MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Tepidanaerobacter acetatoxydans Re1 complete genome

Total Repeats: 6797

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019954	ACAA	2	8	107	114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_019954	ATTG	2	8	128	135	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_019954	CATG	2	8	704	711	25 %	25 %	25 %	25 %	555077095
4	NC_019954	TCTT	2	8	761	768	0 %	75 %	0 %	25 %	555077095
5	NC_019954	CCGC	2	8	968	975	0 %	0 %	25 %	75 %	555077095
6	NC_019954	GAAT	2	8	2004	2011	50 %	25 %	25 %	0 %	438000912
7	NC_019954	TGGA	2	8	2357	2364	25 %	25 %	50 %	0 %	438000912
8	NC_019954	GAAA	2	8	2984	2991	75 %	0 %	25 %	0 %	438000913
9	NC_019954	TATT	2	8	3324	3331	25 %	75 %	0 %	0 %	555077096
10	NC_019954	GACA	2	8	3442	3449	50 %	0 %	25 %	25 %	555077096
11	NC_019954	GATT	2	8	3882	3889	25 %	50 %	25 %	0 %	555077096
12	NC_019954	ACAT	2	8	4157	4164	50 %	25 %	0 %	25 %	555077096
13	NC_019954	GCAG	2	8	4166	4173	25 %	0 %	50 %	25 %	555077096
14	NC_019954	TATT	2	8	4202	4209	25 %	75 %	0 %	0 %	555077096
15	NC_019954	ATTC	2	8	4227	4234	25 %	50 %	0 %	25 %	555077096
16	NC_019954	TTTA	2	8	4493	4500	25 %	75 %	0 %	0 %	555077097
17	NC_019954	TGGA	2	8	5451	5458	25 %	25 %	50 %	0 %	555077098
18	NC_019954	ATGA	2	8	5940	5947	50 %	25 %	25 %	0 %	555077098
19	NC_019954	CAAA	2	8	6066	6073	75 %	0 %	0 %	25 %	555077098
20	NC_019954	GTAG	2	8	7072	7079	25 %	25 %	50 %	0 %	438000918
21	NC_019954	GCCA	2	8	8531	8538	25 %	0 %	25 %	50 %	438000918
22	NC_019954	ACAA	2	8	8659	8666	75 %	0 %	0 %	25 %	438000918
23	NC_019954	GTTG	2	8	9111	9118	0 %	50 %	50 %	0 %	438000918
24	NC_019954	AAAT	2	8	9450	9457	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_019954	AAGT	2	8	9921	9928	50 %	25 %	25 %	0 %	438000919
26	NC_019954	GGCA	2	8	11033	11040	25 %	0 %	50 %	25 %	555077099
27	NC_019954	AGTC	2	8	11412	11419	25 %	25 %	25 %	25 %	555077099
28	NC_019954	TAAA	2	8	11637	11644	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_019954	TTGA	2	8	11732	11739	25 %	50 %	25 %	0 %	555077100
30	NC_019954	TGAT	2	8	12338	12345	25 %	50 %	25 %	0 %	438000922
31	NC_019954	GAAA	2	8	13983	13990	75 %	0 %	25 %	0 %	438000924
32	NC_019954	AGAT	2	8	14003	14010	50 %	25 %	25 %	0 %	438000924
33	NC_019954	AGTT	2	8	15183	15190	25 %	50 %	25 %	0 %	438000926
34	NC_019954	GACT	2	8	15627	15634	25 %	25 %	25 %	25 %	438000926
35	NC_019954	TGAA	2	8	15693	15700	50 %	25 %	25 %	0 %	438000926
36	NC_019954	CAAA	2	8	16570	16577	75 %	0 %	0 %	25 %	438000926
37	NC_019954	TTAT	2	8	17152	17159	25 %	75 %	0 %	0 %	438000927
38	NC_019954	ATCT	2	8	17325	17332	25 %	50 %	0 %	25 %	438000927
39	NC_019954	ATTT	2	8	18230	18237	25 %	75 %	0 %	0 %	438000928
40	NC_019954	TGAT	2	8	19669	19676	25 %	50 %	25 %	0 %	438000929
41	NC_019954	TGGA	2	8	19881	19888	25 %	25 %	50 %	0 %	438000929
42	NC_019954	GCTT	2	8	20143	20150	0 %	50 %	25 %	25 %	438000929
43	NC_019954	TACC	2	8	20272	20279	25 %	25 %	0 %	50 %	438000929
44	NC_019954	GGAA	2	8	20566	20573	50 %	0 %	50 %	0 %	438000929
45	NC_019954	ATAA	2	8	20796	20803	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019954	TAAT	2	8	21013	21020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019954	TTAA	2	8	21023	21030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_019954	ATCC	2	8	21674	21681	25 %	25 %	0 %	50 %	555077101
