MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thermoplasmatales archaeon BRNA1

Total Repeats: 32512

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_020892	GAT	2	6	205788	205793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933826
4502	NC_020892	CGT	2	6	205799	205804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933826
4503	NC_020892	TCCGC	2	10	205825	205834	0 %	20 %	20 %	60 %	474933826
4504	NC_020892	TCC	2	6	205836	205841	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933826
4505	NC_020892	TCC	2	6	205860	205865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933826
4506	NC_020892	GTCC	2	8	205907	205914	0 %	25 %	25 %	50 %	474933826
4507	NC_020892	CGG	2	6	206002	206007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933826
4508	NC_020892	CTC	2	6	206093	206098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933827
4509	NC_020892	ATC	3	9	206200	206208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933827
4510	NC_020892	CGG	2	6	206217	206222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933827
4511	NC_020892	ATG	2	6	206233	206238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933827
4512	NC_020892	GC	3	6	206362	206367	0 %	0 %	50 %	50 %	474933827
4513	NC_020892	CAC	3	9	206451	206459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933827
4514	NC_020892	AAG	2	6	206461	206466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933827
4515	NC_020892	AGG	2	6	206501	206506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933827
4516	NC_020892	ATG	2	6	206598	206603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933827
4517	NC_020892	CCT	2	6	206630	206635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4518	NC_020892	CG	5	10	206680	206689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_020892	AT	3	6	206696	206701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_020892	C	6	6	206767	206772	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4521	NC_020892	ACA	3	9	206845	206853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933828
4522	NC_020892	CTGG	2	8	206867	206874	0 %	25 %	50 %	25 %	474933828
4523	NC_020892	CAT	2	6	206900	206905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933828
4524	NC_020892	TCG	2	6	206923	206928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
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4526	NC_020892	CAT	2	6	207050	207055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933828
4527	NC_020892	GAG	2	6	207086	207091	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933828
4528	NC_020892	CGG	2	6	207098	207103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933828
4529	NC_020892	GAA	2	6	207104	207109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933828
4530	NC_020892	CCG	2	6	207151	207156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933828
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4532	NC_020892	GCCTCG	2	12	207214	207225	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	474933828
4533	NC_020892	TCC	2	6	207250	207255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933828
4534	NC_020892	CTC	2	6	207320	207325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933828
4535	NC_020892	CGG	2	6	207334	207339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933828
4536	NC_020892	CAG	2	6	207356	207361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933828
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4538	NC_020892	G	6	6	207456	207461	0 %	0 %	100 %	0 %	474933828
4539	NC_020892	TGA	2	6	207481	207486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933828
4540	NC_020892	ACC	2	6	207495	207500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933828
4541	NC_020892	TTC	2	6	207501	207506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933828
4542	NC_020892	TACA	2	8	207515	207522	50 %	25 %	0 %	25 %	474933828
4543	NC_020892	CCG	2	6	207526	207531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933828
4544	NC_020892	GGA	2	6	207537	207542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933828
4545	NC_020892	GAT	2	6	207554	207559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933828
4546	NC_020892	TCA	2	6	207571	207576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933828
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4548	NC_020892	CTG	2	6	207615	207620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
4549	NC_020892	GAAG	2	8	207667	207674	50 %	0 %	50 %	0 %	474933828
4550	NC_020892	CCAAGG	2	12	207694	207705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933828
4551	NC_020892	TTCCTG	2	12	207723	207734	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	474933828
4552	NC_020892	TGATCC	2	12	207736	207747	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	474933828
4553	NC_020892	CGT	2	6	207748	207753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
4554	NC_020892	TCG	2	6	207832	207837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
4555	NC_020892	CAT	2	6	207860	207865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933828
4556	NC_020892	AAG	2	6	207903	207908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933828
4557	NC_020892	GCT	2	6	207950	207955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
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4560	NC_020892	GCC	2	6	208002	208007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933828
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4562	NC_020892	GGA	2	6	208100	208105	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933828
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4564	NC_020892	TCC	2	6	208174	208179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933828
4565	NC_020892	TCA	2	6	208186	208191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933828
4566	NC_020892	GTC	2	6	208193	208198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
