MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 64410

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019902	CTT	2	6	66	71	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759340
2	NC_019902	CTG	2	6	82	87	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
3	NC_019902	CAT	2	6	129	134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
4	NC_019902	GTG	2	6	235	240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
5	NC_019902	GCC	2	6	259	264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
6	NC_019902	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
7	NC_019902	GCT	2	6	354	359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
8	NC_019902	GAA	2	6	398	403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759340
9	NC_019902	CAA	2	6	453	458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759340
10	NC_019902	GAT	2	6	480	485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759340
11	NC_019902	TGC	3	9	515	523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
12	NC_019902	ACT	2	6	549	554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
13	NC_019902	CAT	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
14	NC_019902	CGC	2	6	634	639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
15	NC_019902	GCC	2	6	664	669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
16	NC_019902	TGG	2	6	809	814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759340
17	NC_019902	GCC	2	6	916	921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
18	NC_019902	GCC	2	6	982	987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
19	NC_019902	AGC	2	6	1105	1110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
20	NC_019902	CAT	2	6	1170	1175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
21	NC_019902	ATC	2	6	1213	1218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759340
22	NC_019902	CTG	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
23	NC_019902	CGA	2	6	1257	1262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
24	NC_019902	GCC	2	6	1351	1356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
25	NC_019902	CTG	2	6	1372	1377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
26	NC_019902	GGA	2	6	1380	1385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759340
27	NC_019902	GGC	2	6	1407	1412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759340
28	NC_019902	CCG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759340
29	NC_019902	CGA	2	6	1569	1574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759340
30	NC_019902	AAG	2	6	1607	1612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759340
31	NC_019902	GGC	2	6	1617	1622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759340
32	NC_019902	TCG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759340
33	NC_019902	GAA	2	6	2074	2079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_019902	TGA	2	6	2104	2109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_019902	TGG	2	6	2247	2252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_019902	CTT	2	6	2270	2275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_019902	GAC	2	6	2411	2416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_019902	TGG	3	9	2431	2439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_019902	CGC	3	9	2479	2487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_019902	TGG	2	6	2556	2561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_019902	GCA	2	6	2582	2587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_019902	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_019902	TAG	2	6	2797	2802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019902	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019902	TGA	2	6	2921	2926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019902	CGG	2	6	3327	3332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_019902	GTG	2	6	3414	3419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759341
48	NC_019902	GGT	2	6	3588	3593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759341
49	NC_019902	CGG	2	6	3625	3630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759341
50	NC_019902	GGC	3	9	3635	3643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759341
51	NC_019902	GCC	2	6	3702	3707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759341
52	NC_019902	ACG	2	6	3757	3762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759341
53	NC_019902	GCC	2	6	3773	3778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759341
54	NC_019902	CAG	2	6	3787	3792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759341
55	NC_019902	GGC	2	6	3850	3855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_019902	CGA	2	6	3909	3914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_019902	ACG	2	6	3915	3920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_019902	CGT	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_019902	ACG	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_019902	CGC	2	6	4047	4052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_019902	CCG	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_019902	TGG	2	6	4780	4785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_019902	CGG	2	6	4807	4812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_019902	ATC	2	6	4887	4892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759342
65	NC_019902	ATG	2	6	4953	4958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759342
66	NC_019902	GCA	2	6	4987	4992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759342
67	NC_019902	GTG	2	6	5092	5097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_019902	TCA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_019902	CGG	2	6	5172	5177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_019902	ATG	2	6	5221	5226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_019902	GCC	2	6	5324	5329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759343
72	NC_019902	TTG	2	6	5382	5387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759343
73	NC_019902	CAG	2	6	5438	5443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759343
74	NC_019902	CTC	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759343
75	NC_019902	TGG	2	6	5452	5457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759343
76	NC_019902	CGC	2	6	5479	5484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759343
77	NC_019902	TGA	2	6	5612	5617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_019902	GGC	2	6	5627	5632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_019902	TCA	2	6	5686	5691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759344
80	NC_019902	AGC	2	6	5809	5814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
81	NC_019902	CCT	2	6	5918	5923	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759344
82	NC_019902	GTG	2	6	6028	6033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759344
83	NC_019902	TCC	2	6	6070	6075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759344
84	NC_019902	ACC	3	9	6247	6255	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759344
85	NC_019902	CAC	2	6	6258	6263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759344
86	NC_019902	GCA	2	6	6275	6280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
87	NC_019902	AGT	2	6	6299	6304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759344
88	NC_019902	TCT	2	6	6343	6348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759344
89	NC_019902	AGC	2	6	6397	6402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759344
90	NC_019902	GCT	2	6	6446	6451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759344
91	NC_019902	GCC	2	6	6502	6507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759344
