MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 2076

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	TATAA	2	10	61	70	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019954	AAAAC	2	10	425	434	80 %	0 %	0 %	20 %	555077095
3	NC_019954	TCGCT	2	10	602	611	0 %	40 %	20 %	40 %	555077095
4	NC_019954	TAAAA	2	10	2862	2871	80 %	20 %	0 %	0 %	438000912
5	NC_019954	ATTTT	2	10	2936	2945	20 %	80 %	0 %	0 %	438000912
6	NC_019954	ATAAA	2	10	4748	4757	80 %	20 %	0 %	0 %	555077097
7	NC_019954	AAAAT	2	10	5089	5098	80 %	20 %	0 %	0 %	555077098
8	NC_019954	AAGGG	2	10	6008	6017	40 %	0 %	60 %	0 %	555077098
9	NC_019954	CAAAA	2	10	10636	10645	80 %	0 %	0 %	20 %	438000919
10	NC_019954	AACAC	2	10	11807	11816	60 %	0 %	0 %	40 %	555077100
11	NC_019954	TTTTA	2	10	13606	13615	20 %	80 %	0 %	0 %	438000924
12	NC_019954	ATATA	2	10	14091	14100	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_019954	CATTA	2	10	14635	14644	40 %	40 %	0 %	20 %	438000925
14	NC_019954	TGCAC	2	10	15841	15850	20 %	20 %	20 %	40 %	438000926
15	NC_019954	AAGAC	2	10	16482	16491	60 %	0 %	20 %	20 %	438000926
16	NC_019954	ATTCT	2	10	16680	16689	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_019954	TAGCA	2	10	16734	16743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_019954	AGGCA	2	10	17245	17254	40 %	0 %	40 %	20 %	438000927
19	NC_019954	GACAA	2	10	18559	18568	60 %	0 %	20 %	20 %	438000928
20	NC_019954	ATCCC	2	10	18797	18806	20 %	20 %	0 %	60 %	438000928
21	NC_019954	CTTAA	2	10	18947	18956	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_019954	TTTTC	2	10	19240	19249	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_019954	GCCAA	2	10	19756	19765	40 %	0 %	20 %	40 %	438000929
24	NC_019954	CGATT	2	10	20483	20492	20 %	40 %	20 %	20 %	438000929
25	NC_019954	GCAAA	2	10	20830	20839	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_019954	ATTAC	2	10	23029	23038	40 %	40 %	0 %	20 %	555077102
27	NC_019954	ATTTT	2	10	28314	28323	20 %	80 %	0 %	0 %	438000937
28	NC_019954	AAATC	2	10	31993	32002	60 %	20 %	0 %	20 %	438000943
29	NC_019954	AAACA	2	10	37243	37252	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_019954	ATAAG	2	10	37337	37346	60 %	20 %	20 %	0 %	438000949
31	NC_019954	CAAGT	2	10	39629	39638	40 %	20 %	20 %	20 %	438000951
32	NC_019954	AATAC	2	10	41165	41174	60 %	20 %	0 %	20 %	438000952
33	NC_019954	ATATA	2	10	41781	41790	60 %	40 %	0 %	0 %	438000952
34	NC_019954	TGATA	2	10	42257	42266	40 %	40 %	20 %	0 %	438000953
35	NC_019954	GGCAA	2	10	45545	45554	40 %	0 %	40 %	20 %	555077111
36	NC_019954	TGTTT	2	10	48543	48552	0 %	80 %	20 %	0 %	438000959
37	NC_019954	TAATT	2	10	52630	52639	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_019954	AAAGA	2	10	54053	54062	80 %	0 %	20 %	0 %	438000963
39	NC_019954	ATTTA	2	10	54230	54239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_019954	AATAC	2	10	55875	55884	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_019954	ATATC	2	10	59988	59997	40 %	40 %	0 %	20 %	555077117
42	NC_019954	CATGA	2	10	61224	61233	40 %	20 %	20 %	20 %	555077118
43	NC_019954	TAAAT	2	10	61247	61256	60 %	40 %	0 %	0 %	555077118
44	NC_019954	AGAAA	2	10	62203	62212	80 %	0 %	20 %	0 %	555077118
45	NC_019954	CAAGT	2	10	64077	64086	40 %	20 %	20 %	20 %	438000974
46	NC_019954	GAAAT	2	10	67398	67407	60 %	20 %	20 %	0 %	438000979
47	NC_019954	ATGTG	2	10	69161	69170	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019954	CATCA	2	10	69181	69190	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_019954	GCTTA	2	10	70957	70966	20 %	40 %	20 %	20 %	438000983
