MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_020892	CGG	2	6	250762	250767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_020892	TTCTCT	2	12	250778	250789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_020892	TC	3	6	250808	250813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_020892	TCGTCA	2	12	250829	250840	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933870
5505	NC_020892	ATG	2	6	250887	250892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933870
5506	NC_020892	GGC	2	6	250930	250935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933870
5507	NC_020892	CGAGGA	2	12	250941	250952	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	474933870
5508	NC_020892	CGG	3	9	250968	250976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933870
5509	NC_020892	TCA	2	6	250986	250991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933870
5510	NC_020892	CGA	2	6	251045	251050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5511	NC_020892	AGA	2	6	251138	251143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933871
5512	NC_020892	AGG	2	6	251179	251184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5513	NC_020892	TCT	2	6	251195	251200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5514	NC_020892	AGG	2	6	251257	251262	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5515	NC_020892	GAT	2	6	251356	251361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5516	NC_020892	GAG	2	6	251385	251390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5517	NC_020892	GAT	2	6	251551	251556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5518	NC_020892	GAT	2	6	251565	251570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5519	NC_020892	CGG	2	6	251573	251578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933871
5520	NC_020892	AGG	2	6	251581	251586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5521	NC_020892	CTT	2	6	251601	251606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5522	NC_020892	ACGA	2	8	251608	251615	50 %	0 %	25 %	25 %	474933871
5523	NC_020892	ATG	2	6	251683	251688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5524	NC_020892	GGGC	2	8	251693	251700	0 %	0 %	75 %	25 %	474933871
5525	NC_020892	CGA	2	6	251705	251710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5526	NC_020892	CTT	2	6	251721	251726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5527	NC_020892	GAA	2	6	251802	251807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933871
5528	NC_020892	TGA	2	6	251825	251830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5529	NC_020892	GGT	3	9	251859	251867	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933871
5530	NC_020892	CCGATG	2	12	251938	251949	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5531	NC_020892	CCT	2	6	252035	252040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933871
5532	NC_020892	GAGGAA	2	12	252051	252062	50 %	0 %	50 %	0 %	474933871
5533	NC_020892	GAC	2	6	252066	252071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5534	NC_020892	GGAA	2	8	252079	252086	50 %	0 %	50 %	0 %	474933871
5535	NC_020892	CCG	2	6	252106	252111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933871
5536	NC_020892	GAC	2	6	252123	252128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5537	NC_020892	TCG	2	6	252205	252210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5538	NC_020892	C	6	6	252358	252363	0 %	0 %	0 %	100 %	474933871
5539	NC_020892	GGA	2	6	252396	252401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5540	NC_020892	ATC	2	6	252421	252426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933871
5541	NC_020892	TCG	2	6	252460	252465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5542	NC_020892	CGA	2	6	252485	252490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5543	NC_020892	GTC	2	6	252519	252524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5544	NC_020892	GGC	2	6	252543	252548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933871
5545	NC_020892	TCG	2	6	252562	252567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5546	NC_020892	TGA	2	6	252581	252586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933871
5547	NC_020892	CTTC	2	8	252647	252654	0 %	50 %	0 %	50 %	474933871
5548	NC_020892	CGT	2	6	252656	252661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5549	NC_020892	CCA	2	6	252794	252799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933871
5550	NC_020892	GAG	2	6	252846	252851	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933871
5551	NC_020892	GTC	2	6	252909	252914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5552	NC_020892	TCC	2	6	252949	252954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933871
5553	NC_020892	CGA	3	9	252992	253000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5554	NC_020892	CTT	2	6	253021	253026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933871
5555	NC_020892	CTG	2	6	253074	253079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933871
5556	NC_020892	TTG	2	6	253096	253101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933871
5557	NC_020892	GGT	2	6	253107	253112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933871
5558	NC_020892	CGG	2	6	253176	253181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933872
5559	NC_020892	G	6	6	253267	253272	0 %	0 %	100 %	0 %	474933872
5560	NC_020892	CGC	2	6	253416	253421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5561	NC_020892	GCG	2	6	253439	253444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_020892	TAT	2	6	253485	253490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_020892	ATT	2	6	253536	253541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_020892	CGGT	2	8	253563	253570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5565	NC_020892	TTA	2	6	253600	253605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_020892	CCG	2	6	253705	253710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933873
5567	NC_020892	ATC	2	6	253749	253754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933873