92	NC_019902	CGG	2	6	6700	6705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_019902	AGC	2	6	6754	6759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_019902	GTG	2	6	6894	6899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_019902	CGA	2	6	7076	7081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759345
96	NC_019902	GTT	2	6	7127	7132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759345
97	NC_019902	GGC	2	6	7153	7158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
98	NC_019902	GCC	3	9	7266	7274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759345
99	NC_019902	CGG	2	6	7360	7365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
100	NC_019902	GCG	2	6	7524	7529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759345
101	NC_019902	TGC	2	6	7612	7617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_019902	ACG	2	6	7780	7785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759346
103	NC_019902	CAT	2	6	7837	7842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759346
104	NC_019902	TCA	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759346
105	NC_019902	GGC	2	6	7894	7899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_019902	TTC	2	6	7997	8002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759347
107	NC_019902	GGC	2	6	8170	8175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_019902	CCA	2	6	8238	8243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_019902	TCC	2	6	8246	8251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_019902	CGG	2	6	8294	8299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019902	CAG	2	6	8393	8398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019902	TCA	2	6	8494	8499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759349
113	NC_019902	CGC	2	6	8569	8574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
114	NC_019902	GGC	2	6	8775	8780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
115	NC_019902	GGC	2	6	8786	8791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
116	NC_019902	CAG	2	6	8831	8836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
117	NC_019902	CCG	2	6	8846	8851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
118	NC_019902	CCT	2	6	8941	8946	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759349
119	NC_019902	CGA	2	6	9000	9005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
120	NC_019902	CTG	2	6	9104	9109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759349
121	NC_019902	ACC	2	6	9123	9128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
122	NC_019902	ACC	2	6	9172	9177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
123	NC_019902	GCA	2	6	9193	9198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
124	NC_019902	CGC	2	6	9206	9211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759349
125	NC_019902	GGC	2	6	9216	9221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
126	NC_019902	ACC	2	6	9243	9248	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
127	NC_019902	GAA	2	6	9266	9271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	430759349
128	NC_019902	ACC	2	6	9315	9320	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759349
129	NC_019902	CGG	2	6	9404	9409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759349
130	NC_019902	CGT	2	6	9557	9562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759349
131	NC_019902	TGG	2	6	9772	9777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759349
132	NC_019902	GCA	2	6	9790	9795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
133	NC_019902	GCA	2	6	9910	9915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759349
134	NC_019902	AGG	2	6	10239	10244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019902	GAT	2	6	10269	10274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759350
136	NC_019902	CGG	2	6	10275	10280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759350
137	NC_019902	AGC	2	6	10385	10390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759350
138	NC_019902	CCT	2	6	10458	10463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759350
139	NC_019902	TCC	2	6	10610	10615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759350
140	NC_019902	ACC	3	9	10787	10795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759350
141	NC_019902	ACC	2	6	10799	10804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759350
142	NC_019902	TCA	2	6	10815	10820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_019902	AGT	2	6	10839	10844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_019902	GAT	2	6	10973	10978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759351
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147	NC_019902	CGC	2	6	11143	11148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_019902	ATC	2	6	11173	11178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_019902	GCG	2	6	11372	11377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
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155	NC_019902	GGC	2	6	11735	11740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759352
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161	NC_019902	GGA	2	6	12167	12172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759352
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168	NC_019902	TCA	2	6	12783	12788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_019902	CGG	2	6	12807	12812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_019902	CCG	2	6	12888	12893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_019902	TCA	2	6	12983	12988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_019902	TCC	2	6	13052	13057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
174	NC_019902	CCT	2	6	13154	13159	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_019902	TCC	2	6	13267	13272	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759353
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195	NC_019902	AGC	2	6	14325	14330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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197	NC_019902	TGT	2	6	14550	14555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_019902	ACG	2	6	18510	18515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759363
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260	NC_019902	TCT	2	6	19226	19231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
261	NC_019902	GTC	2	6	19290	19295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
262	NC_019902	GGC	2	6	19320	19325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
263	NC_019902	CAG	2	6	19502	19507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759365
264	NC_019902	TGG	2	6	19678	19683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759365
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269	NC_019902	CTC	2	6	19856	19861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
270	NC_019902	ATC	2	6	20073	20078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759366
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281	NC_019902	CTG	2	6	20636	20641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759367
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283	NC_019902	TCA	2	6	20882	20887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
284	NC_019902	CAC	2	6	20906	20911	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_019902	TCA	2	6	21053	21058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_019902	TGA	2	6	21221	21226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
287	NC_019902	CCG	2	6	21291	21296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
288	NC_019902	GCC	2	6	21512	21517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
289	NC_019902	CCG	2	6	21643	21648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759368
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321	NC_019902	TCA	2	6	23825	23830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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