AAC	2	6	29323	29328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	488657436
587	NC_021179	A	7	7	29335	29341	100 %	0 %	0 %	0 %	488657436
588	NC_021179	A	6	6	29447	29452	100 %	0 %	0 %	0 %	488657436
589	NC_021179	TCT	2	6	29476	29481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657436
590	NC_021179	GAA	2	6	29550	29555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	488657436
591	NC_021179	TC	3	6	29586	29591	0 %	50 %	0 %	50 %	488657436
592	NC_021179	AG	3	6	29866	29871	50 %	0 %	50 %	0 %	488657437
593	NC_021179	ACC	2	6	29943	29948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657437
594	NC_021179	TGCGC	2	10	29965	29974	0 %	20 %	40 %	40 %	488657437
595	NC_021179	AGT	2	6	29979	29984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657437
596	NC_021179	CCG	2	6	30121	30126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	488657437
597	NC_021179	TCT	2	6	30160	30165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
598	NC_021179	CAC	2	6	30319	30324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	488657437
599	NC_021179	T	6	6	30337	30342	0 %	100 %	0 %	0 %	488657437
600	NC_021179	TC	3	6	30395	30400	0 %	50 %	0 %	50 %	488657437
601	NC_021179	AGC	2	6	30462	30467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657437
602	NC_021179	TGC	2	6	30492	30497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
603	NC_021179	TGT	2	6	30537	30542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657437
604	NC_021179	GTG	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	488657437
605	NC_021179	TG	3	6	30635	30640	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
606	NC_021179	TCCAG	2	10	30791	30800	20 %	20 %	20 %	40 %	488657437
607	NC_021179	TTC	2	6	30803	30808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
608	NC_021179	TGC	2	6	30818	30823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
609	NC_021179	CGT	2	6	30924	30929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
610	NC_021179	AAAG	2	8	30939	30946	75 %	0 %	25 %	0 %	488657437
611	NC_021179	CA	3	6	30961	30966	50 %	0 %	0 %	50 %	488657437
612	NC_021179	GT	3	6	31054	31059	0 %	50 %	50 %	0 %	488657437
613	NC_021179	CTA	2	6	31105	31110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657437
614	NC_021179	GCGG	2	8	31115	31122	0 %	0 %	75 %	25 %	488657437
615	NC_021179	ATG	2	6	31169	31174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	488657437
616	NC_021179	CTT	2	6	31228	31233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	488657437
617	NC_021179	CTG	2	6	31249	31254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
618	NC_021179	TCGT	2	8	31281	31288	0 %	50 %	25 %	25 %	488657437
619	NC_021179	GAACAG	2	12	31306	31317	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	488657437
620	NC_021179	A	6	6	31322	31327	100 %	0 %	0 %	0 %	488657437
621	NC_021179	TGGGG	2	10	31349	31358	0 %	20 %	80 %	0 %	488657437
622	NC_021179	GTT	2	6	31366	31371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	488657437
623	NC_021179	TCC	2	6	31404	31409	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	488657437
624	NC_021179	TGTC	2	8	31421	31428	0 %	50 %	25 %	25 %	488657437
625	NC_021179	GC	3	6	31460	31465	0 %	0 %	50 %	50 %	488657437
626	NC_021179	GCT	2	6	31467	31472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	488657437
627	NC_021179	TCA	2	6	31521	31526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	488657437
628	NC_021179	T	7	7	31529	31535	0 %	100 %	0 %	0 %	488657437
629	NC_021179	GTCTGG	2	12	31541	31552	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	488657437
630	NC_021179	GCA	2	6	31585	31590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	488657437
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632	NC_021179	GA	3	6	31733	31738	50 %	0 %	50 %	0 %	488657437
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