50	NC_019954	GTATT	2	10	71013	71022	20 %	60 %	20 %	0 %	438000983
51	NC_019954	AATTG	2	10	74125	74134	40 %	40 %	20 %	0 %	438000984
52	NC_019954	AATAT	2	10	75764	75773	60 %	40 %	0 %	0 %	555077119
53	NC_019954	AAGAA	2	10	77481	77490	80 %	0 %	20 %	0 %	555077120
54	NC_019954	GTTTG	2	10	81115	81124	0 %	60 %	40 %	0 %	555077122
55	NC_019954	ACCGT	2	10	81715	81724	20 %	20 %	20 %	40 %	555077122
56	NC_019954	ATATG	2	10	83093	83102	40 %	40 %	20 %	0 %	438000992
57	NC_019954	ATTTT	2	10	85495	85504	20 %	80 %	0 %	0 %	555077123
58	NC_019954	TATAA	2	10	86571	86580	60 %	40 %	0 %	0 %	438000996
59	NC_019954	ATATG	2	10	87067	87076	40 %	40 %	20 %	0 %	438000996
60	NC_019954	GGATG	2	10	87459	87468	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
61	NC_019954	TTTTA	2	10	90603	90612	20 %	80 %	0 %	0 %	438001000
62	NC_019954	GTGAG	2	10	91344	91353	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019954	TGCTG	2	10	92157	92166	0 %	40 %	40 %	20 %	555077125
64	NC_019954	ATGAA	2	10	92636	92645	60 %	20 %	20 %	0 %	555077125
65	NC_019954	ATATT	2	10	93979	93988	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_019954	CCTTA	2	10	97337	97346	20 %	40 %	0 %	40 %	438001009
67	NC_019954	ATTTT	2	10	99423	99432	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019954	ATAGA	2	10	99823	99832	60 %	20 %	20 %	0 %	438001012
69	NC_019954	AAAAT	2	10	101317	101326	80 %	20 %	0 %	0 %	438001013
70	NC_019954	AATAC	2	10	102190	102199	60 %	20 %	0 %	20 %	438001014
71	NC_019954	GTCAG	2	10	103376	103385	20 %	20 %	40 %	20 %	438001016
72	NC_019954	CAAAA	2	10	105000	105009	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_019954	CGGAC	2	10	105589	105598	20 %	0 %	40 %	40 %	438001019
74	NC_019954	AAACT	2	10	106538	106547	60 %	20 %	0 %	20 %	555077130
75	NC_019954	CGAAA	2	10	106663	106672	60 %	0 %	20 %	20 %	555077130
76	NC_019954	ACTAT	2	10	107327	107336	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_019954	TAATT	2	10	107421	107430	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019954	TTGGT	2	10	107978	107987	0 %	60 %	40 %	0 %	438001023
79	NC_019954	AGAAA	2	10	108993	109002	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019954	ACAGA	2	10	115880	115889	60 %	0 %	20 %	20 %	555077134
81	NC_019954	ATTTC	2	10	117972	117981	20 %	60 %	0 %	20 %	438001036
82	NC_019954	TCAGG	2	10	118282	118291	20 %	20 %	40 %	20 %	438001036
83	NC_019954	GTCAA	2	10	118473	118482	40 %	20 %	20 %	20 %	438001036
84	NC_019954	TGCTT	2	10	119039	119048	0 %	60 %	20 %	20 %	555077135
85	NC_019954	CTTCA	2	10	120051	120060	20 %	40 %	0 %	40 %	555077135
86	NC_019954	ATTTG	2	10	122088	122097	20 %	60 %	20 %	0 %	438001039
87	NC_019954	GTGAT	2	10	122729	122738	20 %	40 %	40 %	0 %	555077136
88	NC_019954	GAAAG	2	10	124588	124597	60 %	0 %	40 %	0 %	438001043
89	NC_019954	TAAAA	2	10	125647	125656	80 %	20 %	0 %	0 %	438001043
90	NC_019954	AGGAG	2	10	126113	126122	40 %	0 %	60 %	0 %	555077137
91	NC_019954	TTATT	2	10	129004	129013	20 %	80 %	0 %	0 %	555077140
92	NC_019954	TGATT	2	10	129055	129064	20 %	60 %	20 %	0 %	555077140
93	NC_019954	TTATA	2	10	129423	129432	40 %	60 %	0 %	0 %	555077141
94	NC_019954	TTTAT	2	10	129834	129843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019954	AGTTT	2	10	130481	130490	20 %	60 %	20 %	0 %	555077142
96	NC_019954	GGGAG	2	10	134101	134110	20 %	0 %	80 %	0 %	438001049
97	NC_019954	ATGAA	2	10	134681	134690	60 %	20 %	20 %	0 %	438001050
98	NC_019954	CATAT	2	10	135453	135462	40 %	40 %	0 %	20 %	438001050
99	NC_019954	TATAA	2	10	135757	135766	60 %	40 %	0 %	0 %	438001050
100	NC_019954	ATTAT	2	10	139352	139361	40 %	60 %	0 %	0 %	438001054
