MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Thioalkalivibrio nitratireducens DSM 14787

Total Repeats: 92032

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_019902	GTG	2	6	262401	262406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600
6002	NC_019902	ATTT	2	8	262419	262426	25 %	75 %	0 %	0 %	430759600
6003	NC_019902	GTG	2	6	262436	262441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600
6004	NC_019902	CGA	2	6	262486	262491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759600
6005	NC_019902	CGA	2	6	262495	262500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759600
6006	NC_019902	GGT	2	6	262556	262561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759600
6007	NC_019902	GGCGCG	2	12	262565	262576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759600
6008	NC_019902	CGAGCG	2	12	262589	262600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	430759600
6009	NC_019902	GC	3	6	262605	262610	0 %	0 %	50 %	50 %	430759600
6010	NC_019902	ATG	2	6	262640	262645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759600
6011	NC_019902	GGCTG	2	10	262702	262711	0 %	20 %	60 %	20 %	430759601
6012	NC_019902	TGG	2	6	262716	262721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759601
6013	NC_019902	GGCT	2	8	262760	262767	0 %	25 %	50 %	25 %	430759601
6014	NC_019902	AGG	2	6	262794	262799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759601
6015	NC_019902	GTT	2	6	262827	262832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	430759602
6016	NC_019902	TGG	2	6	262835	262840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759602
6017	NC_019902	CGG	2	6	262842	262847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6018	NC_019902	GGT	2	6	262863	262868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759602
6019	NC_019902	TCG	2	6	262931	262936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759602
6020	NC_019902	GGT	2	6	263061	263066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759602
6021	NC_019902	CGG	2	6	263136	263141	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6022	NC_019902	GCCA	2	8	263152	263159	25 %	0 %	25 %	50 %	430759602
6023	NC_019902	GC	3	6	263167	263172	0 %	0 %	50 %	50 %	430759602
6024	NC_019902	ACG	2	6	263174	263179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759602
6025	NC_019902	GCC	2	6	263190	263195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759602
6026	NC_019902	GGC	2	6	263199	263204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6027	NC_019902	GC	4	8	263217	263224	0 %	0 %	50 %	50 %	430759602
6028	NC_019902	GC	3	6	263236	263241	0 %	0 %	50 %	50 %	430759602
6029	NC_019902	CGGT	2	8	263243	263250	0 %	25 %	50 %	25 %	430759602
6030	NC_019902	GGC	2	6	263269	263274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6031	NC_019902	CGG	2	6	263280	263285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6032	NC_019902	CGG	2	6	263292	263297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6033	NC_019902	CGG	2	6	263304	263309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759602
6034	NC_019902	G	6	6	263317	263322	0 %	0 %	100 %	0 %	430759602
6035	NC_019902	GCT	2	6	263370	263375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6036	NC_019902	TTC	2	6	263473	263478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759603
6037	NC_019902	CGA	2	6	263520	263525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6038	NC_019902	GCT	2	6	263562	263567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6039	NC_019902	GCT	3	9	263616	263624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6040	NC_019902	GCG	2	6	263653	263658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6041	NC_019902	CG	3	6	263684	263689	0 %	0 %	50 %	50 %	430759603
6042	NC_019902	CTG	2	6	263779	263784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6043	NC_019902	CGG	2	6	263786	263791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6044	NC_019902	TGC	2	6	263819	263824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6045	NC_019902	CCG	2	6	263848	263853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6046	NC_019902	TCGCGT	2	12	263885	263896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6047	NC_019902	CGC	2	6	263904	263909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6048	NC_019902	CGG	2	6	263916	263921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6049	NC_019902	GC	3	6	263941	263946	0 %	0 %	50 %	50 %	430759603
6050	NC_019902	TGG	2	6	264010	264015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759603
6051	NC_019902	TAC	2	6	264019	264024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759603
6052	NC_019902	TGG	2	6	264043	264048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759603
6053	NC_019902	CGT	2	6	264071	264076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6054	NC_019902	GCT	2	6	264102	264107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6055	NC_019902	GCG	2	6	264134	264139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6056	NC_019902	TGC	2	6	264188	264193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6057	NC_019902	GGT	2	6	264288	264293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759603