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4568	NC_020892	TCG	2	6	208384	208389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933828
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4578	NC_020892	CATC	2	8	208985	208992	25 %	25 %	0 %	50 %	474933829
4579	NC_020892	CAT	2	6	209043	209048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933829
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4583	NC_020892	TCG	2	6	209291	209296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933829
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4588	NC_020892	GCA	2	6	209587	209592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933831
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4590	NC_020892	CCTC	2	8	209697	209704	0 %	25 %	0 %	75 %	474933831
4591	NC_020892	TCAC	2	8	209769	209776	25 %	25 %	0 %	50 %	474933831
4592	NC_020892	GGA	2	6	209785	209790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933831
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4602	NC_020892	TCC	2	6	210129	210134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933831
4603	NC_020892	AGG	3	9	210150	210158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933831
4604	NC_020892	TGA	2	6	210186	210191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933831
4605	NC_020892	GGGC	2	8	210192	210199	0 %	0 %	75 %	25 %	474933831
4606	NC_020892	CCA	2	6	210243	210248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933831
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4619	NC_020892	AGGA	2	8	210684	210691	50 %	0 %	50 %	0 %	474933832
4620	NC_020892	GA	3	6	210784	210789	50 %	0 %	50 %	0 %	474933832
4621	NC_020892	GAGG	2	8	210833	210840	25 %	0 %	75 %	0 %	474933832
4622	NC_020892	CCT	2	6	210911	210916	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933832
4623	NC_020892	TCA	2	6	210922	210927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933832
4624	NC_020892	AGG	2	6	210958	210963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933832
4625	NC_020892	CGT	2	6	211001	211006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933832
4626	NC_020892	GAG	2	6	211023	211028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933832
4627	NC_020892	AGG	2	6	211057	211062	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933832
4628	NC_020892	CAT	2	6	211151	211156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933832
4629	NC_020892	CTC	2	6	211172	211177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933832
4630	NC_020892	CA	3	6	211189	211194	50 %	0 %	0 %	50 %	474933832
4631	NC_020892	TCC	2	6	211219	211224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933832
4632	NC_020892	TCA	2	6	211237	211242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933832
4633	NC_020892	GCC	2	6	211257	211262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933832
4634	NC_020892	CAA	2	6	211366	211371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933833
4635	NC_020892	GCCATC	2	12	211433	211444	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	474933833
4636	NC_020892	CCG	2	6	211482	211487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933833
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4639	NC_020892	TGA	2	6	211596	211601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933833
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4641	NC_020892	GGA	2	6	211693	211698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933833
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4647	NC_020892	C	6	6	211929	211934	0 %	0 %	0 %	100 %	474933833
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4650	NC_020892	ACG	2	6	212034	212039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933833
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4652	NC_020892	GAG	2	6	212116	212121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933833
4653	NC_020892	CGA	2	6	212182	212187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933833
4654	NC_020892	GTC	2	6	212213	212218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933833
4655	NC_020892	GAT	2	6	212254	212259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933833
4656	NC_020892	CGG	2	6	212266	212271	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933833
4657	NC_020892	GGAGG	2	10	212279	212288	20 %	0 %	80 %	0 %	474933833
4658	NC_020892	GGA	2	6	212349	212354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933833
4659	NC_020892	GC	3	6	212379	212384	0 %	0 %	50 %	50 %	474933833
4660	NC_020892	GGACAG	2	12	212605	212616	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	474933833
4661	NC_020892	CCTT	2	8	212698	212705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4662	NC_020892	CTT	2	6	212741	212746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933834
4663	NC_020892	TCT	2	6	212806	212811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933834
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4681	NC_020892	CGA	2	6	213509	213514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	474933835
4682	NC_020892	CTT	2	6	213525	213530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933835
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4693	NC_020892	CCA	2	6	213995	214000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	474933835
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4703	NC_020892	GAT	2	6	214432	214437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933836
4704	NC_020892	GGACCT	2	12	214440	214451	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	474933836
4705	NC_020892	GTCG	2	8	214498	214505	0 %	25 %	50 %	25 %	474933836
4706	NC_020892	GATG	2	8	214510	214517	25 %	25 %	50 %	0 %	474933836
4707	NC_020892	GGT	2	6	214549	214554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933836
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4713	NC_020892	TA	3	6	214766	214771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4714	NC_020892	G	6	6	214808	214813	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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4729	NC_020892	CAT	2	6	215624	215629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933837
