MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_019902	AGT	2	6	156836	156841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759496
3503	NC_019902	CGT	2	6	156848	156853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759496
3504	NC_019902	CGC	2	6	156951	156956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759496
3505	NC_019902	GC	3	6	156999	157004	0 %	0 %	50 %	50 %	430759496
3506	NC_019902	TCA	2	6	157031	157036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759496
3507	NC_019902	CAT	2	6	157116	157121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759496
3508	NC_019902	CG	4	8	157128	157135	0 %	0 %	50 %	50 %	430759496
3509	NC_019902	CGA	2	6	157151	157156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759496
3510	NC_019902	CCG	2	6	157160	157165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759496
3511	NC_019902	CGT	3	9	157229	157237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759496
3512	NC_019902	GCA	2	6	157238	157243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759496
3513	NC_019902	CCA	2	6	157265	157270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759496
3514	NC_019902	CGG	2	6	157271	157276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759496
3515	NC_019902	GTG	2	6	157287	157292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759496
3516	NC_019902	GCC	2	6	157353	157358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759496
3517	NC_019902	GAT	2	6	157365	157370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759496
3518	NC_019902	TGAT	2	8	157384	157391	25 %	50 %	25 %	0 %	430759496
3519	NC_019902	GTC	2	6	157446	157451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_019902	GGT	2	6	157502	157507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_019902	GCT	2	6	157560	157565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_019902	GGT	2	6	157567	157572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_019902	CCG	2	6	157573	157578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_019902	CAT	2	6	157674	157679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759497
3525	NC_019902	ATC	2	6	157687	157692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759497
3526	NC_019902	GGCGAG	2	12	157801	157812	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	430759497
3527	NC_019902	CGTG	2	8	157815	157822	0 %	25 %	50 %	25 %	430759497
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3529	NC_019902	CAT	2	6	157896	157901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759497
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3531	NC_019902	CAT	2	6	157921	157926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759497
3532	NC_019902	TAC	2	6	157951	157956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759497
3533	NC_019902	CA	3	6	158006	158011	50 %	0 %	0 %	50 %	430759498
3534	NC_019902	AGGC	2	8	158015	158022	25 %	0 %	50 %	25 %	430759498
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3539	NC_019902	TGG	2	6	158214	158219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759498
3540	NC_019902	GCA	2	6	158253	158258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759498
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3542	NC_019902	CGC	2	6	158338	158343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3543	NC_019902	CGA	2	6	158356	158361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759499
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3549	NC_019902	CTGG	2	8	158479	158486	0 %	25 %	50 %	25 %	430759499
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3551	NC_019902	GGTGCC	2	12	158605	158616	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430759499
3552	NC_019902	GCT	2	6	158686	158691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759499
3553	NC_019902	CGC	2	6	158754	158759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759499
3554	NC_019902	CTG	2	6	158834	158839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759499
3555	NC_019902	GCT	2	6	158866	158871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759499
3556	NC_019902	GCC	2	6	158885	158890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759499
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3558	NC_019902	GCT	3	9	159061	159069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759499
3559	NC_019902	C	6	6	159089	159094	0 %	0 %	0 %	100 %	430759499
3560	NC_019902	CTGCG	2	10	159228	159237	0 %	20 %	40 %	40 %	430759499
3561	NC_019902	GCGG	2	8	159241	159248	0 %	0 %	75 %	25 %	430759499
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3580	NC_019902	GACC	2	8	159908	159915	25 %	0 %	25 %	50 %	430759500
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3584	NC_019902	GGGGC	2	10	160031	160040	0 %	0 %	80 %	20 %	430759500
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3592	NC_019902	CG	3	6	160193	160198	0 %	0 %	50 %	50 %	430759500
3593	NC_019902	CG	3	6	160228	160233	0 %	0 %	50 %	50 %	430759500
3594	NC_019902	CG	3	6	160259	160264	0 %	0 %	50 %	50 %	430759500
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3600	NC_019902	CGA	2	6	160403	160408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759500
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3602	NC_019902	TCGC	2	8	160518	160525	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3603	NC_019902	CGG	2	6	160527	160532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_019902	GGC	2	6	160539	160544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_019902	CAG	2	6	160566	160571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_019902	CCG	2	6	160577	160582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_019902	CG	3	6	160696	160701	0 %	0 %	50 %	50 %	430759501
3608	NC_019902	AGCGC	2	10	160841	160850	20 %	0 %	40 %	40 %	430759501
3609	NC_019902	TGT	2	6	160853	160858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759501
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3614	NC_019902	CTGC	2	8	161072	161079	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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3616	NC_019902	GA	3	6	161159	161164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3617	NC_019902	GAT	2	6	161168	161173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759502
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3620	NC_019902	GGC	3	9	161258	161266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759502
3621	NC_019902	GC	3	6	161292	161297	0 %	0 %	50 %	50 %	430759502
3622	NC_019902	GTC	2	6	161298	161303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3623	NC_019902	TCG	2	6	161337	161342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3624	NC_019902	CAA	2	6	161357	161362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759502
3625	NC_019902	ACG	2	6	161398	161403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3626	NC_019902	CGA	2	6	161444	161449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3627	NC_019902	GAG	2	6	161472	161477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759502
3628	NC_019902	GAC	2	6	161478	161483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3629	NC_019902	CTG	2	6	161520	161525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759502
3630	NC_019902	GTG	2	6	161637	161642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759502