6058	NC_019902	GC	3	6	264324	264329	0 %	0 %	50 %	50 %	430759603
6059	NC_019902	GGTC	2	8	264336	264343	0 %	25 %	50 %	25 %	430759603
6060	NC_019902	CGG	2	6	264345	264350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6061	NC_019902	CG	3	6	264368	264373	0 %	0 %	50 %	50 %	430759603
6062	NC_019902	GCT	2	6	264381	264386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6063	NC_019902	CAA	2	6	264390	264395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	430759603
6064	NC_019902	TGC	2	6	264398	264403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6065	NC_019902	GCG	2	6	264418	264423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6066	NC_019902	TGC	2	6	264425	264430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6067	NC_019902	TCGG	2	8	264481	264488	0 %	25 %	50 %	25 %	430759603
6068	NC_019902	CCG	2	6	264490	264495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6069	NC_019902	TGC	2	6	264524	264529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6070	NC_019902	TGC	3	9	264536	264544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6071	NC_019902	AGC	2	6	264590	264595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6072	NC_019902	GGC	2	6	264599	264604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6073	NC_019902	GCT	2	6	264672	264677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6074	NC_019902	ATC	2	6	264709	264714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759603
6075	NC_019902	GCA	2	6	264761	264766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6076	NC_019902	CTG	2	6	264844	264849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6077	NC_019902	ACG	3	9	264878	264886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6078	NC_019902	CGG	2	6	264927	264932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6079	NC_019902	CGA	2	6	265014	265019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6080	NC_019902	CGGC	2	8	265020	265027	0 %	0 %	50 %	50 %	430759603
6081	NC_019902	ACT	2	6	265058	265063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759603
6082	NC_019902	CA	3	6	265085	265090	50 %	0 %	0 %	50 %	430759603
6083	NC_019902	CTA	2	6	265173	265178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759603
6084	NC_019902	GGC	2	6	265228	265233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759603
6085	NC_019902	GCC	2	6	265240	265245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6086	NC_019902	ACCG	2	8	265246	265253	25 %	0 %	25 %	50 %	430759603
6087	NC_019902	CGCGTG	2	12	265261	265272	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	430759603
6088	NC_019902	CGC	2	6	265273	265278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6089	NC_019902	GAG	2	6	265279	265284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759603
6090	NC_019902	CGA	3	9	265293	265301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759603
6091	NC_019902	CCG	2	6	265310	265315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759603
6092	NC_019902	GCGTTC	2	12	265365	265376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759604
6093	NC_019902	GCT	2	6	265377	265382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759604
6094	NC_019902	TTCTGA	2	12	265397	265408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	430759604
6095	NC_019902	TGG	2	6	265472	265477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759604
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6097	NC_019902	CGT	2	6	265580	265585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759604
6098	NC_019902	GCC	2	6	265598	265603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759604
6099	NC_019902	GAG	2	6	265706	265711	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759604
6100	NC_019902	CGGG	2	8	265743	265750	0 %	0 %	75 %	25 %	430759604
6101	NC_019902	GC	3	6	265839	265844	0 %	0 %	50 %	50 %	430759604
6102	NC_019902	GCG	2	6	265854	265859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759604
6103	NC_019902	GTTCG	2	10	265925	265934	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6104	NC_019902	CGG	2	6	265956	265961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6105	NC_019902	TGTTCG	2	12	266036	266047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	430759605
6106	NC_019902	GGT	2	6	266070	266075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759605
6107	NC_019902	ACC	2	6	266080	266085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759605
6108	NC_019902	ACC	2	6	266156	266161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759605
6109	NC_019902	GCAGC	2	10	266211	266220	20 %	0 %	40 %	40 %	430759605
6110	NC_019902	GCC	2	6	266284	266289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759605
6111	NC_019902	GGC	2	6	266290	266295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759605