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4742	NC_020892	GGCG	2	8	216077	216084	0 %	0 %	75 %	25 %	474933838
4743	NC_020892	CTC	2	6	216116	216121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933838
4744	NC_020892	GAG	3	9	216161	216169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933838
4745	NC_020892	TGG	2	6	216211	216216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	474933838
4746	NC_020892	GTC	3	9	216359	216367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933838
4747	NC_020892	TTG	2	6	216381	216386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	474933838
4748	NC_020892	GTC	2	6	216416	216421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933838
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4751	NC_020892	CAT	2	6	216521	216526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933838
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4754	NC_020892	TCTCGG	2	12	216672	216683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	474933839
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4853	NC_020892	TCT	2	6	221285	221290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	474933842
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4859	NC_020892	GCAGA	2	10	221680	221689	40 %	0 %	40 %	20 %	474933842
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4864	NC_020892	CCG	2	6	221839	221844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	474933842
4865	NC_020892	TCC	2	6	221896	221901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	474933842
4866	NC_020892	GAG	2	6	221908	221913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933842
4867	NC_020892	GAGG	2	8	221925	221932	25 %	0 %	75 %	0 %	474933842
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4869	NC_020892	GAG	2	6	221989	221994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	474933842
4870	NC_020892	GAA	2	6	222000	222005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933842
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4873	NC_020892	GGC	2	6	222069	222074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	474933842
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4877	NC_020892	CCG	2	6	222212	222217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4878	NC_020892	CAT	2	6	222341	222346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	474933843
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4897	NC_020892	CGGA	2	8	222943	222950	25 %	0 %	50 %	25 %	474933843
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4963	NC_020892	GGAC	2	8	225911	225918	25 %	0 %	50 %	25 %	474933846
4964	NC_020892	CT	3	6	225958	225963	0 %	50 %	0 %	50 %	474933846
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4967	NC_020892	TAA	2	6	226061	226066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4968	NC_020892	AAG	2	6	226132	226137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4969	NC_020892	ATT	2	6	226251	226256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4970	NC_020892	AGG	2	6	226294	226299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4971	NC_020892	ACA	2	6	226376	226381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4972	NC_020892	AAG	2	6	226423	226428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4973	NC_020892	GAT	2	6	226476	226481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4974	NC_020892	TCA	2	6	226485	226490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4975	NC_020892	CAT	2	6	226519	226524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4976	NC_020892	AGA	2	6	226550	226555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4977	NC_020892	AATA	2	8	226563	226570	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4978	NC_020892	TG	3	6	226614	226619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4979	NC_020892	GACA	2	8	226664	226671	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4980	NC_020892	TCC	2	6	226677	226682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4981	NC_020892	GAAA	2	8	226760	226767	75 %	0 %	25 %	0 %	474933847
4982	NC_020892	ACA	2	6	226772	226777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	474933847
4983	NC_020892	ATG	2	6	226780	226785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	474933847
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4985	NC_020892	GA	3	6	226911	226916	50 %	0 %	50 %	0 %	474933847
4986	NC_020892	AGA	2	6	226924	226929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	474933847
4987	NC_020892	T	6	6	226964	226969	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4988	NC_020892	GATC	2	8	226985	226992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4989	NC_020892	AT	3	6	227119	227124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4990	NC_020892	ATCC	2	8	227153	227160	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4991	NC_020892	CA	3	6	227169	227174	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4992	NC_020892	AATG	2	8	227180	227187	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4993	NC_020892	AGCG	2	8	227317	227324	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4994	NC_020892	ATGAA	2	10	227337	227346	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4995	NC_020892	AAT	2	6	227412	227417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4996	NC_020892	ATT	2	6	227431	227436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4997	NC_020892	GAA	2	6	227533	227538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4998	NC_020892	AAT	2	6	227563	227568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4999	NC_020892	TTC	2	6	227593	227598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5000	NC_020892	GTAA	2	8	227776	227783	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

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