101	NC_019954	CAAAT	2	10	140683	140692	60 %	20 %	0 %	20 %	438001057
102	NC_019954	ACGAA	2	10	142220	142229	60 %	0 %	20 %	20 %	555077145
103	NC_019954	AATTT	2	10	143471	143480	40 %	60 %	0 %	0 %	555077146
104	NC_019954	AGGGA	2	10	143567	143576	40 %	0 %	60 %	0 %	555077146
105	NC_019954	TTAAA	2	10	144218	144227	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019954	ATTAA	2	10	144235	144244	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019954	GAGGT	2	10	144501	144510	20 %	20 %	60 %	0 %	555077147
108	NC_019954	AAGGC	2	10	144882	144891	40 %	0 %	40 %	20 %	555077147
109	NC_019954	GCTGT	2	10	145326	145335	0 %	40 %	40 %	20 %	555077147
110	NC_019954	GTTTG	2	10	147140	147149	0 %	60 %	40 %	0 %	555077149
111	NC_019954	ATTTG	2	10	148601	148610	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_019954	ATATT	2	10	148737	148746	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_019954	TAACT	2	10	148811	148820	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_019954	ATCCA	2	10	152160	152169	40 %	20 %	0 %	40 %	438001066
115	NC_019954	TTATT	2	10	152720	152729	20 %	80 %	0 %	0 %	555077150
116	NC_019954	TGACA	2	10	154304	154313	40 %	20 %	20 %	20 %	438001068
117	NC_019954	CAATA	2	10	155417	155426	60 %	20 %	0 %	20 %	438001069
118	NC_019954	ACTAA	2	10	157094	157103	60 %	20 %	0 %	20 %	438001071
119	NC_019954	AACGG	2	10	157528	157537	40 %	0 %	40 %	20 %	438001073
120	NC_019954	AAATA	2	10	158566	158575	80 %	20 %	0 %	0 %	438001074
121	NC_019954	TAATA	2	10	161685	161694	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_019954	CAGGG	2	10	162504	162513	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_019954	AAGGC	2	10	163412	163421	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_019954	AGATG	2	10	163544	163553	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
125	NC_019954	GCCGT	2	10	164463	164472	0 %	20 %	40 %	40 %	438001081
126	NC_019954	TGCCA	2	10	164704	164713	20 %	20 %	20 %	40 %	438001081
127	NC_019954	TCCAA	2	10	164920	164929	40 %	20 %	0 %	40 %	438001081
128	NC_019954	TAGGG	2	10	166247	166256	20 %	20 %	60 %	0 %	438001083
129	NC_019954	CGCTT	2	10	166829	166838	0 %	40 %	20 %	40 %	438001083
130	NC_019954	ACGGT	2	10	167941	167950	20 %	20 %	40 %	20 %	438001083
131	NC_019954	TATAT	3	15	168897	168911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_019954	GAATA	2	10	168922	168931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019954	ATGCC	2	10	170220	170229	20 %	20 %	20 %	40 %	555077156
134	NC_019954	CATAA	2	10	170289	170298	60 %	20 %	0 %	20 %	555077156
135	NC_019954	GGTTT	2	10	170559	170568	0 %	60 %	40 %	0 %	555077157
136	NC_019954	TGCGG	2	10	171008	171017	0 %	20 %	60 %	20 %	438001088
137	NC_019954	GATAA	2	10	172062	172071	60 %	20 %	20 %	0 %	438001089
138	NC_019954	AGGGA	2	10	172618	172627	40 %	0 %	60 %	0 %	438001089
139	NC_019954	ATAAC	2	10	173329	173338	60 %	20 %	0 %	20 %	438001089
140	NC_019954	TAGAG	2	10	174237	174246	40 %	20 %	40 %	0 %	438001090
141	NC_019954	TGATA	2	10	175250	175259	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_019954	AGAAA	2	10	176609	176618	80 %	0 %	20 %	0 %	555077158
143	NC_019954	TAGTA	2	10	178004	178013	40 %	40 %	20 %	0 %	555077160
144	NC_019954	TTATT	2	10	179008	179017	20 %	80 %	0 %	0 %	555077161
145	NC_019954	TTAAG	2	10	180111	180120	40 %	40 %	20 %	0 %	438001096
146	NC_019954	TAATA	2	10	180685	180694	60 %	40 %	0 %	0 %	438001096
147	NC_019954	TGTTT	2	10	182412	182421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_019954	ATTTT	2	10	182609	182618	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_019954	TTTAT	2	10	183909	183918	20 %	80 %	0 %	0 %	438001099