3631	NC_019902	CGGGG	2	10	161708	161717	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3632	NC_019902	CTGC	2	8	161719	161726	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3633	NC_019902	GCC	2	6	161736	161741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3634	NC_019902	GCCA	2	8	161772	161779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3635	NC_019902	CGG	2	6	161800	161805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3636	NC_019902	CGAC	2	8	161962	161969	25 %	0 %	25 %	50 %	430759503
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3639	NC_019902	CCG	2	6	162112	162117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759503
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3641	NC_019902	CGCTGG	2	12	162133	162144	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430759503
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3644	NC_019902	CTG	2	6	162264	162269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759503
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3652	NC_019902	GGT	2	6	162575	162580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759503
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3662	NC_019902	GC	3	6	163087	163092	0 %	0 %	50 %	50 %	430759503
3663	NC_019902	GCT	2	6	163142	163147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759503
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3671	NC_019902	GC	3	6	163511	163516	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3672	NC_019902	GT	3	6	163544	163549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3673	NC_019902	CGGG	2	8	163553	163560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3674	NC_019902	CGGCG	2	10	163643	163652	0 %	0 %	60 %	40 %	430759504
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3702	NC_019902	CGA	2	6	165239	165244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
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3719	NC_019902	TCA	2	6	165853	165858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759505
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3722	NC_019902	CCGG	2	8	165962	165969	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3723	NC_019902	CCCGCA	2	12	166040	166051	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	430759505
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3729	NC_019902	CG	3	6	166402	166407	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
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3734	NC_019902	GCCG	2	8	166613	166620	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3735	NC_019902	CTG	2	6	166626	166631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
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3740	NC_019902	CAC	2	6	166731	166736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759505
3741	NC_019902	ACC	2	6	166794	166799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759505
3742	NC_019902	CCG	2	6	166894	166899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759505
3743	NC_019902	GCT	2	6	166913	166918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3744	NC_019902	ACG	2	6	166960	166965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3745	NC_019902	TCGC	2	8	166974	166981	0 %	25 %	25 %	50 %	430759505
3746	NC_019902	CG	3	6	167042	167047	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3747	NC_019902	TCGA	2	8	167049	167056	25 %	25 %	25 %	25 %	430759505
3748	NC_019902	GC	3	6	167061	167066	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3749	NC_019902	CGG	2	6	167116	167121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759505
3750	NC_019902	CGA	2	6	167153	167158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3751	NC_019902	CG	4	8	167186	167193	0 %	0 %	50 %	50 %	430759505
3752	NC_019902	TGC	2	6	167194	167199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
3753	NC_019902	GCT	2	6	167296	167301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759505
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3755	NC_019902	GGGC	2	8	167377	167384	0 %	0 %	75 %	25 %	430759505
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3761	NC_019902	TGA	2	6	167685	167690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759506
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3763	NC_019902	TGG	3	9	167757	167765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759506
3764	NC_019902	GCCT	2	8	167800	167807	0 %	25 %	25 %	50 %	430759506
3765	NC_019902	ATC	2	6	167852	167857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759506
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3782	NC_019902	GGA	2	6	168820	168825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759508
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3784	NC_019902	GAC	2	6	168893	168898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759508
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3805	NC_019902	GGC	2	6	169748	169753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3806	NC_019902	GCT	2	6	169823	169828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759510
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3834	NC_019902	TCC	2	6	170944	170949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	430759510
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3839	NC_019902	TGC	2	6	171142	171147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759510
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3842	NC_019902	GTC	2	6	171281	171286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3846	NC_019902	CGCT	2	8	171483	171490	0 %	25 %	25 %	50 %	430759511
3847	NC_019902	TGA	2	6	171568	171573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759511
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3856	NC_019902	CGGGTT	2	12	171922	171933	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	430759511
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3859	NC_019902	C	6	6	172083	172088	0 %	0 %	0 %	100 %	430759511
3860	NC_019902	ACC	2	6	172152	172157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759511
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3862	NC_019902	GC	3	6	172356	172361	0 %	0 %	50 %	50 %	430759511
3863	NC_019902	CGT	2	6	172375	172380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
3864	NC_019902	CGT	2	6	172456	172461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759511
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3888	NC_019902	TCCA	2	8	173845	173852	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3987	NC_019902	GGGT	2	8	177734	177741	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
3988	NC_019902	GGA	2	6	177773	177778	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_019902	GATG	2	8	177804	177811	25 %	25 %	50 %	0 %	430759517
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3992	NC_019902	CCGGCG	2	12	177925	177936	0 %	0 %	50 %	50 %	430759517
3993	NC_019902	CGA	2	6	177951	177956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
3994	NC_019902	GGGTC	2	10	177972	177981	0 %	20 %	60 %	20 %	430759517
3995	NC_019902	GCC	2	6	177988	177993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759517
3996	NC_019902	CGA	2	6	177996	178001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517
3997	NC_019902	GCC	2	6	178057	178062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759517
3998	NC_019902	CGGC	2	8	178079	178086	0 %	0 %	50 %	50 %	430759517
3999	NC_019902	GACC	2	8	178098	178105	25 %	0 %	25 %	50 %	430759517
4000	NC_019902	CGA	2	6	178107	178112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759517

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