49	NC_019954	AAGG	2	8	22062	22069	50 %	0 %	50 %	0 %	438000931
50	NC_019954	GGAA	2	8	23270	23277	50 %	0 %	50 %	0 %	555077102
51	NC_019954	CATT	2	8	23471	23478	25 %	50 %	0 %	25 %	555077103
52	NC_019954	AAAT	2	8	24215	24222	75 %	25 %	0 %	0 %	555077103
53	NC_019954	AGAA	2	8	24342	24349	75 %	0 %	25 %	0 %	555077103
54	NC_019954	GTCT	2	8	24678	24685	0 %	50 %	25 %	25 %	555077103
55	NC_019954	AAGA	2	8	26340	26347	75 %	0 %	25 %	0 %	438000935
56	NC_019954	GCAA	2	8	27044	27051	50 %	0 %	25 %	25 %	438000935
57	NC_019954	TTAA	2	8	27633	27640	50 %	50 %	0 %	0 %	555077105
58	NC_019954	TCTA	2	8	27683	27690	25 %	50 %	0 %	25 %	555077105
59	NC_019954	GATT	2	8	28003	28010	25 %	50 %	25 %	0 %	438000937
60	NC_019954	TACA	2	8	28181	28188	50 %	25 %	0 %	25 %	438000937
61	NC_019954	ATTT	2	8	28507	28514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_019954	AAAG	2	8	28793	28800	75 %	0 %	25 %	0 %	555077106
63	NC_019954	GGAA	2	8	29039	29046	50 %	0 %	50 %	0 %	555077107
64	NC_019954	CTTT	2	8	29348	29355	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_019954	ATTT	2	8	30019	30026	25 %	75 %	0 %	0 %	555077108
66	NC_019954	AACA	2	8	30590	30597	75 %	0 %	0 %	25 %	555077108
67	NC_019954	TCTT	2	8	30778	30785	0 %	75 %	0 %	25 %	555077109
68	NC_019954	ATTT	2	8	31397	31404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_019954	TGCT	2	8	31671	31678	0 %	50 %	25 %	25 %	438000943
70	NC_019954	TTTA	2	8	32058	32065	25 %	75 %	0 %	0 %	438000943
71	NC_019954	ATTT	2	8	32084	32091	25 %	75 %	0 %	0 %	438000943
72	NC_019954	CTGC	2	8	33051	33058	0 %	25 %	25 %	50 %	438000945
73	NC_019954	ACTT	2	8	33435	33442	25 %	50 %	0 %	25 %	438000945
74	NC_019954	CAGG	2	8	34067	34074	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
75	NC_019954	TATT	2	8	34322	34329	25 %	75 %	0 %	0 %	438000947
76	NC_019954	TTTG	2	8	34714	34721	0 %	75 %	25 %	0 %	438000947
77	NC_019954	AAAT	2	8	35297	35304	75 %	25 %	0 %	0 %	438000948
78	NC_019954	AAGG	2	8	36852	36859	50 %	0 %	50 %	0 %	438000948
79	NC_019954	GTAA	2	8	37007	37014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_019954	AAAG	2	8	37319	37326	75 %	0 %	25 %	0 %	438000949
81	NC_019954	AAAT	2	8	37821	37828	75 %	25 %	0 %	0 %	438000949
82	NC_019954	ATTT	2	8	39810	39817	25 %	75 %	0 %	0 %	438000951
83	NC_019954	GACA	2	8	40129	40136	50 %	0 %	25 %	25 %	438000951
84	NC_019954	GATT	2	8	40604	40611	25 %	50 %	25 %	0 %	438000951
85	NC_019954	CTTA	2	8	40945	40952	25 %	50 %	0 %	25 %	438000952
86	NC_019954	TATT	2	8	40977	40984	25 %	75 %	0 %	0 %	438000952
87	NC_019954	TCTT	2	8	41930	41937	0 %	75 %	0 %	25 %	438000953
88	NC_019954	GGAT	2	8	42384	42391	25 %	25 %	50 %	0 %	438000953
89	NC_019954	ATTT	2	8	43643	43650	25 %	75 %	0 %	0 %	438000954
90	NC_019954	CAGA	2	8	44259	44266	50 %	0 %	25 %	25 %	555077110
91	NC_019954	ACCT	2	8	44332	44339	25 %	25 %	0 %	50 %	555077110
92	NC_019954	GAAG	2	8	44785	44792	50 %	0 %	50 %	0 %	555077110
93	NC_019954	TTAT	2	8	45809	45816	25 %	75 %	0 %	0 %	555077111
94	NC_019954	GAAA	2	8	45871	45878	75 %	0 %	25 %	0 %	555077111
95	NC_019954	GGCA	2	8	46689	46696	25 %	0 %	50 %	25 %	555077111
96	NC_019954	ATAA	2	8	47556	47563	75 %	25 %	0 %	0 %	555077111
97	NC_019954	GTTT	2	8	47612	47619	0 %	75 %	25 %	0 %	438000958