5568	NC_020892	AGG	2	6	253761	253766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933873
5569	NC_020892	GCT	2	6	253783	253788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933873
5570	NC_020892	TGC	2	6	253803	253808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933873
5571	NC_020892	AGGA	2	8	253839	253846	50 %	0 %	50 %	0 %	474933873
5572	NC_020892	ATTG	2	8	253858	253865	25 %	50 %	25 %	0 %	474933873
5573	NC_020892	GCC	2	6	253874	253879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_020892	TC	3	6	253883	253888	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5575	NC_020892	CGG	2	6	253889	253894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_020892	ATG	2	6	253896	253901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_020892	GTT	2	6	253912	253917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933874
5578	NC_020892	GGC	2	6	253989	253994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933874
5579	NC_020892	CAT	2	6	254017	254022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933874
5580	NC_020892	CGT	2	6	254025	254030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933874
5581	NC_020892	CGA	2	6	254052	254057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933874
5582	NC_020892	GAA	2	6	254080	254085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933874
5583	NC_020892	CGA	2	6	254127	254132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933874
5584	NC_020892	CTC	2	6	254155	254160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933874
5585	NC_020892	AGT	2	6	254166	254171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933874
5586	NC_020892	CAG	2	6	254173	254178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933874
5587	NC_020892	GAGC	2	8	254185	254192	25 %	0 %	50 %	25 %	474933874
5588	NC_020892	TGA	3	9	254208	254216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933874
5589	NC_020892	GAG	2	6	254281	254286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933874
5590	NC_020892	GTA	2	6	254356	254361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933874
5591	NC_020892	GAG	2	6	254434	254439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933874
5592	NC_020892	GCT	2	6	254460	254465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933874
5593	NC_020892	TAGT	2	8	254563	254570	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_020892	ATT	2	6	254603	254608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5595	NC_020892	ATTT	2	8	254615	254622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5596	NC_020892	AAT	2	6	254634	254639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_020892	AAT	2	6	254647	254652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_020892	AGC	2	6	254811	254816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933875
5599	NC_020892	GGTGAC	2	12	254833	254844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	474933875
5600	NC_020892	ATG	2	6	254921	254926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933875
5601	NC_020892	TGA	2	6	254940	254945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933875
5602	NC_020892	GCA	2	6	254977	254982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933875
5603	NC_020892	CAG	2	6	254995	255000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933875
5604	NC_020892	GGC	2	6	255022	255027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933875
5605	NC_020892	GCC	2	6	255082	255087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933875
5606	NC_020892	CAT	2	6	255096	255101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933875
5607	NC_020892	TCC	2	6	255114	255119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933875
5608	NC_020892	CCTC	2	8	255192	255199	0 %	25 %	0 %	75 %	474933875
5609	NC_020892	AGT	2	6	255258	255263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933875
5610	NC_020892	CCA	2	6	255291	255296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933875
5611	NC_020892	ACGC	2	8	255326	255333	25 %	0 %	25 %	50 %	474933875
5612	NC_020892	ACA	2	6	255368	255373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933875
5613	NC_020892	GGCG	2	8	255572	255579	0 %	0 %	75 %	25 %	474933876
5614	NC_020892	CAT	2	6	255626	255631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933876
5615	NC_020892	TAA	2	6	255830	255835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5616	NC_020892	CGT	2	6	255876	255881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933877
5617	NC_020892	GTC	2	6	255913	255918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933877
5618	NC_020892	AGC	2	6	256019	256024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933877
5619	NC_020892	ATC	2	6	256051	256056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933877
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5621	NC_020892	CCG	2	6	256190	256195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933877
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5985	NC_020892	CTC	2	6	273333	273338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933896
5986	NC_020892	GAG	2	6	273341	273346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933896
5987	NC_020892	GAA	2	6	273365	273370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933896
5988	NC_020892	TCCCC	2	10	273371	273380	0 %	20 %	0 %	80 %	474933896
5989	NC_020892	AGG	2	6	273399	273404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933896
5990	NC_020892	CGT	2	6	273433	273438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933896
5991	NC_020892	GCCT	2	8	273596	273603	0 %	25 %	25 %	50 %	474933896
5992	NC_020892	GAA	2	6	273642	273647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933896
5993	NC_020892	GTT	2	6	273668	273673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933896
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5999	NC_020892	CTTGAG	2	12	273991	274002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	474933897
6000	NC_020892	CTT	2	6	274003	274008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933897

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