150	NC_019954	AAGGG	2	10	185001	185010	40 %	0 %	60 %	0 %	438001102
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152	NC_019954	AAAGC	2	10	187992	188001	60 %	0 %	20 %	20 %	555077164
153	NC_019954	ATATA	2	10	189789	189798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_019954	ATCAT	2	10	191109	191118	40 %	40 %	0 %	20 %	438001105
155	NC_019954	ACGAA	2	10	193281	193290	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_019954	GAATA	2	10	193327	193336	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_019954	GATTT	2	10	195657	195666	20 %	60 %	20 %	0 %	438001108
158	NC_019954	TAATT	2	10	196322	196331	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_019954	TTGGT	2	10	196879	196888	0 %	60 %	40 %	0 %	438001111
160	NC_019954	AGAAA	2	10	197894	197903	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_019954	TTCCT	2	10	203645	203654	0 %	60 %	0 %	40 %	438001117
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165	NC_019954	GCAGG	2	10	209816	209825	20 %	0 %	60 %	20 %	438001120
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174	NC_019954	TCGGT	2	10	228344	228353	0 %	40 %	40 %	20 %	438001152
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178	NC_019954	ATTTT	2	10	236941	236950	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_019954	TGATA	2	10	242138	242147	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
182	NC_019954	TTTCT	2	10	246148	246157	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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185	NC_019954	GGGAG	2	10	252481	252490	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
186	NC_019954	ATCCC	2	10	254771	254780	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
187	NC_019954	AAATA	2	10	260028	260037	80 %	20 %	0 %	0 %	438001176
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189	NC_019954	AACTT	2	10	260379	260388	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_019954	CCAGA	2	10	260614	260623	40 %	0 %	20 %	40 %	438001178
192	NC_019954	TTATT	2	10	263122	263131	20 %	80 %	0 %	0 %	438001180
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198	NC_019954	ATACC	2	10	270994	271003	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
199	NC_019954	ATACG	2	10	271275	271284	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
200	NC_019954	ATATT	2	10	272609	272618	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_019954	GCCTT	2	10	273166	273175	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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206	NC_019954	AGTTT	2	10	278179	278188	20 %	60 %	20 %	0 %	438001199
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208	NC_019954	ATTAC	2	10	280998	281007	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
209	NC_019954	GAAAA	2	10	281055	281064	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
210	NC_019954	GTTAA	2	10	282822	282831	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
211	NC_019954	TTTAA	2	10	282911	282920	40 %	60 %	0 %	0 %	438001203
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215	NC_019954	AGTAT	2	10	294700	294709	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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240	NC_019954	ATGGG	2	10	327339	327348	20 %	20 %	60 %	0 %	555077199
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243	NC_019954	TAATT	2	10	335886	335895	40 %	60 %	0 %	0 %	438001254
244	NC_019954	TGAAT	2	10	336177	336186	40 %	40 %	20 %	0 %	438001254