6112	NC_019902	GCTG	2	8	266319	266326	0 %	25 %	50 %	25 %	430759605
6113	NC_019902	CGG	3	9	266346	266354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759605
6114	NC_019902	CCG	2	6	266371	266376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759605
6115	NC_019902	TCCG	2	8	266388	266395	0 %	25 %	25 %	50 %	430759605
6116	NC_019902	CGA	2	6	266424	266429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759605
6117	NC_019902	TCG	2	6	266432	266437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759605
6118	NC_019902	GAC	2	6	266470	266475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759605
6119	NC_019902	CGG	2	6	266565	266570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759605
6120	NC_019902	ACG	2	6	266576	266581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759605
6121	NC_019902	TGG	2	6	266591	266596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759605
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6123	NC_019902	CG	3	6	266728	266733	0 %	0 %	50 %	50 %	430759605
6124	NC_019902	GC	3	6	266773	266778	0 %	0 %	50 %	50 %	430759605
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6230	NC_019902	TCG	2	6	270549	270554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6236	NC_019902	ACT	2	6	270767	270772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759609
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6238	NC_019902	CGA	2	6	270807	270812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759609
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6241	NC_019902	CCA	2	6	270890	270895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759609
6242	NC_019902	GGC	2	6	271007	271012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759609
6243	NC_019902	CGAC	2	8	271094	271101	25 %	0 %	25 %	50 %	430759609
6244	NC_019902	ATG	2	6	271126	271131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	430759609
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6283	NC_019902	GCCG	2	8	272647	272654	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6284	NC_019902	GC	3	6	272756	272761	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6285	NC_019902	GGA	2	6	272762	272767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6357	NC_019902	GCAGC	2	10	275815	275824	20 %	0 %	40 %	40 %	430759612
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6361	NC_019902	TGG	2	6	275879	275884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759612
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6363	NC_019902	C	6	6	275913	275918	0 %	0 %	0 %	100 %	430759612
6364	NC_019902	TTC	2	6	275936	275941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	430759612
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6366	NC_019902	TGC	2	6	276015	276020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759612
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6368	NC_019902	GGT	2	6	276088	276093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	430759612
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6376	NC_019902	CG	3	6	276476	276481	0 %	0 %	50 %	50 %	430759612
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6472	NC_019902	CGT	2	6	280122	280127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759614
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6483	NC_019902	GC	3	6	280661	280666	0 %	0 %	50 %	50 %	430759615
6484	NC_019902	GCA	2	6	280670	280675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759615
6485	NC_019902	AACG	2	8	280687	280694	50 %	0 %	25 %	25 %	430759615
6486	NC_019902	AGC	2	6	280752	280757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	430759615
6487	NC_019902	CAT	2	6	280820	280825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	430759615
6488	NC_019902	CTGG	2	8	280831	280838	0 %	25 %	50 %	25 %	430759615
6489	NC_019902	CGG	2	6	280867	280872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	430759615
6490	NC_019902	GGA	2	6	280930	280935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	430759616
6491	NC_019902	CCGG	2	8	281032	281039	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
6492	NC_019902	GCT	3	9	281095	281103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	430759616
6493	NC_019902	CGC	2	6	281253	281258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759616
6494	NC_019902	CG	3	6	281301	281306	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
6495	NC_019902	CCA	2	6	281310	281315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	430759616
6496	NC_019902	GCCGCG	2	12	281381	281392	0 %	0 %	50 %	50 %	430759616
6497	NC_019902	CGG	2	6	281446	281451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6498	NC_019902	GGTC	2	8	281453	281460	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6499	NC_019902	CG	3	6	281493	281498	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6500	NC_019902	GCC	2	6	281523	281528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	430759617

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