98	NC_019954	ATTT	2	8	48323	48330	25 %	75 %	0 %	0 %	438000958
99	NC_019954	TGTC	2	8	48418	48425	0 %	50 %	25 %	25 %	438000958
100	NC_019954	TTGA	2	8	48574	48581	25 %	50 %	25 %	0 %	438000959
101	NC_019954	GGCA	2	8	48646	48653	25 %	0 %	50 %	25 %	438000959
102	NC_019954	GAAA	2	8	48870	48877	75 %	0 %	25 %	0 %	438000959
103	NC_019954	AATG	2	8	49039	49046	50 %	25 %	25 %	0 %	438000959
104	NC_019954	GGCA	2	8	49137	49144	25 %	0 %	50 %	25 %	438000959
105	NC_019954	GCAA	2	8	49165	49172	50 %	0 %	25 %	25 %	438000959
106	NC_019954	AATA	2	8	49341	49348	75 %	25 %	0 %	0 %	438000959
107	NC_019954	GGAA	2	8	50229	50236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019954	GAAA	2	8	50997	51004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_019954	TCAT	2	8	51053	51060	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019954	TTTA	2	8	51152	51159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_019954	ATAA	2	8	51782	51789	75 %	25 %	0 %	0 %	438000961
112	NC_019954	TTCT	2	8	52576	52583	0 %	75 %	0 %	25 %	438000961
113	NC_019954	CAAG	2	8	52973	52980	50 %	0 %	25 %	25 %	438000963
114	NC_019954	TTAA	2	8	54221	54228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_019954	TTCT	2	8	54715	54722	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_019954	TCGT	2	8	55546	55553	0 %	50 %	25 %	25 %	555077113
117	NC_019954	TAAT	2	8	55965	55972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_019954	TTAA	2	8	55973	55980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_019954	TTCC	2	8	56193	56200	0 %	50 %	0 %	50 %	555077114
120	NC_019954	ACAA	2	8	56314	56321	75 %	0 %	0 %	25 %	555077114
121	NC_019954	TTCC	2	8	56345	56352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_019954	TATT	2	8	56393	56400	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_019954	CAGA	2	8	57279	57286	50 %	0 %	25 %	25 %	438000967
124	NC_019954	AGCC	2	8	57781	57788	25 %	0 %	25 %	50 %	438000967
125	NC_019954	TTGC	2	8	57793	57800	0 %	50 %	25 %	25 %	438000967
126	NC_019954	CTTT	2	8	58489	58496	0 %	75 %	0 %	25 %	555077115
127	NC_019954	AAAT	2	8	58506	58513	75 %	25 %	0 %	0 %	555077115
128	NC_019954	AATA	2	8	59675	59682	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_019954	TGAT	2	8	60058	60065	25 %	50 %	25 %	0 %	555077117
130	NC_019954	TTAG	2	8	60273	60280	25 %	50 %	25 %	0 %	555077117
131	NC_019954	TTTA	2	8	60817	60824	25 %	75 %	0 %	0 %	555077118
132	NC_019954	TCAG	2	8	61622	61629	25 %	25 %	25 %	25 %	555077118
133	NC_019954	CCTT	2	8	63214	63221	0 %	50 %	0 %	50 %	438000974
134	NC_019954	CATG	2	8	63969	63976	25 %	25 %	25 %	25 %	438000974
135	NC_019954	CAGC	2	8	63982	63989	25 %	0 %	25 %	50 %	438000974
136	NC_019954	TCTT	2	8	64903	64910	0 %	75 %	0 %	25 %	438000977
137	NC_019954	ACAA	2	8	66008	66015	75 %	0 %	0 %	25 %	438000978
138	NC_019954	CTGA	2	8	66940	66947	25 %	25 %	25 %	25 %	438000978
139	NC_019954	AGGA	2	8	67728	67735	50 %	0 %	50 %	0 %	438000979
140	NC_019954	AATA	3	12	69586	69597	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_019954	ATTT	2	8	69714	69721	25 %	75 %	0 %	0 %	438000982
142	NC_019954	TAAA	2	8	69987	69994	75 %	25 %	0 %	0 %	438000982
143	NC_019954	ATCT	2	8	70561	70568	25 %	50 %	0 %	25 %	438000982
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