245	NC_019954	ATGAT	2	10	336203	336212	40 %	40 %	20 %	0 %	438001254
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247	NC_019954	ACATT	2	10	339385	339394	40 %	40 %	0 %	20 %	438001258
248	NC_019954	CAAAG	2	10	342104	342113	60 %	0 %	20 %	20 %	438001259
249	NC_019954	AATAA	2	10	343141	343150	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_019954	ATTTT	2	10	345435	345444	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
251	NC_019954	AAAGA	2	10	345607	345616	80 %	0 %	20 %	0 %	555077202
252	NC_019954	TTTGA	2	10	346855	346864	20 %	60 %	20 %	0 %	438001265
253	NC_019954	ATTTA	3	15	349269	349283	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_019954	GGTAA	2	10	349676	349685	40 %	20 %	40 %	0 %	438001269
255	NC_019954	TGGGG	2	10	350419	350428	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
256	NC_019954	TAATT	2	10	351532	351541	40 %	60 %	0 %	0 %	438001271
257	NC_019954	ACAGT	2	10	351789	351798	40 %	20 %	20 %	20 %	438001271
258	NC_019954	ACCGA	2	10	352040	352049	40 %	0 %	20 %	40 %	438001271
259	NC_019954	AATTT	2	10	352091	352100	40 %	60 %	0 %	0 %	438001271
260	NC_019954	ATATT	2	10	352260	352269	40 %	60 %	0 %	0 %	438001271
261	NC_019954	TATCA	2	10	354988	354997	40 %	40 %	0 %	20 %	438001273
262	NC_019954	ATTAT	2	10	357076	357085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_019954	TACAA	2	10	360516	360525	60 %	20 %	0 %	20 %	438001279
264	NC_019954	TTACA	2	10	364212	364221	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_019954	AAAAC	2	10	368419	368428	80 %	0 %	0 %	20 %	438001286
266	NC_019954	TAAAA	2	10	370442	370451	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_019954	TACAC	2	10	371334	371343	40 %	20 %	0 %	40 %	438001288
268	NC_019954	TAGTA	2	10	371406	371415	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019954	CAGGT	2	10	373951	373960	20 %	20 %	40 %	20 %	438001292
270	NC_019954	GTAAT	2	10	374738	374747	40 %	40 %	20 %	0 %	438001293
271	NC_019954	AGGCC	2	10	376486	376495	20 %	0 %	40 %	40 %	438001296
272	NC_019954	TCATA	2	10	381913	381922	40 %	40 %	0 %	20 %	438001301
273	NC_019954	ATTTT	2	10	381994	382003	20 %	80 %	0 %	0 %	438001301
274	NC_019954	AATAG	2	10	382034	382043	60 %	20 %	20 %	0 %	438001301
275	NC_019954	ATTAT	2	10	382494	382503	40 %	60 %	0 %	0 %	438001301
276	NC_019954	ACTTT	2	10	383043	383052	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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279	NC_019954	ATTTT	2	10	384509	384518	20 %	80 %	0 %	0 %	438001304
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286	NC_019954	TCCAT	2	10	390216	390225	20 %	40 %	0 %	40 %	438001310
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387	NC_019954	CTTTT	2	10	530215	530224	0 %	80 %	0 %	20 %	555077262
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390	NC_019954	TTTAA	2	10	534754	534763	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
391	NC_019954	AACAT	2	10	536087	536096	60 %	20 %	0 %	20 %	555077263
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393	NC_019954	TTAAA	2	10	536832	536841	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_019954	ACCCA	2	10	538112	538121	40 %	0 %	0 %	60 %	438001470
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399	NC_019954	TTTAA	2	10	542733	542742	40 %	60 %	0 %	0 %	438001474
400	NC_019954	CATTA	2	10	543394	543403	40 %	40 %	0 %	20 %	438001475
401	NC_019954	GATAT	2	10	546345	546354	40 %	40 %	20 %	0 %	438001479
402	NC_019954	AGGGC	2	10	547575	547584	20 %	0 %	60 %	20 %	438001480
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